MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 101059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4114	NC_016822	TCAA	2	8	199623	199630	50 %	25 %	0 %	25 %	383176774
4115	NC_016822	TCA	2	6	199719	199724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176774
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4117	NC_016822	TCG	2	6	199873	199878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176775
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4119	NC_016822	T	6	6	200028	200033	0 %	100 %	0 %	0 %	383176775
4120	NC_016822	ACG	2	6	200083	200088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176775
4121	NC_016822	GCA	2	6	200111	200116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176775
4122	NC_016822	TTC	2	6	200124	200129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176775
4123	NC_016822	ACGA	2	8	200166	200173	50 %	0 %	25 %	25 %	383176775
4124	NC_016822	CGC	2	6	200208	200213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176775
4125	NC_016822	ATG	2	6	200302	200307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176775
4126	NC_016822	CGA	2	6	200318	200323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176775
4127	NC_016822	CAG	2	6	200400	200405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176775
4128	NC_016822	CAC	2	6	200433	200438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176775
4129	NC_016822	AGGC	2	8	200485	200492	25 %	0 %	50 %	25 %	383176775
4130	NC_016822	GTT	2	6	200504	200509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176775
4131	NC_016822	ATC	2	6	200581	200586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176775
4132	NC_016822	T	6	6	200624	200629	0 %	100 %	0 %	0 %	383176775
4133	NC_016822	TCT	2	6	200635	200640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176775
4134	NC_016822	TTGA	2	8	200647	200654	25 %	50 %	25 %	0 %	383176775
4135	NC_016822	AT	4	8	200697	200704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_016822	CAA	2	6	200824	200829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4137	NC_016822	GC	3	6	200863	200868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4138	NC_016822	AAC	2	6	200929	200934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4139	NC_016822	AC	4	8	200933	200940	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4140	NC_016822	TA	3	6	201013	201018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4141	NC_016822	CAT	2	6	201147	201152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176776
4142	NC_016822	CTGAA	2	10	201194	201203	40 %	20 %	20 %	20 %	383176776
4143	NC_016822	AAGCG	2	10	201258	201267	40 %	0 %	40 %	20 %	383176776
4144	NC_016822	GCT	2	6	201277	201282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176776
4145	NC_016822	TTC	2	6	201298	201303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176776
4146	NC_016822	GCTG	2	8	201314	201321	0 %	25 %	50 %	25 %	383176776
4147	NC_016822	AAGA	2	8	201421	201428	75 %	0 %	25 %	0 %	383176776
4148	NC_016822	AAG	2	6	201551	201556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176776
4149	NC_016822	AAC	2	6	201559	201564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176776
4150	NC_016822	ACG	3	9	201638	201646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176776
4151	NC_016822	TGC	2	6	201681	201686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176776
4152	NC_016822	GAA	2	6	201730	201735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176776
4153	NC_016822	TAA	2	6	201754	201759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176776
4154	NC_016822	GGC	2	6	201799	201804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4155	NC_016822	GAGC	2	8	201850	201857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4156	NC_016822	GCG	2	6	201873	201878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4157	NC_016822	GTA	2	6	201913	201918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4158	NC_016822	ATG	2	6	202071	202076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176777
4159	NC_016822	A	6	6	202083	202088	100 %	0 %	0 %	0 %	383176777
4160	NC_016822	ACTG	2	8	202091	202098	25 %	25 %	25 %	25 %	383176777
4161	NC_016822	AGC	2	6	202157	202162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176777
4162	NC_016822	A	6	6	202164	202169	100 %	0 %	0 %	0 %	383176777
4163	NC_016822	TGC	2	6	202181	202186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176777
4164	NC_016822	CAT	2	6	202226	202231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176777
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4170	NC_016822	TGC	2	6	202532	202537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176777
4171	NC_016822	AAGC	2	8	202538	202545	50 %	0 %	25 %	25 %	383176777
4172	NC_016822	TCA	2	6	202552	202557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176777
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4175	NC_016822	GAA	2	6	202673	202678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176777
