MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 101059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016822	AGT	2	6	48361	48366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176634
1003	NC_016822	ATG	2	6	48369	48374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176634
1004	NC_016822	ACCCA	2	10	48399	48408	40 %	0 %	0 %	60 %	383176634
1005	NC_016822	CAG	2	6	48501	48506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176634
1006	NC_016822	ATG	2	6	48510	48515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176634
1007	NC_016822	AAC	2	6	48549	48554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176634
1008	NC_016822	GCG	2	6	48577	48582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176634
1009	NC_016822	CGA	2	6	48622	48627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176634
1010	NC_016822	CGA	2	6	48640	48645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176634
1011	NC_016822	AAC	2	6	48654	48659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176634
1012	NC_016822	AGA	2	6	48733	48738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176634
1013	NC_016822	AGCC	2	8	48809	48816	25 %	0 %	25 %	50 %	383176634
1014	NC_016822	CGG	2	6	48857	48862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176634
1015	NC_016822	GTA	3	9	48872	48880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176634
1016	NC_016822	GCA	2	6	48909	48914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176634
1017	NC_016822	AGG	2	6	48922	48927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383176634
1018	NC_016822	CAT	2	6	48932	48937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176634
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1020	NC_016822	CCAG	2	8	49009	49016	25 %	0 %	25 %	50 %	383176634
1021	NC_016822	AACC	2	8	49017	49024	50 %	0 %	0 %	50 %	383176634
1022	NC_016822	CAC	2	6	49034	49039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176634
1023	NC_016822	TAA	2	6	49096	49101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176634
1024	NC_016822	CAA	2	6	49137	49142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176634
1025	NC_016822	CGA	2	6	49150	49155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176634
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1027	NC_016822	CGG	2	6	49163	49168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176634
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1029	NC_016822	ATTT	2	8	49243	49250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016822	GTTT	2	8	49260	49267	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016822	ATT	3	9	49291	49299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016822	T	8	8	49372	49379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_016822	ATT	2	6	49415	49420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_016822	TGT	2	6	49434	49439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_016822	A	7	7	49449	49455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_016822	T	6	6	49507	49512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_016822	ACC	2	6	49644	49649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_016822	ACG	2	6	49657	49662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_016822	ATT	2	6	49695	49700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176635
1040	NC_016822	GTGC	2	8	49712	49719	0 %	25 %	50 %	25 %	383176635
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1043	NC_016822	GCA	2	6	49842	49847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176635
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1052	NC_016822	GAAACC	2	12	50184	50195	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383176635
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1056	NC_016822	CGG	3	9	50308	50316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176635
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1065	NC_016822	GGC	2	6	50758	50763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176636
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1068	NC_016822	GAA	2	6	50876	50881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176636
1069	NC_016822	CAG	2	6	50914	50919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176636
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1082	NC_016822	ACT	2	6	51731	51736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176637
1083	NC_016822	GAA	2	6	51820	51825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176637
1084	NC_016822	GC	3	6	51830	51835	0 %	0 %	50 %	50 %	383176637
1085	NC_016822	GTC	2	6	51886	51891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176637
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1087	NC_016822	GCG	2	6	52130	52135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176637
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1099	NC_016822	CCTT	2	8	52568	52575	0 %	50 %	0 %	50 %	383176637
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1103	NC_016822	GCCGAT	2	12	52833	52844	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383176638
1104	NC_016822	GCT	2	6	52859	52864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176638
1105	NC_016822	AAG	2	6	52893	52898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176638
1106	NC_016822	CTGGGG	2	12	52962	52973	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383176638
1107	NC_016822	CG	3	6	52999	53004	0 %	0 %	50 %	50 %	383176638
1108	NC_016822	A	7	7	53076	53082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016822	CCG	2	6	53142	53147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176639
1110	NC_016822	GGT	2	6	53167	53172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176639
1111	NC_016822	TGGCG	2	10	53205	53214	0 %	20 %	60 %	20 %	383176639
1112	NC_016822	TTG	2	6	53263	53268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176639
1113	NC_016822	ATC	2	6	53362	53367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176639
1114	NC_016822	CGA	2	6	53390	53395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176639
1115	NC_016822	TGTT	2	8	53396	53403	0 %	75 %	25 %	0 %	383176639
1116	NC_016822	CGC	2	6	53535	53540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176639
1117	NC_016822	ATG	2	6	53591	53596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176639
1118	NC_016822	GGC	2	6	53602	53607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176639
1119	NC_016822	GCG	2	6	53629	53634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176639
