MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 11386

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016856	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016856	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	378448276
3	NC_016856	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	378448276
4	NC_016856	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	378448277
5	NC_016856	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	378448278
6	NC_016856	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	378448278
7	NC_016856	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	378448278
8	NC_016856	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	378448278
9	NC_016856	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	378448280
10	NC_016856	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	378448280
11	NC_016856	GCGT	2	8	8156	8163	0 %	25 %	50 %	25 %	378448281
12	NC_016856	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	378448281
13	NC_016856	CTGT	2	8	8666	8673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016856	GAAC	2	8	9718	9725	50 %	0 %	25 %	25 %	378448283
15	NC_016856	CAGG	2	8	10122	10129	25 %	0 %	50 %	25 %	378448284
16	NC_016856	TTGA	2	8	10977	10984	25 %	50 %	25 %	0 %	378448285
17	NC_016856	TGGC	2	8	11004	11011	0 %	25 %	50 %	25 %	378448285
18	NC_016856	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	378448285
19	NC_016856	TCTG	2	8	11389	11396	0 %	50 %	25 %	25 %	378448286
20	NC_016856	ATGG	2	8	11647	11654	25 %	25 %	50 %	0 %	378448287
21	NC_016856	TGGT	2	8	11738	11745	0 %	50 %	50 %	0 %	378448287
22	NC_016856	CAAC	2	8	12251	12258	50 %	0 %	0 %	50 %	378448287
23	NC_016856	AAGA	2	8	12325	12332	75 %	0 %	25 %	0 %	378448287
24	NC_016856	CCAT	2	8	12902	12909	25 %	25 %	0 %	50 %	378448287
25	NC_016856	GCGT	2	8	12930	12937	0 %	25 %	50 %	25 %	378448287
26	NC_016856	GGCT	2	8	13422	13429	0 %	25 %	50 %	25 %	378448287
27	NC_016856	CGGT	2	8	14592	14599	0 %	25 %	50 %	25 %	378448288
28	NC_016856	TCAG	2	8	15243	15250	25 %	25 %	25 %	25 %	378448290
29	NC_016856	TTTG	2	8	15533	15540	0 %	75 %	25 %	0 %	378448290
30	NC_016856	CGAA	2	8	15748	15755	50 %	0 %	25 %	25 %	378448290
31	NC_016856	ATTG	2	8	15760	15767	25 %	50 %	25 %	0 %	378448290
32	NC_016856	ATTA	2	8	16428	16435	50 %	50 %	0 %	0 %	378448291
33	NC_016856	ATAA	2	8	16520	16527	75 %	25 %	0 %	0 %	378448292
34	NC_016856	AATA	2	8	17996	18003	75 %	25 %	0 %	0 %	378448296
35	NC_016856	GGGC	2	8	18582	18589	0 %	0 %	75 %	25 %	378448296
36	NC_016856	CGTG	2	8	19282	19289	0 %	25 %	50 %	25 %	378448296
37	NC_016856	CCAA	2	8	21283	21290	50 %	0 %	0 %	50 %	378448297
38	NC_016856	GACG	2	8	21629	21636	25 %	0 %	50 %	25 %	378448297
39	NC_016856	TGGC	2	8	22282	22289	0 %	25 %	50 %	25 %	378448297
40	NC_016856	TGGC	2	8	22388	22395	0 %	25 %	50 %	25 %	378448297
41	NC_016856	CGCC	2	8	22654	22661	0 %	0 %	25 %	75 %	378448297
42	NC_016856	CTGG	2	8	23000	23007	0 %	25 %	50 %	25 %	378448297
43	NC_016856	TTAT	2	8	23265	23272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016856	TTTA	2	8	23498	23505	25 %	75 %	0 %	0 %	378448299
45	NC_016856	TCTG	2	8	23955	23962	0 %	50 %	25 %	25 %	378448299
