MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 102934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016856	CTGA	2	8	116711	116718	25 %	25 %	25 %	25 %	410023155
2502	NC_016856	TGCC	2	8	116773	116780	0 %	25 %	25 %	50 %	410023155
2503	NC_016856	TGA	2	6	116788	116793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023155
2504	NC_016856	ATGA	2	8	116808	116815	50 %	25 %	25 %	0 %	410023155
2505	NC_016856	GTTC	2	8	116816	116823	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2506	NC_016856	AT	3	6	116902	116907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_016856	AAT	2	6	116914	116919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_016856	GGC	2	6	116934	116939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_016856	GAGT	2	8	116944	116951	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_016856	ATGG	2	8	117049	117056	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_016856	ATG	2	6	117108	117113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_016856	CAG	2	6	117124	117129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_016856	TTTA	2	8	117166	117173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_016856	A	6	6	117281	117286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_016856	T	6	6	117293	117298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_016856	GTTT	2	8	117299	117306	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_016856	TAAT	2	8	117307	117314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_016856	ATA	2	6	117364	117369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_016856	TAAA	2	8	117390	117397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_016856	TCG	2	6	117417	117422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_016856	CT	3	6	117427	117432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2522	NC_016856	TAATT	2	10	117436	117445	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_016856	ATTTT	2	10	117462	117471	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_016856	CGGGTG	2	12	117478	117489	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2525	NC_016856	T	6	6	117624	117629	0 %	100 %	0 %	0 %	378448393
2526	NC_016856	ACAGA	2	10	117645	117654	60 %	0 %	20 %	20 %	378448393
2527	NC_016856	ATT	2	6	117669	117674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448393
2528	NC_016856	T	7	7	117689	117695	0 %	100 %	0 %	0 %	378448393
2529	NC_016856	A	6	6	117716	117721	100 %	0 %	0 %	0 %	378448393
2530	NC_016856	ATT	2	6	117738	117743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448393
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2533	NC_016856	GGAA	2	8	117809	117816	50 %	0 %	50 %	0 %	378448393
2534	NC_016856	ATT	2	6	117843	117848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448393
2535	NC_016856	AT	3	6	117896	117901	50 %	50 %	0 %	0 %	378448393
2536	NC_016856	TCA	2	6	117914	117919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448393
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2539	NC_016856	TGC	2	6	118014	118019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448394
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2541	NC_016856	GGC	2	6	118045	118050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448394
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2543	NC_016856	CTT	2	6	118072	118077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448394
2544	NC_016856	GCG	2	6	118167	118172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448394
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2553	NC_016856	TCT	2	6	118638	118643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448394
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2555	NC_016856	ATCA	2	8	118861	118868	50 %	25 %	0 %	25 %	378448395
2556	NC_016856	GC	3	6	118947	118952	0 %	0 %	50 %	50 %	378448395
2557	NC_016856	GCCA	2	8	118954	118961	25 %	0 %	25 %	50 %	378448395
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2559	NC_016856	CAG	2	6	119074	119079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448395
2560	NC_016856	CGA	2	6	119112	119117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448395
2561	NC_016856	GCCGG	2	10	119120	119129	0 %	0 %	60 %	40 %	378448395
2562	NC_016856	GCC	2	6	119167	119172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448395
2563	NC_016856	GGAC	2	8	119221	119228	25 %	0 %	50 %	25 %	378448395
2564	NC_016856	AC	3	6	119227	119232	50 %	0 %	0 %	50 %	378448395
2565	NC_016856	CGAGC	2	10	119245	119254	20 %	0 %	40 %	40 %	378448395
2566	NC_016856	TCC	2	6	119291	119296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448395
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2597	NC_016856	GC	5	10	120693	120702	0 %	0 %	50 %	50 %	378448396
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2625	NC_016856	CAATTG	2	12	121996	122007	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378448396
2626	NC_016856	TCCA	2	8	122020	122027	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2627	NC_016856	AG	3	6	122052	122057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_016856	CAGG	2	8	122074	122081	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2629	NC_016856	AATGCT	2	12	122104	122115	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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2631	NC_016856	GTC	2	6	122292	122297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2632	NC_016856	TCT	2	6	122321	122326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2633	NC_016856	G	6	6	122336	122341	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_016856	T	7	7	122450	122456	0 %	100 %	0 %	0 %	378448397
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2991	NC_016856	GAT	2	6	139541	139546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448416
2992	NC_016856	CGG	2	6	139581	139586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448416
2993	NC_016856	GC	3	6	139605	139610	0 %	0 %	50 %	50 %	378448416
2994	NC_016856	CCGCA	2	10	139651	139660	20 %	0 %	20 %	60 %	378448416
2995	NC_016856	GCC	2	6	139718	139723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448416
2996	NC_016856	GTT	2	6	139729	139734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448416
2997	NC_016856	GCG	2	6	139822	139827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448416
2998	NC_016856	GCT	2	6	139879	139884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448416
2999	NC_016856	TGA	2	6	139972	139977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448416
3000	NC_016856	TCG	2	6	140026	140031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448416

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