MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016831	CGCC	2	8	22656	22663	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
502	NC_016831	GGC	2	6	22682	22687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_016831	AGA	2	6	22702	22707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016831	CGG	2	6	22744	22749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_016831	T	6	6	22754	22759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016831	CT	3	6	22796	22801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_016831	GGT	2	6	22949	22954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016831	CTA	2	6	22956	22961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_016831	CGG	2	6	22996	23001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_016831	CTGG	2	8	23002	23009	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
511	NC_016831	TAT	2	6	23027	23032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016831	ATA	2	6	23053	23058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016831	TTA	2	6	23168	23173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016831	TCTTAA	2	12	23205	23216	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
515	NC_016831	TTAT	2	8	23267	23274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_016831	A	7	7	23340	23346	100 %	0 %	0 %	0 %	378953824
517	NC_016831	TGA	2	6	23347	23352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953824
518	NC_016831	ACG	2	6	23353	23358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953824
519	NC_016831	ATA	2	6	23371	23376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378953824
520	NC_016831	CTTTT	2	10	23395	23404	0 %	80 %	0 %	20 %	378953824
521	NC_016831	T	6	6	23401	23406	0 %	100 %	0 %	0 %	378953824
522	NC_016831	CAG	2	6	23409	23414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953824
523	NC_016831	TTG	2	6	23454	23459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953824
524	NC_016831	TTTA	2	8	23500	23507	25 %	75 %	0 %	0 %	378953824
525	NC_016831	ATG	2	6	23515	23520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953824
526	NC_016831	GTT	2	6	23550	23555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953824
527	NC_016831	ATG	2	6	23566	23571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953824
528	NC_016831	AT	3	6	23584	23589	50 %	50 %	0 %	0 %	378953824
529	NC_016831	CG	3	6	23654	23659	0 %	0 %	50 %	50 %	378953824
530	NC_016831	ACG	2	6	23755	23760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953824
531	NC_016831	TGA	2	6	23791	23796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953824
532	NC_016831	GC	4	8	23797	23804	0 %	0 %	50 %	50 %	378953824
533	NC_016831	GCT	2	6	23849	23854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953824
534	NC_016831	TCTG	2	8	23957	23964	0 %	50 %	25 %	25 %	378953824
535	NC_016831	A	7	7	23969	23975	100 %	0 %	0 %	0 %	378953824
536	NC_016831	GGC	2	6	24001	24006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953824
537	NC_016831	AT	3	6	24058	24063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016831	GTT	2	6	24118	24123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016831	ACA	2	6	24197	24202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_016831	GAT	2	6	24234	24239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016831	TAA	2	6	24261	24266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_016831	TAA	2	6	24268	24273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_016831	ACG	2	6	24308	24313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_016831	AAG	2	6	24355	24360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016831	T	7	7	24365	24371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_016831	GAA	2	6	24401	24406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016831	CAG	2	6	24411	24416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_016831	A	6	6	24427	24432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_016831	TGAA	2	8	24468	24475	50 %	25 %	25 %	0 %	378953825
550	NC_016831	TGT	2	6	24523	24528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953825
551	NC_016831	TAC	2	6	24545	24550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953825
552	NC_016831	CGGTA	2	10	24563	24572	20 %	20 %	40 %	20 %	378953825
553	NC_016831	CTGTT	2	10	24602	24611	0 %	60 %	20 %	20 %	378953825
554	NC_016831	TGG	2	6	24682	24687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953825
555	NC_016831	AGA	2	6	24698	24703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378953825
556	NC_016831	CCAG	2	8	24739	24746	25 %	0 %	25 %	50 %	378953825
557	NC_016831	GCG	2	6	24750	24755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953825
558	NC_016831	CGA	2	6	24826	24831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953825
559	NC_016831	T	7	7	25027	25033	0 %	100 %	0 %	0 %	378953826
560	NC_016831	CG	3	6	25066	25071	0 %	0 %	50 %	50 %	378953826
561	NC_016831	A	8	8	25117	25124	100 %	0 %	0 %	0 %	378953826
562	NC_016831	ATT	2	6	25143	25148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953826
563	NC_016831	CTG	2	6	25153	25158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953826
564	NC_016831	CGG	2	6	25160	25165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953826
565	NC_016831	CCT	2	6	25247	25252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378953826
566	NC_016831	ATT	2	6	25258	25263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953826
567	NC_016831	TTC	2	6	25266	25271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953826
