MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 100290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016832	AATA	2	8	279979	279986	75 %	25 %	0 %	0 %	378958388
6002	NC_016832	TCC	2	6	279987	279992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_016832	CT	3	6	280029	280034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_016832	TTAC	2	8	280088	280095	25 %	50 %	0 %	25 %	378958389
6005	NC_016832	ACT	2	6	280289	280294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958389
6006	NC_016832	AC	3	6	280324	280329	50 %	0 %	0 %	50 %	378958389
6007	NC_016832	CGG	2	6	280337	280342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958389
6008	NC_016832	CA	3	6	280411	280416	50 %	0 %	0 %	50 %	378958389
6009	NC_016832	TGC	2	6	280429	280434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958389
6010	NC_016832	TC	3	6	280450	280455	0 %	50 %	0 %	50 %	378958389
6011	NC_016832	TTG	2	6	280567	280572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958389
6012	NC_016832	TAA	2	6	280625	280630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_016832	CAA	2	6	280751	280756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_016832	ACG	2	6	280834	280839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958390
6015	NC_016832	TCG	2	6	280856	280861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958390
6016	NC_016832	GC	4	8	280977	280984	0 %	0 %	50 %	50 %	378958390
6017	NC_016832	AGC	2	6	281154	281159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958390
6018	NC_016832	CAA	2	6	281331	281336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958390
6019	NC_016832	AGT	2	6	281373	281378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958390
6020	NC_016832	GGC	2	6	281419	281424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958390
6021	NC_016832	CGAT	2	8	281432	281439	25 %	25 %	25 %	25 %	378958390
6022	NC_016832	ATTA	2	8	281488	281495	50 %	50 %	0 %	0 %	378958390
6023	NC_016832	TCT	2	6	281507	281512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958390
6024	NC_016832	TTCA	2	8	281566	281573	25 %	50 %	0 %	25 %	378958390
6025	NC_016832	CGC	2	6	281583	281588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958390
6026	NC_016832	CAG	2	6	281593	281598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958390
6027	NC_016832	CCA	2	6	281601	281606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958390
6028	NC_016832	CAG	2	6	281638	281643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958390
6029	NC_016832	T	6	6	281655	281660	0 %	100 %	0 %	0 %	378958390
6030	NC_016832	CCA	2	6	281682	281687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958390
6031	NC_016832	CGC	2	6	281740	281745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958390
6032	NC_016832	GC	3	6	281747	281752	0 %	0 %	50 %	50 %	378958390
6033	NC_016832	GCG	2	6	281760	281765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958390
6034	NC_016832	CGC	2	6	281832	281837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958390
6035	NC_016832	GCC	2	6	281872	281877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958390
6036	NC_016832	CG	3	6	281902	281907	0 %	0 %	50 %	50 %	378958390
6037	NC_016832	TCA	2	6	282012	282017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958390
6038	NC_016832	CG	3	6	282024	282029	0 %	0 %	50 %	50 %	378958390
6039	NC_016832	TCA	2	6	282059	282064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958390
6040	NC_016832	GAA	2	6	282085	282090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958390
6041	NC_016832	CTT	2	6	282147	282152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958390
6042	NC_016832	GCA	2	6	282201	282206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958390
6043	NC_016832	CT	3	6	282236	282241	0 %	50 %	0 %	50 %	378958390
6044	NC_016832	GGCT	2	8	282253	282260	0 %	25 %	50 %	25 %	378958390
6045	NC_016832	GTT	2	6	282295	282300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958390
6046	NC_016832	CACG	2	8	282309	282316	25 %	0 %	25 %	50 %	378958390
6047	NC_016832	T	6	6	282328	282333	0 %	100 %	0 %	0 %	378958390
6048	NC_016832	TA	3	6	282363	282368	50 %	50 %	0 %	0 %	378958390
6049	NC_016832	ATC	2	6	282389	282394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958390
6050	NC_016832	GC	3	6	282398	282403	0 %	0 %	50 %	50 %	378958390
6051	NC_016832	TGG	2	6	282413	282418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958390
6052	NC_016832	TGT	2	6	282483	282488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958390
6053	NC_016832	A	7	7	282536	282542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_016832	AAAT	2	8	282740	282747	75 %	25 %	0 %	0 %	378958391
6055	NC_016832	CGT	2	6	282777	282782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958391
6056	NC_016832	GGC	3	9	282852	282860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958391
6057	NC_016832	CCA	2	6	282902	282907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958391
6058	NC_016832	CCA	2	6	282920	282925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958391
6059	NC_016832	CT	3	6	282955	282960	0 %	50 %	0 %	50 %	378958391
6060	NC_016832	GCC	2	6	283085	283090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958391
6061	NC_016832	GCC	2	6	283092	283097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958391
6062	NC_016832	TGA	2	6	283108	283113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958391
6063	NC_016832	CGC	2	6	283199	283204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958391
6064	NC_016832	GACCA	2	10	283215	283224	40 %	0 %	20 %	40 %	378958391
6065	NC_016832	GCT	2	6	283293	283298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958391
6066	NC_016832	AGC	2	6	283348	283353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958392
6067	NC_016832	GCA	2	6	283384	283389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958392
