MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 100290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016832	TGG	2	6	232597	232602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958348
5002	NC_016832	CCA	2	6	232646	232651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958348
5003	NC_016832	GCG	2	6	232711	232716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958348
5004	NC_016832	GCG	2	6	232744	232749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958348
5005	NC_016832	TTG	2	6	232764	232769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958348
5006	NC_016832	GGC	2	6	232847	232852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958348
5007	NC_016832	GC	3	6	232876	232881	0 %	0 %	50 %	50 %	378958348
5008	NC_016832	GCT	2	6	232931	232936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958348
5009	NC_016832	CTG	2	6	232962	232967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958348
5010	NC_016832	GC	3	6	232968	232973	0 %	0 %	50 %	50 %	378958348
5011	NC_016832	ATGG	2	8	233048	233055	25 %	25 %	50 %	0 %	378958348
5012	NC_016832	GC	3	6	233089	233094	0 %	0 %	50 %	50 %	378958348
5013	NC_016832	GCT	2	6	233096	233101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958348
5014	NC_016832	GCT	2	6	233108	233113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958348
5015	NC_016832	GC	3	6	233134	233139	0 %	0 %	50 %	50 %	378958348
5016	NC_016832	GGC	2	6	233165	233170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958348
5017	NC_016832	GC	3	6	233209	233214	0 %	0 %	50 %	50 %	378958348
5018	NC_016832	CTG	3	9	233217	233225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958348
5019	NC_016832	CT	3	6	233241	233246	0 %	50 %	0 %	50 %	378958348
5020	NC_016832	GCT	2	6	233288	233293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958348
5021	NC_016832	GAA	2	6	233295	233300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958348
5022	NC_016832	GGC	2	6	233330	233335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958348
5023	NC_016832	GGCG	2	8	233342	233349	0 %	0 %	75 %	25 %	378958348
5024	NC_016832	TGGCGG	2	12	233356	233367	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378958348
5025	NC_016832	ATT	2	6	233373	233378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958348
5026	NC_016832	GTG	2	6	233448	233453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958348
5027	NC_016832	CTGC	2	8	233496	233503	0 %	25 %	25 %	50 %	378958348
5028	NC_016832	GCG	3	9	233517	233525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958348
5029	NC_016832	CTG	2	6	233529	233534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958348
5030	NC_016832	ATT	2	6	233535	233540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958348
5031	NC_016832	GCC	2	6	233547	233552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958348
5032	NC_016832	GCG	2	6	233557	233562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958348
5033	NC_016832	CGC	2	6	233569	233574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958348
5034	NC_016832	TGC	2	6	233620	233625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958348
5035	NC_016832	ATG	2	6	233628	233633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958348
5036	NC_016832	GCG	2	6	233644	233649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958348
5037	NC_016832	CGC	2	6	233769	233774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958348
5038	NC_016832	GCG	2	6	233797	233802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958348
5039	NC_016832	CG	5	10	233807	233816	0 %	0 %	50 %	50 %	378958348
5040	NC_016832	GCT	2	6	233849	233854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958348
5041	NC_016832	GGC	2	6	233861	233866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958348
5042	NC_016832	CGA	2	6	233884	233889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958348
5043	NC_016832	CGG	2	6	234058	234063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958348
5044	NC_016832	GC	3	6	234085	234090	0 %	0 %	50 %	50 %	378958348
5045	NC_016832	GGC	2	6	234140	234145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_016832	GTAAGC	2	12	234187	234198	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5047	NC_016832	CG	3	6	234241	234246	0 %	0 %	50 %	50 %	378958349
5048	NC_016832	TAT	2	6	234257	234262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958349
5049	NC_016832	GTC	2	6	234267	234272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958349
5050	NC_016832	TG	3	6	234278	234283	0 %	50 %	50 %	0 %	378958349
5051	NC_016832	CGAC	2	8	234284	234291	25 %	0 %	25 %	50 %	378958349
5052	NC_016832	TCC	2	6	234334	234339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958349
5053	NC_016832	GAA	2	6	234351	234356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958349
5054	NC_016832	GAA	2	6	234423	234428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958349
5055	NC_016832	GCC	2	6	234441	234446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958349
5056	NC_016832	ACC	2	6	234457	234462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958349
5057	NC_016832	CTT	2	6	234476	234481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958349