46	NC_016856	TGAA	2	8	24466	24473	50 %	25 %	25 %	0 %	378448302
47	NC_016856	CCAG	2	8	24737	24744	25 %	0 %	25 %	50 %	378448302
48	NC_016856	ACCG	2	8	25414	25421	25 %	0 %	25 %	50 %	410023154
49	NC_016856	AAAT	2	8	25474	25481	75 %	25 %	0 %	0 %	410023154
50	NC_016856	TCTG	2	8	25931	25938	0 %	50 %	25 %	25 %	378448304
51	NC_016856	GCCT	2	8	26112	26119	0 %	25 %	25 %	50 %	378448304
52	NC_016856	CCTT	2	8	26618	26625	0 %	50 %	0 %	50 %	378448304
53	NC_016856	TCAG	2	8	26977	26984	25 %	25 %	25 %	25 %	378448304
54	NC_016856	ATCA	2	8	27390	27397	50 %	25 %	0 %	25 %	378448304
55	NC_016856	CAGC	2	8	27434	27441	25 %	0 %	25 %	50 %	378448304
56	NC_016856	AGCC	2	8	27924	27931	25 %	0 %	25 %	50 %	378448304
57	NC_016856	CCGA	2	8	28131	28138	25 %	0 %	25 %	50 %	378448304
58	NC_016856	ATTA	2	8	28524	28531	50 %	50 %	0 %	0 %	378448305
59	NC_016856	GGCG	2	8	28766	28773	0 %	0 %	75 %	25 %	378448305
60	NC_016856	ATGA	2	8	29971	29978	50 %	25 %	25 %	0 %	378448306
61	NC_016856	TGCT	2	8	30541	30548	0 %	50 %	25 %	25 %	378448308
62	NC_016856	TATC	2	8	30597	30604	25 %	50 %	0 %	25 %	378448308
63	NC_016856	GTAA	2	8	30634	30641	50 %	25 %	25 %	0 %	378448308
64	NC_016856	TTCG	2	8	30896	30903	0 %	50 %	25 %	25 %	378448308
65	NC_016856	GTCA	2	8	31406	31413	25 %	25 %	25 %	25 %	378448309
66	NC_016856	ACCG	2	8	32226	32233	25 %	0 %	25 %	50 %	378448310
67	NC_016856	AGGC	2	8	32264	32271	25 %	0 %	50 %	25 %	378448310
68	NC_016856	CCTG	2	8	32700	32707	0 %	25 %	25 %	50 %	378448311
69	NC_016856	CGCA	2	8	32890	32897	25 %	0 %	25 %	50 %	378448311
70	NC_016856	TAAA	2	8	32960	32967	75 %	25 %	0 %	0 %	378448311
71	NC_016856	CCAG	2	8	33346	33353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016856	TTAT	2	8	33529	33536	25 %	75 %	0 %	0 %	378448312
73	NC_016856	TTGG	2	8	33913	33920	0 %	50 %	50 %	0 %	378448312
74	NC_016856	CTTT	2	8	34293	34300	0 %	75 %	0 %	25 %	378448312
75	NC_016856	GAAG	2	8	34333	34340	50 %	0 %	50 %	0 %	378448312
76	NC_016856	TAAA	2	8	34385	34392	75 %	25 %	0 %	0 %	378448313
77	NC_016856	ATAA	2	8	34664	34671	75 %	25 %	0 %	0 %	378448313
78	NC_016856	GTGC	2	8	34787	34794	0 %	25 %	50 %	25 %	378448313
79	NC_016856	TTAA	2	8	34797	34804	50 %	50 %	0 %	0 %	378448313
80	NC_016856	TGAT	2	8	35032	35039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016856	TGGA	2	8	35549	35556	25 %	25 %	50 %	0 %	378448315
82	NC_016856	GGGA	2	8	36493	36500	25 %	0 %	75 %	0 %	378448315
83	NC_016856	ATAC	2	8	37478	37485	50 %	25 %	0 %	25 %	378448316
84	NC_016856	GAAG	2	8	37550	37557	50 %	0 %	50 %	0 %	378448316
85	NC_016856	CACG	2	8	38113	38120	25 %	0 %	25 %	50 %	378448316
86	NC_016856	TAAT	2	8	38215	38222	50 %	50 %	0 %	0 %	378448316
87	NC_016856	CCAT	2	8	38671	38678	25 %	25 %	0 %	50 %	378448316
88	NC_016856	ATTA	2	8	38765	38772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016856	AATT	2	8	40048	40055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016856	GCGG	2	8	40539	40546	0 %	0 %	75 %	25 %	378448318
91	NC_016856	CTGG	2	8	40757	40764	0 %	25 %	50 %	25 %	378448318
92	NC_016856	CCGA	2	8	41274	41281	25 %	0 %	25 %	50 %	378448318
93	NC_016856	ATCG	2	8	41430	41437	25 %	25 %	25 %	25 %	378448318
94	NC_016856	TCAA	2	8	41491	41498	50 %	25 %	0 %	25 %	378448318
