MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 102934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016856	CAA	2	6	186516	186521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_016856	GAG	2	6	186548	186553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_016856	TCG	2	6	186557	186562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448462
4004	NC_016856	AGA	2	6	186567	186572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448462
4005	NC_016856	TGC	2	6	186597	186602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448462
4006	NC_016856	GCT	2	6	186657	186662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448462
4007	NC_016856	GAA	3	9	186682	186690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448462
4008	NC_016856	TCC	2	6	186720	186725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448462
4009	NC_016856	GCT	2	6	186766	186771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448462
4010	NC_016856	ACC	2	6	186787	186792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448462
4011	NC_016856	CTG	2	6	186826	186831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448462
4012	NC_016856	ACA	2	6	186851	186856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448462
4013	NC_016856	TGAT	2	8	186866	186873	25 %	50 %	25 %	0 %	378448462
4014	NC_016856	TGC	2	6	186903	186908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448462
4015	NC_016856	CTG	2	6	186928	186933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448462
4016	NC_016856	ACG	2	6	186950	186955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448462
4017	NC_016856	AGA	2	6	186957	186962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448462
4018	NC_016856	CCG	2	6	187039	187044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448462
4019	NC_016856	A	6	6	187052	187057	100 %	0 %	0 %	0 %	378448462
4020	NC_016856	TCACCG	2	12	187058	187069	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378448462
4021	NC_016856	CGA	2	6	187098	187103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448462
4022	NC_016856	TC	4	8	187104	187111	0 %	50 %	0 %	50 %	378448462
4023	NC_016856	CAAA	2	8	187221	187228	75 %	0 %	0 %	25 %	378448462
4024	NC_016856	A	6	6	187243	187248	100 %	0 %	0 %	0 %	378448462
4025	NC_016856	GTG	2	6	187276	187281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448462
4026	NC_016856	TTC	2	6	187290	187295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448462
4027	NC_016856	GCG	3	9	187364	187372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448462
4028	NC_016856	CGG	2	6	187383	187388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448462
4029	NC_016856	TCT	2	6	187403	187408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448462
4030	NC_016856	GC	3	6	187430	187435	0 %	0 %	50 %	50 %	378448462
4031	NC_016856	GTGC	2	8	187576	187583	0 %	25 %	50 %	25 %	378448462
4032	NC_016856	GGT	2	6	187585	187590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448462
4033	NC_016856	ACC	2	6	187621	187626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448462
4034	NC_016856	AGC	2	6	187693	187698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448462
4035	NC_016856	GGTC	2	8	187725	187732	0 %	25 %	50 %	25 %	378448462
4036	NC_016856	TCCG	2	8	187754	187761	0 %	25 %	25 %	50 %	378448462
4037	NC_016856	TAC	2	6	187806	187811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448462
4038	NC_016856	CGA	2	6	187827	187832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448462
4039	NC_016856	CCG	2	6	187862	187867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448462
4040	NC_016856	CAC	2	6	187923	187928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448462
4041	NC_016856	CAC	2	6	187930	187935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448462
4042	NC_016856	TC	3	6	187970	187975	0 %	50 %	0 %	50 %	378448462
4043	NC_016856	TGC	3	9	188018	188026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448462
4044	NC_016856	CGG	2	6	188043	188048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448462
4045	NC_016856	CGG	2	6	188087	188092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448462
4046	NC_016856	TCTGG	2	10	188095	188104	0 %	40 %	40 %	20 %	378448462
4047	NC_016856	GCC	2	6	188113	188118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448462
4048	NC_016856	CTG	2	6	188245	188250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448462
4049	NC_016856	GAA	2	6	188259	188264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448462
4050	NC_016856	TCT	2	6	188279	188284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448462
4051	NC_016856	CCG	2	6	188357	188362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448462
4052	NC_016856	TTG	2	6	188408	188413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448462
4053	NC_016856	CTG	2	6	188437	188442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448462
4054	NC_016856	GAT	2	6	188448	188453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448462
4055	NC_016856	CCG	2	6	188472	188477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448462
4056	NC_016856	CGT	2	6	188488	188493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448462
