MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. D23580

Total Repeats: 103009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016854	ACTG	2	8	253991	253998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5502	NC_016854	TGC	2	6	254027	254032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_016854	CAA	2	6	254077	254082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_016854	GC	3	6	254116	254121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5505	NC_016854	AC	3	6	254147	254152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_016854	AAC	2	6	254185	254190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_016854	AC	4	8	254189	254196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_016854	GC	3	6	254386	254391	0 %	0 %	50 %	50 %	378443669
5509	NC_016854	CAT	2	6	254405	254410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378443669
5510	NC_016854	CTGAA	2	10	254452	254461	40 %	20 %	20 %	20 %	378443669
5511	NC_016854	AAGCG	2	10	254516	254525	40 %	0 %	40 %	20 %	378443669
5512	NC_016854	GCT	2	6	254535	254540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443669
5513	NC_016854	TTC	2	6	254556	254561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378443669
5514	NC_016854	GCTG	2	8	254572	254579	0 %	25 %	50 %	25 %	378443669
5515	NC_016854	AAGA	2	8	254679	254686	75 %	0 %	25 %	0 %	378443669
5516	NC_016854	AAC	2	6	254817	254822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378443669
5517	NC_016854	GAA	2	6	254988	254993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378443669
5518	NC_016854	TAA	2	6	255012	255017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378443669
5519	NC_016854	GGC	2	6	255056	255061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_016854	GTA	2	6	255169	255174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_016854	ATG	2	6	255329	255334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443670
5522	NC_016854	A	6	6	255341	255346	100 %	0 %	0 %	0 %	378443670
5523	NC_016854	CTGA	2	8	255350	255357	25 %	25 %	25 %	25 %	378443670
5524	NC_016854	GCG	2	6	255416	255421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443670
5525	NC_016854	A	6	6	255422	255427	100 %	0 %	0 %	0 %	378443670
5526	NC_016854	GCT	2	6	255440	255445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443670
5527	NC_016854	GACT	2	8	255508	255515	25 %	25 %	25 %	25 %	378443670
5528	NC_016854	CGC	2	6	255565	255570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443670
5529	NC_016854	GAA	2	6	255617	255622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378443670
5530	NC_016854	TCG	2	6	255667	255672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443670
5531	NC_016854	GCAA	2	8	255794	255801	50 %	0 %	25 %	25 %	378443670
5532	NC_016854	CTG	2	6	255831	255836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443670
5533	NC_016854	GAAA	2	8	255895	255902	75 %	0 %	25 %	0 %	378443670
5534	NC_016854	GAA	2	6	255931	255936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378443670
5535	NC_016854	CTG	2	6	256004	256009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443670
5536	NC_016854	GACT	2	8	256078	256085	25 %	25 %	25 %	25 %	378443670
5537	NC_016854	GCA	2	6	256088	256093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443670
5538	NC_016854	TGC	2	6	256099	256104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443670
5539	NC_016854	GAG	2	6	256131	256136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_016854	CTT	2	6	256151	256156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_016854	CT	3	6	256164	256169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5542	NC_016854	GAAA	2	8	256259	256266	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_016854	GCG	2	6	256317	256322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443671
5544	NC_016854	TGGTG	2	10	256420	256429	0 %	40 %	60 %	0 %	378443671
5545	NC_016854	GGT	2	6	256436	256441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378443671
5546	NC_016854	CGCC	2	8	256570	256577	0 %	0 %	25 %	75 %	378443671
5547	NC_016854	CTG	2	6	256640	256645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443671
5548	NC_016854	TAA	2	6	256648	256653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378443671
5549	NC_016854	TCTG	2	8	256666	256673	0 %	50 %	25 %	25 %	378443671
5550	NC_016854	TTC	2	6	256691	256696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378443671
5551	NC_016854	GGC	2	6	256873	256878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443671
5552	NC_016854	GC	3	6	256938	256943	0 %	0 %	50 %	50 %	378443671
5553	NC_016854	CGT	2	6	256946	256951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443671
5554	NC_016854	GTG	2	6	256952	256957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378443671
5555	NC_016854	AAG	2	6	256968	256973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378443671
5556	NC_016854	AAT	2	6	256989	256994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378443671
5557	NC_016854	TTA	2	6	257042	257047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_016854	TG	3	6	257092	257097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_016854	GTCTG	2	10	257101	257110	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5560	NC_016854	CTG	2	6	257245	257250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443672
