MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016831	CTGC	2	8	231028	231035	0 %	25 %	25 %	50 %	378954003
5002	NC_016831	GCG	3	9	231049	231057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954003
5003	NC_016831	CTG	2	6	231061	231066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954003
5004	NC_016831	ATT	2	6	231067	231072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954003
5005	NC_016831	GCC	2	6	231079	231084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954003
5006	NC_016831	GCG	2	6	231089	231094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954003
5007	NC_016831	CGC	2	6	231101	231106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954003
5008	NC_016831	TGC	2	6	231152	231157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954003
5009	NC_016831	ATG	2	6	231160	231165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954003
5010	NC_016831	GCG	2	6	231176	231181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954003
5011	NC_016831	CGC	2	6	231301	231306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954003
5012	NC_016831	GCG	2	6	231329	231334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954003
5013	NC_016831	CG	5	10	231339	231348	0 %	0 %	50 %	50 %	378954003
5014	NC_016831	GCT	2	6	231381	231386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954003
5015	NC_016831	GGC	2	6	231393	231398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954003
5016	NC_016831	CGA	2	6	231416	231421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954003
5017	NC_016831	CGG	2	6	231590	231595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954003
5018	NC_016831	GC	3	6	231617	231622	0 %	0 %	50 %	50 %	378954003
5019	NC_016831	A	8	8	231659	231666	100 %	0 %	0 %	0 %	378954003
5020	NC_016831	CAATAT	2	12	231723	231734	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378954004
5021	NC_016831	CTGTC	2	10	231790	231799	0 %	40 %	20 %	40 %	378954004
5022	NC_016831	AAG	2	6	231836	231841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954004
5023	NC_016831	GC	3	6	231885	231890	0 %	0 %	50 %	50 %	378954004
5024	NC_016831	TGA	2	6	231943	231948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_016831	AAT	2	6	231971	231976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_016831	TAA	3	9	232065	232073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_016831	ATA	2	6	232094	232099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_016831	ATT	2	6	232104	232109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_016831	T	7	7	232108	232114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_016831	TAA	2	6	232122	232127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_016831	A	6	6	232126	232131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_016831	AAAT	2	8	232143	232150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_016831	A	7	7	232169	232175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_016831	T	6	6	232188	232193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_016831	T	8	8	232195	232202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_016831	AAAT	2	8	232220	232227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_016831	TA	3	6	232243	232248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_016831	T	7	7	232270	232276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_016831	T	7	7	232299	232305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_016831	CTTG	2	8	232317	232324	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_016831	TTTG	2	8	232326	232333	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_016831	T	6	6	232334	232339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_016831	TAT	2	6	232356	232361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_016831	TGA	2	6	232369	232374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_016831	TAAA	2	8	232380	232387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_016831	A	6	6	232385	232390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_016831	CG	3	6	232427	232432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_016831	TTAT	2	8	232442	232449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_016831	GTT	2	6	232456	232461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_016831	CTT	2	6	232464	232469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_016831	ATATA	2	10	232503	232512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_016831	CTA	2	6	232516	232521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_016831	TAA	2	6	232584	232589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_016831	CAG	2	6	232606	232611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954005
5055	NC_016831	TGC	2	6	232625	232630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954005
5056	NC_016831	TGC	2	6	232664	232669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954005
5057	NC_016831	CGA	2	6	232739	232744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954005
5058	NC_016831	CAC	2	6	232847	232852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954005
5059	NC_016831	AAG	2	6	232858	232863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954005
5060	NC_016831	CGG	3	9	232934	232942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954005
5061	NC_016831	ACC	2	6	232975	232980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954005
5062	NC_016831	GCG	3	9	233043	233051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954005
5063	NC_016831	CAG	2	6	233123	233128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954005
