MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 100290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016832	TGG	2	6	210088	210093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958330
4502	NC_016832	GCA	2	6	210124	210129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958330
4503	NC_016832	TAG	2	6	210136	210141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958330
4504	NC_016832	ATA	2	6	210168	210173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_016832	TGA	2	6	210175	210180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_016832	TTGCG	2	10	210239	210248	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4507	NC_016832	GATT	2	8	210311	210318	25 %	50 %	25 %	0 %	378958331
4508	NC_016832	TGG	2	6	210407	210412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958331
4509	NC_016832	ACT	2	6	210468	210473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958331
4510	NC_016832	TTG	2	6	210529	210534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958331
4511	NC_016832	TAG	2	6	210537	210542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958331
4512	NC_016832	ATT	2	6	210564	210569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958331
4513	NC_016832	ATT	2	6	210591	210596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958331
4514	NC_016832	AGG	2	6	210608	210613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958331
4515	NC_016832	GGC	2	6	210759	210764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958331
4516	NC_016832	CTG	2	6	211040	211045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958331
4517	NC_016832	GAAG	2	8	211049	211056	50 %	0 %	50 %	0 %	378958331
4518	NC_016832	CAG	2	6	211127	211132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958331
4519	NC_016832	AGGT	2	8	211156	211163	25 %	25 %	50 %	0 %	378958331
4520	NC_016832	CAT	2	6	211319	211324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958331
4521	NC_016832	GTA	2	6	211357	211362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958331
4522	NC_016832	CAT	2	6	211392	211397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958331
4523	NC_016832	GGC	2	6	211407	211412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958331
4524	NC_016832	TGT	2	6	211419	211424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958331
4525	NC_016832	T	6	6	211426	211431	0 %	100 %	0 %	0 %	378958331
4526	NC_016832	TAA	2	6	211460	211465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_016832	ATT	2	6	211475	211480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958332
4528	NC_016832	GCT	2	6	211506	211511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958332
4529	NC_016832	GTC	2	6	211522	211527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958332
4530	NC_016832	T	6	6	211547	211552	0 %	100 %	0 %	0 %	378958332
4531	NC_016832	GCA	2	6	211597	211602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958332
4532	NC_016832	GTG	2	6	211646	211651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958332
4533	NC_016832	GGT	2	6	211656	211661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958332
4534	NC_016832	CAC	2	6	211668	211673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958332
4535	NC_016832	CCA	2	6	211690	211695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958332
4536	NC_016832	TTG	2	6	211725	211730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958332
4537	NC_016832	GTG	2	6	211757	211762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958332
4538	NC_016832	C	7	7	211836	211842	0 %	0 %	0 %	100 %	378958332
4539	NC_016832	GGCG	2	8	211881	211888	0 %	0 %	75 %	25 %	378958332
4540	NC_016832	TGG	2	6	211892	211897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958332
4541	NC_016832	ATCT	2	8	211920	211927	25 %	50 %	0 %	25 %	378958332
4542	NC_016832	GGT	2	6	212093	212098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958333
4543	NC_016832	CCG	2	6	212139	212144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958333
4544	NC_016832	CAT	2	6	212156	212161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958333
4545	NC_016832	GTT	2	6	212187	212192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958333
4546	NC_016832	CAG	2	6	212235	212240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958333
4547	NC_016832	GTC	2	6	212277	212282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958333
4548	NC_016832	TGC	2	6	212303	212308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958333
4549	NC_016832	TGT	2	6	212312	212317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958333
4550	NC_016832	GCT	2	6	212354	212359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958333
4551	NC_016832	ATT	2	6	212375	212380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958333
4552	NC_016832	T	6	6	212402	212407	0 %	100 %	0 %	0 %	378958333
4553	NC_016832	TTTTA	2	10	212450	212459	20 %	80 %	0 %	0 %	378958333
4554	NC_016832	ACG	2	6	212655	212660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958333
4555	NC_016832	ATC	2	6	212682	212687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_016832	TGC	2	6	212797	212802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958334
4557	NC_016832	GC	3	6	212801	212806	0 %	0 %	50 %	50 %	378958334
4558	NC_016832	TCG	2	6	212807	212812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958334
