MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 102934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016856	TA	3	6	231005	231010	50 %	50 %	0 %	0 %	378448505
5002	NC_016856	T	7	7	231032	231038	0 %	100 %	0 %	0 %	378448505
5003	NC_016856	T	7	7	231061	231067	0 %	100 %	0 %	0 %	378448505
5004	NC_016856	CTTG	2	8	231079	231086	0 %	50 %	25 %	25 %	378448505
5005	NC_016856	TTTG	2	8	231088	231095	0 %	75 %	25 %	0 %	378448505
5006	NC_016856	T	6	6	231096	231101	0 %	100 %	0 %	0 %	378448505
5007	NC_016856	TAT	2	6	231118	231123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448505
5008	NC_016856	TAAA	2	8	231142	231149	75 %	25 %	0 %	0 %	378448505
5009	NC_016856	A	6	6	231147	231152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_016856	TTAT	2	8	231204	231211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_016856	GTT	2	6	231218	231223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_016856	CTT	2	6	231226	231231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_016856	ATATA	2	10	231265	231274	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_016856	CTA	2	6	231278	231283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_016856	TG	3	6	231313	231318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_016856	TAA	2	6	231346	231351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_016856	CAG	2	6	231368	231373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448506
5018	NC_016856	TGC	2	6	231387	231392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448506
5019	NC_016856	TGC	2	6	231426	231431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448506
5020	NC_016856	CGA	2	6	231501	231506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448506
5021	NC_016856	CAC	2	6	231609	231614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448506
5022	NC_016856	AAG	2	6	231620	231625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448506
5023	NC_016856	CGG	3	9	231696	231704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448506
5024	NC_016856	ACC	2	6	231737	231742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448506
5025	NC_016856	GCG	3	9	231805	231813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448506
5026	NC_016856	CTG	2	6	231854	231859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448506
5027	NC_016856	CCA	2	6	231860	231865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448506
5028	NC_016856	CAG	2	6	231885	231890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448506
5029	NC_016856	ATC	2	6	231929	231934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_016856	GAT	2	6	231954	231959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_016856	A	7	7	231969	231975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_016856	TA	3	6	231981	231986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_016856	A	6	6	232019	232024	100 %	0 %	0 %	0 %	378448507
5034	NC_016856	GTG	2	6	232049	232054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448507
5035	NC_016856	GAT	2	6	232136	232141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448507
5036	NC_016856	TC	3	6	232153	232158	0 %	50 %	0 %	50 %	378448507
5037	NC_016856	ATC	2	6	232197	232202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448507
5038	NC_016856	TTA	2	6	232245	232250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448507
5039	NC_016856	ATA	2	6	232263	232268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448507
5040	NC_016856	GCT	2	6	232315	232320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448507
5041	NC_016856	ATT	2	6	232442	232447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448507
5042	NC_016856	TAT	2	6	232521	232526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448507
5043	NC_016856	ATG	2	6	232566	232571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448507
5044	NC_016856	GGTG	2	8	232606	232613	0 %	25 %	75 %	0 %	378448507
5045	NC_016856	GC	3	6	232636	232641	0 %	0 %	50 %	50 %	378448507
5046	NC_016856	GGCG	2	8	232743	232750	0 %	0 %	75 %	25 %	378448507
5047	NC_016856	GGC	2	6	232829	232834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448507
5048	NC_016856	CGA	2	6	232846	232851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448507
5049	NC_016856	AT	3	6	232890	232895	50 %	50 %	0 %	0 %	378448507
5050	NC_016856	GC	3	6	232904	232909	0 %	0 %	50 %	50 %	378448507
5051	NC_016856	GCGG	2	8	232938	232945	0 %	0 %	75 %	25 %	378448507
5052	NC_016856	GAA	2	6	233033	233038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448507
5053	NC_016856	GGC	2	6	233162	233167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448507
5054	NC_016856	CCT	2	6	233187	233192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448507
5055	NC_016856	CGG	2	6	233221	233226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448507
5056	NC_016856	GCT	2	6	233284	233289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448507
5057	NC_016856	TGA	2	6	233404	233409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448507
5058	NC_016856	GAA	2	6	233450	233455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448507
5059	NC_016856	TGA	2	6	233731	233736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448507
5060	NC_016856	CAA	2	6	233770	233775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448507
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5062	NC_016856	CG	3	6	233882	233887	0 %	0 %	50 %	50 %	378448507
5063	NC_016856	CTA	2	6	233911	233916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448507
5064	NC_016856	CGG	2	6	233983	233988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448507
5065	NC_016856	GCG	2	6	234003	234008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448507
5066	NC_016856	GCACC	2	10	234037	234046	20 %	0 %	20 %	60 %	378448507
5067	NC_016856	CGG	2	6	234055	234060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448507
