MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016831	GTT	2	6	209125	209130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_016831	GCTG	2	8	209187	209194	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4503	NC_016831	TATTGA	2	12	209373	209384	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_016831	CG	3	6	209499	209504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4505	NC_016831	TGC	2	6	209526	209531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_016831	AC	3	6	209542	209547	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4507	NC_016831	AGCGC	2	10	209548	209557	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4508	NC_016831	ATAA	2	8	209559	209566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_016831	GTTT	2	8	209626	209633	0 %	75 %	25 %	0 %	378953984
4510	NC_016831	TGA	2	6	209663	209668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953984
4511	NC_016831	GGC	3	9	209691	209699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953984
4512	NC_016831	ATA	2	6	209790	209795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378953984
4513	NC_016831	TTC	2	6	209806	209811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953984
4514	NC_016831	GTGTT	2	10	209932	209941	0 %	60 %	40 %	0 %	378953984
4515	NC_016831	TGC	2	6	209954	209959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953984
4516	NC_016831	CCAG	2	8	209978	209985	25 %	0 %	25 %	50 %	378953984
4517	NC_016831	GCC	2	6	210015	210020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953984
4518	NC_016831	GTA	2	6	210035	210040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953984
4519	NC_016831	CAA	2	6	210268	210273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378953984
4520	NC_016831	TGA	2	6	210303	210308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_016831	CCA	2	6	210341	210346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_016831	GCGG	2	8	210425	210432	0 %	0 %	75 %	25 %	378953985
4523	NC_016831	CTG	2	6	210463	210468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953985
4524	NC_016831	CAT	2	6	210562	210567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953985
4525	NC_016831	GC	3	6	210617	210622	0 %	0 %	50 %	50 %	378953985
4526	NC_016831	CTG	2	6	210630	210635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953985
4527	NC_016831	AG	3	6	210711	210716	50 %	0 %	50 %	0 %	378953985
4528	NC_016831	TTC	2	6	210722	210727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953985
4529	NC_016831	GCG	2	6	210828	210833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953985
4530	NC_016831	GGC	2	6	210848	210853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953985
4531	NC_016831	AGTG	2	8	210863	210870	25 %	25 %	50 %	0 %	378953985
4532	NC_016831	GAT	2	6	210994	210999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_016831	GAA	2	6	211011	211016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_016831	AT	4	8	211050	211057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_016831	ATT	2	6	211065	211070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_016831	GTTT	2	8	211080	211087	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_016831	GCT	2	6	211134	211139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_016831	AAT	2	6	211152	211157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_016831	T	7	7	211163	211169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_016831	A	6	6	211174	211179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_016831	GT	3	6	211194	211199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_016831	A	7	7	211208	211214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_016831	CAT	2	6	211223	211228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_016831	GGA	2	6	211247	211252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_016831	AAG	2	6	211322	211327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378953986
4546	NC_016831	ATG	2	6	211397	211402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953986
4547	NC_016831	TG	3	6	211401	211406	0 %	50 %	50 %	0 %	378953986
4548	NC_016831	CGGCG	2	10	211462	211471	0 %	0 %	60 %	40 %	378953986
4549	NC_016831	TGA	2	6	211491	211496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953986
4550	NC_016831	GGA	2	6	211549	211554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378953986
4551	NC_016831	GC	3	6	211617	211622	0 %	0 %	50 %	50 %	378953986
4552	NC_016831	CAG	3	9	211646	211654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953986
4553	NC_016831	TGC	2	6	211674	211679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953986
4554	NC_016831	GAC	2	6	211711	211716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_016831	T	6	6	211738	211743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_016831	AT	3	6	211757	211762	50 %	50 %	0 %	0 %	378953987
4557	NC_016831	GTT	2	6	211773	211778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953987
4558	NC_016831	ACG	2	6	211842	211847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953987
4559	NC_016831	GCC	2	6	211854	211859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953987
4560	NC_016831	ATT	2	6	211945	211950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953987
4561	NC_016831	TGG	2	6	212140	212145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953987
4562	NC_016831	ATT	2	6	212163	212168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953987
4563	NC_016831	GGCT	2	8	212224	212231	0 %	25 %	50 %	25 %	378953987
4564	NC_016831	ATC	2	6	212284	212289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953987
4565	NC_016831	TGA	2	6	212300	212305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953987
4566	NC_016831	CCA	2	6	212332	212337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953987