95	NC_016856	ACCG	2	8	41758	41765	25 %	0 %	25 %	50 %	378448319
96	NC_016856	GAAA	2	8	41809	41816	75 %	0 %	25 %	0 %	378448319
97	NC_016856	GGTC	2	8	42381	42388	0 %	25 %	50 %	25 %	378448319
98	NC_016856	TTTG	2	8	42905	42912	0 %	75 %	25 %	0 %	378448319
99	NC_016856	GTAT	2	8	43200	43207	25 %	50 %	25 %	0 %	378448320
100	NC_016856	TCCG	2	8	43594	43601	0 %	25 %	25 %	50 %	378448320
101	NC_016856	ATGA	2	8	45656	45663	50 %	25 %	25 %	0 %	378448321
102	NC_016856	AACG	2	8	45958	45965	50 %	0 %	25 %	25 %	378448321
103	NC_016856	TGAC	2	8	46042	46049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016856	GAAA	2	8	46906	46913	75 %	0 %	25 %	0 %	378448322
105	NC_016856	TCGC	2	8	46921	46928	0 %	25 %	25 %	50 %	378448322
106	NC_016856	GCTG	2	8	47112	47119	0 %	25 %	50 %	25 %	378448322
107	NC_016856	CACG	2	8	47810	47817	25 %	0 %	25 %	50 %	378448323
108	NC_016856	CAGC	2	8	47837	47844	25 %	0 %	25 %	50 %	378448323
109	NC_016856	CTGC	2	8	47974	47981	0 %	25 %	25 %	50 %	378448323
110	NC_016856	TACC	2	8	48321	48328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016856	CATG	2	8	48542	48549	25 %	25 %	25 %	25 %	378448324
112	NC_016856	AAGT	2	8	49336	49343	50 %	25 %	25 %	0 %	378448324
113	NC_016856	CCAG	2	8	49394	49401	25 %	0 %	25 %	50 %	378448324
114	NC_016856	TTGA	2	8	50175	50182	25 %	50 %	25 %	0 %	378448324
115	NC_016856	GAAA	2	8	50510	50517	75 %	0 %	25 %	0 %	378448325
116	NC_016856	GCCA	2	8	50851	50858	25 %	0 %	25 %	50 %	378448325
117	NC_016856	TAAA	2	8	51244	51251	75 %	25 %	0 %	0 %	378448325
118	NC_016856	TCTT	2	8	51363	51370	0 %	75 %	0 %	25 %	378448325
119	NC_016856	AGTA	2	8	51937	51944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016856	ATCA	2	8	51977	51984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_016856	GAAA	2	8	52097	52104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016856	AGGG	2	8	52130	52137	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016856	CATA	2	8	52889	52896	50 %	25 %	0 %	25 %	378448328
124	NC_016856	TCAG	2	8	52900	52907	25 %	25 %	25 %	25 %	378448328
125	NC_016856	TGGC	2	8	53614	53621	0 %	25 %	50 %	25 %	378448328
126	NC_016856	GTTC	2	8	56031	56038	0 %	50 %	25 %	25 %	378448329
127	NC_016856	AGCC	2	8	57441	57448	25 %	0 %	25 %	50 %	378448332
128	NC_016856	AAAG	2	8	57520	57527	75 %	0 %	25 %	0 %	378448332
129	NC_016856	ATGG	2	8	57653	57660	25 %	25 %	50 %	0 %	378448332
130	NC_016856	TGAT	2	8	58325	58332	25 %	50 %	25 %	0 %	378448333
131	NC_016856	TGGA	2	8	58994	59001	25 %	25 %	50 %	0 %	378448334
132	NC_016856	CCTG	2	8	59030	59037	0 %	25 %	25 %	50 %	378448334
133	NC_016856	GATT	2	8	59392	59399	25 %	50 %	25 %	0 %	378448334
134	NC_016856	GATC	2	8	59761	59768	25 %	25 %	25 %	25 %	378448334
135	NC_016856	CTGG	2	8	60886	60893	0 %	25 %	50 %	25 %	378448335
136	NC_016856	GTGG	2	8	61051	61058	0 %	25 %	75 %	0 %	378448335
137	NC_016856	CTGC	2	8	61261	61268	0 %	25 %	25 %	50 %	378448336
138	NC_016856	ACCA	2	8	61897	61904	50 %	0 %	0 %	50 %	378448337
139	NC_016856	GTGG	2	8	61932	61939	0 %	25 %	75 %	0 %	378448337
140	NC_016856	CATT	2	8	62122	62129	25 %	50 %	0 %	25 %	378448337
141	NC_016856	TCAA	2	8	63163	63170	50 %	25 %	0 %	25 %	378448337
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