MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 100290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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100002	NC_016832	CGG	2	6	4753134	4753139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962804
100003	NC_016832	GAA	3	9	4753241	4753249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962804
100004	NC_016832	CGT	2	6	4753259	4753264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962804
100005	NC_016832	TGG	2	6	4753300	4753305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962804
100006	NC_016832	GTCA	2	8	4753391	4753398	25 %	25 %	25 %	25 %	378962804
100007	NC_016832	TGGC	2	8	4753514	4753521	0 %	25 %	50 %	25 %	378962804
100008	NC_016832	CTGG	2	8	4753524	4753531	0 %	25 %	50 %	25 %	378962804
100009	NC_016832	CGCAG	2	10	4753620	4753629	20 %	0 %	40 %	40 %	378962805
100010	NC_016832	TCT	2	6	4753658	4753663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962805
100011	NC_016832	GTA	2	6	4753669	4753674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962805
100012	NC_016832	ACG	2	6	4753696	4753701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962805
100013	NC_016832	GGT	2	6	4753864	4753869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962805
100014	NC_016832	TGG	2	6	4753936	4753941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962805
100015	NC_016832	AGC	2	6	4754048	4754053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962805
100016	NC_016832	GGCG	2	8	4754114	4754121	0 %	0 %	75 %	25 %	378962805
100017	NC_016832	CGA	2	6	4754150	4754155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962805
100018	NC_016832	GC	3	6	4754192	4754197	0 %	0 %	50 %	50 %	378962805
100019	NC_016832	CG	3	6	4754252	4754257	0 %	0 %	50 %	50 %	378962805
100020	NC_016832	CTG	2	6	4754274	4754279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962805
100021	NC_016832	ACG	2	6	4754290	4754295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962805
100022	NC_016832	GCC	2	6	4754378	4754383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962805
100023	NC_016832	CCAG	2	8	4754421	4754428	25 %	0 %	25 %	50 %	378962805
100024	NC_016832	CAA	2	6	4754482	4754487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100025	NC_016832	ATA	2	6	4754513	4754518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100026	NC_016832	T	6	6	4754522	4754527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100027	NC_016832	T	8	8	4754547	4754554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100028	NC_016832	T	7	7	4754567	4754573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100029	NC_016832	ATT	2	6	4754591	4754596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100030	NC_016832	ATTTT	2	10	4754618	4754627	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100031	NC_016832	TAA	2	6	4754636	4754641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100032	NC_016832	TGC	2	6	4754712	4754717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962806
100033	NC_016832	CG	3	6	4754732	4754737	0 %	0 %	50 %	50 %	378962806
100034	NC_016832	GTG	2	6	4754795	4754800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962806
100035	NC_016832	ACGTG	2	10	4754829	4754838	20 %	20 %	40 %	20 %	378962806
100036	NC_016832	GGC	2	6	4754861	4754866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962806
100037	NC_016832	CGC	2	6	4754905	4754910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962806
100038	NC_016832	CAG	2	6	4754921	4754926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962806
100039	NC_016832	GGT	2	6	4754980	4754985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962806
100040	NC_016832	A	6	6	4754990	4754995	100 %	0 %	0 %	0 %	378962806
100041	NC_016832	ATG	2	6	4755039	4755044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962806
100042	NC_016832	GAA	2	6	4755103	4755108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962806
100043	NC_016832	GCA	2	6	4755163	4755168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962807
100044	NC_016832	TCGC	2	8	4755258	4755265	0 %	25 %	25 %	50 %	378962807
100045	NC_016832	GAT	2	6	4755455	4755460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962807
100046	NC_016832	CGC	2	6	4755480	4755485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962807
100047	NC_016832	GCT	2	6	4755511	4755516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962807
100048	NC_016832	TGC	2	6	4755535	4755540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962807
100049	NC_016832	GGT	2	6	4755550	4755555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962807
100050	NC_016832	CGG	2	6	4755585	4755590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962807
100051	NC_016832	CGC	2	6	4755612	4755617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962807
100052	NC_016832	CTG	3	9	4755656	4755664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962807
100053	NC_016832	GTCTG	2	10	4755707	4755716	0 %	40 %	40 %	20 %	378962807
100054	NC_016832	GC	3	6	4755766	4755771	0 %	0 %	50 %	50 %	378962807
100055	NC_016832	CG	3	6	4755779	4755784	0 %	0 %	50 %	50 %	378962807
100056	NC_016832	TC	3	6	4755796	4755801	0 %	50 %	0 %	50 %	378962807
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100058	NC_016832	TGC	2	6	4755869	4755874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962808
100059	NC_016832	GTCGCC	2	12	4755892	4755903	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378962808
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100061	NC_016832	CG	3	6	4755955	4755960	0 %	0 %	50 %	50 %	378962808
100062	NC_016832	GCT	2	6	4755990	4755995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962808
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100098	NC_016832	CAGT	2	8	4757892	4757899	25 %	25 %	25 %	25 %	378962809
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100103	NC_016832	CTG	2	6	4758310	4758315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962809
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100109	NC_016832	AAAT	2	8	4758676	4758683	75 %	25 %	0 %	0 %	378962809
100110	NC_016832	GC	4	8	4758691	4758698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100111	NC_016832	GGC	2	6	4758796	4758801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962810
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100114	NC_016832	GGT	2	6	4758832	4758837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962810
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100116	NC_016832	TGG	2	6	4758885	4758890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962810
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100231	NC_016832	T	7	7	4765278	4765284	0 %	100 %	0 %	0 %	378962816
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100273	NC_016832	TAAA	2	8	4767449	4767456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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