MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 101059

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70118	NC_016822	TGC	2	6	3471865	3471870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180198
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70223	NC_016822	CCT	2	6	3476662	3476667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70224	NC_016822	ATA	2	6	3476722	3476727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70225	NC_016822	CAA	3	9	3476773	3476781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70226	NC_016822	GCT	2	6	3476887	3476892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180201
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70229	NC_016822	AAT	2	6	3476978	3476983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383180201
70230	NC_016822	GT	3	6	3476994	3476999	0 %	50 %	50 %	0 %	383180201
70231	NC_016822	CGGTG	2	10	3477134	3477143	0 %	20 %	60 %	20 %	383180201
70232	NC_016822	GTC	2	6	3477152	3477157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180201
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70350	NC_016822	GCCA	2	8	3483443	3483450	25 %	0 %	25 %	50 %	383180208
70351	NC_016822	T	6	6	3483452	3483457	0 %	100 %	0 %	0 %	383180208
70352	NC_016822	GCG	2	6	3483480	3483485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180208
70353	NC_016822	TAAA	2	8	3483502	3483509	75 %	25 %	0 %	0 %	383180208
70354	NC_016822	GT	3	6	3483557	3483562	0 %	50 %	50 %	0 %	383180209
70355	NC_016822	GGT	2	6	3483582	3483587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383180209
70356	NC_016822	CA	3	6	3483675	3483680	50 %	0 %	0 %	50 %	383180209
70357	NC_016822	CAG	2	6	3483696	3483701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180209
70358	NC_016822	GCG	2	6	3483702	3483707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180209
70359	NC_016822	TGA	2	6	3483733	3483738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180209
70360	NC_016822	GAT	3	9	3483851	3483859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180209
70361	NC_016822	GCA	4	12	3483860	3483871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180209
70362	NC_016822	GCTCA	2	10	3483930	3483939	20 %	20 %	20 %	40 %	383180209
70363	NC_016822	CCAG	2	8	3484318	3484325	25 %	0 %	25 %	50 %	383180209
70364	NC_016822	TCG	2	6	3484456	3484461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180210
70365	NC_016822	TTA	2	6	3484477	3484482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383180210
70366	NC_016822	CTG	2	6	3484515	3484520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180210
70367	NC_016822	AC	3	6	3484527	3484532	50 %	0 %	0 %	50 %	383180210
70368	NC_016822	CCA	2	6	3484538	3484543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383180210
70369	NC_016822	CAT	2	6	3484761	3484766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180210
70370	NC_016822	GT	3	6	3484781	3484786	0 %	50 %	50 %	0 %	383180210
70371	NC_016822	T	6	6	3484810	3484815	0 %	100 %	0 %	0 %	383180211
70372	NC_016822	TGA	2	6	3484822	3484827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180211
70373	NC_016822	TGCAGC	2	12	3484828	3484839	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383180211
70374	NC_016822	TCA	2	6	3484942	3484947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180211
70375	NC_016822	CCA	2	6	3484991	3484996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383180211
70376	NC_016822	C	6	6	3485020	3485025	0 %	0 %	0 %	100 %	383180211
70377	NC_016822	ATC	2	6	3485131	3485136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180211
70378	NC_016822	GCG	2	6	3485248	3485253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180211
70379	NC_016822	CCG	2	6	3485274	3485279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383180211
70380	NC_016822	A	7	7	3485339	3485345	100 %	0 %	0 %	0 %	383180211
70381	NC_016822	AAT	2	6	3485370	3485375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383180211
70382	NC_016822	AAT	2	6	3485578	3485583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70383	NC_016822	CAC	2	6	3485614	3485619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70384	NC_016822	GAA	2	6	3485633	3485638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383180212
70385	NC_016822	AGCA	2	8	3485719	3485726	50 %	0 %	25 %	25 %	383180212
70386	NC_016822	GCC	2	6	3485757	3485762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383180212
70387	NC_016822	TGC	2	6	3485771	3485776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180212
70388	NC_016822	A	6	6	3485782	3485787	100 %	0 %	0 %	0 %	383180212
70389	NC_016822	GC	3	6	3485796	3485801	0 %	0 %	50 %	50 %	383180212
70390	NC_016822	CGCGA	2	10	3485859	3485868	20 %	0 %	40 %	40 %	383180212
70391	NC_016822	GCGT	2	8	3485939	3485946	0 %	25 %	50 %	25 %	383180212
