MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 100290

< Previous12345678910111213...200201Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_016832	GCC	2	6	92673	92678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958219
2004	NC_016832	CCG	2	6	92709	92714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958219
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2131	NC_016832	AATG	2	8	98990	98997	50 %	25 %	25 %	0 %	378958227
2132	NC_016832	TGG	2	6	99076	99081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958227
2133	NC_016832	GAT	2	6	99083	99088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958227
2134	NC_016832	CTG	2	6	99093	99098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958227
2135	NC_016832	GCC	2	6	99099	99104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958227
2136	NC_016832	GCG	2	6	99106	99111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958227
2137	NC_016832	CCA	2	6	99115	99120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958227
2138	NC_016832	TGG	2	6	99172	99177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958227
2139	NC_016832	GCGCT	2	10	99207	99216	0 %	20 %	40 %	40 %	378958227
2140	NC_016832	CG	3	6	99221	99226	0 %	0 %	50 %	50 %	378958227
2141	NC_016832	GGCG	2	8	99332	99339	0 %	0 %	75 %	25 %	378958227
2142	NC_016832	CTG	2	6	99342	99347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958227
2143	NC_016832	TGC	2	6	99403	99408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958227
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2145	NC_016832	GATT	2	8	99440	99447	25 %	50 %	25 %	0 %	378958227
2146	NC_016832	TGG	2	6	99457	99462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958227
2147	NC_016832	CTG	2	6	99480	99485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958227
2148	NC_016832	TTG	2	6	99486	99491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958227
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2150	NC_016832	GGCGC	2	10	99621	99630	0 %	0 %	60 %	40 %	378958227
2151	NC_016832	GGC	2	6	99695	99700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958227
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2154	NC_016832	CGA	2	6	99776	99781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958227
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2159	NC_016832	GCGAC	2	10	99934	99943	20 %	0 %	40 %	40 %	378958227
2160	NC_016832	GCG	2	6	99972	99977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958227
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2163	NC_016832	GCTGGG	2	12	100187	100198	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378958227
2164	NC_016832	GC	3	6	100217	100222	0 %	0 %	50 %	50 %	378958227
2165	NC_016832	TCTGT	2	10	100226	100235	0 %	60 %	20 %	20 %	378958227
2166	NC_016832	TGG	2	6	100252	100257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958227
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2170	NC_016832	A	6	6	100458	100463	100 %	0 %	0 %	0 %	378958228
2171	NC_016832	ACT	2	6	100506	100511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958228
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2188	NC_016832	CTTCGC	2	12	101242	101253	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378958230
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2239	NC_016832	CCCAA	2	10	104531	104540	40 %	0 %	0 %	60 %	378958234
2240	NC_016832	CGC	2	6	104586	104591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958234
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2242	NC_016832	GC	3	6	104649	104654	0 %	0 %	50 %	50 %	378958234
2243	NC_016832	CTG	2	6	104655	104660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958234
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2246	NC_016832	CTG	2	6	104889	104894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958234
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2248	NC_016832	CAA	2	6	104951	104956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958234
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2251	NC_016832	CTT	2	6	105092	105097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958234
2252	NC_016832	CGA	2	6	105118	105123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958234
2253	NC_016832	GTT	2	6	105129	105134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958234
2254	NC_016832	ATC	2	6	105151	105156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958234
2255	NC_016832	TTGTT	2	10	105238	105247	0 %	80 %	20 %	0 %	378958234
2256	NC_016832	TCT	2	6	105302	105307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958234
2257	NC_016832	TGG	2	6	105355	105360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958234
2258	NC_016832	CGT	2	6	105371	105376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958234
2259	NC_016832	GCT	2	6	105383	105388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958234
2260	NC_016832	CCTG	2	8	105391	105398	0 %	25 %	25 %	50 %	378958234
2261	NC_016832	ACG	2	6	105451	105456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958234
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2263	NC_016832	GAC	2	6	105465	105470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958234