4057	NC_016856	TGGC	2	8	188512	188519	0 %	25 %	50 %	25 %	378448462
4058	NC_016856	GCT	2	6	188529	188534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448462
4059	NC_016856	CGG	2	6	188561	188566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448462
4060	NC_016856	GAC	2	6	188626	188631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448462
4061	NC_016856	CTG	2	6	188638	188643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448462
4062	NC_016856	CGA	2	6	188667	188672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448462
4063	NC_016856	GCT	2	6	188727	188732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448462
4064	NC_016856	GCC	2	6	188775	188780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448462
4065	NC_016856	CGC	2	6	188793	188798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448462
4066	NC_016856	GAA	2	6	188809	188814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448462
4067	NC_016856	TAC	2	6	188818	188823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448462
4068	NC_016856	GGT	2	6	188913	188918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448462
4069	NC_016856	GGC	2	6	188991	188996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448462
4070	NC_016856	GCG	2	6	189001	189006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448462
4071	NC_016856	CGG	2	6	189068	189073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448462
4072	NC_016856	TATTTT	2	12	189241	189252	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	378448463
4073	NC_016856	CTT	2	6	189255	189260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448463
4074	NC_016856	CT	3	6	189277	189282	0 %	50 %	0 %	50 %	378448463
4075	NC_016856	TA	3	6	189287	189292	50 %	50 %	0 %	0 %	378448463
4076	NC_016856	GTAT	2	8	189365	189372	25 %	50 %	25 %	0 %	378448463
4077	NC_016856	TGG	2	6	189383	189388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448463
4078	NC_016856	TAT	2	6	189475	189480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448463
4079	NC_016856	TCA	2	6	189560	189565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448463
4080	NC_016856	T	6	6	189606	189611	0 %	100 %	0 %	0 %	378448463
4081	NC_016856	GGTT	2	8	189716	189723	0 %	50 %	50 %	0 %	378448463
4082	NC_016856	ATG	2	6	189758	189763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448463
4083	NC_016856	TGC	2	6	189769	189774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448463
4084	NC_016856	T	6	6	189798	189803	0 %	100 %	0 %	0 %	378448463
4085	NC_016856	ATT	2	6	189805	189810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448463
4086	NC_016856	CAT	2	6	189819	189824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448463
4087	NC_016856	TAT	2	6	189850	189855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448463
4088	NC_016856	TTG	2	6	189898	189903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448463
4089	NC_016856	GT	3	6	189906	189911	0 %	50 %	50 %	0 %	378448463
4090	NC_016856	T	6	6	189955	189960	0 %	100 %	0 %	0 %	378448463
4091	NC_016856	TGTT	2	8	189989	189996	0 %	75 %	25 %	0 %	378448463
4092	NC_016856	AAG	2	6	190021	190026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448463
4093	NC_016856	CTATA	2	10	190070	190079	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4094	NC_016856	TAA	2	6	190087	190092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_016856	TAC	2	6	190123	190128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_016856	TCT	2	6	190187	190192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_016856	T	7	7	190227	190233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_016856	GGT	2	6	190373	190378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448464
4099	NC_016856	CG	3	6	190442	190447	0 %	0 %	50 %	50 %	378448464
4100	NC_016856	TGGA	2	8	190503	190510	25 %	25 %	50 %	0 %	378448464
4101	NC_016856	GAA	2	6	190515	190520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448464
4102	NC_016856	TGA	2	6	190522	190527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448464
4103	NC_016856	TTA	2	6	190580	190585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448464
4104	NC_016856	AG	3	6	190592	190597	50 %	0 %	50 %	0 %	378448464
4105	NC_016856	GGA	2	6	190616	190621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448464
4106	NC_016856	GTC	2	6	190632	190637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448464
4107	NC_016856	CT	3	6	190673	190678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4108	NC_016856	T	6	6	190769	190774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_016856	T	6	6	190787	190792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_016856	TTA	2	6	190798	190803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_016856	TTGA	2	8	190845	190852	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_016856	CAA	2	6	190881	190886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_016856	A	6	6	190914	190919	100 %	0 %	0 %	0 %	378448465
4114	NC_016856	CGG	2	6	190937	190942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448465
4115	NC_016856	ATG	2	6	190944	190949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448465
4116	NC_016856	CGG	2	6	191009	191014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448465
