MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 101059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_016822	CTG	2	6	24237	24242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176610
503	NC_016822	GTG	2	6	24255	24260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176610
504	NC_016822	TGGC	2	8	24275	24282	0 %	25 %	50 %	25 %	383176610
505	NC_016822	GCA	2	6	24371	24376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176610
506	NC_016822	ATC	2	6	24496	24501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176611
507	NC_016822	C	6	6	24501	24506	0 %	0 %	0 %	100 %	383176611
508	NC_016822	CTC	2	6	24541	24546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383176611
509	NC_016822	TAT	2	6	24552	24557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176611
510	NC_016822	TCA	2	6	24560	24565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176611
511	NC_016822	TGGC	2	8	24572	24579	0 %	25 %	50 %	25 %	383176611
512	NC_016822	ATT	2	6	24697	24702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176611
513	NC_016822	ATA	2	6	24716	24721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176611
514	NC_016822	T	6	6	24737	24742	0 %	100 %	0 %	0 %	383176611
515	NC_016822	ATC	2	6	24760	24765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176611
516	NC_016822	TGA	2	6	24776	24781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176611
517	NC_016822	GGC	2	6	24847	24852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176611
518	NC_016822	TAT	2	6	24888	24893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016822	ATT	2	6	24931	24936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016822	TAC	2	6	24942	24947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_016822	GTT	2	6	25057	25062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016822	ATT	2	6	25063	25068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016822	T	6	6	25085	25090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016822	TGA	2	6	25109	25114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016822	CTT	2	6	25147	25152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_016822	AAG	2	6	25156	25161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016822	CAT	2	6	25172	25177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_016822	T	6	6	25220	25225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016822	TAA	2	6	25243	25248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016822	TCA	2	6	25249	25254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_016822	CTTT	2	8	25281	25288	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
532	NC_016822	TGA	2	6	25303	25308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176612
533	NC_016822	T	6	6	25315	25320	0 %	100 %	0 %	0 %	383176612
534	NC_016822	TGA	2	6	25368	25373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176612
535	NC_016822	TTA	2	6	25399	25404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176612
536	NC_016822	CAT	2	6	25418	25423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176612
537	NC_016822	TCA	2	6	25495	25500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176612
538	NC_016822	ATA	2	6	25582	25587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176612
539	NC_016822	T	6	6	25603	25608	0 %	100 %	0 %	0 %	383176612
540	NC_016822	T	7	7	25646	25652	0 %	100 %	0 %	0 %	383176612
541	NC_016822	GTT	2	6	25662	25667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176612
542	NC_016822	AT	3	6	25718	25723	50 %	50 %	0 %	0 %	383176612
543	NC_016822	ACA	2	6	25734	25739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176612
544	NC_016822	ATA	2	6	25743	25748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176612
545	NC_016822	TATTAA	2	12	25805	25816	50 %	50 %	0 %	0 %	383176612
546	NC_016822	TAT	2	6	25871	25876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176612
547	NC_016822	TAA	2	6	25881	25886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176612
548	NC_016822	TAT	2	6	25904	25909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176612
549	NC_016822	GAC	2	6	25926	25931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176612
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552	NC_016822	ATT	2	6	26071	26076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176612
553	NC_016822	ATC	2	6	26085	26090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176612
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556	NC_016822	T	8	8	26146	26153	0 %	100 %	0 %	0 %	383176612
557	NC_016822	T	7	7	26186	26192	0 %	100 %	0 %	0 %	383176612
558	NC_016822	TGA	2	6	26233	26238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176612
559	NC_016822	TA	3	6	26288	26293	50 %	50 %	0 %	0 %	383176612
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563	NC_016822	TC	3	6	26499	26504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
564	NC_016822	A	7	7	26519	26525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016822	TGA	2	6	26526	26531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016822	A	6	6	26567	26572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016822	TCA	2	6	26574	26579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_016822	TATT	2	8	26644	26651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016822	CAT	2	6	26656	26661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_016822	CTA	2	6	26662	26667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_016822	TGA	2	6	26733	26738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_016822	TTAAT	2	10	26746	26755	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016822	ACT	2	6	26771	26776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_016822	TTG	2	6	26838	26843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_016822	CAT	2	6	27128	27133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_016822	AGC	2	6	27137	27142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_016822	A	8	8	27149	27156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016822	TTG	2	6	27211	27216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176613
