MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 102934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016856	CCTTCG	2	12	254070	254081	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378448526
5502	NC_016856	GGC	2	6	254096	254101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448526
5503	NC_016856	CT	3	6	254157	254162	0 %	50 %	0 %	50 %	378448526
5504	NC_016856	CGA	2	6	254206	254211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448526
5505	NC_016856	CAC	2	6	254321	254326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448526
5506	NC_016856	AGGC	2	8	254373	254380	25 %	0 %	50 %	25 %	378448526
5507	NC_016856	GTT	2	6	254392	254397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448526
5508	NC_016856	GGT	2	6	254438	254443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448526
5509	NC_016856	T	6	6	254512	254517	0 %	100 %	0 %	0 %	378448526
5510	NC_016856	GAT	2	6	254572	254577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_016856	AAT	2	6	254584	254589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_016856	TCAG	2	8	254612	254619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5513	NC_016856	T	6	6	254688	254693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_016856	ACTG	2	8	254704	254711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5515	NC_016856	TGC	2	6	254740	254745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_016856	CAA	2	6	254790	254795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_016856	GC	3	6	254829	254834	0 %	0 %	50 %	50 %	378448527
5518	NC_016856	AC	3	6	254860	254865	50 %	0 %	0 %	50 %	378448527
5519	NC_016856	AAC	2	6	254898	254903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448527
5520	NC_016856	AC	4	8	254902	254909	50 %	0 %	0 %	50 %	378448527
5521	NC_016856	GC	3	6	255099	255104	0 %	0 %	50 %	50 %	378448528
5522	NC_016856	CAT	2	6	255118	255123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448528
5523	NC_016856	CTGAA	2	10	255165	255174	40 %	20 %	20 %	20 %	378448528
5524	NC_016856	AAGCG	2	10	255229	255238	40 %	0 %	40 %	20 %	378448528
5525	NC_016856	GCT	2	6	255248	255253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448528
5526	NC_016856	TTC	2	6	255269	255274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448528
5527	NC_016856	GCTG	2	8	255285	255292	0 %	25 %	50 %	25 %	378448528
5528	NC_016856	AAGA	2	8	255392	255399	75 %	0 %	25 %	0 %	378448528
5529	NC_016856	AAC	2	6	255530	255535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448528
5530	NC_016856	GAA	2	6	255701	255706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448528
5531	NC_016856	TAA	2	6	255725	255730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448528
5532	NC_016856	GGC	2	6	255769	255774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_016856	GTA	2	6	255882	255887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_016856	ATG	2	6	256042	256047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448529
5535	NC_016856	A	6	6	256054	256059	100 %	0 %	0 %	0 %	378448529
5536	NC_016856	CTGA	2	8	256063	256070	25 %	25 %	25 %	25 %	378448529
5537	NC_016856	GCG	2	6	256129	256134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448529
5538	NC_016856	A	6	6	256135	256140	100 %	0 %	0 %	0 %	378448529
5539	NC_016856	GCT	2	6	256153	256158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448529
5540	NC_016856	GACT	2	8	256221	256228	25 %	25 %	25 %	25 %	378448529
5541	NC_016856	CGC	2	6	256278	256283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448529
5542	NC_016856	GAA	2	6	256330	256335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448529
5543	NC_016856	TCG	2	6	256380	256385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448529
5544	NC_016856	GC	3	6	256432	256437	0 %	0 %	50 %	50 %	378448529
5545	NC_016856	GCAA	2	8	256507	256514	50 %	0 %	25 %	25 %	378448529
5546	NC_016856	CTG	2	6	256544	256549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448529
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5548	NC_016856	GAA	2	6	256644	256649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448529
5549	NC_016856	CTG	2	6	256717	256722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448529
5550	NC_016856	GACT	2	8	256791	256798	25 %	25 %	25 %	25 %	378448529
5551	NC_016856	GCA	2	6	256801	256806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448529
5552	NC_016856	TGC	2	6	256812	256817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448529
5553	NC_016856	GAG	2	6	256844	256849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_016856	CTT	2	6	256864	256869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_016856	CT	3	6	256877	256882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5556	NC_016856	GAAA	2	8	256972	256979	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_016856	GCG	2	6	257030	257035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448530
5558	NC_016856	TGGTG	2	10	257133	257142	0 %	40 %	60 %	0 %	378448530
5559	NC_016856	GGT	2	6	257149	257154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448530
5560	NC_016856	CGCC	2	8	257283	257290	0 %	0 %	25 %	75 %	378448530
5561	NC_016856	CTG	2	6	257353	257358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448530
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5563	NC_016856	TCTG	2	8	257379	257386	0 %	50 %	25 %	25 %	378448530
5564	NC_016856	TTC	2	6	257404	257409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448530
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5567	NC_016856	CGT	2	6	257659	257664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448530
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5572	NC_016856	TG	3	6	257805	257810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_016856	GTCTG	2	10	257814	257823	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5574	NC_016856	CTG	2	6	257958	257963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448531
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5588	NC_016856	GCG	2	6	258506	258511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5602	NC_016856	GCA	2	6	258972	258977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448532
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5608	NC_016856	TCAT	2	8	259314	259321	25 %	50 %	0 %	25 %	378448532
5609	NC_016856	ATGGC	2	10	259400	259409	20 %	20 %	40 %	20 %	378448532
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5616	NC_016856	CG	3	6	259702	259707	0 %	0 %	50 %	50 %	378448532
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5619	NC_016856	T	6	6	259870	259875	0 %	100 %	0 %	0 %	378448533
5620	NC_016856	CG	3	6	259964	259969	0 %	0 %	50 %	50 %	378448533
5621	NC_016856	A	6	6	260048	260053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5625	NC_016856	GTCC	2	8	260200	260207	0 %	25 %	25 %	50 %	378448534
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5629	NC_016856	TG	3	6	260323	260328	0 %	50 %	50 %	0 %	378448534
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5988	NC_016856	TGA	2	6	278279	278284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448547
5989	NC_016856	GTG	3	9	278292	278300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448547
5990	NC_016856	A	6	6	278302	278307	100 %	0 %	0 %	0 %	378448547
5991	NC_016856	CTG	2	6	278322	278327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448547
5992	NC_016856	GCT	2	6	278369	278374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448547
5993	NC_016856	TGC	2	6	278542	278547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448547
5994	NC_016856	GAT	2	6	278570	278575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448547
5995	NC_016856	AGGTG	2	10	278612	278621	20 %	20 %	60 %	0 %	378448547
5996	NC_016856	CTG	2	6	278751	278756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448547
5997	NC_016856	TGCTC	2	10	278758	278767	0 %	40 %	20 %	40 %	378448547
5998	NC_016856	TCA	2	6	278943	278948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448548
5999	NC_016856	TCCCT	2	10	279105	279114	0 %	40 %	0 %	60 %	378448548
6000	NC_016856	T	6	6	279264	279269	0 %	100 %	0 %	0 %	378448548

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