MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 100290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016832	CGA	2	6	187320	187325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958309
4002	NC_016832	CTG	2	6	187326	187331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958309
4003	NC_016832	ATT	2	6	187358	187363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958309
4004	NC_016832	CTG	2	6	187385	187390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958309
4005	NC_016832	CTGT	2	8	187406	187413	0 %	50 %	25 %	25 %	378958309
4006	NC_016832	TGC	2	6	187515	187520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958309
4007	NC_016832	CGC	2	6	187534	187539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958309
4008	NC_016832	TGG	2	6	187546	187551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958309
4009	NC_016832	TAT	2	6	187573	187578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958309
4010	NC_016832	TGC	2	6	187614	187619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958309
4011	NC_016832	ATT	2	6	187667	187672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958309
4012	NC_016832	ACC	2	6	187715	187720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958309
4013	NC_016832	ATG	2	6	187721	187726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958309
4014	NC_016832	ATC	3	9	187730	187738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958309
4015	NC_016832	ATG	2	6	187739	187744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958309
4016	NC_016832	GTC	3	9	187745	187753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958309
4017	NC_016832	TGG	2	6	187755	187760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958309
4018	NC_016832	TGA	2	6	187761	187766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958309
4019	NC_016832	TCG	2	6	187767	187772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958309
4020	NC_016832	TGC	2	6	187786	187791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958309
4021	NC_016832	AAC	2	6	187794	187799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958309
4022	NC_016832	GGT	2	6	187805	187810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958309
4023	NC_016832	CTG	2	6	187859	187864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958309
4024	NC_016832	CGG	2	6	187889	187894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958309
4025	NC_016832	CGT	2	6	187925	187930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958309
4026	NC_016832	ACC	2	6	187953	187958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958309
4027	NC_016832	TGA	2	6	187981	187986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958309
4028	NC_016832	TGG	2	6	188020	188025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958309
4029	NC_016832	GTC	2	6	188028	188033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958309
4030	NC_016832	CGG	2	6	188038	188043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958309
4031	NC_016832	GAGC	2	8	188113	188120	25 %	0 %	50 %	25 %	378958309
4032	NC_016832	CATC	2	8	188140	188147	25 %	25 %	0 %	50 %	378958309
4033	NC_016832	TGGC	2	8	188268	188275	0 %	25 %	50 %	25 %	378958309
4034	NC_016832	GCC	2	6	188502	188507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958309
4035	NC_016832	CA	3	6	188577	188582	50 %	0 %	0 %	50 %	378958309
4036	NC_016832	TC	3	6	188622	188627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_016832	TGCC	2	8	188657	188664	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4038	NC_016832	T	6	6	188834	188839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_016832	T	6	6	188847	188852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_016832	CTA	2	6	188917	188922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_016832	ACT	2	6	188923	188928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_016832	CAA	2	6	188960	188965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_016832	GAG	2	6	188992	188997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_016832	TCG	2	6	189001	189006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958310
4045	NC_016832	AGA	2	6	189011	189016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958310
4046	NC_016832	TGC	2	6	189041	189046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958310
4047	NC_016832	GCT	2	6	189101	189106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958310
4048	NC_016832	GAA	3	9	189126	189134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958310
4049	NC_016832	TCC	2	6	189164	189169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958310
4050	NC_016832	GCT	2	6	189210	189215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958310
4051	NC_016832	ACC	2	6	189231	189236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958310
4052	NC_016832	CTG	2	6	189270	189275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958310
4053	NC_016832	ACA	2	6	189295	189300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958310
4054	NC_016832	CTG	2	6	189372	189377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958310
4055	NC_016832	ACG	2	6	189394	189399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958310
4056	NC_016832	AGA	2	6	189401	189406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958310
4057	NC_016832	CCG	2	6	189483	189488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958310
4058	NC_016832	A	6	6	189496	189501	100 %	0 %	0 %	0 %	378958310
4059	NC_016832	TCACCG	2	12	189502	189513	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378958310
4060	NC_016832	CGA	2	6	189542	189547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958310
4061	NC_016832	TC	4	8	189548	189555	0 %	50 %	0 %	50 %	378958310
4062	NC_016832	CAAA	2	8	189665	189672	75 %	0 %	0 %	25 %	378958310
4063	NC_016832	A	6	6	189687	189692	100 %	0 %	0 %	0 %	378958310
