MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016831	ATT	2	6	186115	186120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_016831	ACC	2	6	186163	186168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_016831	ATG	2	6	186169	186174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_016831	ATC	3	9	186178	186186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_016831	ATG	2	6	186187	186192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_016831	GTC	3	9	186193	186201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_016831	TGG	2	6	186203	186208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_016831	TGA	2	6	186209	186214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_016831	TCG	2	6	186215	186220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_016831	TGC	2	6	186234	186239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_016831	AAC	2	6	186242	186247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_016831	GGT	2	6	186253	186258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_016831	CTG	2	6	186307	186312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_016831	CGG	2	6	186337	186342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_016831	ACC	2	6	186401	186406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_016831	TGG	2	6	186468	186473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_016831	GTC	2	6	186476	186481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_016831	CGG	2	6	186486	186491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_016831	GAGC	2	8	186561	186568	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4020	NC_016831	CATC	2	8	186588	186595	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4021	NC_016831	TGGC	2	8	186716	186723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4022	NC_016831	CGC	2	6	186950	186955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_016831	GGC	2	6	187004	187009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_016831	CA	3	6	187026	187031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4025	NC_016831	TC	3	6	187071	187076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_016831	TGCC	2	8	187106	187113	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4027	NC_016831	T	6	6	187283	187288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_016831	T	6	6	187296	187301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_016831	CTA	2	6	187366	187371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_016831	ACT	2	6	187372	187377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_016831	CAA	2	6	187409	187414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_016831	GAG	2	6	187441	187446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_016831	TCG	2	6	187450	187455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953964
4034	NC_016831	AGA	2	6	187460	187465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378953964
4035	NC_016831	TGC	2	6	187490	187495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953964
4036	NC_016831	GCT	2	6	187550	187555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953964
4037	NC_016831	GAA	3	9	187575	187583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378953964
4038	NC_016831	TCC	2	6	187613	187618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378953964
4039	NC_016831	GCT	2	6	187659	187664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953964
4040	NC_016831	ACC	2	6	187680	187685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953964
4041	NC_016831	CTG	2	6	187719	187724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953964
4042	NC_016831	ACA	2	6	187744	187749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378953964
4043	NC_016831	CTG	2	6	187821	187826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953964
4044	NC_016831	ACG	2	6	187843	187848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953964
4045	NC_016831	AGA	2	6	187850	187855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378953964
4046	NC_016831	CCG	2	6	187932	187937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953964
4047	NC_016831	A	6	6	187945	187950	100 %	0 %	0 %	0 %	378953964
4048	NC_016831	TCACCG	2	12	187951	187962	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378953964
4049	NC_016831	CGA	2	6	187991	187996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953964
4050	NC_016831	TC	4	8	187997	188004	0 %	50 %	0 %	50 %	378953964
4051	NC_016831	CAAA	2	8	188114	188121	75 %	0 %	0 %	25 %	378953964
4052	NC_016831	A	6	6	188136	188141	100 %	0 %	0 %	0 %	378953964
4053	NC_016831	GTG	2	6	188169	188174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953964
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4055	NC_016831	GCG	3	9	188257	188265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953964
4056	NC_016831	CGG	2	6	188276	188281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953964
4057	NC_016831	TCT	2	6	188296	188301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953964
4058	NC_016831	CGA	2	6	188462	188467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953964
4059	NC_016831	GTGC	2	8	188469	188476	0 %	25 %	50 %	25 %	378953964
4060	NC_016831	GGT	2	6	188478	188483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953964
4061	NC_016831	ACC	2	6	188514	188519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953964
4062	NC_016831	AGC	2	6	188586	188591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953964
4063	NC_016831	GGTC	2	8	188618	188625	0 %	25 %	50 %	25 %	378953964
4064	NC_016831	GCG	2	6	188632	188637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953964
4065	NC_016831	CGA	2	6	188720	188725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953964
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4069	NC_016831	TC	3	6	188863	188868	0 %	50 %	0 %	50 %	378953964
4070	NC_016831	TGC	3	9	188911	188919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953964
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4072	NC_016831	CGG	2	6	188980	188985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953964
4073	NC_016831	CTGGT	2	10	188989	188998	0 %	40 %	40 %	20 %	378953964
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4083	NC_016831	CGG	2	6	189454	189459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953964
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4085	NC_016831	CTG	2	6	189531	189536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953964
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4088	NC_016831	GCT	2	6	189620	189625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953964
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4094	NC_016831	CGG	2	6	189961	189966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953964
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4096	NC_016831	TAT	2	6	190097	190102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953965
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4103	NC_016831	GC	3	6	190331	190336	0 %	0 %	50 %	50 %	378953965
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4107	NC_016831	AACC	2	8	190516	190523	50 %	0 %	0 %	50 %	378953965
4108	NC_016831	ATT	2	6	190534	190539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953965
4109	NC_016831	TCCT	2	8	190563	190570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4110	NC_016831	A	6	6	190594	190599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_016831	CTG	2	6	190620	190625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4116	NC_016831	CT	3	6	190831	190836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4119	NC_016831	GTC	2	6	190890	190895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_016831	GATG	2	8	190934	190941	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4396	NC_016831	AAGT	2	8	204129	204136	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4492	NC_016831	CGTCA	2	10	208597	208606	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4495	NC_016831	TCG	2	6	208737	208742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4496	NC_016831	GCTG	2	8	208755	208762	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4497	NC_016831	CGG	2	6	208848	208853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4498	NC_016831	TCG	2	6	209015	209020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4499	NC_016831	CCT	2	6	209088	209093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4500	NC_016831	CGG	2	6	209104	209109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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