MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12 plasmid unnamed

Total Repeats: 3475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016825	CAG	2	6	81155	81160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_016825	TA	3	6	81163	81168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_016825	GTTG	2	8	81336	81343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_016825	ACG	2	6	81368	81373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_016825	GACT	2	8	81472	81479	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1506	NC_016825	CAG	2	6	81569	81574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_016825	ACC	2	6	81691	81696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_016825	TCGG	2	8	81749	81756	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1509	NC_016825	GAA	2	6	81758	81763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_016825	GCC	2	6	81784	81789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_016825	CAC	2	6	81898	81903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_016825	T	6	6	82065	82070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_016825	TCT	2	6	82087	82092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_016825	CGT	2	6	82102	82107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_016825	CGT	2	6	82118	82123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962919
1516	NC_016825	GGC	2	6	82268	82273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962919
1517	NC_016825	GGTGT	2	10	82302	82311	0 %	40 %	60 %	0 %	378962919
1518	NC_016825	CCAG	2	8	82315	82322	25 %	0 %	25 %	50 %	378962919
1519	NC_016825	T	7	7	82415	82421	0 %	100 %	0 %	0 %	378962919
1520	NC_016825	GTA	2	6	82476	82481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962919
1521	NC_016825	GTG	2	6	82482	82487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962919
1522	NC_016825	CAG	2	6	82490	82495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962919
1523	NC_016825	CATAGC	2	12	82682	82693	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378962919
1524	NC_016825	TTCA	2	8	82713	82720	25 %	50 %	0 %	25 %	378962919
1525	NC_016825	GTT	2	6	82735	82740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_016825	G	7	7	82779	82785	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016825	CA	3	6	82868	82873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_016825	GAA	2	6	82920	82925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_016825	GAAAT	2	10	82965	82974	60 %	20 %	20 %	0 %	378962920
1530	NC_016825	CTG	2	6	83013	83018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962920
1531	NC_016825	AC	3	6	83065	83070	50 %	0 %	0 %	50 %	378962920
1532	NC_016825	AG	3	6	83100	83105	50 %	0 %	50 %	0 %	378962920
1533	NC_016825	TAC	2	6	83268	83273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962920
1534	NC_016825	CTC	2	6	83392	83397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378962920
1535	NC_016825	CAG	2	6	83552	83557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962920
1536	NC_016825	CCG	2	6	83564	83569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962920
1537	NC_016825	GGT	2	6	83603	83608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962920
1538	NC_016825	GGC	2	6	83618	83623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962920
1539	NC_016825	GGC	2	6	83627	83632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962920
1540	NC_016825	ACATC	2	10	83715	83724	40 %	20 %	0 %	40 %	378962920
1541	NC_016825	TAC	2	6	83976	83981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962920
1542	NC_016825	C	6	6	84064	84069	0 %	0 %	0 %	100 %	378962920
1543	NC_016825	CTA	2	6	84202	84207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962920
1544	NC_016825	TCG	2	6	84208	84213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962920
1545	NC_016825	CGG	2	6	84344	84349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962920
1546	NC_016825	GGT	2	6	84431	84436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962920
1547	NC_016825	TAAC	2	8	84460	84467	50 %	25 %	0 %	25 %	378962920
1548	NC_016825	CCA	2	6	84490	84495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962920
1549	NC_016825	TAA	2	6	84527	84532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962920
1550	NC_016825	ACA	3	9	84655	84663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962920
1551	NC_016825	CGC	2	6	84706	84711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962920
1552	NC_016825	TGT	2	6	84713	84718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962920
1553	NC_016825	CGA	2	6	84794	84799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962920
1554	NC_016825	GCG	2	6	84835	84840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962920
1555	NC_016825	GAT	2	6	84930	84935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962920
1556	NC_016825	TGCGGT	2	12	84956	84967	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378962920
1557	NC_016825	AAC	2	6	85020	85025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962920
1558	NC_016825	A	6	6	85125	85130	100 %	0 %	0 %	0 %	378962920
1559	NC_016825	CGT	2	6	85217	85222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962920
1560	NC_016825	CCA	2	6	85294	85299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962920
1561	NC_016825	AGAA	2	8	85409	85416	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_016825	TAT	2	6	85497	85502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378962921
1563	NC_016825	TGC	2	6	85567	85572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962921
1564	NC_016825	ACC	2	6	85589	85594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962921