4064	NC_016832	GTG	2	6	189720	189725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958310
4065	NC_016832	TTC	2	6	189734	189739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958310
4066	NC_016832	GCG	3	9	189808	189816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958310
4067	NC_016832	CGG	2	6	189827	189832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958310
4068	NC_016832	TCT	2	6	189847	189852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958310
4069	NC_016832	GC	3	6	189874	189879	0 %	0 %	50 %	50 %	378958310
4070	NC_016832	CTG	2	6	189975	189980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958310
4071	NC_016832	CGA	2	6	190013	190018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958310
4072	NC_016832	ACC	2	6	190065	190070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958310
4073	NC_016832	AGC	2	6	190137	190142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958310
4074	NC_016832	TC	3	6	190150	190155	0 %	50 %	0 %	50 %	378958310
4075	NC_016832	GGTC	2	8	190169	190176	0 %	25 %	50 %	25 %	378958310
4076	NC_016832	GCG	2	6	190183	190188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958310
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4078	NC_016832	TGA	2	6	190271	190276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958310
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4080	NC_016832	CAC	2	6	190367	190372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958310
4081	NC_016832	CAC	2	6	190374	190379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958310
4082	NC_016832	CGG	2	6	190406	190411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958310
4083	NC_016832	TGC	3	9	190462	190470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958310
4084	NC_016832	CGG	2	6	190487	190492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958310
4085	NC_016832	CGG	2	6	190531	190536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958310
4086	NC_016832	TCTGG	2	10	190539	190548	0 %	40 %	40 %	20 %	378958310
4087	NC_016832	GCC	2	6	190557	190562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958310
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4091	NC_016832	CTG	2	6	190881	190886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958310
4092	NC_016832	GAT	2	6	190892	190897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958310
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4101	NC_016832	GCT	2	6	191171	191176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958310
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4104	NC_016832	TAC	2	6	191262	191267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958310
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4107	NC_016832	GGC	2	6	191435	191440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958310
4108	NC_016832	CGG	2	6	191512	191517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958310
4109	NC_016832	TACC	2	8	191522	191529	25 %	25 %	0 %	50 %	378958310
4110	NC_016832	CT	3	6	191550	191555	0 %	50 %	0 %	50 %	378958310
4111	NC_016832	GGC	2	6	191654	191659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_016832	CTG	2	6	191720	191725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_016832	T	7	7	191733	191739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_016832	GCT	2	6	191747	191752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_016832	GGT	2	6	191856	191861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958311
4116	NC_016832	CG	3	6	191925	191930	0 %	0 %	50 %	50 %	378958311
4117	NC_016832	TGGA	2	8	191986	191993	25 %	25 %	50 %	0 %	378958311
4118	NC_016832	GAA	2	6	191998	192003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958311
4119	NC_016832	TGA	2	6	192005	192010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958311
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4121	NC_016832	AG	3	6	192075	192080	50 %	0 %	50 %	0 %	378958311
4122	NC_016832	GGA	2	6	192099	192104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958311
4123	NC_016832	GTC	2	6	192115	192120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958311
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4135	NC_016832	CTG	2	6	192550	192555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958313
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4222	NC_016832	GTG	2	6	196381	196386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4223	NC_016832	GTA	2	6	196413	196418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958317
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4225	NC_016832	CTG	2	6	196455	196460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958317
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4229	NC_016832	TGG	2	6	196720	196725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958317
4230	NC_016832	CA	3	6	196836	196841	50 %	0 %	0 %	50 %	378958317
4231	NC_016832	CCA	2	6	196865	196870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958317
4232	NC_016832	CCT	2	6	197193	197198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4233	NC_016832	CGG	2	6	197293	197298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958318
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4237	NC_016832	CGC	2	6	197399	197404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958318
4238	NC_016832	GCC	2	6	197507	197512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958318
4239	NC_016832	ATCGG	2	10	197577	197586	20 %	20 %	40 %	20 %	378958318
4240	NC_016832	CGT	2	6	197644	197649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958318
4241	NC_016832	TCG	2	6	197673	197678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958318
4242	NC_016832	GGC	2	6	197710	197715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958318
