MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12 plasmid unnamed

Total Repeats: 3475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016825	ACT	2	6	156857	156862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378963026
3002	NC_016825	GTT	2	6	156868	156873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378963026
3003	NC_016825	GA	3	6	156949	156954	50 %	0 %	50 %	0 %	378963026
3004	NC_016825	CT	3	6	156974	156979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_016825	A	7	7	156984	156990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_016825	ATG	2	6	157033	157038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_016825	CA	3	6	157050	157055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3008	NC_016825	CAA	2	6	157069	157074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_016825	TAA	2	6	157139	157144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_016825	G	7	7	157171	157177	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_016825	TAAA	2	8	157233	157240	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_016825	TTA	2	6	157291	157296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_016825	CGTTTA	2	12	157330	157341	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3014	NC_016825	AC	3	6	157401	157406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_016825	GGC	2	6	157429	157434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378963027
3016	NC_016825	AC	3	6	157445	157450	50 %	0 %	0 %	50 %	378963027
3017	NC_016825	TAA	2	6	157452	157457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378963027
3018	NC_016825	GACA	2	8	157521	157528	50 %	0 %	25 %	25 %	378963027
3019	NC_016825	AGA	2	6	157531	157536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378963027
3020	NC_016825	GCA	2	6	157553	157558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378963027
3021	NC_016825	GGGTT	2	10	157685	157694	0 %	40 %	60 %	0 %	378963027
3022	NC_016825	T	6	6	157693	157698	0 %	100 %	0 %	0 %	378963027
3023	NC_016825	TGG	2	6	157766	157771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378963027
3024	NC_016825	GAAA	2	8	157795	157802	75 %	0 %	25 %	0 %	378963027
3025	NC_016825	GCA	2	6	157832	157837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378963027
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3027	NC_016825	GGA	2	6	157891	157896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378963027
3028	NC_016825	GCAA	2	8	157913	157920	50 %	0 %	25 %	25 %	378963027
3029	NC_016825	AAT	2	6	157925	157930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378963027
3030	NC_016825	ACT	2	6	157975	157980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378963027
3031	NC_016825	ATG	2	6	158012	158017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378963027
3032	NC_016825	AT	3	6	158065	158070	50 %	50 %	0 %	0 %	378963027
3033	NC_016825	TGA	2	6	158103	158108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378963028
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3035	NC_016825	ATG	2	6	158236	158241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378963028
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3038	NC_016825	ACAA	2	8	158324	158331	75 %	0 %	0 %	25 %	378963028
3039	NC_016825	GAA	2	6	158347	158352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378963028
3040	NC_016825	TC	3	6	158369	158374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3041	NC_016825	TAA	2	6	158388	158393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_016825	GGT	2	6	158486	158491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_016825	TGAT	2	8	158511	158518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_016825	ATA	2	6	158560	158565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_016825	TATT	2	8	158601	158608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_016825	ACA	2	6	158651	158656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378963029
3047	NC_016825	GAA	2	6	158704	158709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378963029
3048	NC_016825	CTG	2	6	158710	158715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378963029
3049	NC_016825	GTT	3	9	158728	158736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378963029
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3051	NC_016825	GAA	2	6	158752	158757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378963029
3052	NC_016825	AGCTG	2	10	158769	158778	20 %	20 %	40 %	20 %	378963029
3053	NC_016825	TTCT	2	8	158856	158863	0 %	75 %	0 %	25 %	378963029
3054	NC_016825	A	6	6	158884	158889	100 %	0 %	0 %	0 %	378963029
3055	NC_016825	AAC	2	6	158987	158992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378963029
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3057	NC_016825	TTA	2	6	159087	159092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_016825	AAT	2	6	159115	159120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_016825	GTT	2	6	159305	159310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_016825	ACT	2	6	159388	159393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_016825	GTA	2	6	159396	159401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_016825	AATTC	2	10	159412	159421	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3063	NC_016825	AT	3	6	159486	159491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_016825	TTA	2	6	159554	159559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_016825	TGCC	2	8	159560	159567	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3066	NC_016825	CAC	2	6	159606	159611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_016825	C	8	8	159629	159636	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3068	NC_016825	ACAGA	2	10	159637	159646	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3069	NC_016825	GCA	2	6	159684	159689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378963030
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3071	NC_016825	TTCATT	2	12	159723	159734	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378963030
3072	NC_016825	CTT	2	6	159736	159741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378963030
