MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016831	CAAA	2	8	139252	139259	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_016831	AAT	2	6	139285	139290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_016831	T	6	6	139323	139328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_016831	CTTT	2	8	139334	139341	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3005	NC_016831	TTGTT	2	10	139398	139407	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_016831	TCG	2	6	139424	139429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_016831	CGG	2	6	139604	139609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_016831	T	7	7	139621	139627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_016831	T	6	6	139709	139714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_016831	CTTG	2	8	139734	139741	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3011	NC_016831	TCC	2	6	139751	139756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_016831	AAG	2	6	139801	139806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_016831	G	6	6	139827	139832	0 %	0 %	100 %	0 %	378953923
3014	NC_016831	CATC	2	8	139936	139943	25 %	25 %	0 %	50 %	378953923
3015	NC_016831	CTG	2	6	139952	139957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953923
3016	NC_016831	CCTG	2	8	139966	139973	0 %	25 %	25 %	50 %	378953923
3017	NC_016831	ATT	2	6	139982	139987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953923
3018	NC_016831	GATG	2	8	140074	140081	25 %	25 %	50 %	0 %	378953923
3019	NC_016831	AAG	2	6	140136	140141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378953923
3020	NC_016831	CAA	2	6	140161	140166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378953923
3021	NC_016831	GAT	2	6	140279	140284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953924
3022	NC_016831	AC	3	6	140297	140302	50 %	0 %	0 %	50 %	378953924
3023	NC_016831	CGG	2	6	140381	140386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953924
3024	NC_016831	CGAT	2	8	140437	140444	25 %	25 %	25 %	25 %	378953924
3025	NC_016831	CAT	2	6	140498	140503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953924
3026	NC_016831	GCTG	2	8	140522	140529	0 %	25 %	50 %	25 %	378953924
3027	NC_016831	TCT	2	6	140592	140597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953924
3028	NC_016831	CG	3	6	140671	140676	0 %	0 %	50 %	50 %	378953924
3029	NC_016831	GCC	2	6	140685	140690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953924
3030	NC_016831	CGG	2	6	140704	140709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953924
3031	NC_016831	AGG	2	6	140710	140715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378953924
3032	NC_016831	GAG	2	6	140748	140753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378953924
3033	NC_016831	TTG	2	6	140782	140787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953924
3034	NC_016831	GGT	2	6	140834	140839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953924
3035	NC_016831	GCG	3	9	140841	140849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953924
3036	NC_016831	GGA	2	6	140927	140932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378953924
3037	NC_016831	GCTC	2	8	140953	140960	0 %	25 %	25 %	50 %	378953924
3038	NC_016831	GGCG	2	8	140976	140983	0 %	0 %	75 %	25 %	378953924
3039	NC_016831	ATC	2	6	140991	140996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953924
3040	NC_016831	CGG	2	6	141067	141072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953924
3041	NC_016831	A	6	6	141099	141104	100 %	0 %	0 %	0 %	378953924
3042	NC_016831	AGTTC	2	10	141183	141192	20 %	40 %	20 %	20 %	378953924
3043	NC_016831	AG	3	6	141203	141208	50 %	0 %	50 %	0 %	378953924
3044	NC_016831	CAG	2	6	141223	141228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_016831	TGCCT	2	10	141283	141292	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3046	NC_016831	CAT	2	6	141352	141357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953925
3047	NC_016831	CGG	2	6	141363	141368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953925
3048	NC_016831	ACG	2	6	141380	141385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953925
3049	NC_016831	GAA	2	6	141476	141481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378953925
3050	NC_016831	GCA	2	6	141538	141543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953925
3051	NC_016831	AGC	2	6	141604	141609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953926
3052	NC_016831	GAA	2	6	141638	141643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378953926
3053	NC_016831	TCA	2	6	141654	141659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953926
3054	NC_016831	T	7	7	141705	141711	0 %	100 %	0 %	0 %	378953926
3055	NC_016831	CG	3	6	141719	141724	0 %	0 %	50 %	50 %	378953926
3056	NC_016831	ACCG	2	8	141821	141828	25 %	0 %	25 %	50 %	378953926
3057	NC_016831	AAG	2	6	141885	141890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378953926
3058	NC_016831	CGG	2	6	141901	141906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953926
3059	NC_016831	TTTA	2	8	142004	142011	25 %	75 %	0 %	0 %	378953926
3060	NC_016831	GC	3	6	142016	142021	0 %	0 %	50 %	50 %	378953926
3061	NC_016831	A	6	6	142052	142057	100 %	0 %	0 %	0 %	378953926
3062	NC_016831	CGC	2	6	142094	142099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953926
3063	NC_016831	TAC	2	6	142100	142105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953926
3064	NC_016831	GCGA	2	8	142212	142219	25 %	0 %	50 %	25 %	378953926
3065	NC_016831	TCC	2	6	142262	142267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378953926
3066	NC_016831	TGA	2	6	142306	142311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953926
3067	NC_016831	AAC	2	6	142343	142348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378953926