5561	NC_016854	AGA	2	6	257316	257321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378443672
5562	NC_016854	GCC	2	6	257445	257450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443672
5563	NC_016854	GAA	2	6	257458	257463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378443672
5564	NC_016854	CGT	2	6	257464	257469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443672
5565	NC_016854	CGTC	2	8	257529	257536	0 %	25 %	25 %	50 %	378443672
5566	NC_016854	CTG	2	6	257563	257568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443672
5567	NC_016854	TCG	2	6	257598	257603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443672
5568	NC_016854	GAA	2	6	257611	257616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378443672
5569	NC_016854	GCG	2	6	257656	257661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443672
5570	NC_016854	AAG	2	6	257672	257677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378443672
5571	NC_016854	TGAT	2	8	257695	257702	25 %	50 %	25 %	0 %	378443672
5572	NC_016854	GTG	2	6	257748	257753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_016854	AGA	2	6	257769	257774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_016854	GCG	2	6	257793	257798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_016854	GCA	2	6	257881	257886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443673
5576	NC_016854	GTG	2	6	257895	257900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378443673
5577	NC_016854	TGG	2	6	257935	257940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378443673
5578	NC_016854	CGC	2	6	257986	257991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443673
5579	NC_016854	AAT	2	6	258035	258040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378443673
5580	NC_016854	CAG	2	6	258045	258050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443673
5581	NC_016854	CAG	2	6	258081	258086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443673
5582	NC_016854	GGC	2	6	258101	258106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443673
5583	NC_016854	TGA	2	6	258110	258115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443673
5584	NC_016854	GGC	2	6	258131	258136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443673
5585	NC_016854	GGC	2	6	258170	258175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443673
5586	NC_016854	CTG	2	6	258198	258203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443673
5587	NC_016854	GCGG	2	8	258229	258236	0 %	0 %	75 %	25 %	378443673
5588	NC_016854	GCA	2	6	258259	258264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443673
5589	NC_016854	TGG	2	6	258395	258400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378443673
5590	NC_016854	GTC	2	6	258457	258462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443673
5591	NC_016854	CCA	2	6	258505	258510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378443673
5592	NC_016854	TGA	2	6	258511	258516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443673
5593	NC_016854	ATCC	2	8	258585	258592	25 %	25 %	0 %	50 %	378443673
5594	NC_016854	TCAT	2	8	258601	258608	25 %	50 %	0 %	25 %	378443673
5595	NC_016854	ATGGC	2	10	258687	258696	20 %	20 %	40 %	20 %	378443673
5596	NC_016854	GC	3	6	258715	258720	0 %	0 %	50 %	50 %	378443673
5597	NC_016854	GC	3	6	258745	258750	0 %	0 %	50 %	50 %	378443673
5598	NC_016854	GC	3	6	258760	258765	0 %	0 %	50 %	50 %	378443673
5599	NC_016854	GGC	2	6	258824	258829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443673
5600	NC_016854	ACG	2	6	258831	258836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443673
5601	NC_016854	GGAT	2	8	258934	258941	25 %	25 %	50 %	0 %	378443673
5602	NC_016854	CG	3	6	258989	258994	0 %	0 %	50 %	50 %	378443673
5603	NC_016854	AGA	2	6	259050	259055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_016854	T	6	6	259122	259127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_016854	T	6	6	259157	259162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_016854	CG	3	6	259251	259256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5607	NC_016854	A	6	6	259335	259340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_016854	TGT	2	6	259348	259353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378443674
5609	NC_016854	AAT	2	6	259409	259414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378443674
5610	NC_016854	ATGG	2	8	259416	259423	25 %	25 %	50 %	0 %	378443674
5611	NC_016854	GTCC	2	8	259487	259494	0 %	25 %	25 %	50 %	378443674
5612	NC_016854	TGC	2	6	259511	259516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443674
5613	NC_016854	TAG	2	6	259553	259558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443674
5614	NC_016854	ACCG	2	8	259570	259577	25 %	0 %	25 %	50 %	378443674
5615	NC_016854	TG	3	6	259610	259615	0 %	50 %	50 %	0 %	378443674
5616	NC_016854	TAT	2	6	259667	259672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378443674
5617	NC_016854	ATA	2	6	259741	259746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378443674
5618	NC_016854	CGG	2	6	259778	259783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443674
5619	NC_016854	TGC	2	6	259840	259845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443674