1120	NC_016822	TGTT	2	8	53641	53648	0 %	75 %	25 %	0 %	383176639
1121	NC_016822	TTA	2	6	53692	53697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176639
1122	NC_016822	GAT	3	9	53727	53735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176639
1123	NC_016822	AGC	2	6	53771	53776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176639
1124	NC_016822	CGC	2	6	53809	53814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_016822	TGTT	2	8	53831	53838	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_016822	GCC	2	6	53839	53844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_016822	TTG	2	6	53908	53913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176640
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1134	NC_016822	AAT	2	6	54277	54282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176640
1135	NC_016822	TTG	2	6	54334	54339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176640
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1138	NC_016822	AT	3	6	54482	54487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1251	NC_016822	ATT	2	6	59710	59715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176646
1252	NC_016822	TAA	2	6	59759	59764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176647
1253	NC_016822	CGGCGT	2	12	59924	59935	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383176647
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1255	NC_016822	AAT	2	6	60024	60029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176647
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1274	NC_016822	GCA	2	6	61056	61061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176648
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1373	NC_016822	GCG	2	6	65537	65542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1374	NC_016822	CAA	2	6	65662	65667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176651
1375	NC_016822	CCG	2	6	65805	65810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176651
1376	NC_016822	CCA	2	6	65817	65822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176651
1377	NC_016822	CCA	2	6	65910	65915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176651
1378	NC_016822	GATG	2	8	65930	65937	25 %	25 %	50 %	0 %	383176651
1379	NC_016822	GCTCGC	2	12	65970	65981	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383176651
1380	NC_016822	CGC	2	6	66036	66041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176651
1381	NC_016822	CTGC	2	8	66072	66079	0 %	25 %	25 %	50 %	383176651
1382	NC_016822	TCA	2	6	66102	66107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176651
1383	NC_016822	ACA	2	6	66144	66149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176651
1384	NC_016822	ACC	2	6	66167	66172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176651
1385	NC_016822	AACC	2	8	66199	66206	50 %	0 %	0 %	50 %	383176651
1386	NC_016822	GCCT	2	8	66300	66307	0 %	25 %	25 %	50 %	383176652
1387	NC_016822	CTG	2	6	66327	66332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176652
1388	NC_016822	TCG	2	6	66358	66363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176652
1389	NC_016822	GC	3	6	66385	66390	0 %	0 %	50 %	50 %	383176652
1390	NC_016822	TCG	2	6	66427	66432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176652
1391	NC_016822	ATCA	2	8	66450	66457	50 %	25 %	0 %	25 %	383176652
1392	NC_016822	CTG	2	6	66516	66521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176652
1393	NC_016822	TGC	2	6	66539	66544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176652
1394	NC_016822	GCC	2	6	66601	66606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176652
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1397	NC_016822	CCA	2	6	66713	66718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176652
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1399	NC_016822	TGC	2	6	66764	66769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176652
1400	NC_016822	TAA	2	6	66830	66835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176652
1401	NC_016822	GGTGAT	2	12	66876	66887	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383176652
1402	NC_016822	TGT	2	6	66953	66958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176652
1403	NC_016822	CGC	2	6	66959	66964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176652
1404	NC_016822	TGAT	2	8	66973	66980	25 %	50 %	25 %	0 %	383176652
1405	NC_016822	ATA	2	6	66985	66990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176652
1406	NC_016822	CAG	2	6	67095	67100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176652
1407	NC_016822	GAC	2	6	67373	67378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176652
1408	NC_016822	GCT	2	6	67385	67390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176652
1409	NC_016822	TGGC	2	8	67432	67439	0 %	25 %	50 %	25 %	383176652
1410	NC_016822	CAG	2	6	67479	67484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176652
1411	NC_016822	TCT	2	6	67501	67506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176652
1412	NC_016822	GGC	2	6	67518	67523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176652
1413	NC_016822	CG	3	6	67691	67696	0 %	0 %	50 %	50 %	383176652
1414	NC_016822	CCA	2	6	67707	67712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176652
1415	NC_016822	CGGCAG	2	12	67839	67850	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383176652
1416	NC_016822	TCGCTG	2	12	67981	67992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176652
1417	NC_016822	TGC	2	6	67995	68000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176652
1418	NC_016822	ATC	2	6	68032	68037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176652
1419	NC_016822	CAG	2	6	68082	68087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176652
1420	NC_016822	CAG	2	6	68169	68174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176652
1421	NC_016822	CAG	3	9	68226	68234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176652
1422	NC_016822	GTT	2	6	68258	68263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176652
1423	NC_016822	ACC	2	6	68326	68331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176652
1424	NC_016822	ACG	2	6	68379	68384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176652
1425	NC_016822	TCA	3	9	68464	68472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176652
1426	NC_016822	GCA	2	6	68501	68506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176652