4117	NC_016856	CTG	2	6	191067	191072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448465
4118	NC_016856	GCG	2	6	191218	191223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448465
4119	NC_016856	TGC	2	6	191267	191272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448465
4120	NC_016856	ATG	2	6	191332	191337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448465
4121	NC_016856	CTTT	2	8	191341	191348	0 %	75 %	0 %	25 %	378448465
4122	NC_016856	GAT	2	6	191351	191356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448465
4123	NC_016856	TGG	2	6	191401	191406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448465
4124	NC_016856	T	6	6	191468	191473	0 %	100 %	0 %	0 %	378448465
4125	NC_016856	GGC	2	6	191481	191486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448465
4126	NC_016856	GCT	2	6	191489	191494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448465
4127	NC_016856	CTTT	2	8	191500	191507	0 %	75 %	0 %	25 %	378448465
4128	NC_016856	GGGC	2	8	191521	191528	0 %	0 %	75 %	25 %	378448465
4129	NC_016856	CGTT	2	8	191590	191597	0 %	50 %	25 %	25 %	378448465
4130	NC_016856	GCG	2	6	191655	191660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448465
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4133	NC_016856	GCT	2	6	191739	191744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448465
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4152	NC_016856	TCG	2	6	192420	192425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448466
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4165	NC_016856	GCGG	2	8	193052	193059	0 %	0 %	75 %	25 %	378448466
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4203	NC_016856	GTA	2	6	194930	194935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448469
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4231	NC_016856	A	7	7	196611	196617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4232	NC_016856	CAT	2	6	196626	196631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4233	NC_016856	ATT	2	6	196660	196665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4234	NC_016856	GGA	2	6	196682	196687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4235	NC_016856	T	6	6	196739	196744	0 %	100 %	0 %	0 %	378448471
4236	NC_016856	A	6	6	196850	196855	100 %	0 %	0 %	0 %	378448471
4237	NC_016856	ACA	2	6	197008	197013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448471
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4239	NC_016856	TAT	2	6	197098	197103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4240	NC_016856	TATTG	2	10	197131	197140	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4241	NC_016856	GCCGC	2	10	197304	197313	0 %	0 %	40 %	60 %	378448472
4242	NC_016856	GCC	2	6	197318	197323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448472
4243	NC_016856	ACG	2	6	197528	197533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448472
4244	NC_016856	TCG	2	6	197565	197570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448472
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4247	NC_016856	CGC	2	6	197638	197643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448472
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4249	NC_016856	CGA	2	6	197770	197775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448472
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4273	NC_016856	CGT	2	6	198933	198938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448473
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4341	NC_016856	ATCCA	2	10	202654	202663	40 %	20 %	0 %	40 %	378448475
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4348	NC_016856	AT	3	6	202848	202853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4349	NC_016856	AAGT	2	8	202870	202877	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4351	NC_016856	A	7	7	202916	202922	100 %	0 %	0 %	0 %	378448476
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4481	NC_016856	CCA	2	6	209079	209084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4482	NC_016856	GCGG	2	8	209163	209170	0 %	0 %	75 %	25 %	378448481
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4489	NC_016856	GCG	2	6	209566	209571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448481
4490	NC_016856	GGC	2	6	209586	209591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448481
4491	NC_016856	AGTG	2	8	209601	209608	25 %	25 %	50 %	0 %	378448481
4492	NC_016856	GAT	2	6	209732	209737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4493	NC_016856	GAA	2	6	209749	209754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4494	NC_016856	AT	4	8	209788	209795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4495	NC_016856	ATT	2	6	209803	209808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448482
4496	NC_016856	GTTT	2	8	209818	209825	0 %	75 %	25 %	0 %	378448482
4497	NC_016856	GCT	2	6	209872	209877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448482
4498	NC_016856	AAT	2	6	209890	209895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448482
4499	NC_016856	T	7	7	209901	209907	0 %	100 %	0 %	0 %	378448482
4500	NC_016856	A	6	6	209912	209917	100 %	0 %	0 %	0 %	378448482

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