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588	NC_016822	CTT	2	6	27528	27533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_016822	GCA	2	6	27651	27656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176614
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599	NC_016822	TGCG	2	8	28066	28073	0 %	25 %	50 %	25 %	383176615
600	NC_016822	TCA	2	6	28112	28117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176615
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611	NC_016822	AGC	2	6	28640	28645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176615
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613	NC_016822	CCGC	2	8	28697	28704	0 %	0 %	25 %	75 %	383176615
614	NC_016822	T	6	6	28708	28713	0 %	100 %	0 %	0 %	383176615
615	NC_016822	TGA	2	6	28775	28780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176616
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619	NC_016822	A	7	7	28918	28924	100 %	0 %	0 %	0 %	383176616
620	NC_016822	ATG	2	6	28937	28942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176616
621	NC_016822	CCT	2	6	28945	28950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383176616
622	NC_016822	GCA	2	6	28961	28966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176616
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624	NC_016822	CCG	3	9	29129	29137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176616
625	NC_016822	CAT	2	6	29268	29273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176616
626	NC_016822	CG	3	6	29275	29280	0 %	0 %	50 %	50 %	383176616
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629	NC_016822	CTGC	2	8	29515	29522	0 %	25 %	25 %	50 %	383176616
630	NC_016822	TGC	2	6	29684	29689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176616
631	NC_016822	GAC	2	6	29797	29802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176616
632	NC_016822	TCG	2	6	29921	29926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176616
633	NC_016822	GCT	2	6	29931	29936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176616
634	NC_016822	GC	3	6	29948	29953	0 %	0 %	50 %	50 %	383176616
635	NC_016822	TGC	2	6	29954	29959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176616
636	NC_016822	GCA	2	6	29973	29978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176616
637	NC_016822	TGC	2	6	29989	29994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176616
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640	NC_016822	CGC	2	6	30029	30034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176616
641	NC_016822	TGCG	2	8	30065	30072	0 %	25 %	50 %	25 %	383176616
642	NC_016822	GAA	2	6	30256	30261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176616
643	NC_016822	GTG	2	6	30297	30302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176616
644	NC_016822	TGT	2	6	30405	30410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176616
645	NC_016822	TGGT	2	8	30477	30484	0 %	50 %	50 %	0 %	383176616
646	NC_016822	CGC	2	6	30611	30616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176616
647	NC_016822	TGA	2	6	30623	30628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176616
648	NC_016822	TGC	2	6	30717	30722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176616
649	NC_016822	TCG	2	6	30732	30737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176616
650	NC_016822	CG	3	6	30750	30755	0 %	0 %	50 %	50 %	383176616
651	NC_016822	CTG	2	6	30760	30765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176616
652	NC_016822	TGG	2	6	30818	30823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176616
653	NC_016822	CAT	2	6	30963	30968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176616
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655	NC_016822	TGA	2	6	31089	31094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176616
656	NC_016822	GTGG	2	8	31270	31277	0 %	25 %	75 %	0 %	383176616
657	NC_016822	ACG	2	6	31397	31402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176616
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659	NC_016822	CAG	2	6	31417	31422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176616
660	NC_016822	GCT	2	6	31484	31489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176616
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662	NC_016822	TGA	2	6	31591	31596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176616
663	NC_016822	GCTG	2	8	31624	31631	0 %	25 %	50 %	25 %	383176617
664	NC_016822	TGG	2	6	31636	31641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176617
665	NC_016822	GCA	2	6	31666	31671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176617
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667	NC_016822	GCG	2	6	31758	31763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176617
668	NC_016822	GCG	2	6	31783	31788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176617
669	NC_016822	TGA	2	6	31846	31851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176617
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672	NC_016822	GC	3	6	31912	31917	0 %	0 %	50 %	50 %	383176617
673	NC_016822	T	6	6	32057	32062	0 %	100 %	0 %	0 %	383176617
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675	NC_016822	AAT	2	6	32083	32088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176617
676	NC_016822	GATGC	2	10	32100	32109	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