5068	NC_016856	GCT	2	6	234067	234072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448507
5069	NC_016856	TA	3	6	234126	234131	50 %	50 %	0 %	0 %	378448507
5070	NC_016856	ACT	2	6	234171	234176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448507
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5073	NC_016856	GGC	2	6	234335	234340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448507
5074	NC_016856	CGC	2	6	234342	234347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448507
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5076	NC_016856	TGC	2	6	234528	234533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448507
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5082	NC_016856	GGC	2	6	234733	234738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448508
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5088	NC_016856	CCGC	2	8	235098	235105	0 %	0 %	25 %	75 %	378448508
5089	NC_016856	GCA	2	6	235128	235133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448508
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5091	NC_016856	GTG	2	6	235207	235212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448508
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5093	NC_016856	GC	3	6	235358	235363	0 %	0 %	50 %	50 %	378448508
5094	NC_016856	ACA	2	6	235391	235396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448508
5095	NC_016856	GCCGC	2	10	235573	235582	0 %	0 %	40 %	60 %	378448509
5096	NC_016856	CGG	2	6	235596	235601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448509
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5098	NC_016856	GC	3	6	235808	235813	0 %	0 %	50 %	50 %	378448509
5099	NC_016856	GCG	2	6	235856	235861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448509
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5103	NC_016856	G	6	6	235991	235996	0 %	0 %	100 %	0 %	378448510
5104	NC_016856	CCG	2	6	236052	236057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448510
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5107	NC_016856	GTGA	2	8	236223	236230	25 %	25 %	50 %	0 %	378448510
5108	NC_016856	CGG	3	9	236239	236247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448510
5109	NC_016856	CCA	2	6	236314	236319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448510
5110	NC_016856	TGAA	2	8	236326	236333	50 %	25 %	25 %	0 %	378448510
5111	NC_016856	GGC	2	6	236394	236399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448510
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5115	NC_016856	CGGGAT	2	12	236776	236787	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378448511
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5119	NC_016856	TAT	2	6	237070	237075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448512
5120	NC_016856	GGAG	2	8	237132	237139	25 %	0 %	75 %	0 %	378448512
5121	NC_016856	GAT	2	6	237337	237342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448512
5122	NC_016856	CTGG	2	8	237354	237361	0 %	25 %	50 %	25 %	378448512
5123	NC_016856	CCG	2	6	237412	237417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448512
5124	NC_016856	CAGTT	2	10	237426	237435	20 %	40 %	20 %	20 %	378448512
5125	NC_016856	AAC	2	6	237498	237503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448512
5126	NC_016856	G	6	6	237564	237569	0 %	0 %	100 %	0 %	378448512
5127	NC_016856	GCA	2	6	237584	237589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448512
5128	NC_016856	ATC	2	6	237689	237694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448512
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5132	NC_016856	A	9	9	237854	237862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_016856	GGC	2	6	237869	237874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5134	NC_016856	GTT	2	6	237894	237899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5234	NC_016856	GGC	2	6	242402	242407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448518
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5239	NC_016856	T	6	6	242596	242601	0 %	100 %	0 %	0 %	378448518
5240	NC_016856	CGGG	2	8	242608	242615	0 %	0 %	75 %	25 %	378448518
5241	NC_016856	GCT	2	6	242627	242632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448518
5242	NC_016856	CGG	2	6	242653	242658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448518
5243	NC_016856	GA	3	6	242683	242688	50 %	0 %	50 %	0 %	378448518
5244	NC_016856	CG	3	6	242698	242703	0 %	0 %	50 %	50 %	378448518
5245	NC_016856	AGC	2	6	242733	242738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448518
5246	NC_016856	CGC	2	6	242820	242825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448519
5247	NC_016856	ACC	2	6	242890	242895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448519
5248	NC_016856	TAA	2	6	243008	243013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448519
5249	NC_016856	CGC	2	6	243020	243025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448519
5250	NC_016856	CT	3	6	243060	243065	0 %	50 %	0 %	50 %	378448519
5251	NC_016856	CGG	2	6	243080	243085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448519
5252	NC_016856	CCGG	2	8	243112	243119	0 %	0 %	50 %	50 %	378448519
5253	NC_016856	CGT	2	6	243167	243172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448519
5254	NC_016856	GAC	2	6	243192	243197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448519
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5260	NC_016856	ATG	2	6	243448	243453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448519
5261	NC_016856	ATCG	2	8	243554	243561	25 %	25 %	25 %	25 %	378448520
5262	NC_016856	TCG	2	6	243587	243592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448520
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5265	NC_016856	GCA	2	6	243767	243772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448520
5266	NC_016856	GGA	2	6	243830	243835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448520