6068	NC_016832	GC	3	6	283436	283441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_016832	CGC	2	6	283489	283494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6070	NC_016832	AAC	2	6	283654	283659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_016832	ATA	2	6	283701	283706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_016832	AATG	2	8	283714	283721	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_016832	AAT	2	6	283787	283792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_016832	CGC	2	6	283838	283843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958393
6075	NC_016832	TCA	2	6	283876	283881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958393
6076	NC_016832	T	6	6	283902	283907	0 %	100 %	0 %	0 %	378958393
6077	NC_016832	CTGG	2	8	284013	284020	0 %	25 %	50 %	25 %	378958393
6078	NC_016832	TGA	2	6	284033	284038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958393
6079	NC_016832	GCG	2	6	284081	284086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958393
6080	NC_016832	CAA	2	6	284096	284101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958393
6081	NC_016832	CGA	2	6	284123	284128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958393
6082	NC_016832	GCA	4	12	284189	284200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958393
6083	NC_016832	GGTCG	2	10	284217	284226	0 %	20 %	60 %	20 %	378958393
6084	NC_016832	GATTT	2	10	284269	284278	20 %	60 %	20 %	0 %	378958393
6085	NC_016832	T	7	7	284276	284282	0 %	100 %	0 %	0 %	378958393
6086	NC_016832	TTTC	2	8	284471	284478	0 %	75 %	0 %	25 %	378958393
6087	NC_016832	TGC	2	6	284506	284511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958393
6088	NC_016832	TTTGAA	2	12	284619	284630	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378958393
6089	NC_016832	TGTGT	2	10	284659	284668	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_016832	TAAA	2	8	284723	284730	75 %	25 %	0 %	0 %	378958394
6091	NC_016832	TCA	2	6	284761	284766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958394
6092	NC_016832	GCC	2	6	284816	284821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958394
6093	NC_016832	GCC	2	6	284834	284839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958394
6094	NC_016832	ACCAG	2	10	284889	284898	40 %	0 %	20 %	40 %	378958394
6095	NC_016832	GCG	2	6	284938	284943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958394
6096	NC_016832	TCGC	2	8	284953	284960	0 %	25 %	25 %	50 %	378958394
6097	NC_016832	AAC	2	6	284991	284996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958394
6098	NC_016832	GGCGC	2	10	285024	285033	0 %	0 %	60 %	40 %	378958394
6099	NC_016832	ATT	2	6	285084	285089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958394
6100	NC_016832	ATC	2	6	285102	285107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958394
6101	NC_016832	GAT	2	6	285119	285124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958394
6102	NC_016832	ACC	2	6	285150	285155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958394
6103	NC_016832	AG	3	6	285158	285163	50 %	0 %	50 %	0 %	378958394
6104	NC_016832	GAA	2	6	285251	285256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958394
6105	NC_016832	CAT	2	6	285311	285316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958394
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6107	NC_016832	TG	3	6	285394	285399	0 %	50 %	50 %	0 %	378958395
6108	NC_016832	CCGC	2	8	285436	285443	0 %	0 %	25 %	75 %	378958395
6109	NC_016832	ATA	2	6	285463	285468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958395
6110	NC_016832	ACG	2	6	285486	285491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958395
6111	NC_016832	CG	3	6	285490	285495	0 %	0 %	50 %	50 %	378958395
6112	NC_016832	AGC	2	6	285505	285510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958395
6113	NC_016832	GCA	2	6	285545	285550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958395
6114	NC_016832	GCG	2	6	285647	285652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958395
6115	NC_016832	TGA	2	6	285710	285715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958395
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6118	NC_016832	GC	3	6	285842	285847	0 %	0 %	50 %	50 %	378958395
6119	NC_016832	TGG	2	6	285848	285853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958395
6120	NC_016832	CG	3	6	285891	285896	0 %	0 %	50 %	50 %	378958395
6121	NC_016832	CCG	2	6	285922	285927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958395
6122	NC_016832	CAG	2	6	285978	285983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958395
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6124	NC_016832	AG	3	6	286068	286073	50 %	0 %	50 %	0 %	378958395
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6242	NC_016832	CTT	2	6	292803	292808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6243	NC_016832	GT	3	6	292812	292817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6244	NC_016832	AGCGC	2	10	292845	292854	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6245	NC_016832	CCG	2	6	292871	292876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6246	NC_016832	ACCC	2	8	292958	292965	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6247	NC_016832	TA	3	6	293000	293005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6248	NC_016832	CAG	2	6	293077	293082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958398
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6250	NC_016832	G	7	7	293115	293121	0 %	0 %	100 %	0 %	378958398
6251	NC_016832	TTC	2	6	293150	293155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958398
6252	NC_016832	GTT	2	6	293214	293219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958398
6253	NC_016832	GCA	2	6	293232	293237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958398
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6495	NC_016832	CAT	2	6	304907	304912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6497	NC_016832	ATC	2	6	305015	305020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958410
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6499	NC_016832	T	6	6	305080	305085	0 %	100 %	0 %	0 %	378958410
6500	NC_016832	CG	3	6	305108	305113	0 %	0 %	50 %	50 %	378958410

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