MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103c complete sequence

Total Repeats: 267

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016814	CG	3	6	1860	1865	0 %	0 %	50 %	50 %	378775796
2	NC_016814	CG	3	6	2575	2580	0 %	0 %	50 %	50 %	378775797
3	NC_016814	CG	3	6	2680	2685	0 %	0 %	50 %	50 %	378775797
4	NC_016814	CG	3	6	5324	5329	0 %	0 %	50 %	50 %	378775799
5	NC_016814	GA	3	6	5493	5498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016814	GC	3	6	5533	5538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016814	GC	3	6	5596	5601	0 %	0 %	50 %	50 %	378775800
8	NC_016814	GC	3	6	6248	6253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016814	AT	3	6	7303	7308	50 %	50 %	0 %	0 %	378775802
10	NC_016814	GC	3	6	7574	7579	0 %	0 %	50 %	50 %	378775802
11	NC_016814	GA	3	6	7643	7648	50 %	0 %	50 %	0 %	378775802
12	NC_016814	CT	3	6	7796	7801	0 %	50 %	0 %	50 %	378775802
13	NC_016814	TC	3	6	8232	8237	0 %	50 %	0 %	50 %	378775802
14	NC_016814	GC	3	6	8443	8448	0 %	0 %	50 %	50 %	378775802
15	NC_016814	CG	3	6	8573	8578	0 %	0 %	50 %	50 %	378775802
16	NC_016814	GC	3	6	8909	8914	0 %	0 %	50 %	50 %	378775802
17	NC_016814	CG	3	6	9447	9452	0 %	0 %	50 %	50 %	378775802
18	NC_016814	CG	3	6	9922	9927	0 %	0 %	50 %	50 %	378775802
19	NC_016814	GC	3	6	9931	9936	0 %	0 %	50 %	50 %	378775802
20	NC_016814	CG	3	6	10081	10086	0 %	0 %	50 %	50 %	378775803
21	NC_016814	GC	3	6	10894	10899	0 %	0 %	50 %	50 %	378775804
22	NC_016814	CG	3	6	11779	11784	0 %	0 %	50 %	50 %	378775805
23	NC_016814	CG	3	6	12708	12713	0 %	0 %	50 %	50 %	378775808
24	NC_016814	CG	3	6	13759	13764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016814	CG	3	6	15163	15168	0 %	0 %	50 %	50 %	378775811
26	NC_016814	GC	3	6	16958	16963	0 %	0 %	50 %	50 %	378775811
27	NC_016814	TC	3	6	17141	17146	0 %	50 %	0 %	50 %	378775811
28	NC_016814	CG	3	6	17512	17517	0 %	0 %	50 %	50 %	378775811
29	NC_016814	GA	3	6	17605	17610	50 %	0 %	50 %	0 %	378775811
30	NC_016814	TC	3	6	18958	18963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016814	GC	3	6	20154	20159	0 %	0 %	50 %	50 %	378775814
32	NC_016814	TG	3	6	20894	20899	0 %	50 %	50 %	0 %	378775816
33	NC_016814	GC	3	6	21825	21830	0 %	0 %	50 %	50 %	378775818
34	NC_016814	CG	3	6	22835	22840	0 %	0 %	50 %	50 %	378775818
35	NC_016814	GC	3	6	22895	22900	0 %	0 %	50 %	50 %	378775818
36	NC_016814	GC	3	6	23018	23023	0 %	0 %	50 %	50 %	378775818
37	NC_016814	AC	3	6	23229	23234	50 %	0 %	0 %	50 %	378775818
38	NC_016814	CG	3	6	23494	23499	0 %	0 %	50 %	50 %	378775820
39	NC_016814	AG	3	6	24225	24230	50 %	0 %	50 %	0 %	378775821
40	NC_016814	CA	3	6	24409	24414	50 %	0 %	0 %	50 %	378775821
41	NC_016814	CG	3	6	24758	24763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016814	TG	3	6	25245	25250	0 %	50 %	50 %	0 %	378775822
43	NC_016814	GA	3	6	25540	25545	50 %	0 %	50 %	0 %	378775822
44	NC_016814	CT	3	6	26714	26719	0 %	50 %	0 %	50 %	378775823
45	NC_016814	CG	3	6	26777	26782	0 %	0 %	50 %	50 %	378775823
46	NC_016814	GC	3	6	28339	28344	0 %	0 %	50 %	50 %	378775824
47	NC_016814	CT	3	6	29372	29377	0 %	50 %	0 %	50 %	378775825
48	NC_016814	CG	3	6	29757	29762	0 %	0 %	50 %	50 %	378775826
