MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 100290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016832	GTG	2	6	45643	45648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958174
1003	NC_016832	ATGA	2	8	45652	45659	50 %	25 %	25 %	0 %	378958174
1004	NC_016832	GC	3	6	45701	45706	0 %	0 %	50 %	50 %	378958174
1005	NC_016832	CAG	2	6	45742	45747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958174
1006	NC_016832	TGA	2	6	45786	45791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958174
1007	NC_016832	GCT	2	6	45867	45872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958174
1008	NC_016832	TAC	2	6	45937	45942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958174
1009	NC_016832	AACG	2	8	45954	45961	50 %	0 %	25 %	25 %	378958174
1010	NC_016832	ATC	2	6	46030	46035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_016832	TGAC	2	8	46038	46045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_016832	A	6	6	46052	46057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_016832	A	6	6	46086	46091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016832	TCA	2	6	46100	46105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_016832	TA	3	6	46106	46111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016832	TAG	2	6	46146	46151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016832	GAA	2	6	46156	46161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_016832	GA	3	6	46173	46178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_016832	T	6	6	46204	46209	0 %	100 %	0 %	0 %	378958175
1020	NC_016832	AGC	2	6	46210	46215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958175
1021	NC_016832	CAT	2	6	46230	46235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958175
1022	NC_016832	TCA	2	6	46238	46243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958175
1023	NC_016832	CGC	2	6	46245	46250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958175
1024	NC_016832	CAA	2	6	46350	46355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958175
1025	NC_016832	TGT	2	6	46364	46369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958175
1026	NC_016832	GCC	2	6	46483	46488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958175
1027	NC_016832	CGG	2	6	46491	46496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958175
1028	NC_016832	GAT	2	6	46497	46502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958175
1029	NC_016832	ACT	2	6	46532	46537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958175
1030	NC_016832	GGGCT	2	10	46557	46566	0 %	20 %	60 %	20 %	378958175
1031	NC_016832	ATC	2	6	46666	46671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958175
1032	NC_016832	CAT	2	6	46686	46691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958175
1033	NC_016832	TAT	2	6	46692	46697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958175
1034	NC_016832	GGC	2	6	46743	46748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958175
1035	NC_016832	GCT	2	6	46770	46775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958175
1036	NC_016832	GCG	2	6	46784	46789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958175
1037	NC_016832	TA	3	6	46805	46810	50 %	50 %	0 %	0 %	378958175
1038	NC_016832	CGG	2	6	46835	46840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958175
1039	NC_016832	CTT	2	6	46887	46892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958175
1040	NC_016832	GAAA	2	8	46902	46909	75 %	0 %	25 %	0 %	378958175
1041	NC_016832	TGC	2	6	47045	47050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958175
1042	NC_016832	ATT	2	6	47059	47064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958175
1043	NC_016832	CTG	2	6	47071	47076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958175
1044	NC_016832	GCTG	2	8	47108	47115	0 %	25 %	50 %	25 %	378958175
1045	NC_016832	TG	3	6	47186	47191	0 %	50 %	50 %	0 %	378958175
1046	NC_016832	TTA	2	6	47255	47260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958175
1047	NC_016832	GTG	2	6	47305	47310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958175
1048	NC_016832	GC	4	8	47325	47332	0 %	0 %	50 %	50 %	378958175
1049	NC_016832	GAAGG	2	10	47360	47369	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016832	GA	3	6	47407	47412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_016832	TAT	2	6	47447	47452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958176
1052	NC_016832	AAG	2	6	47469	47474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958176
1053	NC_016832	CGC	2	6	47511	47516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958176
1054	NC_016832	TGT	2	6	47697	47702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958176
1055	NC_016832	CAG	2	6	47743	47748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958176
1056	NC_016832	GCG	2	6	47759	47764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958176
1057	NC_016832	GTG	3	9	47765	47773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958176
1058	NC_016832	CACG	2	8	47806	47813	25 %	0 %	25 %	50 %	378958176
1059	NC_016832	CAGC	2	8	47833	47840	25 %	0 %	25 %	50 %	378958176
1060	NC_016832	GCA	2	6	47884	47889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958176
1061	NC_016832	CCTG	3	12	47969	47980	0 %	25 %	25 %	50 %	378958176
1062	NC_016832	GTT	2	6	48031	48036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958176
1063	NC_016832	TGA	2	6	48085	48090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958176
1064	NC_016832	ATG	2	6	48123	48128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958176
1065	NC_016832	GAA	2	6	48215	48220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958176
1066	NC_016832	GA	3	6	48239	48244	50 %	0 %	50 %	0 %	378958176
1067	NC_016832	CGG	2	6	48258	48263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958176
1068	NC_016832	ACT	2	6	48285	48290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958176
1069	NC_016832	TACC	2	8	48317	48324	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_016832	GCGTA	2	10	48433	48442	20 %	20 %	40 %	20 %	378958177
1071	NC_016832	CCT	2	6	48456	48461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958177
1072	NC_016832	CATG	2	8	48538	48545	25 %	25 %	25 %	25 %	378958177
1073	NC_016832	CAG	2	6	48557	48562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958177
1074	NC_016832	TCC	2	6	48666	48671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958177