3073	NC_016825	TAA	2	6	159798	159803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378963031
3074	NC_016825	TGC	2	6	159811	159816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378963031
3075	NC_016825	TTG	2	6	159837	159842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378963031
3076	NC_016825	T	7	7	159844	159850	0 %	100 %	0 %	0 %	378963031
3077	NC_016825	A	6	6	159890	159895	100 %	0 %	0 %	0 %	378963031
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3079	NC_016825	GTA	2	6	159976	159981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378963031
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3085	NC_016825	TTA	2	6	160297	160302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378963031
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3092	NC_016825	AC	3	6	160500	160505	50 %	0 %	0 %	50 %	378963031
3093	NC_016825	ACA	2	6	160509	160514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_016825	CAA	2	6	160664	160669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378963032
3095	NC_016825	CTC	2	6	160695	160700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378963032
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3097	NC_016825	TAT	2	6	160727	160732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378963032
3098	NC_016825	GCT	2	6	160755	160760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378963032
3099	NC_016825	CATC	2	8	160790	160797	25 %	25 %	0 %	50 %	378963032
3100	NC_016825	TCA	2	6	160811	160816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378963032
3101	NC_016825	TGT	2	6	160963	160968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_016825	CAGC	2	8	161005	161012	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_016825	GTG	2	6	161025	161030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_016825	ATCA	2	8	161074	161081	50 %	25 %	0 %	25 %	378963033
3105	NC_016825	AGC	2	6	161109	161114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378963033
3106	NC_016825	CGGT	2	8	161119	161126	0 %	25 %	50 %	25 %	378963033
3107	NC_016825	GCC	2	6	161317	161322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378963033
3108	NC_016825	CAC	2	6	161330	161335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378963033
3109	NC_016825	ACCG	2	8	161360	161367	25 %	0 %	25 %	50 %	378963033
3110	NC_016825	CTGCG	2	10	161403	161412	0 %	20 %	40 %	40 %	378963033
3111	NC_016825	TGG	2	6	161486	161491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378963033
3112	NC_016825	GCA	2	6	161605	161610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378963033
3113	NC_016825	CTG	2	6	161619	161624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378963033
3114	NC_016825	CGC	2	6	161645	161650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_016825	GCCA	2	8	161720	161727	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_016825	GTT	2	6	161751	161756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_016825	ATT	2	6	161885	161890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_016825	T	7	7	161904	161910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_016825	GTA	2	6	161924	161929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_016825	GAC	2	6	161936	161941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_016825	CGA	2	6	161961	161966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_016825	ATTC	2	8	161985	161992	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3123	NC_016825	GAA	2	6	162037	162042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_016825	A	6	6	162056	162061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_016825	AG	3	6	162069	162074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_016825	CCA	2	6	162154	162159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378963034
3127	NC_016825	TTC	2	6	162176	162181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378963034
3128	NC_016825	AAT	2	6	162206	162211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378963034
3129	NC_016825	CGC	2	6	162295	162300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378963034
3130	NC_016825	TGA	2	6	162316	162321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378963034
3131	NC_016825	TGT	2	6	162426	162431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378963034
3132	NC_016825	C	6	6	162434	162439	0 %	0 %	0 %	100 %	378963034
3133	NC_016825	GA	3	6	162441	162446	50 %	0 %	50 %	0 %	378963034
3134	NC_016825	TTTCA	2	10	162464	162473	20 %	60 %	0 %	20 %	378963034
3135	NC_016825	TCC	2	6	162501	162506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378963034
3136	NC_016825	CAG	2	6	162551	162556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378963034
3137	NC_016825	CCCTG	2	10	162589	162598	0 %	20 %	20 %	60 %	378963034
3138	NC_016825	CTG	2	6	162617	162622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378963034
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3140	NC_016825	CAG	2	6	162713	162718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378963034
3141	NC_016825	CAG	2	6	162746	162751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378963034
3142	NC_016825	ATA	2	6	162812	162817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378963034
3143	NC_016825	CAA	2	6	163081	163086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378963035
3144	NC_016825	GAG	2	6	163144	163149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378963035
3145	NC_016825	AGT	2	6	163184	163189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378963035
3146	NC_016825	TCCTG	2	10	163206	163215	0 %	40 %	20 %	40 %	378963035
3147	NC_016825	T	6	6	163266	163271	0 %	100 %	0 %	0 %	378963035
3148	NC_016825	CGGT	2	8	163314	163321	0 %	25 %	50 %	25 %	378963035
3149	NC_016825	CGA	2	6	163363	163368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378963035
3150	NC_016825	CATC	2	8	163440	163447	25 %	25 %	0 %	50 %	378963035
3151	NC_016825	GGT	2	6	163450	163455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378963035
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3153	NC_016825	GTCG	2	8	163579	163586	0 %	25 %	50 %	25 %	378963035
