MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 102934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016856	GCT	2	6	163707	163712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448440
3502	NC_016856	CAG	2	6	163729	163734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448440
3503	NC_016856	A	6	6	163790	163795	100 %	0 %	0 %	0 %	378448440
3504	NC_016856	TCT	2	6	163878	163883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448440
3505	NC_016856	TTA	2	6	164014	164019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448441
3506	NC_016856	GC	3	6	164046	164051	0 %	0 %	50 %	50 %	378448441
3507	NC_016856	CG	3	6	164093	164098	0 %	0 %	50 %	50 %	378448441
3508	NC_016856	CAT	2	6	164102	164107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448441
3509	NC_016856	CGTCA	2	10	164142	164151	20 %	20 %	20 %	40 %	378448441
3510	NC_016856	ACC	2	6	164152	164157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448441
3511	NC_016856	CAG	2	6	164196	164201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448441
3512	NC_016856	CTG	2	6	164235	164240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448441
3513	NC_016856	CTG	2	6	164259	164264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448441
3514	NC_016856	TTC	2	6	164301	164306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448441
3515	NC_016856	A	6	6	164315	164320	100 %	0 %	0 %	0 %	378448441
3516	NC_016856	CGG	2	6	164357	164362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448441
3517	NC_016856	GGGC	2	8	164402	164409	0 %	0 %	75 %	25 %	378448441
3518	NC_016856	GC	3	6	164430	164435	0 %	0 %	50 %	50 %	378448441
3519	NC_016856	ATA	2	6	164437	164442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448441
3520	NC_016856	CCG	2	6	164512	164517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448441
3521	NC_016856	CTA	2	6	164623	164628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_016856	A	7	7	164660	164666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_016856	GAA	2	6	164775	164780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448442
3524	NC_016856	CTG	2	6	164983	164988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448442
3525	NC_016856	GAA	2	6	165009	165014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448442
3526	NC_016856	A	6	6	165097	165102	100 %	0 %	0 %	0 %	378448442
3527	NC_016856	TCG	2	6	165187	165192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448442
3528	NC_016856	ACG	2	6	165324	165329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448442
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3530	NC_016856	GGC	2	6	165423	165428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448442
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3532	NC_016856	GGC	2	6	165489	165494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448442
3533	NC_016856	AG	3	6	165512	165517	50 %	0 %	50 %	0 %	378448442
3534	NC_016856	CGG	2	6	165518	165523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448442
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3536	NC_016856	CGG	2	6	165602	165607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448442
3537	NC_016856	CG	3	6	165621	165626	0 %	0 %	50 %	50 %	378448442
3538	NC_016856	CAC	2	6	165755	165760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448442
3539	NC_016856	CTGG	2	8	165814	165821	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3540	NC_016856	ATCCC	2	10	165842	165851	20 %	20 %	0 %	60 %	378448443
3541	NC_016856	TGA	2	6	165923	165928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448443
3542	NC_016856	GCCAGC	2	12	165967	165978	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378448443
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3545	NC_016856	GAA	2	6	166199	166204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448443
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3547	NC_016856	CGCTGC	2	12	166306	166317	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378448443
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3549	NC_016856	AGA	2	6	166438	166443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448443
3550	NC_016856	GGC	2	6	166473	166478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448443
3551	NC_016856	GCA	2	6	166499	166504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448443
3552	NC_016856	GGC	2	6	166521	166526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448443
3553	NC_016856	AAT	2	6	166536	166541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448443
3554	NC_016856	AGCGC	2	10	166550	166559	20 %	0 %	40 %	40 %	378448443
3555	NC_016856	AGC	2	6	166616	166621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448443
3556	NC_016856	ATC	2	6	166657	166662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448443
3557	NC_016856	GCG	2	6	166673	166678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448443
3558	NC_016856	ATGA	2	8	166827	166834	50 %	25 %	25 %	0 %	378448443
3559	NC_016856	TGA	2	6	166846	166851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448443
3560	NC_016856	CTT	2	6	166871	166876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448443
3561	NC_016856	GCG	2	6	166885	166890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448443
3562	NC_016856	TGA	2	6	166943	166948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448443
3563	NC_016856	TGCC	2	8	167272	167279	0 %	25 %	25 %	50 %	378448444
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3566	NC_016856	ATC	2	6	167405	167410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448444
3567	NC_016856	TGC	2	6	167429	167434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448444
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3570	NC_016856	ATG	3	9	167552	167560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448444
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3572	NC_016856	GGAT	2	8	167618	167625	25 %	25 %	50 %	0 %	378448444
3573	NC_016856	GC	3	6	167712	167717	0 %	0 %	50 %	50 %	378448444
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3589	NC_016856	TGA	2	6	168630	168635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448445
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3597	NC_016856	GC	3	6	169133	169138	0 %	0 %	50 %	50 %	378448447
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3601	NC_016856	GAT	2	6	169454	169459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448447
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3603	NC_016856	GCCA	2	8	169548	169555	25 %	0 %	25 %	50 %	378448447
3604	NC_016856	GCG	2	6	169569	169574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448447
3605	NC_016856	GTTCA	2	10	169656	169665	20 %	40 %	20 %	20 %	378448447
3606	NC_016856	TTGG	2	8	169674	169681	0 %	50 %	50 %	0 %	378448447
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3609	NC_016856	CGG	2	6	169901	169906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448447
3610	NC_016856	GTCG	2	8	169946	169953	0 %	25 %	50 %	25 %	378448447
3611	NC_016856	GGC	2	6	169972	169977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448447
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3613	NC_016856	CAC	2	6	170044	170049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3614	NC_016856	GTTG	2	8	170083	170090	0 %	50 %	50 %	0 %	378448448
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3991	NC_016856	TGGC	2	8	185824	185831	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3992	NC_016856	CG	3	6	185873	185878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3993	NC_016856	GCC	2	6	186058	186063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3994	NC_016856	CA	3	6	186133	186138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3995	NC_016856	TC	3	6	186178	186183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3996	NC_016856	TGCC	2	8	186213	186220	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3997	NC_016856	T	6	6	186390	186395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3998	NC_016856	T	6	6	186403	186408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3999	NC_016856	CTA	2	6	186473	186478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4000	NC_016856	ACT	2	6	186479	186484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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