1075	NC_016832	CCG	2	6	48936	48941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958177
1076	NC_016832	CGT	2	6	48947	48952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958177
1077	NC_016832	CCA	2	6	48953	48958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958177
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1079	NC_016832	GAG	2	6	49020	49025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958177
1080	NC_016832	GACCA	2	10	49038	49047	40 %	0 %	20 %	40 %	378958177
1081	NC_016832	A	6	6	49130	49135	100 %	0 %	0 %	0 %	378958177
1082	NC_016832	GTCGTA	2	12	49205	49216	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378958177
1083	NC_016832	CG	4	8	49306	49313	0 %	0 %	50 %	50 %	378958177
1084	NC_016832	AAGT	2	8	49332	49339	50 %	25 %	25 %	0 %	378958177
1085	NC_016832	CCAG	2	8	49390	49397	25 %	0 %	25 %	50 %	378958177
1086	NC_016832	CG	3	6	49519	49524	0 %	0 %	50 %	50 %	378958177
1087	NC_016832	AAG	2	6	49560	49565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958177
1088	NC_016832	GCG	2	6	49595	49600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958177
1089	NC_016832	CAG	2	6	49622	49627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958177
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1091	NC_016832	CGG	2	6	49691	49696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958177
1092	NC_016832	AGT	2	6	49759	49764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958177
1093	NC_016832	GTT	2	6	49835	49840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958177
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1095	NC_016832	GAT	2	6	50079	50084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958177
1096	NC_016832	TG	3	6	50137	50142	0 %	50 %	50 %	0 %	378958177
1097	NC_016832	TTGA	2	8	50171	50178	25 %	50 %	25 %	0 %	378958177
1098	NC_016832	TGG	2	6	50214	50219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958177
1099	NC_016832	TGC	2	6	50364	50369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958177
1100	NC_016832	CAGAC	2	10	50370	50379	40 %	0 %	20 %	40 %	378958177
1101	NC_016832	TTG	2	6	50390	50395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958177
1102	NC_016832	TGG	2	6	50407	50412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958177
1103	NC_016832	CCT	2	6	50415	50420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_016832	TCT	2	6	50479	50484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958178
1105	NC_016832	GAAA	2	8	50506	50513	75 %	0 %	25 %	0 %	378958178
1106	NC_016832	GCA	2	6	50589	50594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958178
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1108	NC_016832	GGC	2	6	50816	50821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958178
1109	NC_016832	TGT	2	6	50836	50841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958178
1110	NC_016832	GCCA	2	8	50847	50854	25 %	0 %	25 %	50 %	378958178
1111	NC_016832	CAT	2	6	50855	50860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958178
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1113	NC_016832	CAG	2	6	50882	50887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958178
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1116	NC_016832	TCG	2	6	50962	50967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958178
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1121	NC_016832	T	7	7	51124	51130	0 %	100 %	0 %	0 %	378958178
1122	NC_016832	GC	3	6	51205	51210	0 %	0 %	50 %	50 %	378958178
1123	NC_016832	TAAA	2	8	51240	51247	75 %	25 %	0 %	0 %	378958178
1124	NC_016832	ATC	2	6	51257	51262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958178
1125	NC_016832	A	6	6	51273	51278	100 %	0 %	0 %	0 %	378958178
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1127	NC_016832	TCA	2	6	51379	51384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958178
1128	NC_016832	GTG	2	6	51403	51408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958178
1129	NC_016832	TGC	2	6	51452	51457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958178
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1131	NC_016832	GAC	2	6	51550	51555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958178
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1139	NC_016832	AGT	2	6	51955	51960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_016832	ATCA	2	8	51973	51980	50 %	25 %	0 %	25 %	378958179
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1148	NC_016832	A	7	7	52224	52230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_016832	TTG	2	6	52287	52292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958180
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1167	NC_016832	GCG	2	6	53119	53124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958182
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1239	NC_016832	TGA	2	6	56939	56944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958184
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1242	NC_016832	GC	3	6	57005	57010	0 %	0 %	50 %	50 %	378958184
1243	NC_016832	TGC	2	6	57126	57131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958184
1244	NC_016832	AGCGC	2	10	57231	57240	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1245	NC_016832	GTG	2	6	57253	57258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1246	NC_016832	TTCAC	2	10	57378	57387	20 %	40 %	0 %	40 %	378958185
1247	NC_016832	GAT	2	6	57398	57403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958185
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1249	NC_016832	AGCC	2	8	57438	57445	25 %	0 %	25 %	50 %	378958185
1250	NC_016832	AGC	3	9	57486	57494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958185
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1252	NC_016832	AAAG	2	8	57517	57524	75 %	0 %	25 %	0 %	378958185
1253	NC_016832	CGC	2	6	57544	57549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958185
1254	NC_016832	GGC	2	6	57604	57609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958185
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1359	NC_016832	TTTC	2	8	63487	63494	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1366	NC_016832	CAG	3	9	63812	63820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958192
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1374	NC_016832	GC	4	8	64117	64124	0 %	0 %	50 %	50 %	378958192
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