MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 10800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016831	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016831	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	378953806
3	NC_016831	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	378953806
4	NC_016831	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	378953807
5	NC_016831	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	378953808
6	NC_016831	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	378953808
7	NC_016831	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	378953808
8	NC_016831	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	378953808
9	NC_016831	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	378953808
10	NC_016831	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	378953810
11	NC_016831	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	378953810
12	NC_016831	GCGT	2	8	8156	8163	0 %	25 %	50 %	25 %	378953811
13	NC_016831	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	378953811
14	NC_016831	CTGT	2	8	8666	8673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016831	GAAC	2	8	9718	9725	50 %	0 %	25 %	25 %	378953813
16	NC_016831	CAGG	2	8	10122	10129	25 %	0 %	50 %	25 %	378953814
17	NC_016831	TGGC	2	8	11004	11011	0 %	25 %	50 %	25 %	378953815
18	NC_016831	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	378953815
19	NC_016831	ATTT	2	8	11370	11377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016831	TGTT	2	8	11384	11391	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016831	ATGG	2	8	11648	11655	25 %	25 %	50 %	0 %	378953816
22	NC_016831	TGGT	2	8	11739	11746	0 %	50 %	50 %	0 %	378953816
23	NC_016831	CAAC	2	8	12252	12259	50 %	0 %	0 %	50 %	378953816
24	NC_016831	AAGA	2	8	12326	12333	75 %	0 %	25 %	0 %	378953816
25	NC_016831	CCAT	2	8	12903	12910	25 %	25 %	0 %	50 %	378953816
26	NC_016831	GGCT	2	8	13423	13430	0 %	25 %	50 %	25 %	378953816
27	NC_016831	CGGT	2	8	14593	14600	0 %	25 %	50 %	25 %	378953817
28	NC_016831	TCAG	2	8	15245	15252	25 %	25 %	25 %	25 %	378953819
29	NC_016831	TTTG	2	8	15535	15542	0 %	75 %	25 %	0 %	378953819
30	NC_016831	CGAA	2	8	15750	15757	50 %	0 %	25 %	25 %	378953819
31	NC_016831	ATTG	2	8	15762	15769	25 %	50 %	25 %	0 %	378953819
32	NC_016831	ATTA	2	8	16430	16437	50 %	50 %	0 %	0 %	378953820
33	NC_016831	ATAA	2	8	16522	16529	75 %	25 %	0 %	0 %	378953821
34	NC_016831	AATA	2	8	17998	18005	75 %	25 %	0 %	0 %	378953823
35	NC_016831	GGGC	2	8	18584	18591	0 %	0 %	75 %	25 %	378953823
36	NC_016831	CGTG	2	8	19284	19291	0 %	25 %	50 %	25 %	378953823
37	NC_016831	CCAA	2	8	21285	21292	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016831	GACG	2	8	21631	21638	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016831	TGGC	2	8	22284	22291	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016831	TGGC	2	8	22390	22397	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016831	CGCC	2	8	22656	22663	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_016831	CTGG	2	8	23002	23009	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016831	TTAT	2	8	23267	23274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016831	TTTA	2	8	23500	23507	25 %	75 %	0 %	0 %	378953824
45	NC_016831	TCTG	2	8	23957	23964	0 %	50 %	25 %	25 %	378953824
