MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 102934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016856	CT	3	6	279405	279410	0 %	50 %	0 %	50 %	378448549
6002	NC_016856	GCG	2	6	279436	279441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448549
6003	NC_016856	TCA	2	6	279524	279529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448549
6004	NC_016856	GC	3	6	279663	279668	0 %	0 %	50 %	50 %	378448549
6005	NC_016856	GCA	2	6	279719	279724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448549
6006	NC_016856	CTG	2	6	279750	279755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448549
6007	NC_016856	CCGG	2	8	279777	279784	0 %	0 %	50 %	50 %	378448549
6008	NC_016856	CTT	2	6	279828	279833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448549
6009	NC_016856	GA	3	6	279845	279850	50 %	0 %	50 %	0 %	378448549
6010	NC_016856	T	6	6	279941	279946	0 %	100 %	0 %	0 %	378448549
6011	NC_016856	GC	4	8	279953	279960	0 %	0 %	50 %	50 %	378448549
6012	NC_016856	CAG	2	6	279972	279977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448549
6013	NC_016856	GCG	2	6	279996	280001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448549
6014	NC_016856	GCT	2	6	280040	280045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448549
6015	NC_016856	ACTG	2	8	280071	280078	25 %	25 %	25 %	25 %	378448549
6016	NC_016856	CGG	2	6	280084	280089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448549
6017	NC_016856	CT	3	6	280104	280109	0 %	50 %	0 %	50 %	378448549
6018	NC_016856	CGG	2	6	280134	280139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448549
6019	NC_016856	GCG	2	6	280140	280145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448549
6020	NC_016856	GCTG	2	8	280156	280163	0 %	25 %	50 %	25 %	378448549
6021	NC_016856	AGG	2	6	280216	280221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448549
6022	NC_016856	TGGCGC	2	12	280222	280233	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378448549
6023	NC_016856	CGA	2	6	280235	280240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448549
6024	NC_016856	TGG	2	6	280299	280304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448549
6025	NC_016856	ACA	2	6	280322	280327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448549
6026	NC_016856	ACG	2	6	280332	280337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448549
6027	NC_016856	CTGC	2	8	280371	280378	0 %	25 %	25 %	50 %	378448549
6028	NC_016856	TGG	2	6	280406	280411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448549
6029	NC_016856	GAA	2	6	280434	280439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448549
6030	NC_016856	CGA	2	6	280545	280550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448549
6031	NC_016856	CGC	2	6	280558	280563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448549
6032	NC_016856	TGT	2	6	280564	280569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448549
6033	NC_016856	AGC	2	6	280622	280627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448549
6034	NC_016856	AGA	2	6	280628	280633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448549
6035	NC_016856	AAG	2	6	280636	280641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448549
6036	NC_016856	GCGCT	2	10	280670	280679	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6037	NC_016856	CAC	2	6	280727	280732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6038	NC_016856	CAA	2	6	280740	280745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_016856	ATG	2	6	280937	280942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448550
6040	NC_016856	TCAT	2	8	280998	281005	25 %	50 %	0 %	25 %	378448550
6041	NC_016856	GCA	2	6	281035	281040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448551
6042	NC_016856	GCC	2	6	281083	281088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448551
6043	NC_016856	CCT	2	6	281203	281208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448551
6044	NC_016856	CGT	2	6	281425	281430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448552
6045	NC_016856	ATG	2	6	281513	281518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448552
6046	NC_016856	TGA	2	6	281548	281553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448552
6047	NC_016856	ATC	2	6	281616	281621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448552
6048	NC_016856	GCGA	2	8	281690	281697	25 %	0 %	50 %	25 %	378448552
6049	NC_016856	GCG	2	6	281726	281731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448552
6050	NC_016856	TGG	2	6	281738	281743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448552
6051	NC_016856	CAG	2	6	281744	281749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448552
6052	NC_016856	GC	3	6	281763	281768	0 %	0 %	50 %	50 %	378448552
6053	NC_016856	CGA	2	6	281856	281861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448552
6054	NC_016856	AAT	2	6	281897	281902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448552
6055	NC_016856	GGT	2	6	282013	282018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448553
6056	NC_016856	TAT	2	6	282088	282093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448553
6057	NC_016856	GCCA	2	8	282112	282119	25 %	0 %	25 %	50 %	378448553
6058	NC_016856	GAT	2	6	282133	282138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448553
6059	NC_016856	TCATTA	2	12	282143	282154	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378448553
6060	NC_016856	TCT	2	6	282313	282318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448553
6061	NC_016856	TCG	2	6	282342	282347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448553