5620	NC_016854	TGA	2	6	259859	259864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443674
5621	NC_016854	AG	3	6	259865	259870	50 %	0 %	50 %	0 %	378443674
5622	NC_016854	ACTTT	2	10	259982	259991	20 %	60 %	0 %	20 %	378443674
5623	NC_016854	CGT	2	6	260064	260069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443674
5624	NC_016854	CGG	2	6	260072	260077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443674
5625	NC_016854	TGA	2	6	260090	260095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443674
5626	NC_016854	T	7	7	260176	260182	0 %	100 %	0 %	0 %	378443675
5627	NC_016854	GCC	2	6	260186	260191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443675
5628	NC_016854	ATT	2	6	260205	260210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378443675
5629	NC_016854	CGC	2	6	260264	260269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443675
5630	NC_016854	TGGC	2	8	260286	260293	0 %	25 %	50 %	25 %	378443675
5631	NC_016854	TG	3	6	260299	260304	0 %	50 %	50 %	0 %	378443675
5632	NC_016854	TTG	2	6	260331	260336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378443675
5633	NC_016854	ATC	2	6	260344	260349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378443675
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5639	NC_016854	ATT	2	6	260636	260641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378443675
5640	NC_016854	CGG	2	6	260699	260704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443675
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5642	NC_016854	GGC	2	6	260889	260894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443675
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5657	NC_016854	CGTTAG	2	12	261798	261809	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378443676
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5662	NC_016854	TTA	2	6	262117	262122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378443676
5663	NC_016854	G	6	6	262193	262198	0 %	0 %	100 %	0 %	378443676
5664	NC_016854	CTG	2	6	262202	262207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443676
5665	NC_016854	GGGC	2	8	262231	262238	0 %	0 %	75 %	25 %	378443676
5666	NC_016854	GTT	2	6	262294	262299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378443676
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5669	NC_016854	TTAG	2	8	262345	262352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5670	NC_016854	GAA	2	6	262353	262358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5671	NC_016854	ATA	2	6	262362	262367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5675	NC_016854	CTC	2	6	262497	262502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378443677
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5688	NC_016854	CG	3	6	263329	263334	0 %	0 %	50 %	50 %	378443677
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5730	NC_016854	CG	3	6	265645	265650	0 %	0 %	50 %	50 %	378443679
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5733	NC_016854	TCG	2	6	265818	265823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443679
5734	NC_016854	A	6	6	265825	265830	100 %	0 %	0 %	0 %	378443679
5735	NC_016854	TCCAG	2	10	265911	265920	20 %	20 %	20 %	40 %	378443679
5736	NC_016854	ATT	2	6	266000	266005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378443679
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5738	NC_016854	GAT	2	6	266057	266062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443679
5739	NC_016854	ATT	2	6	266084	266089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378443679
5740	NC_016854	CGT	2	6	266116	266121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443679
5741	NC_016854	GGC	2	6	266198	266203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443679
5742	NC_016854	CTC	2	6	266299	266304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378443679
5743	NC_016854	CAA	2	6	266323	266328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378443679
5744	NC_016854	CTG	2	6	266343	266348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443679
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5988	NC_016854	CT	3	6	278692	278697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5989	NC_016854	GCG	2	6	278723	278728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5990	NC_016854	TCA	2	6	278811	278816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378443689
5991	NC_016854	GC	3	6	278950	278955	0 %	0 %	50 %	50 %	378443689
5992	NC_016854	GCA	2	6	279006	279011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443689
5993	NC_016854	CTG	2	6	279037	279042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443689
5994	NC_016854	CCGG	2	8	279064	279071	0 %	0 %	50 %	50 %	378443689
5995	NC_016854	CTT	2	6	279115	279120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378443689
5996	NC_016854	GA	3	6	279132	279137	50 %	0 %	50 %	0 %	378443689
5997	NC_016854	T	6	6	279228	279233	0 %	100 %	0 %	0 %	378443689
5998	NC_016854	GC	4	8	279240	279247	0 %	0 %	50 %	50 %	378443689
5999	NC_016854	CAG	2	6	279259	279264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443689
6000	NC_016854	GCG	2	6	279283	279288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443689

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