MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016831	ATG	2	6	162950	162955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_016831	GCG	2	6	163015	163020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_016831	GGA	2	6	163068	163073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_016831	TTG	2	6	163090	163095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_016831	ACC	2	6	163102	163107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3506	NC_016831	TGA	2	6	163176	163181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_016831	CGG	2	6	163250	163255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_016831	AACG	2	8	163355	163362	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3509	NC_016831	CGC	2	6	163482	163487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3510	NC_016831	TCA	2	6	163503	163508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_016831	TC	3	6	163636	163641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3512	NC_016831	CGC	2	6	163642	163647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_016831	GAG	2	6	163730	163735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_016831	CTGC	2	8	163739	163746	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_016831	TAT	2	6	163766	163771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_016831	CG	3	6	163778	163783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3517	NC_016831	TATT	2	8	163806	163813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_016831	ATT	2	6	163815	163820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_016831	GTC	2	6	163882	163887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953942
3520	NC_016831	CGC	2	6	163902	163907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953942
3521	NC_016831	CGG	2	6	163929	163934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953942
3522	NC_016831	C	6	6	163998	164003	0 %	0 %	0 %	100 %	378953942
3523	NC_016831	GAC	2	6	164005	164010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953942
3524	NC_016831	ACG	2	6	164036	164041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953942
3525	NC_016831	GCA	2	6	164205	164210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953943
3526	NC_016831	CGT	2	6	164217	164222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953943
3527	NC_016831	GATCA	2	10	164284	164293	40 %	20 %	20 %	20 %	378953943
3528	NC_016831	TGT	2	6	164369	164374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953943
3529	NC_016831	GCC	2	6	164419	164424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953943
3530	NC_016831	GCT	2	6	164475	164480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953943
3531	NC_016831	CTG	2	6	164527	164532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953943
3532	NC_016831	GCT	2	6	164595	164600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953943
3533	NC_016831	CAG	2	6	164617	164622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953943
3534	NC_016831	A	6	6	164678	164683	100 %	0 %	0 %	0 %	378953943
3535	NC_016831	TCT	2	6	164766	164771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953943
3536	NC_016831	TTA	2	6	164902	164907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953944
3537	NC_016831	GC	3	6	164934	164939	0 %	0 %	50 %	50 %	378953944
3538	NC_016831	CG	3	6	164981	164986	0 %	0 %	50 %	50 %	378953944
3539	NC_016831	CAT	2	6	164990	164995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953944
3540	NC_016831	CGTCA	2	10	165030	165039	20 %	20 %	20 %	40 %	378953944
3541	NC_016831	ACC	2	6	165040	165045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953944
3542	NC_016831	CAG	2	6	165084	165089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953944
3543	NC_016831	CTG	2	6	165147	165152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953944
3544	NC_016831	TTC	2	6	165189	165194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953944
3545	NC_016831	A	6	6	165203	165208	100 %	0 %	0 %	0 %	378953944
3546	NC_016831	CGG	2	6	165245	165250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953944
3547	NC_016831	GGGC	2	8	165290	165297	0 %	0 %	75 %	25 %	378953944
3548	NC_016831	GC	3	6	165318	165323	0 %	0 %	50 %	50 %	378953944
3549	NC_016831	AAT	2	6	165324	165329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378953944
3550	NC_016831	CCG	2	6	165400	165405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953944
3551	NC_016831	CTA	2	6	165511	165516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_016831	A	7	7	165548	165554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_016831	GAA	2	6	165663	165668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378953945
3554	NC_016831	ATT	2	6	165798	165803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953945
3555	NC_016831	CTG	2	6	165871	165876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953945
3556	NC_016831	A	6	6	165985	165990	100 %	0 %	0 %	0 %	378953945
3557	NC_016831	TCG	2	6	166075	166080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953945
3558	NC_016831	ACG	2	6	166212	166217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953945
3559	NC_016831	CGG	2	6	166252	166257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953945
3560	NC_016831	GGC	2	6	166290	166295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953945
3561	NC_016831	GGC	2	6	166311	166316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953945
3562	NC_016831	CGG	3	9	166349	166357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953945
3563	NC_016831	GGC	2	6	166377	166382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953945
