MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 102934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016856	GT	3	6	209932	209937	0 %	50 %	50 %	0 %	378448482
4502	NC_016856	A	7	7	209946	209952	100 %	0 %	0 %	0 %	378448482
4503	NC_016856	CAT	2	6	209961	209966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448482
4504	NC_016856	GGA	2	6	209985	209990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_016856	AAG	2	6	210060	210065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448483
4506	NC_016856	ATG	2	6	210135	210140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448483
4507	NC_016856	TG	3	6	210139	210144	0 %	50 %	50 %	0 %	378448483
4508	NC_016856	CGGCG	2	10	210200	210209	0 %	0 %	60 %	40 %	378448483
4509	NC_016856	TGA	2	6	210229	210234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448483
4510	NC_016856	GGA	2	6	210287	210292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448483
4511	NC_016856	GC	3	6	210355	210360	0 %	0 %	50 %	50 %	378448483
4512	NC_016856	CAG	3	9	210384	210392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448483
4513	NC_016856	TGC	2	6	210412	210417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448483
4514	NC_016856	GAC	2	6	210449	210454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_016856	T	6	6	210476	210481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_016856	AT	3	6	210495	210500	50 %	50 %	0 %	0 %	378448484
4517	NC_016856	GTT	2	6	210511	210516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448484
4518	NC_016856	ACG	2	6	210580	210585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448484
4519	NC_016856	GCC	2	6	210592	210597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448484
4520	NC_016856	ATT	2	6	210683	210688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448484
4521	NC_016856	TGG	2	6	210878	210883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448484
4522	NC_016856	ATT	2	6	210901	210906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448484
4523	NC_016856	GGCT	2	8	210962	210969	0 %	25 %	50 %	25 %	378448484
4524	NC_016856	ATC	2	6	211022	211027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448484
4525	NC_016856	TGA	2	6	211038	211043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448484
4526	NC_016856	CCA	2	6	211070	211075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448484
4527	NC_016856	TTCGG	2	10	211080	211089	0 %	40 %	40 %	20 %	378448484
4528	NC_016856	GGA	2	6	211155	211160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448484
4529	NC_016856	GC	4	8	211189	211196	0 %	0 %	50 %	50 %	378448484
4530	NC_016856	TGA	2	6	211212	211217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448484
4531	NC_016856	TAT	2	6	211287	211292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448484
4532	NC_016856	T	6	6	211407	211412	0 %	100 %	0 %	0 %	378448484
4533	NC_016856	CGC	2	6	211432	211437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448484
4534	NC_016856	TA	3	6	211445	211450	50 %	50 %	0 %	0 %	378448484
4535	NC_016856	ATA	2	6	211463	211468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448484
4536	NC_016856	CGG	2	6	211492	211497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448484
4537	NC_016856	TCTT	2	8	211530	211537	0 %	75 %	0 %	25 %	378448484
4538	NC_016856	AGC	2	6	211572	211577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448484
4539	NC_016856	TGC	2	6	211646	211651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448484
4540	NC_016856	CTT	2	6	211824	211829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448485
4541	NC_016856	GCC	2	6	211889	211894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448485
4542	NC_016856	GAT	2	6	211909	211914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448485
4543	NC_016856	CTTGC	2	10	212089	212098	0 %	40 %	20 %	40 %	378448485
4544	NC_016856	CTT	2	6	212118	212123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_016856	GGC	2	6	212264	212269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448486
4546	NC_016856	CAG	2	6	212309	212314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448486
4547	NC_016856	GTC	2	6	212339	212344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448486
4548	NC_016856	TTCA	2	8	212360	212367	25 %	50 %	0 %	25 %	378448486
4549	NC_016856	GGCAAT	2	12	212378	212389	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378448486
4550	NC_016856	TCA	2	6	212440	212445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448486
4551	NC_016856	GCT	2	6	212473	212478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448486
4552	NC_016856	TGAGC	2	10	212501	212510	20 %	20 %	40 %	20 %	378448486
4553	NC_016856	AAT	2	6	212531	212536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448486
4554	NC_016856	CGA	2	6	212545	212550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448486
4555	NC_016856	CCA	2	6	212575	212580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448486
4556	NC_016856	CGC	2	6	212677	212682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448486
4557	NC_016856	AG	3	6	212720	212725	50 %	0 %	50 %	0 %	378448486
4558	NC_016856	ACGT	2	8	212739	212746	25 %	25 %	25 %	25 %	378448486
4559	NC_016856	CAC	2	6	212912	212917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448486
4560	NC_016856	CGT	2	6	212959	212964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448486
4561	NC_016856	TGG	2	6	212977	212982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448486
4562	NC_016856	GAC	2	6	213016	213021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448486