4559	NC_016832	TGAGCC	2	12	212827	212838	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378958334
4560	NC_016832	TGG	2	6	212895	212900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958334
4561	NC_016832	GTG	3	9	212966	212974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958334
4562	NC_016832	T	7	7	213040	213046	0 %	100 %	0 %	0 %	378958334
4563	NC_016832	TGG	2	6	213093	213098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958334
4564	NC_016832	CGC	2	6	213127	213132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958334
4565	NC_016832	TGC	2	6	213141	213146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958334
4566	NC_016832	GCT	2	6	213233	213238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958334
4567	NC_016832	TATT	2	8	213245	213252	25 %	75 %	0 %	0 %	378958334
4568	NC_016832	TTA	2	6	213285	213290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958335
4569	NC_016832	CTGG	2	8	213323	213330	0 %	25 %	50 %	25 %	378958335
4570	NC_016832	GTTGC	2	10	213343	213352	0 %	40 %	40 %	20 %	378958335
4571	NC_016832	GCTG	2	8	213381	213388	0 %	25 %	50 %	25 %	378958335
4572	NC_016832	TTC	2	6	213392	213397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958335
4573	NC_016832	TGT	2	6	213466	213471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958335
4574	NC_016832	TCG	2	6	213700	213705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958335
4575	NC_016832	CGAT	2	8	213720	213727	25 %	25 %	25 %	25 %	378958335
4576	NC_016832	GCC	2	6	213737	213742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958335
4577	NC_016832	GC	4	8	213749	213756	0 %	0 %	50 %	50 %	378958335
4578	NC_016832	GCGA	2	8	213861	213868	25 %	0 %	50 %	25 %	378958335
4579	NC_016832	GCT	2	6	213878	213883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958335
4580	NC_016832	ATT	2	6	213887	213892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958335
4581	NC_016832	CTG	2	6	214026	214031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958335
4582	NC_016832	CCG	2	6	214059	214064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958335
4583	NC_016832	CCG	2	6	214119	214124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958335
4584	NC_016832	CAG	2	6	214127	214132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958335
4585	NC_016832	ATC	2	6	214169	214174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958335
4586	NC_016832	AGT	2	6	214285	214290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958335
4587	NC_016832	GGTT	2	8	214347	214354	0 %	50 %	50 %	0 %	378958335
4588	NC_016832	TCA	2	6	214434	214439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958335
4589	NC_016832	CAT	2	6	214453	214458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958335
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4591	NC_016832	TTA	2	6	214668	214673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958335
4592	NC_016832	TTA	2	6	214710	214715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958335
4593	NC_016832	GTA	2	6	214721	214726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958335
4594	NC_016832	TTCAC	2	10	214773	214782	20 %	40 %	0 %	40 %	378958335
4595	NC_016832	CTGCAT	2	12	214817	214828	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378958335
4596	NC_016832	GAG	2	6	214833	214838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958335
4597	NC_016832	TGGC	2	8	214841	214848	0 %	25 %	50 %	25 %	378958335
4598	NC_016832	CCT	2	6	214873	214878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958335
4599	NC_016832	GCC	2	6	214973	214978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958335
4600	NC_016832	CGC	2	6	215014	215019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958335
4601	NC_016832	AAT	2	6	215021	215026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958335
4602	NC_016832	ACA	2	6	215136	215141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958335
4603	NC_016832	CGC	2	6	215279	215284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958335
4604	NC_016832	ATAC	2	8	215285	215292	50 %	25 %	0 %	25 %	378958335
4605	NC_016832	TCT	2	6	215511	215516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958335
4606	NC_016832	TCC	2	6	215517	215522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958335
4607	NC_016832	T	6	6	215525	215530	0 %	100 %	0 %	0 %	378958335
4608	NC_016832	T	7	7	215586	215592	0 %	100 %	0 %	0 %	378958335
4609	NC_016832	CAGG	2	8	215597	215604	25 %	0 %	50 %	25 %	378958335
4610	NC_016832	TTC	2	6	215844	215849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958335
4611	NC_016832	TTC	2	6	215886	215891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_016832	TCAA	2	8	215933	215940	50 %	25 %	0 %	25 %	378958336
4613	NC_016832	GAT	2	6	216014	216019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958336
4614	NC_016832	TGG	2	6	216039	216044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958336
4615	NC_016832	GTAG	2	8	216076	216083	25 %	25 %	50 %	0 %	378958336
4616	NC_016832	GAGTT	2	10	216108	216117	20 %	40 %	40 %	0 %	378958336
4617	NC_016832	GTA	2	6	216126	216131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958336
4618	NC_016832	TCGC	2	8	216146	216153	0 %	25 %	25 %	50 %	378958336
4619	NC_016832	GTT	2	6	216168	216173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958336
4620	NC_016832	CAG	2	6	216183	216188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958336