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2268	NC_016832	GTT	2	6	105736	105741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958235
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2272	NC_016832	AT	3	6	105978	105983	50 %	50 %	0 %	0 %	378958235
2273	NC_016832	GCT	4	12	106046	106057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958235
2274	NC_016832	GTC	2	6	106166	106171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958235
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2282	NC_016832	CTG	2	6	106589	106594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958235
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2285	NC_016832	GCT	2	6	106808	106813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958235
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2287	NC_016832	TACT	2	8	106929	106936	25 %	50 %	0 %	25 %	378958235
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2329	NC_016832	AAGCG	2	10	109095	109104	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2374	NC_016832	TCT	2	6	111046	111051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958239
2375	NC_016832	GGC	3	9	111063	111071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958239
2376	NC_016832	CGG	2	6	111110	111115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958239
2377	NC_016832	TTCGCG	2	12	111126	111137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958239
2378	NC_016832	GGT	2	6	111162	111167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958239
2379	NC_016832	CCA	2	6	111252	111257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958239
2380	NC_016832	CG	3	6	111337	111342	0 %	0 %	50 %	50 %	378958239
2381	NC_016832	CGGCAG	2	12	111384	111395	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378958239
2382	NC_016832	TCA	2	6	111502	111507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958239
2383	NC_016832	GGC	2	6	111510	111515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958239
2384	NC_016832	CGT	2	6	111521	111526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958239
2385	NC_016832	TCG	2	6	111601	111606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958239
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2388	NC_016832	TGGCG	2	10	111759	111768	0 %	20 %	60 %	20 %	378958239
2389	NC_016832	CAG	3	9	111771	111779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958239
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2405	NC_016832	CGA	2	6	112204	112209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958239
2406	NC_016832	CAT	2	6	112214	112219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958239
2407	NC_016832	GCTC	2	8	112292	112299	0 %	25 %	25 %	50 %	378958239
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2409	NC_016832	TCGA	2	8	112341	112348	25 %	25 %	25 %	25 %	378958239
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2415	NC_016832	GGC	2	6	112860	112865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2423	NC_016832	CGCC	2	8	113203	113210	0 %	0 %	25 %	75 %	378958240
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2463	NC_016832	GAT	2	6	115232	115237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2471	NC_016832	ATC	2	6	115567	115572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2473	NC_016832	CGG	2	6	115707	115712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2475	NC_016832	CTTT	2	8	115806	115813	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2480	NC_016832	AC	3	6	116019	116024	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2481	NC_016832	TGA	2	6	116029	116034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958242
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2483	NC_016832	CAA	2	6	116271	116276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958242
2484	NC_016832	A	6	6	116354	116359	100 %	0 %	0 %	0 %	378958242
2485	NC_016832	GCC	2	6	116404	116409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958242
2486	NC_016832	TGGG	2	8	116444	116451	0 %	25 %	75 %	0 %	378958242
2487	NC_016832	TCAG	2	8	116503	116510	25 %	25 %	25 %	25 %	378958242
2488	NC_016832	GTTGAA	2	12	116541	116552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958242
2489	NC_016832	CA	3	6	116568	116573	50 %	0 %	0 %	50 %	378958242
2490	NC_016832	ACGGT	2	10	116629	116638	20 %	20 %	40 %	20 %	378958242
2491	NC_016832	ACCA	2	8	116641	116648	50 %	0 %	0 %	50 %	378958242
2492	NC_016832	CAG	2	6	116720	116725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958242
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2494	NC_016832	CAG	2	6	116890	116895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958242
2495	NC_016832	GCC	2	6	116971	116976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958242
2496	NC_016832	TGGCG	2	10	116997	117006	0 %	20 %	60 %	20 %	378958242
2497	NC_016832	GAAA	2	8	117071	117078	75 %	0 %	25 %	0 %	378958242
2498	NC_016832	TG	3	6	117101	117106	0 %	50 %	50 %	0 %	378958242
2499	NC_016832	GCG	2	6	117162	117167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958242
2500	NC_016832	GCC	2	6	117208	117213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958242

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