46	NC_016831	TGAA	2	8	24468	24475	50 %	25 %	25 %	0 %	378953825
47	NC_016831	CCAG	2	8	24739	24746	25 %	0 %	25 %	50 %	378953825
48	NC_016831	ACCG	2	8	25416	25423	25 %	0 %	25 %	50 %	378953826
49	NC_016831	AAAT	2	8	25476	25483	75 %	25 %	0 %	0 %	378953826
50	NC_016831	TCTG	2	8	25933	25940	0 %	50 %	25 %	25 %	378953827
51	NC_016831	GCCT	2	8	26114	26121	0 %	25 %	25 %	50 %	378953827
52	NC_016831	CCTT	2	8	26620	26627	0 %	50 %	0 %	50 %	378953827
53	NC_016831	TCAG	2	8	26979	26986	25 %	25 %	25 %	25 %	378953827
54	NC_016831	ATCA	2	8	27392	27399	50 %	25 %	0 %	25 %	378953827
55	NC_016831	CAGC	2	8	27436	27443	25 %	0 %	25 %	50 %	378953827
56	NC_016831	AGCC	2	8	27926	27933	25 %	0 %	25 %	50 %	378953827
57	NC_016831	CCGA	2	8	28133	28140	25 %	0 %	25 %	50 %	378953827
58	NC_016831	ATTA	2	8	28526	28533	50 %	50 %	0 %	0 %	378953828
59	NC_016831	GGCG	2	8	28768	28775	0 %	0 %	75 %	25 %	378953828
60	NC_016831	ATGA	2	8	29973	29980	50 %	25 %	25 %	0 %	378953829
61	NC_016831	TGCT	2	8	30543	30550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016831	TATC	2	8	30599	30606	25 %	50 %	0 %	25 %	378953831
63	NC_016831	GTAA	2	8	30636	30643	50 %	25 %	25 %	0 %	378953831
64	NC_016831	TTCG	2	8	30898	30905	0 %	50 %	25 %	25 %	378953831
65	NC_016831	GTCA	2	8	31407	31414	25 %	25 %	25 %	25 %	378953832
66	NC_016831	ACCG	2	8	32227	32234	25 %	0 %	25 %	50 %	378953833
67	NC_016831	AGGC	2	8	32265	32272	25 %	0 %	50 %	25 %	378953833
68	NC_016831	CCTG	2	8	32701	32708	0 %	25 %	25 %	50 %	378953834
69	NC_016831	AACA	2	8	32717	32724	75 %	0 %	0 %	25 %	378953834
70	NC_016831	CGCA	2	8	32891	32898	25 %	0 %	25 %	50 %	378953834
71	NC_016831	TAAA	2	8	32961	32968	75 %	25 %	0 %	0 %	378953834
72	NC_016831	CCAG	2	8	33347	33354	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016831	TTAT	2	8	33530	33537	25 %	75 %	0 %	0 %	378953835
74	NC_016831	TTGG	2	8	33914	33921	0 %	50 %	50 %	0 %	378953835
75	NC_016831	CTTT	2	8	34294	34301	0 %	75 %	0 %	25 %	378953835
76	NC_016831	GAAG	2	8	34334	34341	50 %	0 %	50 %	0 %	378953835
77	NC_016831	ATAA	2	8	34665	34672	75 %	25 %	0 %	0 %	378953836
78	NC_016831	GTGC	2	8	34788	34795	0 %	25 %	50 %	25 %	378953836
79	NC_016831	TTAA	2	8	34798	34805	50 %	50 %	0 %	0 %	378953836
80	NC_016831	TGAT	2	8	35033	35040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016831	TGGA	2	8	35550	35557	25 %	25 %	50 %	0 %	378953838
82	NC_016831	GGGA	2	8	36494	36501	25 %	0 %	75 %	0 %	378953838
83	NC_016831	ATAC	2	8	37479	37486	50 %	25 %	0 %	25 %	378953839
84	NC_016831	GAAG	2	8	37551	37558	50 %	0 %	50 %	0 %	378953839
85	NC_016831	CACG	2	8	38114	38121	25 %	0 %	25 %	50 %	378953839
86	NC_016831	TAAT	2	8	38216	38223	50 %	50 %	0 %	0 %	378953839
87	NC_016831	CCAT	2	8	38672	38679	25 %	25 %	0 %	50 %	378953839
88	NC_016831	ATTA	2	8	38766	38773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016831	AATT	2	8	40046	40053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016831	GCGG	2	8	40537	40544	0 %	0 %	75 %	25 %	378953841
91	NC_016831	CTGG	2	8	40755	40762	0 %	25 %	50 %	25 %	378953841
92	NC_016831	CCGA	2	8	41272	41279	25 %	0 %	25 %	50 %	378953841
93	NC_016831	ATCG	2	8	41428	41435	25 %	25 %	25 %	25 %	378953841
94	NC_016831	TCAA	2	8	41489	41496	50 %	25 %	0 %	25 %	378953841
95	NC_016831	AACC	2	8	41755	41762	50 %	0 %	0 %	50 %	378953842
96	NC_016831	GAAA	2	8	41807	41814	75 %	0 %	25 %	0 %	378953842
