MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 9312

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016832	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016832	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	378958131
3	NC_016832	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	378958131
4	NC_016832	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	378958131
5	NC_016832	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	378958131
6	NC_016832	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	378958131
7	NC_016832	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	378958131
8	NC_016832	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	378958131
9	NC_016832	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	378958131
10	NC_016832	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	378958132
11	NC_016832	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	378958132
12	NC_016832	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	378958133
13	NC_016832	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	378958133
14	NC_016832	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	378958134
15	NC_016832	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	378958134
16	NC_016832	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	378958134
17	NC_016832	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	378958134
18	NC_016832	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	378958135
19	NC_016832	GC	3	6	6889	6894	0 %	0 %	50 %	50 %	378958135
20	NC_016832	CG	3	6	6991	6996	0 %	0 %	50 %	50 %	378958135
21	NC_016832	TC	3	6	7773	7778	0 %	50 %	0 %	50 %	378958136
22	NC_016832	CG	3	6	7860	7865	0 %	0 %	50 %	50 %	378958136
23	NC_016832	CG	3	6	7958	7963	0 %	0 %	50 %	50 %	378958136
24	NC_016832	CT	3	6	8451	8456	0 %	50 %	0 %	50 %	378958136
25	NC_016832	GC	3	6	9573	9578	0 %	0 %	50 %	50 %	378958138
26	NC_016832	CG	3	6	10533	10538	0 %	0 %	50 %	50 %	378958139
27	NC_016832	CG	3	6	12990	12995	0 %	0 %	50 %	50 %	378958142
28	NC_016832	GC	3	6	13302	13307	0 %	0 %	50 %	50 %	378958142
29	NC_016832	GC	3	6	14551	14556	0 %	0 %	50 %	50 %	378958143
30	NC_016832	GA	3	6	14662	14667	50 %	0 %	50 %	0 %	378958143
31	NC_016832	AT	3	6	15378	15383	50 %	50 %	0 %	0 %	378958145
32	NC_016832	AT	3	6	15653	15658	50 %	50 %	0 %	0 %	378958145
33	NC_016832	AT	3	6	15906	15911	50 %	50 %	0 %	0 %	378958145
34	NC_016832	AC	3	6	15967	15972	50 %	0 %	0 %	50 %	378958145
35	NC_016832	GA	3	6	17070	17075	50 %	0 %	50 %	0 %	378958148
36	NC_016832	GC	3	6	18372	18377	0 %	0 %	50 %	50 %	378958150
37	NC_016832	CT	3	6	20346	20351	0 %	50 %	0 %	50 %	378958151
38	NC_016832	GC	3	6	20662	20667	0 %	0 %	50 %	50 %	378958151
39	NC_016832	GC	3	6	20782	20787	0 %	0 %	50 %	50 %	378958151
40	NC_016832	GC	3	6	21187	21192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016832	GC	3	6	22045	22050	0 %	0 %	50 %	50 %	378958152
42	NC_016832	CT	3	6	22800	22805	0 %	50 %	0 %	50 %	378958152
43	NC_016832	AT	3	6	23588	23593	50 %	50 %	0 %	0 %	378958153
44	NC_016832	CG	3	6	23658	23663	0 %	0 %	50 %	50 %	378958153
45	NC_016832	GC	4	8	23801	23808	0 %	0 %	50 %	50 %	378958153