677	NC_016822	TGC	2	6	32136	32141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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679	NC_016822	CGA	2	6	32268	32273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176618
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694	NC_016822	TTGA	2	8	33392	33399	25 %	50 %	25 %	0 %	383176619
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752	NC_016822	CT	3	6	36328	36333	0 %	50 %	0 %	50 %	383176623
753	NC_016822	GCG	2	6	36454	36459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176623
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755	NC_016822	ACC	2	6	36523	36528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176623
756	NC_016822	CGG	2	6	36570	36575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176623
757	NC_016822	A	6	6	36589	36594	100 %	0 %	0 %	0 %	383176623
758	NC_016822	CGT	2	6	36615	36620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176623
759	NC_016822	TGG	2	6	36662	36667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176623
760	NC_016822	TCA	2	6	36849	36854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176623
761	NC_016822	GCT	2	6	36855	36860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176623
762	NC_016822	CAC	2	6	36904	36909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176623
763	NC_016822	GGC	2	6	36910	36915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176623
764	NC_016822	GTG	2	6	36946	36951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176623
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773	NC_016822	ATT	2	6	37431	37436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176624
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776	NC_016822	TGGAGC	2	12	37501	37512	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383176624
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782	NC_016822	CA	3	6	37648	37653	50 %	0 %	0 %	50 %	383176624
783	NC_016822	GAA	2	6	37659	37664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176624
784	NC_016822	ATT	2	6	37701	37706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176624
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793	NC_016822	GGT	2	6	38040	38045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176624
794	NC_016822	TTC	2	6	38120	38125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176624
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801	NC_016822	GAA	2	6	38601	38606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176624
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811	NC_016822	GCT	2	6	39168	39173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176624
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815	NC_016822	CGTC	2	8	39345	39352	0 %	25 %	25 %	50 %	383176624
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817	NC_016822	CGG	2	6	39421	39426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176624
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829	NC_016822	AAG	2	6	39844	39849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176624
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846	NC_016822	TGA	2	6	40542	40547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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857	NC_016822	GCA	2	6	41333	41338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
858	NC_016822	CAC	2	6	41340	41345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
859	NC_016822	AT	3	6	41376	41381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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864	NC_016822	GAT	2	6	41641	41646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176627
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866	NC_016822	TGCCAG	2	12	41672	41683	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383176627
867	NC_016822	CG	3	6	41722	41727	0 %	0 %	50 %	50 %	383176627
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872	NC_016822	GATGC	2	10	41983	41992	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
873	NC_016822	CAG	2	6	42025	42030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
874	NC_016822	CGC	2	6	42049	42054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
875	NC_016822	CGT	2	6	42087	42092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176628
876	NC_016822	TCC	2	6	42115	42120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383176628
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878	NC_016822	CAA	2	6	42258	42263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176628
879	NC_016822	GGC	2	6	42306	42311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176628
880	NC_016822	CT	3	6	42319	42324	0 %	50 %	0 %	50 %	383176628
881	NC_016822	CCAT	2	8	42340	42347	25 %	25 %	0 %	50 %	383176628
882	NC_016822	CA	3	6	42387	42392	50 %	0 %	0 %	50 %	383176628
883	NC_016822	CAC	2	6	42521	42526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176628
884	NC_016822	ACC	2	6	42619	42624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176628
885	NC_016822	GTT	2	6	42658	42663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176629
886	NC_016822	TCC	2	6	42723	42728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383176629
887	NC_016822	CGC	2	6	42760	42765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176629
888	NC_016822	CTT	2	6	42784	42789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176629
889	NC_016822	TGG	2	6	42805	42810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176629
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892	NC_016822	GGC	2	6	42993	42998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176629
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