6062	NC_016856	TAA	2	6	282454	282459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_016856	GGC	2	6	282493	282498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_016856	GCA	2	6	282514	282519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_016856	GCG	2	6	282528	282533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_016856	TGC	2	6	282534	282539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_016856	TGA	2	6	282600	282605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_016856	GAA	2	6	282629	282634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_016856	CGG	2	6	282672	282677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_016856	TAT	2	6	282716	282721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_016856	CG	3	6	282722	282727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6072	NC_016856	GTAT	3	12	282843	282854	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_016856	GCG	2	6	282866	282871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_016856	GGC	2	6	282943	282948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_016856	TGC	2	6	282972	282977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_016856	CACT	2	8	283084	283091	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6077	NC_016856	CAA	2	6	283153	283158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_016856	ACG	2	6	283236	283241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448554
6079	NC_016856	TCG	2	6	283258	283263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448554
6080	NC_016856	GTC	2	6	283353	283358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448554
6081	NC_016856	GC	4	8	283379	283386	0 %	0 %	50 %	50 %	378448554
6082	NC_016856	AGC	2	6	283521	283526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448554
6083	NC_016856	AGC	2	6	283556	283561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448554
6084	NC_016856	CAA	2	6	283733	283738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448554
6085	NC_016856	AGT	2	6	283775	283780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448554
6086	NC_016856	GGC	2	6	283821	283826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448554
6087	NC_016856	CGAT	2	8	283834	283841	25 %	25 %	25 %	25 %	378448554
6088	NC_016856	ATTA	2	8	283890	283897	50 %	50 %	0 %	0 %	378448554
6089	NC_016856	TCT	2	6	283909	283914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448554
6090	NC_016856	TTCA	2	8	283968	283975	25 %	50 %	0 %	25 %	378448554
6091	NC_016856	CGC	2	6	283985	283990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448554
6092	NC_016856	CAG	2	6	283995	284000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448554
6093	NC_016856	CCA	2	6	284003	284008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448554
6094	NC_016856	CAG	2	6	284040	284045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448554
6095	NC_016856	T	6	6	284057	284062	0 %	100 %	0 %	0 %	378448554
6096	NC_016856	CCA	2	6	284084	284089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448554
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6098	NC_016856	GC	3	6	284149	284154	0 %	0 %	50 %	50 %	378448554
6099	NC_016856	GCG	2	6	284162	284167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448554
6100	NC_016856	CGC	2	6	284234	284239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448554
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6102	NC_016856	CG	3	6	284304	284309	0 %	0 %	50 %	50 %	378448554
6103	NC_016856	TCA	2	6	284414	284419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448554
6104	NC_016856	CG	3	6	284426	284431	0 %	0 %	50 %	50 %	378448554
6105	NC_016856	TCA	2	6	284461	284466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448554
6106	NC_016856	GAA	2	6	284487	284492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448554
6107	NC_016856	CTT	2	6	284549	284554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448554
6108	NC_016856	GCA	2	6	284603	284608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448554
6109	NC_016856	CT	3	6	284638	284643	0 %	50 %	0 %	50 %	378448554
6110	NC_016856	GGCT	2	8	284655	284662	0 %	25 %	50 %	25 %	378448554
6111	NC_016856	GTT	2	6	284697	284702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448554
6112	NC_016856	CACG	2	8	284711	284718	25 %	0 %	25 %	50 %	378448554
6113	NC_016856	T	6	6	284730	284735	0 %	100 %	0 %	0 %	378448554
6114	NC_016856	TA	3	6	284765	284770	50 %	50 %	0 %	0 %	378448554
6115	NC_016856	ATC	2	6	284791	284796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448554
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6117	NC_016856	TGG	2	6	284815	284820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448554
6118	NC_016856	TGT	2	6	284885	284890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448554
6119	NC_016856	A	7	7	284938	284944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_016856	AAAT	2	8	285142	285149	75 %	25 %	0 %	0 %	378448555
6121	NC_016856	CGT	2	6	285179	285184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448555
6122	NC_016856	GGC	3	9	285254	285262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448555
6123	NC_016856	CCA	2	6	285304	285309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448555
6124	NC_016856	CCA	2	6	285322	285327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448555
6125	NC_016856	CT	3	6	285357	285362	0 %	50 %	0 %	50 %	378448555
6126	NC_016856	GCC	2	6	285487	285492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448555
6127	NC_016856	GCC	2	6	285494	285499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448555
6128	NC_016856	TGA	2	6	285510	285515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448555
6129	NC_016856	CGC	2	6	285601	285606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448555
6130	NC_016856	GACCA	2	10	285617	285626	40 %	0 %	20 %	40 %	378448555