49	NC_016814	GC	3	6	29970	29975	0 %	0 %	50 %	50 %	378775826
50	NC_016814	GC	3	6	30209	30214	0 %	0 %	50 %	50 %	378775826
51	NC_016814	AC	3	6	32242	32247	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016814	GT	4	8	32423	32430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016814	GC	3	6	32444	32449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016814	GC	3	6	33362	33367	0 %	0 %	50 %	50 %	378775828
55	NC_016814	GC	3	6	35289	35294	0 %	0 %	50 %	50 %	378775829
56	NC_016814	CG	3	6	37666	37671	0 %	0 %	50 %	50 %	378775831
57	NC_016814	GC	4	8	38680	38687	0 %	0 %	50 %	50 %	378775833
58	NC_016814	GT	3	6	39239	39244	0 %	50 %	50 %	0 %	378775833
59	NC_016814	TG	3	6	39893	39898	0 %	50 %	50 %	0 %	378775835
60	NC_016814	GA	3	6	40203	40208	50 %	0 %	50 %	0 %	378775835
61	NC_016814	TG	3	6	41388	41393	0 %	50 %	50 %	0 %	378775836
62	NC_016814	GA	3	6	41685	41690	50 %	0 %	50 %	0 %	378775837
63	NC_016814	CG	3	6	41697	41702	0 %	0 %	50 %	50 %	378775837
64	NC_016814	CT	3	6	41808	41813	0 %	50 %	0 %	50 %	378775837
65	NC_016814	AG	3	6	42146	42151	50 %	0 %	50 %	0 %	378775837
66	NC_016814	CT	3	6	42318	42323	0 %	50 %	0 %	50 %	378775837
67	NC_016814	CG	3	6	43522	43527	0 %	0 %	50 %	50 %	378775837
68	NC_016814	GC	3	6	43594	43599	0 %	0 %	50 %	50 %	378775837
69	NC_016814	AT	3	6	43628	43633	50 %	50 %	0 %	0 %	378775837
70	NC_016814	CT	3	6	43736	43741	0 %	50 %	0 %	50 %	378775837
71	NC_016814	TC	3	6	44656	44661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016814	GC	3	6	45135	45140	0 %	0 %	50 %	50 %	378775840
73	NC_016814	GC	3	6	46283	46288	0 %	0 %	50 %	50 %	378775841
74	NC_016814	TC	3	6	46332	46337	0 %	50 %	0 %	50 %	378775841
75	NC_016814	GC	3	6	46833	46838	0 %	0 %	50 %	50 %	378775842
76	NC_016814	CG	3	6	47602	47607	0 %	0 %	50 %	50 %	378775843
77	NC_016814	AG	3	6	49582	49587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016814	GA	3	6	49705	49710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016814	TC	5	10	49795	49804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016814	TC	3	6	50386	50391	0 %	50 %	0 %	50 %	378775849
81	NC_016814	CG	3	6	50529	50534	0 %	0 %	50 %	50 %	378775849
82	NC_016814	GC	3	6	52072	52077	0 %	0 %	50 %	50 %	378775850
83	NC_016814	CG	4	8	54587	54594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016814	GC	3	6	54636	54641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016814	GC	3	6	54862	54867	0 %	0 %	50 %	50 %	378775853
86	NC_016814	CA	4	8	55727	55734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016814	CG	3	6	56399	56404	0 %	0 %	50 %	50 %	378775854
88	NC_016814	GC	3	6	56617	56622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016814	CT	3	6	56866	56871	0 %	50 %	0 %	50 %	378775855
90	NC_016814	CG	3	6	57207	57212	0 %	0 %	50 %	50 %	378775855
91	NC_016814	GC	3	6	57933	57938	0 %	0 %	50 %	50 %	378775856
92	NC_016814	GC	3	6	58495	58500	0 %	0 %	50 %	50 %	378775856
93	NC_016814	GC	3	6	58507	58512	0 %	0 %	50 %	50 %	378775856
94	NC_016814	AT	3	6	58990	58995	50 %	50 %	0 %	0 %	378775857
95	NC_016814	GC	3	6	59489	59494	0 %	0 %	50 %	50 %	378775857
96	NC_016814	GC	3	6	60825	60830	0 %	0 %	50 %	50 %	378775859
97	NC_016814	CG	3	6	62974	62979	0 %	0 %	50 %	50 %	378775860