4243	NC_016832	CGC	3	9	197803	197811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958318
4244	NC_016832	CAG	2	6	197846	197851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958318
4245	NC_016832	TCA	2	6	197863	197868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958318
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4247	NC_016832	TCG	2	6	197886	197891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958318
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4252	NC_016832	A	7	7	198094	198100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_016832	CAT	2	6	198109	198114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4256	NC_016832	T	6	6	198222	198227	0 %	100 %	0 %	0 %	378958319
4257	NC_016832	A	6	6	198333	198338	100 %	0 %	0 %	0 %	378958319
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4262	NC_016832	TTG	2	6	198613	198618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_016832	GCCGC	2	10	198787	198796	0 %	0 %	40 %	60 %	378958320
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4362	NC_016832	GA	3	6	204025	204030	50 %	0 %	50 %	0 %	378958323
4363	NC_016832	AACA	2	8	204075	204082	75 %	0 %	0 %	25 %	378958323
4364	NC_016832	ATCCA	2	10	204137	204146	40 %	20 %	0 %	40 %	378958323
4365	NC_016832	TTGCGC	2	12	204162	204173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958323
4366	NC_016832	A	6	6	204183	204188	100 %	0 %	0 %	0 %	378958323
4367	NC_016832	CCA	2	6	204203	204208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958323
4368	NC_016832	TTG	2	6	204229	204234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958323
4369	NC_016832	TGA	2	6	204236	204241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958323
4370	NC_016832	ATT	2	6	204319	204324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4371	NC_016832	AT	3	6	204331	204336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4372	NC_016832	AAGT	2	8	204353	204360	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4373	NC_016832	CAA	2	6	204390	204395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958324
4374	NC_016832	A	7	7	204399	204405	100 %	0 %	0 %	0 %	378958324
4375	NC_016832	CGG	2	6	204413	204418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958324
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4382	NC_016832	CGC	2	6	204795	204800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958324
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4399	NC_016832	ATG	2	6	205493	205498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958325
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4405	NC_016832	CTG	2	6	205763	205768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958325
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4427	NC_016832	AT	3	6	206665	206670	50 %	50 %	0 %	0 %	378958327
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4442	NC_016832	TGA	2	6	207382	207387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958327
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4450	NC_016832	TCTT	2	8	207700	207707	0 %	75 %	0 %	25 %	378958327
4451	NC_016832	GGC	2	6	207716	207721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958327
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4459	NC_016832	GGC	2	6	208434	208439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958329
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4472	NC_016832	AG	3	6	208890	208895	50 %	0 %	50 %	0 %	378958329
4473	NC_016832	TGTC	2	8	208914	208921	0 %	50 %	25 %	25 %	378958329
4474	NC_016832	CGT	2	6	209129	209134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958329
4475	NC_016832	GCA	2	6	209204	209209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958329
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4477	NC_016832	TGA	2	6	209256	209261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4478	NC_016832	GCGCT	2	10	209274	209283	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4479	NC_016832	CGCGT	2	10	209326	209335	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4480	NC_016832	TTC	2	6	209375	209380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958330
4481	NC_016832	CGG	2	6	209425	209430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958330
4482	NC_016832	CGCC	2	8	209440	209447	0 %	0 %	25 %	75 %	378958330
4483	NC_016832	CCG	2	6	209484	209489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958330
4484	NC_016832	GCCGAT	2	12	209546	209557	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378958330
4485	NC_016832	GCAC	2	8	209605	209612	25 %	0 %	25 %	50 %	378958330
4486	NC_016832	CCAGCA	2	12	209614	209625	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378958330
4487	NC_016832	GCT	2	6	209637	209642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958330
4488	NC_016832	CAT	2	6	209656	209661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958330
4489	NC_016832	CAG	2	6	209663	209668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958330
4490	NC_016832	CGC	2	6	209683	209688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958330
4491	NC_016832	GCC	2	6	209705	209710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958330
4492	NC_016832	CA	3	6	209749	209754	50 %	0 %	0 %	50 %	378958330
4493	NC_016832	CAAC	2	8	209791	209798	50 %	0 %	0 %	50 %	378958330
4494	NC_016832	GCC	2	6	209804	209809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958330
4495	NC_016832	CGCA	2	8	209834	209841	25 %	0 %	25 %	50 %	378958330
4496	NC_016832	GGCGT	2	10	209874	209883	0 %	20 %	60 %	20 %	378958330
4497	NC_016832	AGC	2	6	209907	209912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958330
4498	NC_016832	GC	3	6	209923	209928	0 %	0 %	50 %	50 %	378958330
4499	NC_016832	CG	3	6	209939	209944	0 %	0 %	50 %	50 %	378958330
4500	NC_016832	CAGG	2	8	209974	209981	25 %	0 %	50 %	25 %	378958330

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