70392	NC_016822	AGC	2	6	3485963	3485968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180212
70393	NC_016822	AAG	2	6	3486085	3486090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383180212
70394	NC_016822	ACC	2	6	3486114	3486119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383180212
70395	NC_016822	CG	3	6	3486168	3486173	0 %	0 %	50 %	50 %	383180212
70396	NC_016822	CGAA	2	8	3486193	3486200	50 %	0 %	25 %	25 %	383180212
70397	NC_016822	TAA	2	6	3486212	3486217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383180212
70398	NC_016822	AGC	2	6	3486235	3486240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180212
70399	NC_016822	ACT	2	6	3486259	3486264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180212
70400	NC_016822	GGC	2	6	3486275	3486280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180212
70401	NC_016822	GCT	2	6	3486329	3486334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180212
70402	NC_016822	AAG	2	6	3486337	3486342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383180212
70403	NC_016822	GC	3	6	3486393	3486398	0 %	0 %	50 %	50 %	383180212
70404	NC_016822	GTG	2	6	3486496	3486501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383180212
70405	NC_016822	GAC	2	6	3486519	3486524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180212
70406	NC_016822	TTG	2	6	3486622	3486627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383180212
70407	NC_016822	GC	3	6	3486649	3486654	0 %	0 %	50 %	50 %	383180212
70408	NC_016822	CGT	2	6	3486662	3486667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180212
70409	NC_016822	TCC	2	6	3486681	3486686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383180212
70410	NC_016822	CAA	2	6	3486689	3486694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383180212
70411	NC_016822	ACAA	2	8	3486727	3486734	75 %	0 %	0 %	25 %	383180212
70412	NC_016822	TCGG	2	8	3486783	3486790	0 %	25 %	50 %	25 %	383180212
70413	NC_016822	TTG	2	6	3486802	3486807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383180212
70414	NC_016822	ACC	2	6	3486822	3486827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383180212
70415	NC_016822	CTG	2	6	3486930	3486935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180212
70416	NC_016822	CGCA	2	8	3487067	3487074	25 %	0 %	25 %	50 %	383180212
70417	NC_016822	ACC	2	6	3487077	3487082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383180212
70418	NC_016822	GAC	4	12	3487111	3487122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180212
70419	NC_016822	TTC	2	6	3487180	3487185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70420	NC_016822	GCTG	3	12	3487358	3487369	0 %	25 %	50 %	25 %	383180213
70421	NC_016822	TGA	2	6	3487379	3487384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180213
70422	NC_016822	TC	3	6	3487392	3487397	0 %	50 %	0 %	50 %	383180213
70423	NC_016822	GAC	2	6	3487410	3487415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180213
70424	NC_016822	ACC	2	6	3487452	3487457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383180213
70425	NC_016822	ACA	2	6	3487462	3487467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383180213
70426	NC_016822	AAG	2	6	3487477	3487482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383180213
70427	NC_016822	CAG	2	6	3487551	3487556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180213
70428	NC_016822	TGGCA	2	10	3487571	3487580	20 %	20 %	40 %	20 %	383180213
70429	NC_016822	ATG	2	6	3487647	3487652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180213
70430	NC_016822	GCG	3	9	3487666	3487674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180213
70431	NC_016822	CAG	2	6	3487686	3487691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180213
70432	NC_016822	CAGC	2	8	3487714	3487721	25 %	0 %	25 %	50 %	383180213
70433	NC_016822	CGACG	2	10	3487742	3487751	20 %	0 %	40 %	40 %	383180213
70434	NC_016822	CAGCC	2	10	3487768	3487777	20 %	0 %	20 %	60 %	383180213
70435	NC_016822	ACT	2	6	3487830	3487835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180213
70436	NC_016822	CAAA	2	8	3487871	3487878	75 %	0 %	0 %	25 %	383180213
70437	NC_016822	TAC	2	6	3488045	3488050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180214
70438	NC_016822	GAA	2	6	3488081	3488086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383180214
70439	NC_016822	CCG	2	6	3488091	3488096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383180214
70440	NC_016822	GTG	2	6	3488120	3488125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383180214
70441	NC_016822	TGA	2	6	3488151	3488156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180214
70442	NC_016822	GTCA	2	8	3488196	3488203	25 %	25 %	25 %	25 %	383180214
70443	NC_016822	CTG	2	6	3488273	3488278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180214