4567	NC_016831	TTCGG	2	10	212342	212351	0 %	40 %	40 %	20 %	378953987
4568	NC_016831	GGA	2	6	212417	212422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378953987
4569	NC_016831	CG	3	6	212436	212441	0 %	0 %	50 %	50 %	378953987
4570	NC_016831	GC	4	8	212451	212458	0 %	0 %	50 %	50 %	378953987
4571	NC_016831	GGT	2	6	212459	212464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953987
4572	NC_016831	TAT	2	6	212549	212554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953987
4573	NC_016831	T	6	6	212669	212674	0 %	100 %	0 %	0 %	378953987
4574	NC_016831	TCG	2	6	212693	212698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953987
4575	NC_016831	TA	3	6	212707	212712	50 %	50 %	0 %	0 %	378953987
4576	NC_016831	ATA	2	6	212725	212730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378953987
4577	NC_016831	CGG	2	6	212754	212759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953987
4578	NC_016831	TCTT	2	8	212792	212799	0 %	75 %	0 %	25 %	378953987
4579	NC_016831	AGC	2	6	212834	212839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953987
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4581	NC_016831	TGC	2	6	212908	212913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953987
4582	NC_016831	CTT	2	6	213086	213091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953988
4583	NC_016831	GCC	2	6	213151	213156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953988
4584	NC_016831	GAT	2	6	213171	213176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953988
4585	NC_016831	CTTGC	2	10	213351	213360	0 %	40 %	20 %	40 %	378953988
4586	NC_016831	CTT	2	6	213380	213385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_016831	GGC	3	9	213526	213534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953989
4588	NC_016831	GTC	2	6	213601	213606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953989
4589	NC_016831	TTCA	2	8	213622	213629	25 %	50 %	0 %	25 %	378953989
4590	NC_016831	GGCAAT	2	12	213640	213651	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378953989
4591	NC_016831	TCA	2	6	213702	213707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953989
4592	NC_016831	GCT	2	6	213735	213740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953989
4593	NC_016831	TGAGC	2	10	213763	213772	20 %	20 %	40 %	20 %	378953989
4594	NC_016831	AAT	2	6	213793	213798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378953989
4595	NC_016831	CGA	2	6	213807	213812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953989
4596	NC_016831	CCA	2	6	213837	213842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953989
4597	NC_016831	CGC	2	6	213939	213944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953989
4598	NC_016831	TGG	2	6	213978	213983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953989
4599	NC_016831	ACGT	2	8	214001	214008	25 %	25 %	25 %	25 %	378953989
4600	NC_016831	CAC	2	6	214174	214179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378953989
4601	NC_016831	CGT	2	6	214221	214226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953989
4602	NC_016831	TGG	2	6	214239	214244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953989
4603	NC_016831	GAC	2	6	214278	214283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953989
4604	NC_016831	GCA	2	6	214296	214301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953989
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4606	NC_016831	TGA	2	6	214348	214353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_016831	GCGCT	2	10	214366	214375	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4608	NC_016831	CGCGT	2	10	214418	214427	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4609	NC_016831	TTC	2	6	214467	214472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953990
4610	NC_016831	CTG	2	6	214509	214514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953990
4611	NC_016831	CGG	2	6	214517	214522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953990
4612	NC_016831	CCG	2	6	214576	214581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953990
4613	NC_016831	GCCGAT	2	12	214638	214649	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378953990
4614	NC_016831	GCAC	2	8	214697	214704	25 %	0 %	25 %	50 %	378953990
4615	NC_016831	CCAGCA	2	12	214706	214717	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378953990
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4619	NC_016831	CCAG	2	8	214886	214893	25 %	0 %	25 %	50 %	378953990
4620	NC_016831	GCC	2	6	214896	214901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953990
4621	NC_016831	CGCA	2	8	214926	214933	25 %	0 %	25 %	50 %	378953990
4622	NC_016831	GC	3	6	215015	215020	0 %	0 %	50 %	50 %	378953990
4623	NC_016831	GCACG	2	10	215027	215036	20 %	0 %	40 %	40 %	378953990
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4991	NC_016831	GC	3	6	230741	230746	0 %	0 %	50 %	50 %	378954003
4992	NC_016831	CTG	3	9	230749	230757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954003
4993	NC_016831	CT	3	6	230773	230778	0 %	50 %	0 %	50 %	378954003
4994	NC_016831	GCT	2	6	230820	230825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954003
4995	NC_016831	GAA	2	6	230827	230832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954003
4996	NC_016831	GGC	2	6	230862	230867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954003
4997	NC_016831	GGCG	2	8	230874	230881	0 %	0 %	75 %	25 %	378954003
4998	NC_016831	TGGCGG	2	12	230888	230899	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378954003
4999	NC_016831	ATT	2	6	230905	230910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954003
5000	NC_016831	GTG	2	6	230980	230985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954003

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