1565	NC_016825	CTG	2	6	85623	85628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962921
1566	NC_016825	CCA	2	6	85682	85687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962921
1567	NC_016825	AGA	2	6	85714	85719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962921
1568	NC_016825	GA	3	6	85718	85723	50 %	0 %	50 %	0 %	378962921
1569	NC_016825	G	7	7	85725	85731	0 %	0 %	100 %	0 %	378962921
1570	NC_016825	GAC	2	6	85763	85768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_016825	TG	3	6	85821	85826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_016825	TG	3	6	85834	85839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_016825	CAG	2	6	85840	85845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_016825	CGGG	2	8	85875	85882	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_016825	CTT	2	6	85894	85899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962922
1576	NC_016825	GCT	2	6	85918	85923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962922
1577	NC_016825	TTTC	2	8	85926	85933	0 %	75 %	0 %	25 %	378962922
1578	NC_016825	GTTG	2	8	86022	86029	0 %	50 %	50 %	0 %	378962922
1579	NC_016825	GCCTT	2	10	86108	86117	0 %	40 %	20 %	40 %	378962922
1580	NC_016825	GCA	2	6	86133	86138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962922
1581	NC_016825	CGC	2	6	86253	86258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962922
1582	NC_016825	ATC	2	6	86312	86317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962922
1583	NC_016825	GACT	2	8	86340	86347	25 %	25 %	25 %	25 %	378962922
1584	NC_016825	GCG	2	6	86362	86367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962922
1585	NC_016825	CGT	2	6	86485	86490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962922
1586	NC_016825	CTG	2	6	86694	86699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962923
1587	NC_016825	TGG	2	6	86704	86709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962923
1588	NC_016825	CACGA	2	10	86739	86748	40 %	0 %	20 %	40 %	378962923
1589	NC_016825	CAGC	2	8	86790	86797	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_016825	AAT	2	6	86829	86834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962924
1591	NC_016825	GAGCA	2	10	87012	87021	40 %	0 %	40 %	20 %	378962924
1592	NC_016825	ATT	2	6	87085	87090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378962924
1593	NC_016825	TG	3	6	87110	87115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_016825	GCC	2	6	87138	87143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_016825	GCA	2	6	87176	87181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_016825	TCT	2	6	87223	87228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962925
1597	NC_016825	CGT	2	6	87297	87302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962925
1598	NC_016825	CTC	2	6	87533	87538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378962926
1599	NC_016825	GGT	2	6	87627	87632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962926
1600	NC_016825	AAT	2	6	87672	87677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_016825	GCA	2	6	87839	87844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962927
1602	NC_016825	GTG	2	6	87916	87921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962927
1603	NC_016825	TCT	3	9	87994	88002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962927
1604	NC_016825	AGTC	2	8	88038	88045	25 %	25 %	25 %	25 %	378962927
1605	NC_016825	GGT	2	6	88059	88064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962927
1606	NC_016825	CAG	2	6	88080	88085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962927
1607	NC_016825	CTG	2	6	88095	88100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962927
1608	NC_016825	GCTC	2	8	88109	88116	0 %	25 %	25 %	50 %	378962927
1609	NC_016825	TC	3	6	88139	88144	0 %	50 %	0 %	50 %	378962927
1610	NC_016825	CTTT	2	8	88246	88253	0 %	75 %	0 %	25 %	378962927
1611	NC_016825	CAG	2	6	88298	88303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962927
1612	NC_016825	TAA	2	6	88451	88456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962927
1613	NC_016825	TTG	2	6	88457	88462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962927
1614	NC_016825	AATT	2	8	88479	88486	50 %	50 %	0 %	0 %	378962927
1615	NC_016825	TGA	2	6	88511	88516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_016825	TAA	2	6	88546	88551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_016825	GAAA	2	8	88555	88562	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_016825	T	6	6	88564	88569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_016825	ATA	2	6	88614	88619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_016825	TAA	2	6	88636	88641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_016825	GGC	2	6	88649	88654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962928
1622	NC_016825	AAT	3	9	88659	88667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962928
1623	NC_016825	ACC	2	6	88745	88750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962928
1624	NC_016825	TCAA	2	8	88824	88831	50 %	25 %	0 %	25 %	378962928
1625	NC_016825	GCATG	2	10	88879	88888	20 %	20 %	40 %	20 %	378962928
1626	NC_016825	ACC	2	6	88889	88894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962928
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1628	NC_016825	TCG	2	6	88944	88949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962928
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1630	NC_016825	ACC	2	6	88971	88976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962928
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