4176	NC_016822	CGTT	2	8	202711	202718	0 %	50 %	25 %	25 %	383176777
4177	NC_016822	GCT	2	6	202745	202750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176777
4178	NC_016822	GACT	2	8	202820	202827	25 %	25 %	25 %	25 %	383176777
4179	NC_016822	GCA	2	6	202830	202835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176777
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4182	NC_016822	CTT	2	6	202894	202899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4183	NC_016822	GAAA	2	8	203003	203010	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4184	NC_016822	TGGTG	2	10	203164	203173	0 %	40 %	60 %	0 %	383176778
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4195	NC_016822	AAG	2	6	203712	203717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176778
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4197	NC_016822	ATAA	2	8	203750	203757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4198	NC_016822	TTG	2	6	203812	203817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4199	NC_016822	GC	3	6	203839	203844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4200	NC_016822	AAATA	2	10	203905	203914	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4201	NC_016822	TAA	2	6	203918	203923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4202	NC_016822	TG	4	8	203979	203986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4203	NC_016822	GTCTG	2	10	203990	203999	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4204	NC_016822	CTG	2	6	204134	204139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176779
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4208	NC_016822	GAA	2	6	204347	204352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176779
4209	NC_016822	CGT	2	6	204353	204358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176779
4210	NC_016822	TCGT	2	8	204375	204382	0 %	50 %	25 %	25 %	383176779
4211	NC_016822	CGT	2	6	204422	204427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176779
4212	NC_016822	GAC	2	6	204479	204484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176779
4213	NC_016822	ACTG	2	8	204514	204521	25 %	25 %	25 %	25 %	383176779
4214	NC_016822	TGC	2	6	204523	204528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176779
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4218	NC_016822	GGC	2	6	204635	204640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4219	NC_016822	GCA	2	6	204721	204726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176780
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4230	NC_016822	TTAC	2	8	205221	205228	25 %	50 %	0 %	25 %	383176780
4231	NC_016822	TGG	2	6	205235	205240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176780
4232	NC_016822	CAA	2	6	205273	205278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176780
4233	NC_016822	ATG	2	6	205350	205355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176780
4234	NC_016822	CGCCAG	2	12	205397	205408	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383176780
4235	NC_016822	CAGT	2	8	205434	205441	25 %	25 %	25 %	25 %	383176780
4236	NC_016822	CATGG	2	10	205526	205535	20 %	20 %	40 %	20 %	383176780
4237	NC_016822	CGA	2	6	205669	205674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176780
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4239	NC_016822	CAA	2	6	205722	205727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176780
4240	NC_016822	A	6	6	205771	205776	100 %	0 %	0 %	0 %	383176780
4241	NC_016822	TG	3	6	205797	205802	0 %	50 %	50 %	0 %	383176780
4242	NC_016822	CG	3	6	205829	205834	0 %	0 %	50 %	50 %	383176780
4243	NC_016822	AG	3	6	205890	205895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_016822	AGT	2	6	205952	205957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_016822	T	8	8	205997	206004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4489	NC_016822	TCA	2	6	219260	219265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176791
4490	NC_016822	GTT	2	6	219280	219285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176791
4491	NC_016822	CG	3	6	219288	219293	0 %	0 %	50 %	50 %	383176791
4492	NC_016822	GGC	2	6	219353	219358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176791
4493	NC_016822	TGT	2	6	219368	219373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176791
4494	NC_016822	TGA	2	6	219450	219455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176791
4495	NC_016822	TGA	2	6	219561	219566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176791
4496	NC_016822	CTA	2	6	219633	219638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176791
4497	NC_016822	CG	4	8	219655	219662	0 %	0 %	50 %	50 %	383176791
4498	NC_016822	TC	3	6	219689	219694	0 %	50 %	0 %	50 %	383176791
4499	NC_016822	TTA	2	6	219706	219711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176791
4500	NC_016822	GAA	2	6	219889	219894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176792

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