568	NC_016831	T	7	7	25283	25289	0 %	100 %	0 %	0 %	378953826
569	NC_016831	CGC	2	6	25346	25351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953826
570	NC_016831	CT	3	6	25352	25357	0 %	50 %	0 %	50 %	378953826
571	NC_016831	A	6	6	25372	25377	100 %	0 %	0 %	0 %	378953826
572	NC_016831	AT	3	6	25382	25387	50 %	50 %	0 %	0 %	378953826
573	NC_016831	TAT	2	6	25392	25397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953826
574	NC_016831	ACCG	2	8	25416	25423	25 %	0 %	25 %	50 %	378953826
575	NC_016831	TATTT	2	10	25436	25445	20 %	80 %	0 %	0 %	378953826
576	NC_016831	AAAT	2	8	25476	25483	75 %	25 %	0 %	0 %	378953826
577	NC_016831	TAC	2	6	25633	25638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953826
578	NC_016831	A	6	6	25669	25674	100 %	0 %	0 %	0 %	378953826
579	NC_016831	CCG	2	6	25693	25698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953826
580	NC_016831	ACG	2	6	25768	25773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953826
581	NC_016831	ATG	2	6	25797	25802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953826
582	NC_016831	TCTG	2	8	25933	25940	0 %	50 %	25 %	25 %	378953827
583	NC_016831	GGC	2	6	25990	25995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953827
584	NC_016831	ACG	2	6	26072	26077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953827
585	NC_016831	GC	3	6	26085	26090	0 %	0 %	50 %	50 %	378953827
586	NC_016831	GCCT	2	8	26114	26121	0 %	25 %	25 %	50 %	378953827
587	NC_016831	GGC	3	9	26182	26190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953827
588	NC_016831	GCC	2	6	26225	26230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953827
589	NC_016831	GCA	2	6	26251	26256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953827
590	NC_016831	GGC	2	6	26281	26286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953827
591	NC_016831	GGC	2	6	26399	26404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953827
592	NC_016831	ACT	2	6	26472	26477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953827
593	NC_016831	GCG	2	6	26496	26501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953827
594	NC_016831	AGCGAC	2	12	26510	26521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953827
595	NC_016831	GCA	2	6	26524	26529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953827
596	NC_016831	ATT	2	6	26608	26613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953827
597	NC_016831	CCTT	2	8	26620	26627	0 %	50 %	0 %	50 %	378953827
598	NC_016831	GAC	2	6	26651	26656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953827
599	NC_016831	CAT	2	6	26749	26754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953827
600	NC_016831	GCC	2	6	26770	26775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953827
601	NC_016831	CCG	2	6	26808	26813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953827
602	NC_016831	GCG	2	6	26817	26822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953827
603	NC_016831	CCG	2	6	26883	26888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953827
604	NC_016831	GGC	2	6	26910	26915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953827
605	NC_016831	GCG	2	6	26924	26929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953827
606	NC_016831	AGT	2	6	26954	26959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953827
607	NC_016831	TCAG	2	8	26979	26986	25 %	25 %	25 %	25 %	378953827
608	NC_016831	GCG	2	6	27075	27080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953827
609	NC_016831	ATA	2	6	27144	27149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378953827
610	NC_016831	GAT	2	6	27263	27268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953827
611	NC_016831	ATT	2	6	27345	27350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953827
612	NC_016831	TTA	2	6	27358	27363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953827
613	NC_016831	AGG	2	6	27368	27373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378953827
614	NC_016831	ATCA	2	8	27392	27399	50 %	25 %	0 %	25 %	378953827
615	NC_016831	TTA	2	6	27426	27431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953827
616	NC_016831	CAGC	2	8	27436	27443	25 %	0 %	25 %	50 %	378953827
617	NC_016831	TGA	2	6	27460	27465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953827
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619	NC_016831	ACA	2	6	27531	27536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378953827
620	NC_016831	GAT	2	6	27620	27625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953827
621	NC_016831	CTG	2	6	27719	27724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953827
622	NC_016831	ACA	2	6	27744	27749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378953827
623	NC_016831	GCG	2	6	27786	27791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953827
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625	NC_016831	GCG	2	6	27888	27893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953827
626	NC_016831	TGG	2	6	27897	27902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953827
627	NC_016831	AGCC	2	8	27926	27933	25 %	0 %	25 %	50 %	378953827
628	NC_016831	CG	3	6	28015	28020	0 %	0 %	50 %	50 %	378953827
629	NC_016831	GGT	2	6	28030	28035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953827
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631	NC_016831	TGA	2	6	28093	28098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953827
632	NC_016831	TGA	2	6	28108	28113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953827
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