5058	NC_016832	GTG	2	6	234514	234519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958349
5059	NC_016832	TTCA	2	8	234558	234565	25 %	50 %	0 %	25 %	378958349
5060	NC_016832	GCC	2	6	234580	234585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958349
5061	NC_016832	CGA	2	6	234661	234666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958349
5062	NC_016832	CGC	2	6	234692	234697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958349
5063	NC_016832	GAT	2	6	234699	234704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958349
5064	NC_016832	CAGGT	2	10	234715	234724	20 %	20 %	40 %	20 %	378958349
5065	NC_016832	ACG	2	6	234730	234735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958349
5066	NC_016832	GTA	2	6	234738	234743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958349
5067	NC_016832	TCG	2	6	234787	234792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958349
5068	NC_016832	CAG	2	6	234798	234803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958349
5069	NC_016832	GCG	2	6	234854	234859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958349
5070	NC_016832	CGA	2	6	234890	234895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958349
5071	NC_016832	CGC	2	6	234930	234935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958349
5072	NC_016832	GC	3	6	234934	234939	0 %	0 %	50 %	50 %	378958349
5073	NC_016832	GC	3	6	235028	235033	0 %	0 %	50 %	50 %	378958349
5074	NC_016832	CAG	2	6	235050	235055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958349
5075	NC_016832	AGC	2	6	235076	235081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958349
5076	NC_016832	TCG	2	6	235142	235147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958349
5077	NC_016832	GC	3	6	235238	235243	0 %	0 %	50 %	50 %	378958349
5078	NC_016832	AT	3	6	235342	235347	50 %	50 %	0 %	0 %	378958349
5079	NC_016832	GCC	2	6	235407	235412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958349
5080	NC_016832	CGC	2	6	235445	235450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958349
5081	NC_016832	TCT	2	6	235662	235667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_016832	TCG	2	6	235734	235739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958350
5083	NC_016832	CGC	2	6	235760	235765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958350
5084	NC_016832	GGC	2	6	235782	235787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958350
5085	NC_016832	GC	3	6	235865	235870	0 %	0 %	50 %	50 %	378958350
5086	NC_016832	T	6	6	235950	235955	0 %	100 %	0 %	0 %	378958350
5087	NC_016832	CGG	2	6	235980	235985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958350
5088	NC_016832	GC	3	6	236009	236014	0 %	0 %	50 %	50 %	378958350
5089	NC_016832	GGA	2	6	236016	236021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958350
5090	NC_016832	TGG	2	6	236038	236043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958350
5091	NC_016832	CGG	2	6	236067	236072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958350
5092	NC_016832	CGGCG	2	10	236208	236217	0 %	0 %	60 %	40 %	378958350
5093	NC_016832	CT	3	6	236224	236229	0 %	50 %	0 %	50 %	378958350
5094	NC_016832	GCG	2	6	236230	236235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958350
5095	NC_016832	CGC	2	6	236243	236248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958350
5096	NC_016832	TAT	2	6	236265	236270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958350
5097	NC_016832	TCA	2	6	236333	236338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958350
5098	NC_016832	ATT	2	6	236380	236385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958350
5099	NC_016832	TAT	2	6	236445	236450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958350
5100	NC_016832	TGC	2	6	236486	236491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958350
5101	NC_016832	GGC	2	6	236521	236526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958350
5102	NC_016832	A	6	6	236533	236538	100 %	0 %	0 %	0 %	378958350
5103	NC_016832	GCG	2	6	236552	236557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958350
5104	NC_016832	CGG	2	6	236562	236567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958350
5105	NC_016832	TTGA	2	8	236587	236594	25 %	50 %	25 %	0 %	378958350
5106	NC_016832	CGGCAG	2	12	236597	236608	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378958350
5107	NC_016832	GCG	2	6	236609	236614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958350
5108	NC_016832	CGC	2	6	236634	236639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958350
5109	NC_016832	CTG	2	6	236665	236670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958350
5110	NC_016832	TTA	2	6	236678	236683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958350
5111	NC_016832	ACG	2	6	236695	236700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958350
5112	NC_016832	TGCTT	2	10	236702	236711	0 %	60 %	20 %	20 %	378958350
5113	NC_016832	TTC	2	6	236712	236717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958350
5114	NC_016832	GC	3	6	236720	236725	0 %	0 %	50 %	50 %	378958350
5115	NC_016832	G	6	6	236727	236732	0 %	0 %	100 %	0 %	378958350
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5119	NC_016832	GC	3	6	236874	236879	0 %	0 %	50 %	50 %	378958350