46	NC_016832	AT	3	6	24062	24067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016832	CG	3	6	25068	25073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016832	CT	3	6	25354	25359	0 %	50 %	0 %	50 %	378958155
49	NC_016832	AT	3	6	25384	25389	50 %	50 %	0 %	0 %	378958155
50	NC_016832	GC	3	6	26087	26092	0 %	0 %	50 %	50 %	378958156
51	NC_016832	CG	3	6	28017	28022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016832	GC	3	6	28145	28150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016832	TC	3	6	28377	28382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016832	GT	3	6	28495	28500	0 %	50 %	50 %	0 %	378958157
55	NC_016832	GT	3	6	28624	28629	0 %	50 %	50 %	0 %	378958157
56	NC_016832	CT	3	6	30109	30114	0 %	50 %	0 %	50 %	378958159
57	NC_016832	CG	3	6	30172	30177	0 %	0 %	50 %	50 %	378958159
58	NC_016832	CG	3	6	30435	30440	0 %	0 %	50 %	50 %	378958159
59	NC_016832	AT	3	6	30536	30541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016832	GC	3	6	30767	30772	0 %	0 %	50 %	50 %	378958160
61	NC_016832	GC	3	6	31057	31062	0 %	0 %	50 %	50 %	378958160
62	NC_016832	GT	3	6	33045	33050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016832	TC	3	6	33489	33494	0 %	50 %	0 %	50 %	378958164
64	NC_016832	AT	3	6	33739	33744	50 %	50 %	0 %	0 %	378958164
65	NC_016832	TA	3	6	33942	33947	50 %	50 %	0 %	0 %	378958164
66	NC_016832	TA	3	6	34437	34442	50 %	50 %	0 %	0 %	378958165
67	NC_016832	AT	3	6	34695	34700	50 %	50 %	0 %	0 %	378958166
68	NC_016832	AT	3	6	35441	35446	50 %	50 %	0 %	0 %	378958168
69	NC_016832	TG	4	8	35656	35663	0 %	50 %	50 %	0 %	378958168
70	NC_016832	GC	3	6	36249	36254	0 %	0 %	50 %	50 %	378958168
71	NC_016832	TA	3	6	37199	37204	50 %	50 %	0 %	0 %	378958169
72	NC_016832	AT	3	6	39515	39520	50 %	50 %	0 %	0 %	378958170
73	NC_016832	AT	3	6	39831	39836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016832	AT	3	6	39946	39951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016832	AT	4	8	40032	40039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016832	AT	3	6	40086	40091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016832	CG	3	6	40374	40379	0 %	0 %	50 %	50 %	378958171
78	NC_016832	CG	3	6	41062	41067	0 %	0 %	50 %	50 %	378958171
79	NC_016832	GT	3	6	41768	41773	0 %	50 %	50 %	0 %	378958172
80	NC_016832	TG	3	6	42798	42803	0 %	50 %	50 %	0 %	378958172
81	NC_016832	CG	3	6	43312	43317	0 %	0 %	50 %	50 %	378958173
82	NC_016832	TA	3	6	43685	43690	50 %	50 %	0 %	0 %	378958173
83	NC_016832	CA	3	6	44998	45003	50 %	0 %	0 %	50 %	378958174
84	NC_016832	GC	3	6	45701	45706	0 %	0 %	50 %	50 %	378958174
85	NC_016832	TA	3	6	46106	46111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016832	GA	3	6	46173	46178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016832	TA	3	6	46805	46810	50 %	50 %	0 %	0 %	378958175
88	NC_016832	TG	3	6	47186	47191	0 %	50 %	50 %	0 %	378958175
89	NC_016832	GC	4	8	47325	47332	0 %	0 %	50 %	50 %	378958175
90	NC_016832	GA	3	6	47407	47412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016832	GA	3	6	48239	48244	50 %	0 %	50 %	0 %	378958176
92	NC_016832	CG	4	8	49306	49313	0 %	0 %	50 %	50 %	378958177
93	NC_016832	CG	3	6	49519	49524	0 %	0 %	50 %	50 %	378958177
94	NC_016832	TG	3	6	50137	50142	0 %	50 %	50 %	0 %	378958177