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1428	NC_016822	AG	3	6	68571	68576	50 %	0 %	50 %	0 %	383176652
1429	NC_016822	ATC	2	6	68593	68598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176652
1430	NC_016822	CAGC	2	8	68633	68640	25 %	0 %	25 %	50 %	383176652
1431	NC_016822	CG	3	6	68645	68650	0 %	0 %	50 %	50 %	383176652
1432	NC_016822	GGC	2	6	68657	68662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176652
1433	NC_016822	CAT	2	6	68669	68674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176652
1434	NC_016822	CG	4	8	68764	68771	0 %	0 %	50 %	50 %	383176652
1435	NC_016822	TCT	2	6	68932	68937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176652
1436	NC_016822	CTT	2	6	68942	68947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176652
1437	NC_016822	TGCG	2	8	69026	69033	0 %	25 %	50 %	25 %	383176652
1438	NC_016822	AAAGT	2	10	69062	69071	60 %	20 %	20 %	0 %	383176652
1439	NC_016822	ACC	2	6	69198	69203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1440	NC_016822	GTG	2	6	69225	69230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1441	NC_016822	T	7	7	69316	69322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_016822	GTG	2	6	69438	69443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176653
1443	NC_016822	TGG	2	6	69474	69479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176653
1444	NC_016822	TTC	2	6	69541	69546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176653
1445	NC_016822	GCG	2	6	69560	69565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176653
1446	NC_016822	GGC	2	6	69575	69580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176653
1447	NC_016822	CTG	2	6	69727	69732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176653
1448	NC_016822	CTG	2	6	69736	69741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176653
1449	NC_016822	GCG	2	6	69747	69752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176653
1450	NC_016822	CCT	2	6	69807	69812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383176653
1451	NC_016822	GTT	2	6	69924	69929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176653
1452	NC_016822	CCA	2	6	69946	69951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176653
1453	NC_016822	TGC	2	6	69962	69967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176653
1454	NC_016822	CGC	2	6	69988	69993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176653
1455	NC_016822	CTT	2	6	69996	70001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176653
1456	NC_016822	AGTCG	2	10	70030	70039	20 %	20 %	40 %	20 %	383176653
1457	NC_016822	CGT	2	6	70056	70061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176653
1458	NC_016822	TCAA	2	8	70073	70080	50 %	25 %	0 %	25 %	383176653
1459	NC_016822	TGA	2	6	70103	70108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176653
1460	NC_016822	CGA	2	6	70123	70128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176653
1461	NC_016822	GGT	2	6	70159	70164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176653
1462	NC_016822	TTA	2	6	70220	70225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176653
1463	NC_016822	GGCA	2	8	70277	70284	25 %	0 %	50 %	25 %	383176653
1464	NC_016822	ATCA	2	8	70375	70382	50 %	25 %	0 %	25 %	383176653
1465	NC_016822	GAT	2	6	70393	70398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176653
1466	NC_016822	CCAGCA	2	12	70422	70433	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383176653
1467	NC_016822	GCC	2	6	70471	70476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176653
1468	NC_016822	GCG	2	6	70488	70493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176653
1469	NC_016822	CCG	2	6	70574	70579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176653
1470	NC_016822	CGG	2	6	70718	70723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176653
1471	NC_016822	A	6	6	70879	70884	100 %	0 %	0 %	0 %	383176653
1472	NC_016822	TAT	2	6	70926	70931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176653
1473	NC_016822	GCA	2	6	70977	70982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176653
1474	NC_016822	CAC	2	6	70999	71004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176653
1475	NC_016822	GAT	2	6	71014	71019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176653
1476	NC_016822	GCGG	2	8	71070	71077	0 %	0 %	75 %	25 %	383176653
1477	NC_016822	GAG	2	6	71108	71113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383176653
1478	NC_016822	GGT	2	6	71197	71202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176653
1479	NC_016822	GCG	2	6	71229	71234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176653
1480	NC_016822	GGTGA	2	10	71309	71318	20 %	20 %	60 %	0 %	383176653
1481	NC_016822	GGCG	2	8	71345	71352	0 %	0 %	75 %	25 %	383176653
1482	NC_016822	TCA	2	6	71406	71411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176653
1483	NC_016822	CGG	2	6	71535	71540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176653
1484	NC_016822	GCCA	2	8	71600	71607	25 %	0 %	25 %	50 %	383176653
1485	NC_016822	CCTG	2	8	71663	71670	0 %	25 %	25 %	50 %	383176653
1486	NC_016822	A	6	6	71691	71696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1487	NC_016822	CAG	2	6	71802	71807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176654
1488	NC_016822	TGC	2	6	71812	71817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176654
1489	NC_016822	GCG	2	6	71831	71836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176654
1490	NC_016822	GTGG	2	8	72093	72100	0 %	25 %	75 %	0 %	383176654
1491	NC_016822	TGG	2	6	72140	72145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176654
1492	NC_016822	GCC	2	6	72171	72176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176654
1493	NC_016822	AGC	2	6	72199	72204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176654
1494	NC_016822	GGA	2	6	72222	72227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383176654
1495	NC_016822	CGC	2	6	72335	72340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176654
1496	NC_016822	TCT	2	6	72436	72441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176654
1497	NC_016822	CGA	2	6	72619	72624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176655
1498	NC_016822	ATCA	2	8	72687	72694	50 %	25 %	0 %	25 %	383176655
1499	NC_016822	GC	3	6	72773	72778	0 %	0 %	50 %	50 %	383176655
1500	NC_016822	CAG	2	6	72900	72905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176655

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