5064	NC_016831	ATC	2	6	233167	233172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_016831	A	7	7	233207	233213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_016831	TA	3	6	233219	233224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_016831	A	6	6	233257	233262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_016831	GTG	2	6	233287	233292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_016831	GAT	2	6	233374	233379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_016831	TC	3	6	233391	233396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5071	NC_016831	ATC	2	6	233435	233440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_016831	TTA	2	6	233483	233488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_016831	ATA	2	6	233501	233506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_016831	GCT	2	6	233553	233558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_016831	ATT	2	6	233680	233685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_016831	TAT	2	6	233759	233764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_016831	ATG	2	6	233804	233809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_016831	GGTG	2	8	233844	233851	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_016831	GC	3	6	233874	233879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5080	NC_016831	GGCG	2	8	233981	233988	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5081	NC_016831	GGC	2	6	234067	234072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_016831	CGA	2	6	234084	234089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_016831	AT	3	6	234128	234133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_016831	GC	3	6	234142	234147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5085	NC_016831	GCGG	2	8	234176	234183	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5086	NC_016831	GAA	2	6	234271	234276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_016831	GGC	2	6	234400	234405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_016831	CCT	2	6	234425	234430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5089	NC_016831	CGG	2	6	234459	234464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_016831	GCT	2	6	234522	234527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_016831	TGA	2	6	234642	234647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_016831	GAA	2	6	234688	234693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_016831	TGA	2	6	234969	234974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_016831	CAA	2	6	235008	235013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_016831	ACA	3	9	235049	235057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_016831	CG	3	6	235120	235125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_016831	TCA	2	6	235158	235163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_016831	CGG	2	6	235221	235226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_016831	GCACC	2	10	235275	235284	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5100	NC_016831	CGG	2	6	235293	235298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_016831	TGG	2	6	235310	235315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_016831	TA	3	6	235364	235369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_016831	ACT	2	6	235409	235414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_016831	CGC	2	6	235516	235521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5105	NC_016831	A	6	6	235540	235545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_016831	GGC	2	6	235573	235578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_016831	CGC	2	6	235580	235585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_016831	ACA	2	6	235604	235609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_016831	GCG	2	6	235720	235725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_016831	TGC	2	6	235766	235771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_016831	TCA	2	6	235789	235794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_016831	GCG	2	6	235845	235850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_016831	CT	3	6	235876	235881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5114	NC_016831	ATG	2	6	235920	235925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954006
5115	NC_016831	TGC	2	6	235957	235962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954006
5116	NC_016831	GGC	2	6	235971	235976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954006
5117	NC_016831	GCC	2	6	235992	235997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954006
5118	NC_016831	TCACC	2	10	236128	236137	20 %	20 %	0 %	60 %	378954006
5119	NC_016831	TCG	2	6	236143	236148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954006
5120	NC_016831	T	6	6	236245	236250	0 %	100 %	0 %	0 %	378954006
5121	NC_016831	CCG	2	6	236271	236276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954006
5122	NC_016831	T	6	6	236329	236334	0 %	100 %	0 %	0 %	378954006
5123	NC_016831	GCA	2	6	236366	236371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954006
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5126	NC_016831	GC	3	6	236596	236601	0 %	0 %	50 %	50 %	378954006
5127	NC_016831	ACA	2	6	236629	236634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954006
5128	NC_016831	GCA	2	6	236763	236768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954007
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5130	NC_016831	CGG	2	6	236834	236839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954007
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5246	NC_016831	CTTC	2	8	242438	242445	0 %	50 %	0 %	50 %	378954012
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5254	NC_016831	TTGG	2	8	242932	242939	0 %	50 %	50 %	0 %	378954013
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5358	NC_016831	C	6	6	247917	247922	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5359	NC_016831	TGCTC	2	10	247995	248004	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5361	NC_016831	TGGC	3	12	248019	248030	0 %	25 %	50 %	25 %	378954018
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5367	NC_016831	GT	3	6	248339	248344	0 %	50 %	50 %	0 %	378954018
5368	NC_016831	ATG	2	6	248357	248362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954018
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5372	NC_016831	GGC	2	6	248512	248517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954018
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5377	NC_016831	ATC	2	6	248694	248699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954018
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5380	NC_016831	GC	3	6	248816	248821	0 %	0 %	50 %	50 %	378954018
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5389	NC_016831	AT	3	6	249210	249215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5390	NC_016831	AC	3	6	249255	249260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5401	NC_016831	CCA	2	6	249709	249714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5402	NC_016831	A	7	7	249723	249729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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