95	NC_016832	GC	3	6	51205	51210	0 %	0 %	50 %	50 %	378958178
96	NC_016832	GC	3	6	51505	51510	0 %	0 %	50 %	50 %	378958178
97	NC_016832	GC	3	6	52509	52514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016832	GT	3	6	52916	52921	0 %	50 %	50 %	0 %	378958182
99	NC_016832	CG	3	6	53262	53267	0 %	0 %	50 %	50 %	378958182
100	NC_016832	CG	3	6	54350	54355	0 %	0 %	50 %	50 %	378958183
101	NC_016832	GT	3	6	54412	54417	0 %	50 %	50 %	0 %	378958183
102	NC_016832	GC	3	6	55023	55028	0 %	0 %	50 %	50 %	378958183
103	NC_016832	CG	3	6	55097	55102	0 %	0 %	50 %	50 %	378958183
104	NC_016832	CG	3	6	55831	55836	0 %	0 %	50 %	50 %	378958183
105	NC_016832	CG	3	6	56086	56091	0 %	0 %	50 %	50 %	378958183
106	NC_016832	GC	3	6	57005	57010	0 %	0 %	50 %	50 %	378958184
107	NC_016832	GC	3	6	57881	57886	0 %	0 %	50 %	50 %	378958186
108	NC_016832	GC	4	8	58111	58118	0 %	0 %	50 %	50 %	378958186
109	NC_016832	TG	3	6	60720	60725	0 %	50 %	50 %	0 %	378958189
110	NC_016832	TC	3	6	61124	61129	0 %	50 %	0 %	50 %	378958190
111	NC_016832	GC	3	6	62386	62391	0 %	0 %	50 %	50 %	378958191
112	NC_016832	AT	3	6	63061	63066	50 %	50 %	0 %	0 %	378958191
113	NC_016832	GT	3	6	63387	63392	0 %	50 %	50 %	0 %	378958191
114	NC_016832	GC	4	8	64117	64124	0 %	0 %	50 %	50 %	378958192
115	NC_016832	GC	3	6	64582	64587	0 %	0 %	50 %	50 %	378958192
116	NC_016832	GC	3	6	66226	66231	0 %	0 %	50 %	50 %	378958193
117	NC_016832	CG	3	6	66323	66328	0 %	0 %	50 %	50 %	378958193
118	NC_016832	GC	3	6	66729	66734	0 %	0 %	50 %	50 %	378958194
119	NC_016832	AT	3	6	68153	68158	50 %	50 %	0 %	0 %	378958195
120	NC_016832	GC	3	6	69032	69037	0 %	0 %	50 %	50 %	378958196
121	NC_016832	GC	3	6	69606	69611	0 %	0 %	50 %	50 %	378958196
122	NC_016832	AC	3	6	69658	69663	50 %	0 %	0 %	50 %	378958196
123	NC_016832	AG	3	6	69804	69809	50 %	0 %	50 %	0 %	378958197
124	NC_016832	CG	3	6	69883	69888	0 %	0 %	50 %	50 %	378958197
125	NC_016832	GC	3	6	69911	69916	0 %	0 %	50 %	50 %	378958197
126	NC_016832	CG	3	6	70540	70545	0 %	0 %	50 %	50 %	378958198
127	NC_016832	CG	3	6	70820	70825	0 %	0 %	50 %	50 %	378958198
128	NC_016832	TG	3	6	71461	71466	0 %	50 %	50 %	0 %	378958199
129	NC_016832	GC	3	6	71972	71977	0 %	0 %	50 %	50 %	378958199
130	NC_016832	TG	3	6	72032	72037	0 %	50 %	50 %	0 %	378958199
131	NC_016832	GC	3	6	72279	72284	0 %	0 %	50 %	50 %	378958199
132	NC_016832	GC	3	6	72456	72461	0 %	0 %	50 %	50 %	378958200
133	NC_016832	CG	3	6	73317	73322	0 %	0 %	50 %	50 %	378958201
134	NC_016832	GC	3	6	73463	73468	0 %	0 %	50 %	50 %	378958201
135	NC_016832	TC	3	6	73850	73855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016832	GC	3	6	73959	73964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016832	AT	3	6	74894	74899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016832	TA	3	6	75213	75218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016832	CT	3	6	75987	75992	0 %	50 %	0 %	50 %	378958204
140	NC_016832	GC	3	6	77152	77157	0 %	0 %	50 %	50 %	378958205
141	NC_016832	CG	3	6	77288	77293	0 %	0 %	50 %	50 %	378958205
142	NC_016832	TC	3	6	77450	77455	0 %	50 %	0 %	50 %	378958205
143	NC_016832	CG	3	6	77764	77769	0 %	0 %	50 %	50 %	378958205
144	NC_016832	GC	5	10	78810	78819	0 %	0 %	50 %	50 %	378958205
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