MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12 plasmid unnamed

Total Repeats: 3475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016825	ATG	2	6	54224	54229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962884
1002	NC_016825	TTCCAT	2	12	54254	54265	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378962884
1003	NC_016825	TCCT	2	8	54272	54279	0 %	50 %	0 %	50 %	378962884
1004	NC_016825	GTG	2	6	54297	54302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962884
1005	NC_016825	A	6	6	54500	54505	100 %	0 %	0 %	0 %	378962886
1006	NC_016825	CA	3	6	54528	54533	50 %	0 %	0 %	50 %	378962886
1007	NC_016825	GTGAT	2	10	54546	54555	20 %	40 %	40 %	0 %	378962886
1008	NC_016825	GCTG	2	8	54612	54619	0 %	25 %	50 %	25 %	378962886
1009	NC_016825	GGA	2	6	54642	54647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378962886
1010	NC_016825	TCT	2	6	54697	54702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962886
1011	NC_016825	TGGC	2	8	54745	54752	0 %	25 %	50 %	25 %	378962886
1012	NC_016825	AATCTG	2	12	54827	54838	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378962886
1013	NC_016825	ACA	2	6	54841	54846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962886
1014	NC_016825	AGA	2	6	54972	54977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_016825	TAT	2	6	55052	55057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016825	GGCA	2	8	55068	55075	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_016825	AAC	2	6	55085	55090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_016825	CAAAA	2	10	55124	55133	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1019	NC_016825	AAAGC	2	10	55278	55287	60 %	0 %	20 %	20 %	378962887
1020	NC_016825	TCTA	2	8	55296	55303	25 %	50 %	0 %	25 %	378962887
1021	NC_016825	AGT	2	6	55418	55423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962887
1022	NC_016825	TTTCCT	2	12	55448	55459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962887
1023	NC_016825	ATG	2	6	55465	55470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962887
1024	NC_016825	CGGA	2	8	55647	55654	25 %	0 %	50 %	25 %	378962887
1025	NC_016825	TCA	2	6	55669	55674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962887
1026	NC_016825	AAC	2	6	55681	55686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962887
1027	NC_016825	CGG	2	6	55687	55692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962887
1028	NC_016825	CGTC	2	8	55693	55700	0 %	25 %	25 %	50 %	378962887
1029	NC_016825	AAT	2	6	55734	55739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962887
1030	NC_016825	TTC	2	6	55782	55787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962887
1031	NC_016825	CCT	2	6	55861	55866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378962887
1032	NC_016825	TTC	2	6	55986	55991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962887
1033	NC_016825	GCA	2	6	56003	56008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962887
1034	NC_016825	TTG	2	6	56016	56021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962887
1035	NC_016825	ATT	2	6	56053	56058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378962887
1036	NC_016825	ATC	3	9	56103	56111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962887
1037	NC_016825	ATT	2	6	56115	56120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378962887
1038	NC_016825	TCA	2	6	56146	56151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962887
1039	NC_016825	CAT	2	6	56321	56326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962887
1040	NC_016825	ATT	2	6	56373	56378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378962887
1041	NC_016825	ATT	2	6	56403	56408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378962887
1042	NC_016825	ATG	2	6	56410	56415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962887
1043	NC_016825	GCA	2	6	56587	56592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962887
1044	NC_016825	TCA	2	6	56695	56700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962887
1045	NC_016825	CTG	2	6	56765	56770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962887
1046	NC_016825	AGG	2	6	56806	56811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378962887
1047	NC_016825	TTGT	2	8	56907	56914	0 %	75 %	25 %	0 %	378962887
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1050	NC_016825	GAAG	2	8	57382	57389	50 %	0 %	50 %	0 %	378962887
1051	NC_016825	TTCA	2	8	57471	57478	25 %	50 %	0 %	25 %	378962887
1052	NC_016825	ATA	2	6	57489	57494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962887
1053	NC_016825	ACC	2	6	57552	57557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962887
1054	NC_016825	AAT	2	6	57652	57657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962887
1055	NC_016825	CTG	2	6	57672	57677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962887
1056	NC_016825	AAT	2	6	57746	57751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962887
1057	NC_016825	TGA	2	6	57796	57801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962887
1058	NC_016825	TAT	2	6	57815	57820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378962887
1059	NC_016825	GCTGTT	2	12	57895	57906	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378962888
1060	NC_016825	ATC	2	6	58043	58048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962888
1061	NC_016825	AAC	2	6	58271	58276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962888
1062	NC_016825	GTT	2	6	58281	58286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962888
1063	NC_016825	T	7	7	58285	58291	0 %	100 %	0 %	0 %	378962888
1064	NC_016825	CAG	2	6	58300	58305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962888
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1067	NC_016825	TTA	2	6	58503	58508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378962888
1068	NC_016825	GAC	2	6	58518	58523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962888
1069	NC_016825	ACTGC	2	10	58531	58540	20 %	20 %	20 %	40 %	378962888
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1072	NC_016825	GA	3	6	58629	58634	50 %	0 %	50 %	0 %	378962888
1073	NC_016825	TCA	2	6	58635	58640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962888
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1076	NC_016825	TTCAT	2	10	58794	58803	20 %	60 %	0 %	20 %	378962888
1077	NC_016825	GCCA	2	8	58943	58950	25 %	0 %	25 %	50 %	378962889
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1081	NC_016825	TCA	2	6	59169	59174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962889
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1085	NC_016825	TAA	2	6	59308	59313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962889
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1088	NC_016825	CCGT	2	8	59396	59403	0 %	25 %	25 %	50 %	378962889
1089	NC_016825	CTT	2	6	59542	59547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962889
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1095	NC_016825	AGTT	2	8	59848	59855	25 %	50 %	25 %	0 %	378962890
1096	NC_016825	TGC	2	6	59862	59867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962890
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1098	NC_016825	T	6	6	60074	60079	0 %	100 %	0 %	0 %	378962890
1099	NC_016825	GTA	2	6	60081	60086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962890
1100	NC_016825	CAG	2	6	60130	60135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962890
1101	NC_016825	ACTC	2	8	60136	60143	25 %	25 %	0 %	50 %	378962890
1102	NC_016825	T	6	6	60144	60149	0 %	100 %	0 %	0 %	378962890
1103	NC_016825	GTT	2	6	60164	60169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962890
1104	NC_016825	ATT	2	6	60180	60185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_016825	CTG	2	6	60277	60282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962891
1106	NC_016825	TAG	2	6	60299	60304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962891
1107	NC_016825	C	6	6	60323	60328	0 %	0 %	0 %	100 %	378962891
1108	NC_016825	CCT	2	6	60461	60466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378962891
1109	NC_016825	CATTTC	2	12	60489	60500	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378962891
1110	NC_016825	AC	3	6	60596	60601	50 %	0 %	0 %	50 %	378962891
1111	NC_016825	ACGC	2	8	60624	60631	25 %	0 %	25 %	50 %	378962891
1112	NC_016825	CAG	2	6	60651	60656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962891
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1253	NC_016825	TCTTGC	2	12	67825	67836	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378962903
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