3564	NC_016831	AG	3	6	166400	166405	50 %	0 %	50 %	0 %	378953945
3565	NC_016831	CGG	2	6	166406	166411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953945
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3567	NC_016831	CGG	2	6	166490	166495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953945
3568	NC_016831	CG	3	6	166509	166514	0 %	0 %	50 %	50 %	378953945
3569	NC_016831	CCGC	2	8	166564	166571	0 %	0 %	25 %	75 %	378953945
3570	NC_016831	CAC	2	6	166643	166648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953945
3571	NC_016831	CTGG	2	8	166702	166709	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3572	NC_016831	ATCCC	2	10	166730	166739	20 %	20 %	0 %	60 %	378953946
3573	NC_016831	CCA	3	9	166781	166789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953946
3574	NC_016831	TGA	2	6	166811	166816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953946
3575	NC_016831	GCCAGC	2	12	166855	166866	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378953946
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3580	NC_016831	CGCTGC	2	12	167194	167205	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378953946
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3582	NC_016831	CG	3	6	167318	167323	0 %	0 %	50 %	50 %	378953946
3583	NC_016831	AGA	2	6	167326	167331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378953946
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3585	NC_016831	GCA	2	6	167387	167392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953946
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3587	NC_016831	AAT	2	6	167424	167429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378953946
3588	NC_016831	AGCGC	2	10	167438	167447	20 %	0 %	40 %	40 %	378953946
3589	NC_016831	AGC	2	6	167504	167509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953946
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3593	NC_016831	TGA	2	6	167734	167739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953946
3594	NC_016831	CTT	2	6	167759	167764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953946
3595	NC_016831	GCG	2	6	167773	167778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953946
3596	NC_016831	TGA	2	6	167831	167836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953946
3597	NC_016831	TGCC	2	8	168160	168167	0 %	25 %	25 %	50 %	378953947
3598	NC_016831	GC	3	6	168177	168182	0 %	0 %	50 %	50 %	378953947
3599	NC_016831	ACC	2	6	168269	168274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953947
3600	NC_016831	ATC	2	6	168293	168298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953947
3601	NC_016831	TGC	2	6	168317	168322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953947
3602	NC_016831	TGG	2	6	168342	168347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953947
3603	NC_016831	GCC	2	6	168389	168394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953947
3604	NC_016831	ATG	3	9	168440	168448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953947
3605	NC_016831	GCA	2	6	168474	168479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953947
3606	NC_016831	GGAT	2	8	168506	168513	25 %	25 %	50 %	0 %	378953947
3607	NC_016831	GC	3	6	168600	168605	0 %	0 %	50 %	50 %	378953947
3608	NC_016831	CAA	2	6	168751	168756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378953947
3609	NC_016831	GAC	2	6	168763	168768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953947
3610	NC_016831	CTT	2	6	168777	168782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953947
3611	NC_016831	CGCC	2	8	168819	168826	0 %	0 %	25 %	75 %	378953947
3612	NC_016831	GAA	2	6	168948	168953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378953947
3613	NC_016831	GAT	2	6	169119	169124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953947
3614	NC_016831	CA	3	6	169148	169153	50 %	0 %	0 %	50 %	378953947
3615	NC_016831	ACC	2	6	169217	169222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953947
3616	NC_016831	TGA	2	6	169265	169270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953947
3617	NC_016831	TGAGC	2	10	169287	169296	20 %	20 %	40 %	20 %	378953947
3618	NC_016831	TGT	2	6	169352	169357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953948
3619	NC_016831	CCAG	2	8	169393	169400	25 %	0 %	25 %	50 %	378953948
3620	NC_016831	GGCG	2	8	169423	169430	0 %	0 %	75 %	25 %	378953948
3621	NC_016831	ATG	2	6	169433	169438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953948
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3989	NC_016831	CGC	2	6	185758	185763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3990	NC_016831	CGA	2	6	185768	185773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3991	NC_016831	CTG	2	6	185774	185779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3992	NC_016831	ATT	2	6	185806	185811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3993	NC_016831	CTG	2	6	185833	185838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3994	NC_016831	CTGT	2	8	185854	185861	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3995	NC_016831	GCC	2	6	185927	185932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3996	NC_016831	TGC	2	6	185963	185968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3997	NC_016831	CGC	2	6	185982	185987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3998	NC_016831	TGG	2	6	185994	185999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3999	NC_016831	TAT	2	6	186021	186026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4000	NC_016831	TGC	2	6	186062	186067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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