4563	NC_016856	GCA	2	6	213034	213039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448486
4564	NC_016856	CAA	2	6	213064	213069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448486
4565	NC_016856	TGA	2	6	213086	213091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448487
4566	NC_016856	GCGCT	2	10	213104	213113	0 %	20 %	40 %	40 %	378448487
4567	NC_016856	CGCGT	2	10	213156	213165	0 %	20 %	40 %	40 %	378448487
4568	NC_016856	TTC	2	6	213205	213210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448488
4569	NC_016856	CTG	2	6	213247	213252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448488
4570	NC_016856	CGG	2	6	213255	213260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448488
4571	NC_016856	CCG	2	6	213314	213319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448488
4572	NC_016856	GCCGAT	2	12	213376	213387	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378448488
4573	NC_016856	GCAC	2	8	213435	213442	25 %	0 %	25 %	50 %	378448488
4574	NC_016856	CCAGCA	2	12	213444	213455	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378448488
4575	NC_016856	CAG	2	6	213493	213498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448488
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4577	NC_016856	CCAG	2	8	213624	213631	25 %	0 %	25 %	50 %	378448488
4578	NC_016856	GCC	2	6	213634	213639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448488
4579	NC_016856	CGCA	2	8	213664	213671	25 %	0 %	25 %	50 %	378448488
4580	NC_016856	GC	3	6	213753	213758	0 %	0 %	50 %	50 %	378448488
4581	NC_016856	CG	3	6	213769	213774	0 %	0 %	50 %	50 %	378448488
4582	NC_016856	CAGG	2	8	213804	213811	25 %	0 %	50 %	25 %	378448488
4583	NC_016856	AG	3	6	213842	213847	50 %	0 %	50 %	0 %	378448488
4584	NC_016856	TCG	2	6	213875	213880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448488
4585	NC_016856	T	6	6	213931	213936	0 %	100 %	0 %	0 %	378448488
4586	NC_016856	CTTG	2	8	213939	213946	0 %	50 %	25 %	25 %	378448488
4587	NC_016856	GCA	2	6	213954	213959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448488
4588	NC_016856	TGG	3	9	213966	213974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448488
4589	NC_016856	G	6	6	214036	214041	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_016856	GCA	2	6	214121	214126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448489
4591	NC_016856	AGATC	2	10	214170	214179	40 %	20 %	20 %	20 %	378448489
4592	NC_016856	CGGT	2	8	214250	214257	0 %	25 %	50 %	25 %	378448489
4593	NC_016856	TTC	2	6	214375	214380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448489
4594	NC_016856	GCG	3	9	214446	214454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448489
4595	NC_016856	GAA	2	6	214466	214471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448489
4596	NC_016856	CGA	2	6	214476	214481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448489
4597	NC_016856	GGC	2	6	214516	214521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448489
4598	NC_016856	CGCGG	2	10	214592	214601	0 %	0 %	60 %	40 %	378448490
4599	NC_016856	CG	3	6	214602	214607	0 %	0 %	50 %	50 %	378448490
4600	NC_016856	ACG	2	6	214623	214628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448490
4601	NC_016856	GCG	2	6	214629	214634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448490
4602	NC_016856	TCG	2	6	214645	214650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448490
4603	NC_016856	CGG	2	6	214680	214685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448490
4604	NC_016856	CAC	2	6	214708	214713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448490
4605	NC_016856	TAT	2	6	214736	214741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448490
4606	NC_016856	GC	3	6	214753	214758	0 %	0 %	50 %	50 %	378448490
4607	NC_016856	CGCGG	2	10	214776	214785	0 %	0 %	60 %	40 %	378448490
4608	NC_016856	CAT	2	6	214922	214927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448490
4609	NC_016856	CGT	2	6	214946	214951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448490
4610	NC_016856	T	6	6	214979	214984	0 %	100 %	0 %	0 %	378448490
4611	NC_016856	CAG	2	6	214995	215000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448490
4612	NC_016856	GGC	2	6	215016	215021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448490
4613	NC_016856	TTC	2	6	215074	215079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448490
4614	NC_016856	ATG	2	6	215092	215097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448490
4615	NC_016856	AAC	2	6	215149	215154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448490
4616	NC_016856	GGT	2	6	215165	215170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448490
4617	NC_016856	GTT	2	6	215180	215185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448490
4618	NC_016856	GC	3	6	215241	215246	0 %	0 %	50 %	50 %	378448490
4619	NC_016856	GGA	2	6	215248	215253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448490
4620	NC_016856	GC	3	6	215341	215346	0 %	0 %	50 %	50 %	378448490
4621	NC_016856	CTT	2	6	215408	215413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448490
4622	NC_016856	CCG	2	6	215428	215433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448490
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4753	NC_016856	GCGAA	2	10	221264	221273	40 %	0 %	40 %	20 %	378448495
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4862	NC_016856	CTA	2	6	225267	225272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448500
4863	NC_016856	GGCT	2	8	225274	225281	0 %	25 %	50 %	25 %	378448500
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