70444	NC_016822	GGC	2	6	3488314	3488319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180214
70445	NC_016822	CTGG	2	8	3488335	3488342	0 %	25 %	50 %	25 %	383180214
70446	NC_016822	ATCG	2	8	3488411	3488418	25 %	25 %	25 %	25 %	383180214
70447	NC_016822	TGC	2	6	3488454	3488459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180214
70448	NC_016822	CTG	2	6	3488467	3488472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180214
70449	NC_016822	CCA	2	6	3488670	3488675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383180214
70450	NC_016822	GGA	2	6	3488680	3488685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383180214
70451	NC_016822	GCTG	2	8	3488697	3488704	0 %	25 %	50 %	25 %	383180214
70452	NC_016822	CAA	2	6	3488731	3488736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383180214
70453	NC_016822	CTG	2	6	3488783	3488788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180214
70454	NC_016822	GAT	2	6	3488807	3488812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180214
70455	NC_016822	TCT	2	6	3488847	3488852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383180214
70456	NC_016822	AGC	2	6	3488902	3488907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180214
70457	NC_016822	GAA	2	6	3488924	3488929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383180214
70458	NC_016822	GAT	2	6	3488932	3488937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180214
70459	NC_016822	GCTG	2	8	3488994	3489001	0 %	25 %	50 %	25 %	383180214
70460	NC_016822	ATG	2	6	3489101	3489106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70461	NC_016822	ACA	2	6	3489233	3489238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383180215
70462	NC_016822	TGC	2	6	3489310	3489315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180215
70463	NC_016822	CAC	2	6	3489423	3489428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383180215
70464	NC_016822	ATT	2	6	3489448	3489453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383180215
70465	NC_016822	GGC	2	6	3489501	3489506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180215
70466	NC_016822	CTT	2	6	3489605	3489610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383180215
70467	NC_016822	CCA	2	6	3489715	3489720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383180215
70468	NC_016822	GCG	2	6	3489737	3489742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180215
70469	NC_016822	ACC	2	6	3489790	3489795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383180215
70470	NC_016822	ATG	2	6	3489922	3489927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180215
70471	NC_016822	CGG	2	6	3489977	3489982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70472	NC_016822	ATG	3	9	3490002	3490010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70473	NC_016822	ATC	2	6	3490011	3490016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70474	NC_016822	GCG	2	6	3490183	3490188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180216
70475	NC_016822	CTCAT	2	10	3490201	3490210	20 %	40 %	0 %	40 %	383180216
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70478	NC_016822	TGGCAG	2	12	3490526	3490537	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383180216
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70480	NC_016822	GGT	2	6	3490659	3490664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383180216
70481	NC_016822	GGC	2	6	3490668	3490673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180216
70482	NC_016822	GGC	2	6	3490680	3490685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180216
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70487	NC_016822	CGG	2	6	3490823	3490828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180216
70488	NC_016822	ACA	2	6	3490842	3490847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70489	NC_016822	TCTCT	2	10	3490917	3490926	0 %	60 %	0 %	40 %	383180217
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70492	NC_016822	AT	3	6	3491134	3491139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70493	NC_016822	ATA	2	6	3491152	3491157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70494	NC_016822	AGC	2	6	3491317	3491322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70495	NC_016822	CCA	2	6	3491363	3491368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383180218
70496	NC_016822	CA	3	6	3491462	3491467	50 %	0 %	0 %	50 %	383180218
70497	NC_016822	TCA	2	6	3491498	3491503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180218
70498	NC_016822	ACC	2	6	3491544	3491549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383180218
70499	NC_016822	GC	3	6	3491555	3491560	0 %	0 %	50 %	50 %	383180218
70500	NC_016822	TCAGA	2	10	3491588	3491597	40 %	20 %	20 %	20 %	383180218

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