MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 102934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016856	CGG	2	6	140059	140064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_016856	CT	4	8	140072	140079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_016856	GCC	2	6	140083	140088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_016856	CAAA	2	8	140091	140098	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3005	NC_016856	AAT	2	6	140124	140129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_016856	ATT	2	6	140134	140139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_016856	T	6	6	140162	140167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_016856	CTTT	2	8	140173	140180	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3009	NC_016856	TTGTT	2	10	140237	140246	0 %	80 %	20 %	0 %	378448417
3010	NC_016856	TCG	2	6	140263	140268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448417
3011	NC_016856	CGG	2	6	140443	140448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_016856	T	7	7	140460	140466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_016856	T	6	6	140548	140553	0 %	100 %	0 %	0 %	378448418
3014	NC_016856	CTTG	2	8	140573	140580	0 %	50 %	25 %	25 %	378448418
3015	NC_016856	TCC	2	6	140590	140595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448418
3016	NC_016856	AAG	2	6	140640	140645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_016856	G	6	6	140666	140671	0 %	0 %	100 %	0 %	378448419
3018	NC_016856	CATC	2	8	140775	140782	25 %	25 %	0 %	50 %	378448419
3019	NC_016856	CTG	2	6	140791	140796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448419
3020	NC_016856	CCTG	2	8	140805	140812	0 %	25 %	25 %	50 %	378448419
3021	NC_016856	ATT	2	6	140821	140826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448419
3022	NC_016856	GATG	2	8	140913	140920	25 %	25 %	50 %	0 %	378448419
3023	NC_016856	AAG	2	6	140975	140980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448419
3024	NC_016856	CAA	2	6	141000	141005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448419
3025	NC_016856	GAT	2	6	141118	141123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448420
3026	NC_016856	AC	3	6	141136	141141	50 %	0 %	0 %	50 %	378448420
3027	NC_016856	CGG	2	6	141220	141225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448420
3028	NC_016856	CGAT	2	8	141276	141283	25 %	25 %	25 %	25 %	378448420
3029	NC_016856	CAT	2	6	141337	141342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448420
3030	NC_016856	GCTG	2	8	141361	141368	0 %	25 %	50 %	25 %	378448420
3031	NC_016856	TCT	2	6	141431	141436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448420
3032	NC_016856	CG	3	6	141510	141515	0 %	0 %	50 %	50 %	378448420
3033	NC_016856	GCC	2	6	141524	141529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448420
3034	NC_016856	CGG	2	6	141543	141548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448420
3035	NC_016856	GAG	2	6	141587	141592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448420
3036	NC_016856	TTG	2	6	141621	141626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448420
3037	NC_016856	GCG	3	9	141680	141688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448420
3038	NC_016856	GGA	2	6	141766	141771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448420
3039	NC_016856	GCTC	2	8	141792	141799	0 %	25 %	25 %	50 %	378448420
3040	NC_016856	GGCG	2	8	141815	141822	0 %	0 %	75 %	25 %	378448420
3041	NC_016856	ATC	2	6	141830	141835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448420
3042	NC_016856	CGG	2	6	141906	141911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448420
3043	NC_016856	A	6	6	141938	141943	100 %	0 %	0 %	0 %	378448420
3044	NC_016856	AGTTC	2	10	142022	142031	20 %	40 %	20 %	20 %	378448420
3045	NC_016856	AG	3	6	142042	142047	50 %	0 %	50 %	0 %	378448420
3046	NC_016856	CAG	2	6	142062	142067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448421
3047	NC_016856	TGCCT	2	10	142122	142131	0 %	40 %	20 %	40 %	378448421
3048	NC_016856	CAT	2	6	142191	142196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448421
3049	NC_016856	CGG	2	6	142202	142207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448421
3050	NC_016856	GGT	2	6	142212	142217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448421
3051	NC_016856	ACG	2	6	142219	142224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448421
3052	NC_016856	GAA	2	6	142315	142320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448421
3053	NC_016856	GCA	2	6	142377	142382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448421
3054	NC_016856	AGC	2	6	142443	142448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448422
3055	NC_016856	GAA	2	6	142477	142482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448422
3056	NC_016856	TCA	2	6	142493	142498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448422
3057	NC_016856	T	7	7	142544	142550	0 %	100 %	0 %	0 %	378448422
