MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016831	TAC	2	6	45165	45170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_016831	ACG	2	6	45192	45197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_016831	GTT	2	6	45293	45298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016831	TCA	2	6	45314	45319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_016831	GAC	2	6	45390	45395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_016831	AGG	2	6	45463	45468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016831	CGT	2	6	45515	45520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_016831	AAT	2	6	45531	45536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_016831	TGA	2	6	45590	45595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_016831	CCG	2	6	45612	45617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_016831	GTG	2	6	45645	45650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016831	ATGA	2	8	45654	45661	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_016831	GC	3	6	45703	45708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_016831	CAG	2	6	45744	45749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_016831	TGA	2	6	45788	45793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016831	GCT	2	6	45869	45874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_016831	TAC	2	6	45939	45944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_016831	AACG	2	8	45956	45963	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_016831	ATC	2	6	46032	46037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_016831	TGAC	2	8	46040	46047	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_016831	A	6	6	46054	46059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016831	A	6	6	46088	46093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_016831	TCA	2	6	46102	46107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_016831	TA	3	6	46108	46113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_016831	TAG	2	6	46148	46153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_016831	GAA	2	6	46158	46163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_016831	GA	3	6	46175	46180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_016831	T	6	6	46206	46211	0 %	100 %	0 %	0 %	378953844
1029	NC_016831	AGC	2	6	46212	46217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953844
1030	NC_016831	CAT	2	6	46232	46237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953844
1031	NC_016831	TCA	2	6	46240	46245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953844
1032	NC_016831	CGC	2	6	46247	46252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953844
1033	NC_016831	CAA	2	6	46352	46357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378953844
1034	NC_016831	TGT	2	6	46366	46371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953844
1035	NC_016831	GCC	2	6	46485	46490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953844
1036	NC_016831	CGG	2	6	46493	46498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953844
1037	NC_016831	GAT	2	6	46499	46504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953844
1038	NC_016831	ACT	2	6	46534	46539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953844
1039	NC_016831	GGGCT	2	10	46559	46568	0 %	20 %	60 %	20 %	378953844
1040	NC_016831	ATC	2	6	46668	46673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953844
1041	NC_016831	GAT	2	6	46674	46679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953844
1042	NC_016831	TTA	2	6	46693	46698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953844
1043	NC_016831	GGC	2	6	46745	46750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953844
1044	NC_016831	GCT	2	6	46772	46777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953844
1045	NC_016831	GCG	2	6	46786	46791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953844
1046	NC_016831	TA	3	6	46807	46812	50 %	50 %	0 %	0 %	378953844
1047	NC_016831	CGG	2	6	46837	46842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953844
1048	NC_016831	GAAA	2	8	46904	46911	75 %	0 %	25 %	0 %	378953844
1049	NC_016831	TCGC	2	8	46919	46926	0 %	25 %	25 %	50 %	378953844
1050	NC_016831	TGC	2	6	47047	47052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953844
1051	NC_016831	ATT	2	6	47061	47066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953844
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1053	NC_016831	GCTG	2	8	47110	47117	0 %	25 %	50 %	25 %	378953844
1054	NC_016831	TG	3	6	47188	47193	0 %	50 %	50 %	0 %	378953844
1055	NC_016831	TTA	2	6	47257	47262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953844
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1057	NC_016831	GC	4	8	47327	47334	0 %	0 %	50 %	50 %	378953844
1058	NC_016831	GA	3	6	47409	47414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016831	TAT	2	6	47449	47454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953845
1060	NC_016831	AAG	2	6	47471	47476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378953845
1061	NC_016831	CGC	2	6	47513	47518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953845
1062	NC_016831	TGT	2	6	47699	47704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953845
1063	NC_016831	CAG	2	6	47745	47750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953845
1064	NC_016831	GCG	2	6	47761	47766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953845
1065	NC_016831	GTG	3	9	47767	47775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953845
1066	NC_016831	CACG	2	8	47808	47815	25 %	0 %	25 %	50 %	378953845
1067	NC_016831	CAGC	2	8	47835	47842	25 %	0 %	25 %	50 %	378953845
1068	NC_016831	GCA	2	6	47886	47891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953845
1069	NC_016831	CTGC	2	8	47972	47979	0 %	25 %	25 %	50 %	378953845
1070	NC_016831	GTT	2	6	48033	48038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953845
1071	NC_016831	TGA	2	6	48087	48092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953845
1072	NC_016831	GAA	2	6	48217	48222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378953845
1073	NC_016831	GA	3	6	48241	48246	50 %	0 %	50 %	0 %	378953845
1074	NC_016831	CGG	2	6	48260	48265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953845
1075	NC_016831	ACT	2	6	48287	48292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953845
1076	NC_016831	TACC	2	8	48319	48326	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_016831	CAG	2	6	48379	48384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953846
1078	NC_016831	GCGTA	2	10	48435	48444	20 %	20 %	40 %	20 %	378953846
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1080	NC_016831	CATG	2	8	48540	48547	25 %	25 %	25 %	25 %	378953846
1081	NC_016831	CAG	2	6	48559	48564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953846
1082	NC_016831	TCC	2	6	48668	48673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378953846
