MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016831	GCG	2	6	279036	279041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954043
6002	NC_016831	GGC	2	6	279094	279099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954043
6003	NC_016831	ATG	2	6	279167	279172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954043
6004	NC_016831	CGG	2	6	279222	279227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954043
6005	NC_016831	TGC	2	6	279231	279236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954043
6006	NC_016831	GATT	2	8	279255	279262	25 %	50 %	25 %	0 %	378954043
6007	NC_016831	AAG	2	6	279297	279302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954043
6008	NC_016831	TGA	2	6	279364	279369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954043
6009	NC_016831	TGA	2	6	279424	279429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954043
6010	NC_016831	GATG	2	8	279478	279485	25 %	25 %	50 %	0 %	378954043
6011	NC_016831	CGC	2	6	279517	279522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954043
6012	NC_016831	TGG	2	6	279525	279530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954043
6013	NC_016831	TGA	2	6	279541	279546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954043
6014	NC_016831	GTG	3	9	279554	279562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954043
6015	NC_016831	A	6	6	279564	279569	100 %	0 %	0 %	0 %	378954043
6016	NC_016831	CTG	2	6	279584	279589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954043
6017	NC_016831	GCT	2	6	279631	279636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954043
6018	NC_016831	TGC	2	6	279804	279809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954043
6019	NC_016831	GAT	2	6	279832	279837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954043
6020	NC_016831	CTG	2	6	280013	280018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954043
6021	NC_016831	TGCTC	2	10	280020	280029	0 %	40 %	20 %	40 %	378954043
6022	NC_016831	TCA	2	6	280205	280210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954044
6023	NC_016831	TCCCT	2	10	280367	280376	0 %	40 %	0 %	60 %	378954044
6024	NC_016831	T	6	6	280526	280531	0 %	100 %	0 %	0 %	378954044
6025	NC_016831	CT	3	6	280667	280672	0 %	50 %	0 %	50 %	378954045
6026	NC_016831	GCG	2	6	280698	280703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954045
6027	NC_016831	TCA	2	6	280786	280791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954045
6028	NC_016831	GC	3	6	280925	280930	0 %	0 %	50 %	50 %	378954045
6029	NC_016831	GCA	2	6	280981	280986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954045
6030	NC_016831	CTG	2	6	281012	281017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954045
6031	NC_016831	CCGG	2	8	281039	281046	0 %	0 %	50 %	50 %	378954045
6032	NC_016831	CTT	2	6	281090	281095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954045
6033	NC_016831	GA	3	6	281107	281112	50 %	0 %	50 %	0 %	378954045
6034	NC_016831	T	6	6	281203	281208	0 %	100 %	0 %	0 %	378954045
6035	NC_016831	GC	4	8	281215	281222	0 %	0 %	50 %	50 %	378954045
6036	NC_016831	GCA	2	6	281233	281238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954045
6037	NC_016831	GCT	2	6	281302	281307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954045
6038	NC_016831	CGG	2	6	281346	281351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954045
6039	NC_016831	CT	3	6	281366	281371	0 %	50 %	0 %	50 %	378954045
6040	NC_016831	CGG	2	6	281396	281401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954045
6041	NC_016831	GCG	2	6	281402	281407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954045
6042	NC_016831	GCTG	2	8	281418	281425	0 %	25 %	50 %	25 %	378954045
6043	NC_016831	AGG	2	6	281478	281483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378954045
6044	NC_016831	TGGCGC	2	12	281484	281495	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378954045
6045	NC_016831	CGA	2	6	281497	281502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954045
6046	NC_016831	TGG	2	6	281561	281566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954045
6047	NC_016831	ACA	2	6	281584	281589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954045
6048	NC_016831	ACG	2	6	281594	281599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954045
6049	NC_016831	CTGC	2	8	281633	281640	0 %	25 %	25 %	50 %	378954045
6050	NC_016831	GGC	2	6	281669	281674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954045
6051	NC_016831	GAA	2	6	281696	281701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954045
6052	NC_016831	CGA	2	6	281807	281812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954045
6053	NC_016831	GTT	3	9	281824	281832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954045
6054	NC_016831	AGC	2	6	281884	281889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954045
6055	NC_016831	AGA	2	6	281890	281895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954045
6056	NC_016831	AAG	2	6	281898	281903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954045
6057	NC_016831	GCGCT	2	10	281932	281941	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6058	NC_016831	CAC	2	6	281989	281994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_016831	CAA	2	6	282002	282007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_016831	ATG	2	6	282199	282204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954046
6061	NC_016831	TCAT	2	8	282260	282267	25 %	50 %	0 %	25 %	378954047
6062	NC_016831	GCA	2	6	282297	282302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954047
6063	NC_016831	GCC	2	6	282345	282350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954047
6064	NC_016831	CCT	2	6	282465	282470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6065	NC_016831	CGT	2	6	282687	282692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954048