3154	NC_016825	ACA	2	6	163623	163628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378963035
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3159	NC_016825	TACA	2	8	163889	163896	50 %	25 %	0 %	25 %	378963036
3160	NC_016825	GC	3	6	163897	163902	0 %	0 %	50 %	50 %	378963036
3161	NC_016825	GCC	2	6	164061	164066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378963036
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3166	NC_016825	AGC	2	6	164193	164198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378963036
3167	NC_016825	CAG	2	6	164288	164293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378963036
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3169	NC_016825	GCAG	2	8	164391	164398	25 %	0 %	50 %	25 %	378963036
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3192	NC_016825	GCCA	2	8	165413	165420	25 %	0 %	25 %	50 %	378963037
3193	NC_016825	AGCATC	2	12	165476	165487	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378963037
3194	NC_016825	TC	3	6	165486	165491	0 %	50 %	0 %	50 %	378963037
3195	NC_016825	GCC	2	6	165545	165550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378963037
3196	NC_016825	C	6	6	165603	165608	0 %	0 %	0 %	100 %	378963037
3197	NC_016825	GCT	2	6	165647	165652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378963037
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3199	NC_016825	GC	3	6	165879	165884	0 %	0 %	50 %	50 %	378963037
3200	NC_016825	CG	3	6	165904	165909	0 %	0 %	50 %	50 %	378963037
3201	NC_016825	GACG	2	8	165912	165919	25 %	0 %	50 %	25 %	378963037
3202	NC_016825	GTC	2	6	165922	165927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378963037
3203	NC_016825	GT	3	6	165943	165948	0 %	50 %	50 %	0 %	378963037
3204	NC_016825	GC	3	6	165954	165959	0 %	0 %	50 %	50 %	378963037
3205	NC_016825	GCC	2	6	165962	165967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378963037
3206	NC_016825	T	6	6	165997	166002	0 %	100 %	0 %	0 %	378963037
3207	NC_016825	ACC	2	6	166088	166093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378963037
3208	NC_016825	CAA	2	6	166114	166119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378963037
3209	NC_016825	CTG	2	6	166153	166158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378963037
3210	NC_016825	CTG	2	6	166171	166176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378963037
3211	NC_016825	TCA	2	6	166230	166235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378963037
3212	NC_016825	GCAG	2	8	166236	166243	25 %	0 %	50 %	25 %	378963037
3213	NC_016825	CCG	2	6	166382	166387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378963038
3214	NC_016825	T	6	6	166408	166413	0 %	100 %	0 %	0 %	378963038
3215	NC_016825	CAC	2	6	166474	166479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378963038
3216	NC_016825	ATC	2	6	166511	166516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378963038
3217	NC_016825	GTG	2	6	166531	166536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378963038
3218	NC_016825	CGC	2	6	166597	166602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378963038
3219	NC_016825	GGT	2	6	166621	166626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378963038
3220	NC_016825	CAA	2	6	166752	166757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378963038
3221	NC_016825	AGT	2	6	166791	166796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378963038
3222	NC_016825	CGC	2	6	166801	166806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378963038
3223	NC_016825	CTC	2	6	166846	166851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378963038
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3225	NC_016825	TGG	2	6	166947	166952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378963038
3226	NC_016825	CAG	2	6	166959	166964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378963038
3227	NC_016825	GCC	2	6	166969	166974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378963038
3228	NC_016825	GC	3	6	167084	167089	0 %	0 %	50 %	50 %	378963038
3229	NC_016825	TGG	2	6	167100	167105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378963038
3230	NC_016825	GAA	2	6	167137	167142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378963038
3231	NC_016825	GCC	2	6	167155	167160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378963038
3232	NC_016825	TCA	2	6	167169	167174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378963038
3233	NC_016825	CCG	2	6	167184	167189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378963038
3234	NC_016825	CTG	2	6	167197	167202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378963038
3235	NC_016825	AAC	2	6	167270	167275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378963038
3236	NC_016825	TTC	2	6	167287	167292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378963038
3237	NC_016825	GCA	2	6	167301	167306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378963038
3238	NC_016825	GCT	2	6	167348	167353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378963038
3239	NC_016825	ACC	2	6	167417	167422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378963038
3240	NC_016825	T	6	6	167434	167439	0 %	100 %	0 %	0 %	378963038
3241	NC_016825	ACC	2	6	167449	167454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378963038
3242	NC_016825	TCA	2	6	167468	167473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378963038
3243	NC_016825	CTG	2	6	167562	167567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378963039
3244	NC_016825	A	6	6	167597	167602	100 %	0 %	0 %	0 %	378963039
3245	NC_016825	AGT	2	6	167670	167675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378963039
3246	NC_016825	CCG	2	6	167685	167690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3247	NC_016825	CTG	2	6	167739	167744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378963040
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3249	NC_016825	ATC	2	6	167886	167891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378963040
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