1083	NC_016831	CCG	2	6	48938	48943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953846
1084	NC_016831	CGT	2	6	48949	48954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953846
1085	NC_016831	CCA	2	6	48955	48960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953846
1086	NC_016831	CGG	2	6	48990	48995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953846
1087	NC_016831	GAG	2	6	49022	49027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378953846
1088	NC_016831	GACCA	2	10	49040	49049	40 %	0 %	20 %	40 %	378953846
1089	NC_016831	A	6	6	49132	49137	100 %	0 %	0 %	0 %	378953846
1090	NC_016831	CCGGC	2	10	49182	49191	0 %	0 %	40 %	60 %	378953846
1091	NC_016831	GTCGTA	2	12	49207	49218	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378953846
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1093	NC_016831	AAGT	2	8	49334	49341	50 %	25 %	25 %	0 %	378953846
1094	NC_016831	CCAG	2	8	49392	49399	25 %	0 %	25 %	50 %	378953846
1095	NC_016831	CG	3	6	49521	49526	0 %	0 %	50 %	50 %	378953846
1096	NC_016831	AAG	2	6	49562	49567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378953846
1097	NC_016831	GCG	2	6	49597	49602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953846
1098	NC_016831	CAG	2	6	49624	49629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953846
1099	NC_016831	CAT	2	6	49687	49692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953846
1100	NC_016831	CGG	2	6	49693	49698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953846
1101	NC_016831	AGT	2	6	49761	49766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953846
1102	NC_016831	GTT	2	6	49837	49842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953846
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1106	NC_016831	TTGA	2	8	50173	50180	25 %	50 %	25 %	0 %	378953846
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1111	NC_016831	TGG	2	6	50409	50414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953846
1112	NC_016831	TCT	2	6	50481	50486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_016831	GAAA	2	8	50508	50515	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016831	AGT	2	6	50516	50521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_016831	GCA	2	6	50591	50596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1119	NC_016831	TGT	2	6	50838	50843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_016831	GCCA	2	8	50849	50856	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_016831	CAT	2	6	50857	50862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1125	NC_016831	GAT	2	6	50944	50949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_016831	TCG	2	6	50964	50969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_016831	ATA	2	6	51022	51027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016831	GCT	2	6	51045	51050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_016831	AGA	2	6	51063	51068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_016831	CGC	2	6	51115	51120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_016831	T	6	6	51126	51131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_016831	GC	3	6	51206	51211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_016831	TAAA	2	8	51241	51248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_016831	ATC	2	6	51258	51263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_016831	A	6	6	51274	51279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_016831	TAA	2	6	51309	51314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_016831	TCA	2	6	51380	51385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_016831	GTG	2	6	51404	51409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_016831	TGC	2	6	51453	51458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1140	NC_016831	GAC	2	6	51551	51556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1141	NC_016831	GAT	3	9	51585	51593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_016831	ATA	2	6	51622	51627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_016831	CAG	3	9	51633	51641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1144	NC_016831	CAG	2	6	51720	51725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1145	NC_016831	GTA	2	6	51764	51769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_016831	ATG	2	6	51776	51781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_016831	AAC	2	6	51859	51864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1150	NC_016831	AGT	2	6	51956	51961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1151	NC_016831	ATCA	2	8	51974	51981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1152	NC_016831	ATT	2	6	51982	51987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1153	NC_016831	TTA	2	6	52010	52015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1154	NC_016831	GGT	2	6	52048	52053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1155	NC_016831	T	6	6	52059	52064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1156	NC_016831	GAAA	2	8	52094	52101	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1157	NC_016831	AGGG	2	8	52127	52134	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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1159	NC_016831	A	6	6	52224	52229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1167	NC_016831	GCA	2	6	52647	52652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1173	NC_016831	TCAG	2	8	52896	52903	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1174	NC_016831	GT	3	6	52915	52920	0 %	50 %	50 %	0 %	378953849
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1251	NC_016831	GC	3	6	57004	57009	0 %	0 %	50 %	50 %	378953851
1252	NC_016831	TGT	2	6	57044	57049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953851
1253	NC_016831	CGGCG	2	10	57122	57131	0 %	0 %	60 %	40 %	378953851
1254	NC_016831	AGCGC	2	10	57230	57239	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1255	NC_016831	GTG	2	6	57252	57257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1257	NC_016831	GAT	2	6	57397	57402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953852
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1262	NC_016831	AAAG	2	8	57516	57523	75 %	0 %	25 %	0 %	378953852
1263	NC_016831	CGC	2	6	57543	57548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953852
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1373	NC_016831	A	6	6	63496	63501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1379	NC_016831	GCC	2	6	63779	63784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953859
1380	NC_016831	CAG	3	9	63811	63819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953859
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1499	NC_016831	ACC	2	6	68221	68226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953862
1500	NC_016831	AGTC	2	8	68232	68239	25 %	25 %	25 %	25 %	378953862

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