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4622	NC_016832	AGA	2	6	216315	216320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958336
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4624	NC_016832	G	7	7	216407	216413	0 %	0 %	100 %	0 %	378958336
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4651	NC_016832	TTA	2	6	217600	217605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4653	NC_016832	T	6	6	217651	217656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4730	NC_016832	GCGCG	2	10	221030	221039	0 %	0 %	60 %	40 %	378958341
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4734	NC_016832	TAA	2	6	221416	221421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4735	NC_016832	GTTC	2	8	221458	221465	0 %	50 %	25 %	25 %	378958342
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4744	NC_016832	ATT	3	9	222155	222163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958343
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4746	NC_016832	TGGC	2	8	222289	222296	0 %	25 %	50 %	25 %	378958343
4747	NC_016832	GCA	2	6	222302	222307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958343
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4750	NC_016832	GC	4	8	222365	222372	0 %	0 %	50 %	50 %	378958343
4751	NC_016832	CAA	2	6	222390	222395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958343
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4753	NC_016832	CA	3	6	222424	222429	50 %	0 %	0 %	50 %	378958343
4754	NC_016832	CG	3	6	222431	222436	0 %	0 %	50 %	50 %	378958343
4755	NC_016832	GC	4	8	222512	222519	0 %	0 %	50 %	50 %	378958343
4756	NC_016832	CGC	2	6	222570	222575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958343
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4759	NC_016832	GC	5	10	222632	222641	0 %	0 %	50 %	50 %	378958343
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4766	NC_016832	CGC	2	6	222820	222825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958344
4767	NC_016832	TGT	2	6	222832	222837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958344
4768	NC_016832	CGGGG	2	10	222848	222857	0 %	0 %	80 %	20 %	378958344
4769	NC_016832	CGT	2	6	222930	222935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958344
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4772	NC_016832	GC	4	8	223013	223020	0 %	0 %	50 %	50 %	378958344
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4779	NC_016832	GCT	3	9	223403	223411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958344
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4783	NC_016832	TCAG	2	8	223696	223703	25 %	25 %	25 %	25 %	378958344
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4789	NC_016832	TTG	2	6	223839	223844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958344
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4795	NC_016832	GCGA	2	8	223963	223970	25 %	0 %	50 %	25 %	378958344
4796	NC_016832	GC	3	6	223975	223980	0 %	0 %	50 %	50 %	378958344
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4813	NC_016832	CGTCTG	2	12	224661	224672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958344
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4819	NC_016832	CAGCG	2	10	225031	225040	20 %	0 %	40 %	40 %	378958344
4820	NC_016832	CG	3	6	225055	225060	0 %	0 %	50 %	50 %	378958344
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4832	NC_016832	A	6	6	225582	225587	100 %	0 %	0 %	0 %	378958345
4833	NC_016832	CGG	3	9	225624	225632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958345
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4852	NC_016832	CAG	3	9	226457	226465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958345
4853	NC_016832	ATC	2	6	226469	226474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958345
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4863	NC_016832	CG	3	6	226769	226774	0 %	0 %	50 %	50 %	378958345
4864	NC_016832	GGCGG	2	10	226781	226790	0 %	0 %	80 %	20 %	378958345
4865	NC_016832	ACG	2	6	226971	226976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958345
4866	NC_016832	TCG	2	6	226978	226983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958345
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4868	NC_016832	CGG	2	6	227076	227081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958345
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4870	NC_016832	CG	3	6	227216	227221	0 %	0 %	50 %	50 %	378958345
4871	NC_016832	GGC	2	6	227311	227316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958345
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4934	NC_016832	CGG	2	6	229426	229431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4993	NC_016832	CAGC	2	8	232313	232320	25 %	0 %	25 %	50 %	378958348
4994	NC_016832	GCT	2	6	232340	232345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958348
4995	NC_016832	GC	3	6	232438	232443	0 %	0 %	50 %	50 %	378958348
4996	NC_016832	GC	3	6	232483	232488	0 %	0 %	50 %	50 %	378958348
4997	NC_016832	GCC	2	6	232503	232508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958348
4998	NC_016832	TCG	2	6	232525	232530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958348
4999	NC_016832	GC	3	6	232531	232536	0 %	0 %	50 %	50 %	378958348
5000	NC_016832	GGCGT	2	10	232545	232554	0 %	20 %	60 %	20 %	378958348

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