3058	NC_016856	CG	3	6	142558	142563	0 %	0 %	50 %	50 %	378448422
3059	NC_016856	ACCG	2	8	142660	142667	25 %	0 %	25 %	50 %	378448422
3060	NC_016856	AAG	2	6	142724	142729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448422
3061	NC_016856	CGG	2	6	142740	142745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448422
3062	NC_016856	TTTA	2	8	142843	142850	25 %	75 %	0 %	0 %	378448422
3063	NC_016856	GC	3	6	142855	142860	0 %	0 %	50 %	50 %	378448422
3064	NC_016856	A	6	6	142891	142896	100 %	0 %	0 %	0 %	378448422
3065	NC_016856	CGC	2	6	142933	142938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448422
3066	NC_016856	TAC	2	6	142939	142944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448422
3067	NC_016856	GCGA	2	8	143051	143058	25 %	0 %	50 %	25 %	378448422
3068	NC_016856	TCC	2	6	143101	143106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448422
3069	NC_016856	TGA	2	6	143145	143150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448422
3070	NC_016856	AAC	2	6	143182	143187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448422
3071	NC_016856	TGGCGA	2	12	143255	143266	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378448422
3072	NC_016856	CAA	2	6	143286	143291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448422
3073	NC_016856	TGG	2	6	143372	143377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448422
3074	NC_016856	TGA	2	6	143378	143383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448422
3075	NC_016856	GC	3	6	143470	143475	0 %	0 %	50 %	50 %	378448422
3076	NC_016856	TAG	2	6	143564	143569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448422
3077	NC_016856	TACT	2	8	143571	143578	25 %	50 %	0 %	25 %	378448422
3078	NC_016856	GGT	2	6	143654	143659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448422
3079	NC_016856	AG	3	6	143667	143672	50 %	0 %	50 %	0 %	378448422
3080	NC_016856	GTG	2	6	143836	143841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448422
3081	NC_016856	ATG	2	6	143845	143850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448422
3082	NC_016856	GCG	4	12	143870	143881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448422
3083	NC_016856	A	6	6	143932	143937	100 %	0 %	0 %	0 %	378448422
3084	NC_016856	CAA	2	6	143961	143966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448422
3085	NC_016856	TGG	2	6	144020	144025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448422
3086	NC_016856	TCA	2	6	144029	144034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448422
3087	NC_016856	TAC	2	6	144055	144060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448422
3088	NC_016856	GGC	2	6	144061	144066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448422
3089	NC_016856	CAT	2	6	144093	144098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448422
3090	NC_016856	GCG	2	6	144101	144106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448422
3091	NC_016856	A	7	7	144152	144158	100 %	0 %	0 %	0 %	378448422
3092	NC_016856	TAAT	2	8	144167	144174	50 %	50 %	0 %	0 %	378448422
3093	NC_016856	CTT	2	6	144215	144220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448423
3094	NC_016856	GTGG	2	8	144226	144233	0 %	25 %	75 %	0 %	378448423
3095	NC_016856	CG	3	6	144244	144249	0 %	0 %	50 %	50 %	378448423
3096	NC_016856	GA	3	6	144258	144263	50 %	0 %	50 %	0 %	378448423
3097	NC_016856	GCG	2	6	144287	144292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448423
3098	NC_016856	GTG	2	6	144311	144316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448423
3099	NC_016856	TCA	2	6	144319	144324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448423
3100	NC_016856	AT	3	6	144340	144345	50 %	50 %	0 %	0 %	378448423
3101	NC_016856	ATT	2	6	144377	144382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448423
3102	NC_016856	GCGA	2	8	144401	144408	25 %	0 %	50 %	25 %	378448423
3103	NC_016856	GTC	2	6	144440	144445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448423
3104	NC_016856	CAGC	2	8	144451	144458	25 %	0 %	25 %	50 %	378448423
3105	NC_016856	TGG	2	6	144522	144527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448423
3106	NC_016856	ACC	4	12	144551	144562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448423
3107	NC_016856	ACT	2	6	144565	144570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448423
3108	NC_016856	TCT	2	6	144743	144748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448423
3109	NC_016856	GCA	2	6	144760	144765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448423
3110	NC_016856	GGC	2	6	144772	144777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448423
3111	NC_016856	GCC	2	6	144788	144793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448423
3112	NC_016856	GGC	2	6	144856	144861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448423
3113	NC_016856	CCAC	2	8	144879	144886	25 %	0 %	0 %	75 %	378448423
3114	NC_016856	CAT	2	6	144887	144892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448423
3115	NC_016856	GAT	2	6	144914	144919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448423
