MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 101059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
101001	NC_016822	TAA	2	6	4985800	4985805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181721
101002	NC_016822	GAC	2	6	4985875	4985880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181721
101003	NC_016822	CTG	2	6	4985930	4985935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181721
101004	NC_016822	TGG	2	6	4986012	4986017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181721
101005	NC_016822	TATT	2	8	4986124	4986131	25 %	75 %	0 %	0 %	383181721
101006	NC_016822	TGT	2	6	4986165	4986170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181721
101007	NC_016822	TGT	2	6	4986183	4986188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181721
101008	NC_016822	TGGA	2	8	4986192	4986199	25 %	25 %	50 %	0 %	383181721
101009	NC_016822	GC	3	6	4986231	4986236	0 %	0 %	50 %	50 %	383181721
101010	NC_016822	TGT	2	6	4986237	4986242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181721
101011	NC_016822	TGG	3	9	4986258	4986266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181721
101012	NC_016822	ATG	2	6	4986278	4986283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181721
101013	NC_016822	AAG	2	6	4986342	4986347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181721
101014	NC_016822	T	8	8	4986417	4986424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101015	NC_016822	GGT	2	6	4986428	4986433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101016	NC_016822	CAC	2	6	4986456	4986461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181722
101017	NC_016822	TGG	2	6	4986486	4986491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181722
101018	NC_016822	GAT	2	6	4986493	4986498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181722
101019	NC_016822	CGG	2	6	4986539	4986544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181722
101020	NC_016822	CAG	2	6	4986601	4986606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181722
101021	NC_016822	AACG	2	8	4986707	4986714	50 %	0 %	25 %	25 %	383181722
101022	NC_016822	ACG	2	6	4986763	4986768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181722
101023	NC_016822	TTC	2	6	4986769	4986774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181722
101024	NC_016822	CAG	2	6	4986805	4986810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181722
101025	NC_016822	AGA	2	6	4986968	4986973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181722
101026	NC_016822	AG	3	6	4987027	4987032	50 %	0 %	50 %	0 %	383181722
101027	NC_016822	CAT	2	6	4987071	4987076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181722
101028	NC_016822	CCTG	2	8	4987213	4987220	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101029	NC_016822	ATGC	2	8	4987221	4987228	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101030	NC_016822	CAA	2	6	4987301	4987306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101031	NC_016822	CAT	2	6	4987307	4987312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101032	NC_016822	AT	3	6	4987441	4987446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101033	NC_016822	TGA	2	6	4987475	4987480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101034	NC_016822	ATC	2	6	4987482	4987487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101035	NC_016822	ATT	2	6	4987513	4987518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101036	NC_016822	TAA	2	6	4987520	4987525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101037	NC_016822	CAT	2	6	4987538	4987543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101038	NC_016822	TAA	2	6	4987549	4987554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101039	NC_016822	GTG	2	6	4987557	4987562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101040	NC_016822	ATTT	2	8	4987578	4987585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101041	NC_016822	T	6	6	4987583	4987588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101042	NC_016822	T	6	6	4987626	4987631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101043	NC_016822	T	6	6	4987672	4987677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101044	NC_016822	TAA	2	6	4987737	4987742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101045	NC_016822	AAG	2	6	4987779	4987784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101046	NC_016822	GCG	2	6	4987848	4987853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181723
101047	NC_016822	AGCC	2	8	4987915	4987922	25 %	0 %	25 %	50 %	383181723
101048	NC_016822	ATA	2	6	4987960	4987965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181723
101049	NC_016822	CCA	2	6	4988020	4988025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181723
101050	NC_016822	GC	3	6	4988028	4988033	0 %	0 %	50 %	50 %	383181723
101051	NC_016822	TAC	2	6	4988052	4988057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181723
101052	NC_016822	TGG	2	6	4988197	4988202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181723
101053	NC_016822	ACA	2	6	4988270	4988275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181723
101054	NC_016822	GAC	2	6	4988348	4988353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181723
101055	NC_016822	TGGCAG	2	12	4988356	4988367	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383181723
101056	NC_016822	TGC	2	6	4988446	4988451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181723
101057	NC_016822	A	7	7	4988461	4988467	100 %	0 %	0 %	0 %	383181723
101058	NC_016822	A	6	6	4988479	4988484	100 %	0 %	0 %	0 %	383181723
101059	NC_016822	AGTA	2	8	4988491	4988498	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.