MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 101059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_016822	TGA	2	6	220026	220031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176792
4503	NC_016822	CTGG	2	8	220042	220049	0 %	25 %	50 %	25 %	383176792
4504	NC_016822	CG	3	6	220054	220059	0 %	0 %	50 %	50 %	383176792
4505	NC_016822	TCG	2	6	220079	220084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176792
4506	NC_016822	GTC	2	6	220106	220111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176792
4507	NC_016822	TGA	2	6	220115	220120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176792
4508	NC_016822	TCA	2	6	220128	220133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176792
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4510	NC_016822	ATC	2	6	220246	220251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176792
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4512	NC_016822	GGT	2	6	220384	220389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176792
4513	NC_016822	TGC	2	6	220433	220438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176792
4514	NC_016822	GGC	2	6	220515	220520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176792
4515	NC_016822	ATC	2	6	220534	220539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176792
4516	NC_016822	CAT	2	6	220575	220580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176792
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4518	NC_016822	CTG	2	6	220645	220650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176792
4519	NC_016822	A	6	6	220692	220697	100 %	0 %	0 %	0 %	383176792
4520	NC_016822	TCG	2	6	220698	220703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176792
4521	NC_016822	TGA	2	6	220715	220720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176792
4522	NC_016822	GGT	2	6	220768	220773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_016822	CAGT	2	8	220779	220786	25 %	25 %	25 %	25 %	383176793
4524	NC_016822	ACTG	2	8	220793	220800	25 %	25 %	25 %	25 %	383176793
4525	NC_016822	TCG	2	6	220872	220877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176793
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4530	NC_016822	CGTC	2	8	221232	221239	0 %	25 %	25 %	50 %	383176793
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4547	NC_016822	A	7	7	222115	222121	100 %	0 %	0 %	0 %	383176793
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4607	NC_016822	CTG	2	6	225602	225607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176796
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4621	NC_016822	AAG	2	6	226164	226169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176796
4622	NC_016822	ACC	3	9	226287	226295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176797
4623	NC_016822	CGA	2	6	226366	226371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176797
4624	NC_016822	ATG	2	6	226460	226465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176797
4625	NC_016822	ATC	2	6	226493	226498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176797
4626	NC_016822	ATTG	2	8	226502	226509	25 %	50 %	25 %	0 %	383176797
4627	NC_016822	CAT	2	6	226519	226524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176797
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4629	NC_016822	CGT	2	6	226598	226603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176798
4630	NC_016822	TTCA	2	8	226614	226621	25 %	50 %	0 %	25 %	383176798
4631	NC_016822	CCT	2	6	226726	226731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4632	NC_016822	CCT	2	6	226861	226866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4633	NC_016822	CT	3	6	226961	226966	0 %	50 %	0 %	50 %	383176799
4634	NC_016822	GC	3	6	226974	226979	0 %	0 %	50 %	50 %	383176799
4635	NC_016822	ATG	2	6	227004	227009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176799
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4639	NC_016822	GCG	2	6	227153	227158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176799
4640	NC_016822	GCG	2	6	227217	227222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176799
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4642	NC_016822	TG	3	6	227253	227258	0 %	50 %	50 %	0 %	383176799
4643	NC_016822	AAC	2	6	227296	227301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176799
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4653	NC_016822	GCG	2	6	227683	227688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4654	NC_016822	TGG	2	6	227699	227704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4655	NC_016822	AAC	2	6	227721	227726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4656	NC_016822	CGA	2	6	227740	227745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4659	NC_016822	TAA	2	6	227926	227931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176801
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4672	NC_016822	TGCGC	2	10	228612	228621	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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4678	NC_016822	TTA	2	6	229249	229254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176802
4679	NC_016822	AGAT	2	8	229261	229268	50 %	25 %	25 %	0 %	383176802
4680	NC_016822	GAG	2	6	229333	229338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383176802
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4683	NC_016822	CTGG	2	8	229469	229476	0 %	25 %	50 %	25 %	383176802
4684	NC_016822	AAAG	2	8	229505	229512	75 %	0 %	25 %	0 %	383176802
4685	NC_016822	GGC	2	6	229526	229531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176802
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4687	NC_016822	CGA	2	6	229635	229640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176803
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4689	NC_016822	CGA	2	6	229676	229681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176803
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4696	NC_016822	AGT	2	6	230214	230219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176803
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4719	NC_016822	TA	3	6	231204	231209	50 %	50 %	0 %	0 %	383176803
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4723	NC_016822	A	7	7	231377	231383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4724	NC_016822	GCT	2	6	231626	231631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176804
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4731	NC_016822	GCGA	2	8	232100	232107	25 %	0 %	50 %	25 %	383176804
4732	NC_016822	ATAC	2	8	232170	232177	50 %	25 %	0 %	25 %	383176805
4733	NC_016822	AGC	2	6	232189	232194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176805
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4735	NC_016822	CGG	2	6	232295	232300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176805
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4740	NC_016822	TTTG	2	8	232694	232701	0 %	75 %	25 %	0 %	383176806
4741	NC_016822	TCA	2	6	232716	232721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176806
4742	NC_016822	TTC	2	6	232743	232748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176806
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4744	NC_016822	GGT	2	6	232865	232870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176806
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4862	NC_016822	GC	3	6	238620	238625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4864	NC_016822	TCC	2	6	238723	238728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4865	NC_016822	CTGA	2	8	238743	238750	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4866	NC_016822	GTAC	2	8	238827	238834	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4867	NC_016822	GGA	2	6	239032	239037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4869	NC_016822	CGTC	2	8	239268	239275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4871	NC_016822	AGC	2	6	239377	239382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4872	NC_016822	CAT	2	6	239383	239388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4874	NC_016822	GTT	2	6	239486	239491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4875	NC_016822	G	6	6	239728	239733	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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4989	NC_016822	ATTA	2	8	246793	246800	50 %	50 %	0 %	0 %	383176815
4990	NC_016822	A	7	7	246821	246827	100 %	0 %	0 %	0 %	383176815
4991	NC_016822	T	6	6	246875	246880	0 %	100 %	0 %	0 %	383176815
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4994	NC_016822	ACTTA	2	10	247012	247021	40 %	40 %	0 %	20 %	383176815
4995	NC_016822	TGAT	2	8	247027	247034	25 %	50 %	25 %	0 %	383176815
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4997	NC_016822	CACC	2	8	247070	247077	25 %	0 %	0 %	75 %	383176815
4998	NC_016822	CGC	2	6	247092	247097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176815
4999	NC_016822	TGT	2	6	247213	247218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176815
5000	NC_016822	CCA	2	6	247272	247277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176815

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