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99	NC_016814	GC	3	6	63332	63337	0 %	0 %	50 %	50 %	378775860
100	NC_016814	GT	3	6	64750	64755	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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102	NC_016814	CG	3	6	65024	65029	0 %	0 %	50 %	50 %	378775862
103	NC_016814	CG	3	6	65305	65310	0 %	0 %	50 %	50 %	378775862
104	NC_016814	TC	3	6	65337	65342	0 %	50 %	0 %	50 %	378775863
105	NC_016814	GC	4	8	65855	65862	0 %	0 %	50 %	50 %	378775863
106	NC_016814	GC	3	6	66036	66041	0 %	0 %	50 %	50 %	378775863
107	NC_016814	GC	3	6	66626	66631	0 %	0 %	50 %	50 %	378775863
108	NC_016814	GC	3	6	66690	66695	0 %	0 %	50 %	50 %	378775863
109	NC_016814	GC	3	6	67325	67330	0 %	0 %	50 %	50 %	378775864
110	NC_016814	AT	3	6	67755	67760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016814	CG	3	6	67924	67929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016814	CG	3	6	68090	68095	0 %	0 %	50 %	50 %	378775866
113	NC_016814	CG	3	6	68658	68663	0 %	0 %	50 %	50 %	378775866
114	NC_016814	CG	3	6	69167	69172	0 %	0 %	50 %	50 %	378775867
115	NC_016814	CG	3	6	69781	69786	0 %	0 %	50 %	50 %	378775867
116	NC_016814	GA	3	6	69840	69845	50 %	0 %	50 %	0 %	378775867
117	NC_016814	TA	3	6	69892	69897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016814	GC	3	6	71017	71022	0 %	0 %	50 %	50 %	378775868
119	NC_016814	CG	3	6	71381	71386	0 %	0 %	50 %	50 %	378775868
120	NC_016814	GA	3	6	72121	72126	50 %	0 %	50 %	0 %	378775869
121	NC_016814	GC	3	6	72357	72362	0 %	0 %	50 %	50 %	378775869
122	NC_016814	GC	3	6	73621	73626	0 %	0 %	50 %	50 %	378775869
123	NC_016814	CG	4	8	74587	74594	0 %	0 %	50 %	50 %	378775869
124	NC_016814	GC	3	6	74761	74766	0 %	0 %	50 %	50 %	378775869
125	NC_016814	TC	3	6	75406	75411	0 %	50 %	0 %	50 %	378775870
126	NC_016814	GC	3	6	76278	76283	0 %	0 %	50 %	50 %	378775872
127	NC_016814	CG	3	6	76595	76600	0 %	0 %	50 %	50 %	378775873
128	NC_016814	TC	3	6	76733	76738	0 %	50 %	0 %	50 %	378775873
129	NC_016814	GC	3	6	77566	77571	0 %	0 %	50 %	50 %	378775874
130	NC_016814	AG	3	6	78004	78009	50 %	0 %	50 %	0 %	378775874
131	NC_016814	GC	3	6	78027	78032	0 %	0 %	50 %	50 %	378775874
132	NC_016814	CG	3	6	78198	78203	0 %	0 %	50 %	50 %	378775874
133	NC_016814	GA	3	6	79432	79437	50 %	0 %	50 %	0 %	378775875
134	NC_016814	CG	3	6	79627	79632	0 %	0 %	50 %	50 %	378775875
135	NC_016814	GC	3	6	79895	79900	0 %	0 %	50 %	50 %	378775875
136	NC_016814	GC	3	6	80259	80264	0 %	0 %	50 %	50 %	378775876
137	NC_016814	GC	3	6	80475	80480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016814	CG	3	6	80495	80500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016814	GA	3	6	81293	81298	50 %	0 %	50 %	0 %	378775878
140	NC_016814	GC	3	6	82069	82074	0 %	0 %	50 %	50 %	378775879
141	NC_016814	CT	3	6	83358	83363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_016814	AG	3	6	83870	83875	50 %	0 %	50 %	0 %	378775884
143	NC_016814	TG	3	6	84330	84335	0 %	50 %	50 %	0 %	378775886
144	NC_016814	GC	3	6	85041	85046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016814	AC	3	6	85740	85745	50 %	0 %	0 %	50 %	378775889
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.