6066	NC_016831	ATG	2	6	282775	282780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954048
6067	NC_016831	TGA	2	6	282810	282815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954048
6068	NC_016831	ATC	2	6	282878	282883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954048
6069	NC_016831	GCGA	2	8	282952	282959	25 %	0 %	50 %	25 %	378954048
6070	NC_016831	GCG	2	6	282988	282993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954048
6071	NC_016831	TGG	2	6	283000	283005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954048
6072	NC_016831	CAG	2	6	283006	283011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954048
6073	NC_016831	GC	3	6	283025	283030	0 %	0 %	50 %	50 %	378954048
6074	NC_016831	CGA	2	6	283118	283123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954048
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6076	NC_016831	CG	3	6	283260	283265	0 %	0 %	50 %	50 %	378954049
6077	NC_016831	GGT	2	6	283275	283280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954049
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6079	NC_016831	GCCA	2	8	283374	283381	25 %	0 %	25 %	50 %	378954049
6080	NC_016831	GAT	2	6	283395	283400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954049
6081	NC_016831	TCATTA	2	12	283405	283416	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378954049
6082	NC_016831	CGC	2	6	283548	283553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954049
6083	NC_016831	TCT	2	6	283575	283580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954049
6084	NC_016831	TCG	2	6	283604	283609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954049
6085	NC_016831	TAA	2	6	283716	283721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954050
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6087	NC_016831	GCA	2	6	283776	283781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954050
6088	NC_016831	GCG	2	6	283790	283795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954050
6089	NC_016831	TGC	2	6	283796	283801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954050
6090	NC_016831	TGA	2	6	283862	283867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954050
6091	NC_016831	GAA	2	6	283891	283896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954050
6092	NC_016831	TAT	2	6	283978	283983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954050
6093	NC_016831	CG	3	6	283984	283989	0 %	0 %	50 %	50 %	378954050
6094	NC_016831	GTAT	3	12	284105	284116	25 %	50 %	25 %	0 %	378954050
6095	NC_016831	GCG	2	6	284128	284133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954050
6096	NC_016831	TGC	2	6	284234	284239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954050
6097	NC_016831	CACT	2	8	284346	284353	25 %	25 %	0 %	50 %	378954050
6098	NC_016831	CAA	2	6	284415	284420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_016831	TCG	2	6	284520	284525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954051
6100	NC_016831	GTC	2	6	284615	284620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954051
6101	NC_016831	GC	4	8	284641	284648	0 %	0 %	50 %	50 %	378954051
6102	NC_016831	AGC	2	6	284818	284823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954051
6103	NC_016831	CAA	2	6	284995	285000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954051
6104	NC_016831	AGT	2	6	285037	285042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954051
6105	NC_016831	GGC	2	6	285083	285088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954051
6106	NC_016831	CGAT	2	8	285096	285103	25 %	25 %	25 %	25 %	378954051
6107	NC_016831	ATTA	2	8	285152	285159	50 %	50 %	0 %	0 %	378954051
6108	NC_016831	TCT	2	6	285171	285176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954051
6109	NC_016831	TTCA	2	8	285230	285237	25 %	50 %	0 %	25 %	378954051
6110	NC_016831	CGC	2	6	285247	285252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954051
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6113	NC_016831	CAG	2	6	285302	285307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954051
6114	NC_016831	T	6	6	285319	285324	0 %	100 %	0 %	0 %	378954051
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6117	NC_016831	GC	3	6	285411	285416	0 %	0 %	50 %	50 %	378954051
6118	NC_016831	GCG	2	6	285424	285429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954051
6119	NC_016831	CGC	2	6	285496	285501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954051
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6121	NC_016831	CG	3	6	285566	285571	0 %	0 %	50 %	50 %	378954051
6122	NC_016831	TCA	2	6	285676	285681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954051
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6124	NC_016831	TCA	2	6	285723	285728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954051
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6246	NC_016831	GCA	2	6	291614	291619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6248	NC_016831	CAG	2	6	291661	291666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6249	NC_016831	G	6	6	291808	291813	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6250	NC_016831	GGA	2	6	291852	291857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6372	NC_016831	GA	3	6	298852	298857	50 %	0 %	50 %	0 %	378954061
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6376	NC_016831	TCCAGA	2	12	299136	299147	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378954062
6377	NC_016831	TTG	2	6	299169	299174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954062
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6499	NC_016831	GGC	2	6	305068	305073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954065
6500	NC_016831	ATG	2	6	305132	305137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954065

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