5120	NC_016832	TGCTGG	2	12	236897	236908	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378958350
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5122	NC_016832	GGC	2	6	237048	237053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958350
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5244	NC_016832	TGGC	3	12	243081	243092	0 %	25 %	50 %	25 %	378958357
5245	NC_016832	GC	3	6	243125	243130	0 %	0 %	50 %	50 %	378958357
5246	NC_016832	CAT	2	6	243139	243144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958357
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5251	NC_016832	GT	3	6	243401	243406	0 %	50 %	50 %	0 %	378958357
5252	NC_016832	ATG	2	6	243419	243424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958357
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5272	NC_016832	CGCTT	2	10	244247	244256	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5273	NC_016832	AC	3	6	244317	244322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5274	NC_016832	CTTA	2	8	244325	244332	25 %	50 %	0 %	25 %	378958358
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5281	NC_016832	CATA	2	8	244706	244713	50 %	25 %	0 %	25 %	378958358
5282	NC_016832	TCA	2	6	244724	244729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5283	NC_016832	AAT	2	6	244744	244749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5284	NC_016832	CCA	2	6	244771	244776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5285	NC_016832	A	7	7	244785	244791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5286	NC_016832	AGA	2	6	244806	244811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5287	NC_016832	GCG	2	6	244839	244844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5288	NC_016832	GTG	2	6	244992	244997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5289	NC_016832	TAT	2	6	245041	245046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5291	NC_016832	T	7	7	245080	245086	0 %	100 %	0 %	0 %	378958359
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5367	NC_016832	GC	3	6	248237	248242	0 %	0 %	50 %	50 %	378958361
5368	NC_016832	CGC	3	9	248258	248266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958361
5369	NC_016832	GCG	2	6	248293	248298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958361
5370	NC_016832	TCT	2	6	248368	248373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958361
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5372	NC_016832	CGA	2	6	248459	248464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958361
5373	NC_016832	GCA	2	6	248516	248521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958361
5374	NC_016832	GC	3	6	248571	248576	0 %	0 %	50 %	50 %	378958361
5375	NC_016832	GGC	2	6	248609	248614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958361
5376	NC_016832	CGT	2	6	248637	248642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958361
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5380	NC_016832	AGC	2	6	248833	248838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958361
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5397	NC_016832	AAAGT	2	10	249431	249440	60 %	20 %	20 %	0 %	378958361
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5405	NC_016832	AGGG	2	8	249774	249781	25 %	0 %	75 %	0 %	378958361
5406	NC_016832	TGG	2	6	249850	249855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5407	NC_016832	AGT	2	6	249881	249886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5433	NC_016832	AAC	2	6	251078	251083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5434	NC_016832	AC	4	8	251082	251089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5435	NC_016832	GC	3	6	251278	251283	0 %	0 %	50 %	50 %	378958363
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5442	NC_016832	AAGA	2	8	251571	251578	75 %	0 %	25 %	0 %	378958363
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5453	NC_016832	GCT	2	6	252332	252337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958364
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5470	NC_016832	CT	3	6	253056	253061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5471	NC_016832	GAAA	2	8	253151	253158	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5486	NC_016832	TTA	2	6	253934	253939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5487	NC_016832	TG	3	6	253984	253989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5488	NC_016832	GTCTG	2	10	253993	254002	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5489	NC_016832	CTG	2	6	254137	254142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958366
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5492	NC_016832	GAA	2	6	254350	254355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958366
5493	NC_016832	CGT	2	6	254356	254361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958366
5494	NC_016832	CGTA	2	8	254412	254419	25 %	25 %	25 %	25 %	378958366
5495	NC_016832	CCG	2	6	254424	254429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958366
5496	NC_016832	CTG	2	6	254455	254460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958366
5497	NC_016832	TCG	2	6	254490	254495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958366
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