6131	NC_016856	GCT	2	6	285695	285700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448555
6132	NC_016856	AGC	2	6	285750	285755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448556
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6134	NC_016856	GC	3	6	285838	285843	0 %	0 %	50 %	50 %	378448556
6135	NC_016856	CGC	2	6	285891	285896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448556
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6138	NC_016856	AATG	2	8	286116	286123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6139	NC_016856	AAT	2	6	286189	286194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6140	NC_016856	CGC	2	6	286240	286245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448557
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6143	NC_016856	CAA	2	6	286378	286383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448557
6144	NC_016856	CTGG	2	8	286415	286422	0 %	25 %	50 %	25 %	378448557
6145	NC_016856	TGA	2	6	286435	286440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448557
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6148	NC_016856	GCA	4	12	286591	286602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448557
6149	NC_016856	GGTCG	2	10	286619	286628	0 %	20 %	60 %	20 %	378448557
6150	NC_016856	GATTT	2	10	286671	286680	20 %	60 %	20 %	0 %	378448557
6151	NC_016856	T	7	7	286678	286684	0 %	100 %	0 %	0 %	378448557
6152	NC_016856	TTTC	2	8	286873	286880	0 %	75 %	0 %	25 %	378448557
6153	NC_016856	TGC	2	6	286908	286913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448557
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6155	NC_016856	TGTGT	2	10	287061	287070	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6156	NC_016856	TAAA	2	8	287125	287132	75 %	25 %	0 %	0 %	378448558
6157	NC_016856	TCA	2	6	287163	287168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448558
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6197	NC_016856	ATCA	2	8	288856	288863	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6198	NC_016856	CTG	2	6	288891	288896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6220	NC_016856	ACT	2	6	290030	290035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6225	NC_016856	TAA	2	6	290342	290347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6230	NC_016856	GGA	2	6	290588	290593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6231	NC_016856	GGC	2	6	290608	290613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6232	NC_016856	GAA	2	6	290851	290856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6233	NC_016856	TGC	2	6	290927	290932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6234	NC_016856	GTC	2	6	290939	290944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6235	NC_016856	TTG	2	6	291000	291005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6236	NC_016856	GGA	2	6	291052	291057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6237	NC_016856	TCA	2	6	291077	291082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6238	NC_016856	AC	3	6	291103	291108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6239	NC_016856	CGT	2	6	291171	291176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6240	NC_016856	AC	3	6	291272	291277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6241	NC_016856	GTAG	2	8	291313	291320	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6242	NC_016856	CCT	2	6	291413	291418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6243	NC_016856	AAG	2	6	291426	291431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6244	NC_016856	CA	3	6	291448	291453	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6245	NC_016856	TGA	2	6	291461	291466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6246	NC_016856	GGT	2	6	291504	291509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6248	NC_016856	TGT	2	6	291584	291589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6379	NC_016856	AGA	2	6	298863	298868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6380	NC_016856	A	6	6	298924	298929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6381	NC_016856	ATGCG	2	10	298935	298944	20 %	20 %	40 %	20 %	378448567
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6457	NC_016856	AAT	2	6	302831	302836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6485	NC_016856	CGCGG	2	10	304372	304381	0 %	0 %	60 %	40 %	378448573
6486	NC_016856	GATA	2	8	304560	304567	50 %	25 %	25 %	0 %	378448573
6487	NC_016856	GA	3	6	304673	304678	50 %	0 %	50 %	0 %	378448573
6488	NC_016856	GCA	2	6	304686	304691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448573
6489	NC_016856	GCCAG	2	10	304721	304730	20 %	0 %	40 %	40 %	378448573
6490	NC_016856	GCTG	2	8	304764	304771	0 %	25 %	50 %	25 %	378448573
6491	NC_016856	GGCG	2	8	304823	304830	0 %	0 %	75 %	25 %	378448573
6492	NC_016856	ATC	2	6	304858	304863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448574
6493	NC_016856	GCA	2	6	304879	304884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448574
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6495	NC_016856	CCGT	2	8	305029	305036	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6496	NC_016856	A	8	8	305083	305090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6497	NC_016856	T	8	8	305116	305123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6498	NC_016856	AAG	2	6	305131	305136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6499	NC_016856	CTT	2	6	305207	305212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448575
6500	NC_016856	CAT	2	6	305360	305365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448576

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