5267	NC_016856	GCCT	2	8	243885	243892	0 %	25 %	25 %	50 %	378448520
5268	NC_016856	CCG	2	6	243912	243917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448520
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5273	NC_016856	CGG	2	6	244166	244171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448520
5274	NC_016856	TGG	2	6	244197	244202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448520
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5282	NC_016856	T	6	6	244542	244547	0 %	100 %	0 %	0 %	378448520
5283	NC_016856	TAAA	2	8	244570	244577	75 %	25 %	0 %	0 %	378448520
5284	NC_016856	GCC	2	6	244675	244680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448520
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5287	NC_016856	GTC	2	6	244920	244925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448520
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5291	NC_016856	A	7	7	245199	245205	100 %	0 %	0 %	0 %	378448521
5292	NC_016856	CGG	2	6	245269	245274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448521
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5312	NC_016856	CAG	2	6	246230	246235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448521
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5314	NC_016856	GC	3	6	246248	246253	0 %	0 %	50 %	50 %	378448521
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5319	NC_016856	AGC	2	6	246438	246443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448521
5320	NC_016856	CGC	2	6	246461	246466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448521
5321	NC_016856	A	6	6	246480	246485	100 %	0 %	0 %	0 %	378448521
5322	NC_016856	CAG	2	6	246510	246515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448521
5323	NC_016856	GTG	2	6	246589	246594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448521
5324	NC_016856	TATT	2	8	246602	246609	25 %	75 %	0 %	0 %	378448521
5325	NC_016856	C	6	6	246675	246680	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5326	NC_016856	TGCTC	2	10	246753	246762	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5327	NC_016856	AGG	2	6	246765	246770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5328	NC_016856	TGGC	3	12	246777	246788	0 %	25 %	50 %	25 %	378448522
5329	NC_016856	GC	3	6	246821	246826	0 %	0 %	50 %	50 %	378448522
5330	NC_016856	CAT	2	6	246835	246840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448522
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5332	NC_016856	GC	3	6	246924	246929	0 %	0 %	50 %	50 %	378448522
5333	NC_016856	CGA	2	6	246964	246969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448522
5334	NC_016856	GT	3	6	247097	247102	0 %	50 %	50 %	0 %	378448522
5335	NC_016856	ATG	2	6	247115	247120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448522
5336	NC_016856	TGA	2	6	247182	247187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448522
5337	NC_016856	GAA	2	6	247202	247207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448522
5338	NC_016856	TGG	2	6	247221	247226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448522
5339	NC_016856	GGC	2	6	247270	247275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448522
5340	NC_016856	GGT	2	6	247276	247281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448522
5341	NC_016856	CAG	2	6	247331	247336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448522
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5345	NC_016856	ATC	2	6	247452	247457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448522
5346	NC_016856	AGC	2	6	247470	247475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448522
5347	NC_016856	CCGGG	2	10	247539	247548	0 %	0 %	60 %	40 %	378448522
5348	NC_016856	GC	3	6	247574	247579	0 %	0 %	50 %	50 %	378448522
5349	NC_016856	GAT	2	6	247585	247590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448522
5350	NC_016856	AG	3	6	247612	247617	50 %	0 %	50 %	0 %	378448522
5351	NC_016856	TGC	2	6	247644	247649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448522
5352	NC_016856	GGC	2	6	247673	247678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448522
5353	NC_016856	GC	3	6	247697	247702	0 %	0 %	50 %	50 %	378448522
5354	NC_016856	AAC	2	6	247730	247735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448522
5355	NC_016856	TTA	2	6	247739	247744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448522
5356	NC_016856	CGG	2	6	247937	247942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5357	NC_016856	AT	3	6	247968	247973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5358	NC_016856	AC	3	6	248013	248018	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5359	NC_016856	CTTA	2	8	248021	248028	25 %	50 %	0 %	25 %	378448523
5360	NC_016856	CGA	2	6	248075	248080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448523
5361	NC_016856	GTC	2	6	248100	248105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448523
5362	NC_016856	CCA	2	6	248234	248239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448523
5363	NC_016856	CTT	2	6	248336	248341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448523
5364	NC_016856	CGAT	2	8	248356	248363	25 %	25 %	25 %	25 %	378448523
5365	NC_016856	CATA	2	8	248402	248409	50 %	25 %	0 %	25 %	378448523
5366	NC_016856	TCA	2	6	248420	248425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5368	NC_016856	CCA	2	6	248467	248472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5496	NC_016856	GAT	2	6	253772	253777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448526
5497	NC_016856	ACG	2	6	253971	253976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448526
5498	NC_016856	CAT	2	6	253990	253995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448526
5499	NC_016856	GCA	2	6	253999	254004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448526
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