97	NC_016831	GGTC	2	8	42379	42386	0 %	25 %	50 %	25 %	378953842
98	NC_016831	TTTG	2	8	42903	42910	0 %	75 %	25 %	0 %	378953842
99	NC_016831	GTAT	2	8	43198	43205	25 %	50 %	25 %	0 %	378953843
100	NC_016831	TCCG	2	8	43592	43599	0 %	25 %	25 %	50 %	378953843
101	NC_016831	ATGA	2	8	45654	45661	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016831	AACG	2	8	45956	45963	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016831	TGAC	2	8	46040	46047	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016831	GAAA	2	8	46904	46911	75 %	0 %	25 %	0 %	378953844
105	NC_016831	TCGC	2	8	46919	46926	0 %	25 %	25 %	50 %	378953844
106	NC_016831	GCTG	2	8	47110	47117	0 %	25 %	50 %	25 %	378953844
107	NC_016831	CACG	2	8	47808	47815	25 %	0 %	25 %	50 %	378953845
108	NC_016831	CAGC	2	8	47835	47842	25 %	0 %	25 %	50 %	378953845
109	NC_016831	CTGC	2	8	47972	47979	0 %	25 %	25 %	50 %	378953845
110	NC_016831	TACC	2	8	48319	48326	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016831	CATG	2	8	48540	48547	25 %	25 %	25 %	25 %	378953846
112	NC_016831	AAGT	2	8	49334	49341	50 %	25 %	25 %	0 %	378953846
113	NC_016831	CCAG	2	8	49392	49399	25 %	0 %	25 %	50 %	378953846
114	NC_016831	TTGA	2	8	50173	50180	25 %	50 %	25 %	0 %	378953846
115	NC_016831	GAAA	2	8	50508	50515	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016831	GCCA	2	8	50849	50856	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016831	TAAA	2	8	51241	51248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016831	AGTA	2	8	51934	51941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016831	ATCA	2	8	51974	51981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016831	GAAA	2	8	52094	52101	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016831	AGGG	2	8	52127	52134	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016831	CATA	2	8	52885	52892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016831	TCAG	2	8	52896	52903	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016831	GCCC	2	8	53068	53075	0 %	0 %	25 %	75 %	378953849
125	NC_016831	TGGC	2	8	53610	53617	0 %	25 %	50 %	25 %	378953849
126	NC_016831	AGCC	2	8	57437	57444	25 %	0 %	25 %	50 %	378953852
127	NC_016831	AAAG	2	8	57516	57523	75 %	0 %	25 %	0 %	378953852
128	NC_016831	ATGG	2	8	57649	57656	25 %	25 %	50 %	0 %	378953852
129	NC_016831	TGAT	2	8	58321	58328	25 %	50 %	25 %	0 %	378953853
130	NC_016831	TGGA	2	8	58990	58997	25 %	25 %	50 %	0 %	378953854
131	NC_016831	CCTG	2	8	59026	59033	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_016831	GATT	2	8	59388	59395	25 %	50 %	25 %	0 %	378953855
133	NC_016831	GATC	2	8	59757	59764	25 %	25 %	25 %	25 %	378953855
134	NC_016831	CTGG	2	8	60882	60889	0 %	25 %	50 %	25 %	378953856
135	NC_016831	GTGG	2	8	61047	61054	0 %	25 %	75 %	0 %	378953856
136	NC_016831	CTGC	2	8	61257	61264	0 %	25 %	25 %	50 %	378953857
137	NC_016831	ACCA	2	8	61893	61900	50 %	0 %	0 %	50 %	378953858
138	NC_016831	CATT	2	8	62118	62125	25 %	50 %	0 %	25 %	378953858
139	NC_016831	TCAA	2	8	63159	63166	50 %	25 %	0 %	25 %	378953858
140	NC_016831	TACT	2	8	63478	63485	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016831	TTTC	2	8	63486	63493	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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143	NC_016831	GCTG	2	8	65127	65134	0 %	25 %	50 %	25 %	378953860
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