MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_016831	CGC	2	6	253852	253857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954022
5503	NC_016831	CAG	2	6	253898	253903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954022
5504	NC_016831	ACC	2	6	253923	253928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954022
5505	NC_016831	CG	3	6	253982	253987	0 %	0 %	50 %	50 %	378954022
5506	NC_016831	CCA	2	6	254014	254019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954022
5507	NC_016831	CGAG	2	8	254026	254033	25 %	0 %	50 %	25 %	378954022
5508	NC_016831	GCC	2	6	254087	254092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954022
5509	NC_016831	GCT	2	6	254096	254101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954022
5510	NC_016831	TGG	2	6	254145	254150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954022
5511	NC_016831	GGC	2	6	254174	254179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954022
5512	NC_016831	CAG	2	6	254258	254263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954022
5513	NC_016831	CAGA	2	8	254299	254306	50 %	0 %	25 %	25 %	378954022
5514	NC_016831	CAG	2	6	254312	254317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954022
5515	NC_016831	CGTA	2	8	254330	254337	25 %	25 %	25 %	25 %	378954022
5516	NC_016831	ATA	2	6	254368	254373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954022
5517	NC_016831	CAG	2	6	254378	254383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954022
5518	NC_016831	CGC	2	6	254467	254472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954022
5519	NC_016831	GCC	2	6	254480	254485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954022
5520	NC_016831	TTCGG	2	10	254564	254573	0 %	40 %	40 %	20 %	378954022
5521	NC_016831	CCAG	2	8	254620	254627	25 %	0 %	25 %	50 %	378954022
5522	NC_016831	GC	3	6	254676	254681	0 %	0 %	50 %	50 %	378954022
5523	NC_016831	AGGG	2	8	254711	254718	25 %	0 %	75 %	0 %	378954022
5524	NC_016831	CT	3	6	254904	254909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_016831	GCC	2	6	254911	254916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5526	NC_016831	ATT	2	6	254998	255003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954023
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5529	NC_016831	GAT	2	6	255014	255019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954023
5530	NC_016831	ACG	2	6	255213	255218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954023
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5533	NC_016831	TTC	2	6	255254	255259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954023
5534	NC_016831	CCTTCG	2	12	255312	255323	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378954023
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5537	NC_016831	CGA	2	6	255448	255453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954023
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5539	NC_016831	AGGC	2	8	255615	255622	25 %	0 %	50 %	25 %	378954023
5540	NC_016831	GTT	2	6	255634	255639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954023
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5543	NC_016831	GAT	2	6	255814	255819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_016831	AAT	2	6	255826	255831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_016831	TCAG	2	8	255854	255861	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5546	NC_016831	GT	3	6	255916	255921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_016831	T	6	6	255930	255935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_016831	ACTG	2	8	255946	255953	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5549	NC_016831	GCC	2	6	255983	255988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_016831	CAA	2	6	256032	256037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_016831	GC	3	6	256071	256076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5552	NC_016831	AC	3	6	256102	256107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5553	NC_016831	AAC	2	6	256140	256145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_016831	AC	4	8	256144	256151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5555	NC_016831	GC	3	6	256341	256346	0 %	0 %	50 %	50 %	378954024
5556	NC_016831	CAT	2	6	256360	256365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954024
5557	NC_016831	CTGAA	2	10	256407	256416	40 %	20 %	20 %	20 %	378954024
5558	NC_016831	AAGCG	2	10	256471	256480	40 %	0 %	40 %	20 %	378954024
5559	NC_016831	GCT	2	6	256490	256495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954024
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5562	NC_016831	AAGA	2	8	256634	256641	75 %	0 %	25 %	0 %	378954024
5563	NC_016831	AAC	2	6	256772	256777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954024
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5567	NC_016831	GTA	2	6	257124	257129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5589	NC_016831	GAAA	2	8	258214	258221	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5605	NC_016831	TG	3	6	259047	259052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_016831	GTCTG	2	10	259056	259065	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5607	NC_016831	CTG	2	6	259200	259205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954027
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5653	NC_016831	T	6	6	261113	261118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5654	NC_016831	A	6	6	261291	261296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5657	NC_016831	GTCC	2	8	261443	261450	0 %	25 %	25 %	50 %	378954029
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5678	NC_016831	TTG	2	6	262287	262292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954030
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5714	NC_016831	TTAG	2	8	264301	264308	25 %	50 %	25 %	0 %	378954032
5715	NC_016831	GAA	2	6	264309	264314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954032
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5720	NC_016831	CTC	2	6	264453	264458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5731	NC_016831	CTA	2	6	265010	265015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954033
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5733	NC_016831	CG	3	6	265285	265290	0 %	0 %	50 %	50 %	378954033
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5740	NC_016831	CAA	2	6	265841	265846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954033
5741	NC_016831	TACGG	2	10	265851	265860	20 %	20 %	40 %	20 %	378954033
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5744	NC_016831	TGA	2	6	266027	266032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954033
5745	NC_016831	ACA	2	6	266059	266064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954033
5746	NC_016831	CGAT	2	8	266185	266192	25 %	25 %	25 %	25 %	378954033
5747	NC_016831	GGT	2	6	266289	266294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954033
5748	NC_016831	TAT	2	6	266346	266351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954033
5749	NC_016831	TGA	2	6	266378	266383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954033
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5755	NC_016831	TCT	2	6	266677	266682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954033
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5760	NC_016831	TCG	2	6	267199	267204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954034
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5772	NC_016831	TCG	2	6	267792	267797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954035
5773	NC_016831	A	6	6	267799	267804	100 %	0 %	0 %	0 %	378954035
5774	NC_016831	TCCAG	2	10	267885	267894	20 %	20 %	20 %	40 %	378954035
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5783	NC_016831	CTG	2	6	268317	268322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954035
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5785	NC_016831	TGA	2	6	268339	268344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954035
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5787	NC_016831	TTA	2	6	268462	268467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5802	NC_016831	GGTA	2	8	269344	269351	25 %	25 %	50 %	0 %	378954037
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5989	NC_016831	TCA	2	6	278338	278343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954043
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5991	NC_016831	CGC	2	6	278373	278378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954043
5992	NC_016831	AAG	2	6	278409	278414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954043
5993	NC_016831	T	6	6	278495	278500	0 %	100 %	0 %	0 %	378954043
5994	NC_016831	GGC	2	6	278501	278506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954043
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