3116	NC_016856	CGC	2	6	144929	144934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448423
3117	NC_016856	TGGC	2	8	144935	144942	0 %	25 %	50 %	25 %	378448423
3118	NC_016856	CGA	2	6	145047	145052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448423
3119	NC_016856	CTG	2	6	145127	145132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448423
3120	NC_016856	CCG	2	6	145185	145190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448423
3121	NC_016856	CG	3	6	145189	145194	0 %	0 %	50 %	50 %	378448423
3122	NC_016856	GGT	3	9	145249	145257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448423
3123	NC_016856	GGC	2	6	145300	145305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448423
3124	NC_016856	GAA	2	6	145397	145402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448423
3125	NC_016856	TCG	2	6	145413	145418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448423
3126	NC_016856	TGAC	2	8	145422	145429	25 %	25 %	25 %	25 %	378448423
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3129	NC_016856	CGT	2	6	145567	145572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448423
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3132	NC_016856	CTG	2	6	145867	145872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448424
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3240	NC_016856	CAT	2	6	150747	150752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448428
3241	NC_016856	GCTG	2	8	150778	150785	0 %	25 %	50 %	25 %	378448428
3242	NC_016856	CCG	2	6	150790	150795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448428
3243	NC_016856	GGC	2	6	150890	150895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448428
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3245	NC_016856	CGG	2	6	150995	151000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448428
3246	NC_016856	GTC	2	6	151029	151034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448428
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3331	NC_016856	A	6	6	155575	155580	100 %	0 %	0 %	0 %	378448432
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3349	NC_016856	GCC	2	6	156345	156350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3350	NC_016856	GA	4	8	156385	156392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3351	NC_016856	ACG	2	6	156420	156425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448433
3352	NC_016856	GGT	2	6	156449	156454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448433
3353	NC_016856	GGC	2	6	156455	156460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448433
3354	NC_016856	TTC	2	6	156509	156514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448433
3355	NC_016856	CGG	2	6	156549	156554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448433
3356	NC_016856	GGCGCT	2	12	156599	156610	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378448433
3357	NC_016856	GTCG	2	8	156620	156627	0 %	25 %	50 %	25 %	378448433
3358	NC_016856	CGG	2	6	156633	156638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448433
3359	NC_016856	TGCG	2	8	156657	156664	0 %	25 %	50 %	25 %	378448433
3360	NC_016856	GGCA	2	8	156697	156704	25 %	0 %	50 %	25 %	378448433
3361	NC_016856	GCG	2	6	156708	156713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448433
3362	NC_016856	CGGCG	2	10	156724	156733	0 %	0 %	60 %	40 %	378448433
3363	NC_016856	GTG	2	6	156782	156787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448433
3364	NC_016856	GCT	2	6	156895	156900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448433
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3487	NC_016856	GTC	2	6	162994	162999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448439
3488	NC_016856	CGC	2	6	163014	163019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448439
3489	NC_016856	CGG	2	6	163041	163046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448439
3490	NC_016856	C	6	6	163110	163115	0 %	0 %	0 %	100 %	378448439
3491	NC_016856	GAC	2	6	163117	163122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448439
3492	NC_016856	ACG	2	6	163148	163153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448439
3493	NC_016856	GCA	2	6	163317	163322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448440
3494	NC_016856	CGT	2	6	163329	163334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448440
3495	NC_016856	GATCA	2	10	163396	163405	40 %	20 %	20 %	20 %	378448440
3496	NC_016856	TGT	2	6	163481	163486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448440
3497	NC_016856	GCC	2	6	163531	163536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448440
3498	NC_016856	GCT	2	6	163587	163592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448440
3499	NC_016856	CCG	2	6	163626	163631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448440
3500	NC_016856	CTG	2	6	163639	163644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448440

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