MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 101059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3509	NC_016822	CTT	2	6	171028	171033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176750
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3744	NC_016822	AACCT	2	10	181210	181219	40 %	20 %	0 %	40 %	383176757
3745	NC_016822	CTG	2	6	181224	181229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176757
3746	NC_016822	CGT	2	6	181243	181248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176757
3747	NC_016822	TGGTC	2	10	181252	181261	0 %	40 %	40 %	20 %	383176757
3748	NC_016822	TCA	2	6	181278	181283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176757
3749	NC_016822	GCA	2	6	181441	181446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176757
3750	NC_016822	CTG	2	6	181485	181490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176757
3751	NC_016822	ACG	2	6	181491	181496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176757
3752	NC_016822	CCG	2	6	181612	181617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176757
3753	NC_016822	ATCG	2	8	181623	181630	25 %	25 %	25 %	25 %	383176757
3754	NC_016822	ACA	2	6	181675	181680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176757
3755	NC_016822	GAT	2	6	181993	181998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176758
3756	NC_016822	TTG	2	6	182012	182017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176758
3757	NC_016822	GCT	2	6	182035	182040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176758
3758	NC_016822	TGG	2	6	182061	182066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176758
3759	NC_016822	TGC	2	6	182085	182090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176758
3760	NC_016822	CGA	2	6	182109	182114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176758
3761	NC_016822	GC	3	6	182133	182138	0 %	0 %	50 %	50 %	383176758
3762	NC_016822	CAC	2	6	182155	182160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176758
3763	NC_016822	TGG	2	6	182205	182210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176758
3764	NC_016822	TGG	2	6	182292	182297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176758
3765	NC_016822	GCG	2	6	182406	182411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176758
3766	NC_016822	GCG	2	6	182439	182444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176758
3767	NC_016822	TGA	2	6	182491	182496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176758
3768	NC_016822	TGGCG	2	10	182497	182506	0 %	20 %	60 %	20 %	383176758
3769	NC_016822	TCGC	2	8	182528	182535	0 %	25 %	25 %	50 %	383176758
3770	NC_016822	GGC	2	6	182542	182547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176758
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3772	NC_016822	GCT	2	6	182575	182580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176758
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3774	NC_016822	GCG	2	6	182650	182655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176758
3775	NC_016822	TTG	2	6	182657	182662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176758
3776	NC_016822	ATC	2	6	182720	182725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176758
3777	NC_016822	TGGA	2	8	182744	182751	25 %	25 %	50 %	0 %	383176758
3778	NC_016822	GCT	2	6	182791	182796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176758
3779	NC_016822	GCA	2	6	182820	182825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176758
3780	NC_016822	GC	3	6	182829	182834	0 %	0 %	50 %	50 %	383176758
3781	NC_016822	GCG	2	6	182901	182906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176758
3782	NC_016822	TGC	2	6	182907	182912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176758
3783	NC_016822	TGG	3	9	182925	182933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176758
3784	NC_016822	GGC	2	6	183025	183030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176758
3785	NC_016822	TGGCGG	2	12	183051	183062	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383176758
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3790	NC_016822	GCG	2	6	183212	183217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176758
3791	NC_016822	CGC	2	6	183241	183246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176758
3792	NC_016822	TGA	2	6	183321	183326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176758
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3798	NC_016822	GAT	2	6	183637	183642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176758
3799	NC_016822	GACG	2	8	183651	183658	25 %	0 %	50 %	25 %	383176758
3800	NC_016822	CA	3	6	183663	183668	50 %	0 %	0 %	50 %	383176758
3801	NC_016822	TGG	2	6	183684	183689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176758
3802	NC_016822	CTG	2	6	183698	183703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176758
3803	NC_016822	TTCCA	2	10	183738	183747	20 %	40 %	0 %	40 %	383176758
3804	NC_016822	CGG	2	6	183753	183758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176758
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3807	NC_016822	CGC	2	6	183955	183960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3808	NC_016822	GCA	2	6	184006	184011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176759
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3815	NC_016822	ACG	2	6	184422	184427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176759
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3824	NC_016822	GAT	2	6	184653	184658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176759
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3832	NC_016822	GCT	2	6	185344	185349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3833	NC_016822	CG	3	6	185524	185529	0 %	0 %	50 %	50 %	383176760
3834	NC_016822	CTT	2	6	185558	185563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176760
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3849	NC_016822	TATT	2	8	186138	186145	25 %	75 %	0 %	0 %	383176760
3850	NC_016822	TTGA	2	8	186197	186204	25 %	50 %	25 %	0 %	383176760
3851	NC_016822	TAT	2	6	186262	186267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176760
3852	NC_016822	TAA	2	6	186292	186297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176760
3853	NC_016822	TGC	2	6	186321	186326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176760
3854	NC_016822	CGG	2	6	186337	186342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176760
3855	NC_016822	TG	3	6	186387	186392	0 %	50 %	50 %	0 %	383176760
3856	NC_016822	GCG	2	6	186426	186431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176760
3857	NC_016822	TCG	2	6	186495	186500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176760
3858	NC_016822	ACC	2	6	186512	186517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176760
3859	NC_016822	GC	3	6	186537	186542	0 %	0 %	50 %	50 %	383176760
3860	NC_016822	GGC	2	6	186679	186684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176760
3861	NC_016822	CG	3	6	186692	186697	0 %	0 %	50 %	50 %	383176760
3862	NC_016822	TTCTGG	2	12	186714	186725	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	383176760
3863	NC_016822	ATT	2	6	186761	186766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176760
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3985	NC_016822	CAG	2	6	193351	193356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176769
3986	NC_016822	GCG	2	6	193430	193435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176769
3987	NC_016822	TCA	2	6	193542	193547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3988	NC_016822	TACGT	2	10	193573	193582	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3989	NC_016822	GGA	2	6	193610	193615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3990	NC_016822	TGGC	3	12	193620	193631	0 %	25 %	50 %	25 %	383176770
3991	NC_016822	CAT	2	6	193678	193683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176770
3992	NC_016822	GCG	2	6	193731	193736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176770
3993	NC_016822	GTC	2	6	193796	193801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176770
3994	NC_016822	ATG	2	6	193958	193963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176770
3995	NC_016822	GAA	2	6	194015	194020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176770
3996	NC_016822	TGA	2	6	194025	194030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176770
3997	NC_016822	GAG	2	6	194045	194050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383176770
3998	NC_016822	TCAA	2	8	194097	194104	50 %	25 %	0 %	25 %	383176770
3999	NC_016822	GTG	2	6	194111	194116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176770
4000	NC_016822	TTG	2	6	194121	194126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176770

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