3068	NC_016831	TGGCGA	2	12	142416	142427	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378953926
3069	NC_016831	CAA	2	6	142447	142452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378953926
3070	NC_016831	TGG	2	6	142533	142538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953926
3071	NC_016831	TGA	2	6	142539	142544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953926
3072	NC_016831	GC	3	6	142631	142636	0 %	0 %	50 %	50 %	378953926
3073	NC_016831	TAG	2	6	142725	142730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953926
3074	NC_016831	TACT	2	8	142732	142739	25 %	50 %	0 %	25 %	378953926
3075	NC_016831	GGT	2	6	142815	142820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953926
3076	NC_016831	AG	3	6	142828	142833	50 %	0 %	50 %	0 %	378953926
3077	NC_016831	GTG	2	6	142997	143002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953926
3078	NC_016831	ATG	2	6	143006	143011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953926
3079	NC_016831	GCG	4	12	143031	143042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953926
3080	NC_016831	GGC	2	6	143047	143052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953926
3081	NC_016831	A	6	6	143093	143098	100 %	0 %	0 %	0 %	378953926
3082	NC_016831	CAA	2	6	143122	143127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378953926
3083	NC_016831	TGG	2	6	143181	143186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953926
3084	NC_016831	TCA	2	6	143190	143195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953926
3085	NC_016831	TAC	2	6	143216	143221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953926
3086	NC_016831	GGC	2	6	143222	143227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953926
3087	NC_016831	CAT	2	6	143254	143259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953926
3088	NC_016831	GCG	2	6	143262	143267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953926
3089	NC_016831	A	7	7	143313	143319	100 %	0 %	0 %	0 %	378953926
3090	NC_016831	TAAT	2	8	143328	143335	50 %	50 %	0 %	0 %	378953926
3091	NC_016831	CTT	2	6	143376	143381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_016831	GTGG	2	8	143387	143394	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_016831	CG	3	6	143405	143410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3094	NC_016831	GA	3	6	143419	143424	50 %	0 %	50 %	0 %	378953927
3095	NC_016831	GCG	2	6	143448	143453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953927
3096	NC_016831	GTG	2	6	143472	143477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953927
3097	NC_016831	TCA	2	6	143480	143485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953927
3098	NC_016831	AT	3	6	143501	143506	50 %	50 %	0 %	0 %	378953927
3099	NC_016831	ATT	2	6	143538	143543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953927
3100	NC_016831	GCGA	2	8	143562	143569	25 %	0 %	50 %	25 %	378953927
3101	NC_016831	GTC	2	6	143601	143606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953927
3102	NC_016831	CAGC	2	8	143612	143619	25 %	0 %	25 %	50 %	378953927
3103	NC_016831	TGG	2	6	143683	143688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953927
3104	NC_016831	ACC	4	12	143712	143723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953927
3105	NC_016831	ACT	2	6	143726	143731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953927
3106	NC_016831	TCT	2	6	143904	143909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953927
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3108	NC_016831	GGC	2	6	143933	143938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953927
3109	NC_016831	GCC	2	6	143949	143954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953927
3110	NC_016831	GGC	2	6	144017	144022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953927
3111	NC_016831	CCAC	2	8	144040	144047	25 %	0 %	0 %	75 %	378953927
3112	NC_016831	GAT	2	6	144075	144080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953927
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3114	NC_016831	CGA	2	6	144208	144213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953927
3115	NC_016831	GCC	2	6	144253	144258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953927
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3119	NC_016831	CG	3	6	144350	144355	0 %	0 %	50 %	50 %	378953927
3120	NC_016831	GGT	3	9	144410	144418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953927
3121	NC_016831	GGC	2	6	144461	144466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953927
3122	NC_016831	GAA	2	6	144558	144563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378953927
3123	NC_016831	TCG	2	6	144574	144579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953927
3124	NC_016831	TGAC	2	8	144583	144590	25 %	25 %	25 %	25 %	378953927
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3353	NC_016831	GA	4	8	155546	155553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3362	NC_016831	GGCA	2	8	155858	155865	25 %	0 %	50 %	25 %	378953936
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3364	NC_016831	CGGCG	2	10	155885	155894	0 %	0 %	60 %	40 %	378953936
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3492	NC_016831	TCT	2	6	162436	162441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953941
3493	NC_016831	TCG	2	6	162599	162604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953941
3494	NC_016831	CGA	2	6	162622	162627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953941
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3499	NC_016831	GGCT	2	8	162930	162937	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3500	NC_016831	TAA	2	6	162938	162943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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