MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103c complete sequence

Total Repeats: 2963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016814	CAA	2	6	122251	122256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_016814	CCG	2	6	122290	122295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2503	NC_016814	TGA	2	6	122395	122400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_016814	GGA	2	6	122407	122412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_016814	GAC	2	6	122471	122476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_016814	CGCA	2	8	122569	122576	25 %	0 %	25 %	50 %	378775938
2507	NC_016814	GAT	2	6	122581	122586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775938
2508	NC_016814	AGA	2	6	122625	122630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775938
2509	NC_016814	GCA	2	6	122772	122777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775938
2510	NC_016814	GAAA	2	8	122900	122907	75 %	0 %	25 %	0 %	378775938
2511	NC_016814	TGC	2	6	122915	122920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775938
2512	NC_016814	GCGATT	2	12	122924	122935	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378775938
2513	NC_016814	TGC	2	6	122949	122954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775938
2514	NC_016814	AGA	2	6	122958	122963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775938
2515	NC_016814	GCG	2	6	123012	123017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775938
2516	NC_016814	CTG	2	6	123053	123058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775938
2517	NC_016814	GCG	2	6	123122	123127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775938
2518	NC_016814	GAA	2	6	123187	123192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775938
2519	NC_016814	ACT	2	6	123246	123251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775939
2520	NC_016814	CTC	2	6	123439	123444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775939
2521	NC_016814	GGC	2	6	123481	123486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775939
2522	NC_016814	TCC	2	6	123602	123607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775939
2523	NC_016814	CGT	2	6	123616	123621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775939
2524	NC_016814	TTG	2	6	123647	123652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378775939
2525	NC_016814	ATC	2	6	123692	123697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775939
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2527	NC_016814	GC	3	6	123771	123776	0 %	0 %	50 %	50 %	378775939
2528	NC_016814	TCG	2	6	123851	123856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775939
2529	NC_016814	CGG	2	6	123937	123942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775939
2530	NC_016814	TCA	2	6	123989	123994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775939
2531	NC_016814	GCT	2	6	124019	124024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775939
2532	NC_016814	AGAA	2	8	124075	124082	75 %	0 %	25 %	0 %	378775939
2533	NC_016814	TTTTCA	2	12	124089	124100	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378775939
2534	NC_016814	CAGCG	2	10	124133	124142	20 %	0 %	40 %	40 %	378775940
2535	NC_016814	GCG	2	6	124322	124327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775940
2536	NC_016814	GC	3	6	124329	124334	0 %	0 %	50 %	50 %	378775940
2537	NC_016814	CGA	2	6	124335	124340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775940
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2539	NC_016814	CG	3	6	124427	124432	0 %	0 %	50 %	50 %	378775940
2540	NC_016814	GCC	2	6	124492	124497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775940
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2542	NC_016814	TTG	2	6	124529	124534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378775940
2543	NC_016814	GC	4	8	124558	124565	0 %	0 %	50 %	50 %	378775940
2544	NC_016814	CAC	2	6	124584	124589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378775940
2545	NC_016814	TGC	2	6	124593	124598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775940
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2547	NC_016814	CAG	2	6	124642	124647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775940
2548	NC_016814	CGG	2	6	124683	124688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775940
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2551	NC_016814	ACG	2	6	124778	124783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775940
2552	NC_016814	CGT	2	6	124795	124800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775940
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2554	NC_016814	GC	3	6	124877	124882	0 %	0 %	50 %	50 %	378775940
2555	NC_016814	ACC	2	6	124883	124888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378775940
2556	NC_016814	GCC	2	6	124889	124894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775940
2557	NC_016814	GC	3	6	124940	124945	0 %	0 %	50 %	50 %	378775940
2558	NC_016814	GCT	2	6	125009	125014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775940
2559	NC_016814	CGC	2	6	125067	125072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775940
2560	NC_016814	GCC	2	6	125074	125079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775940
2561	NC_016814	GTC	2	6	125110	125115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775940
2562	NC_016814	GGC	2	6	125119	125124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775940
2563	NC_016814	TCA	2	6	125179	125184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775941
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2569	NC_016814	GAT	2	6	125552	125557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775941
2570	NC_016814	AG	3	6	125575	125580	50 %	0 %	50 %	0 %	378775941
2571	NC_016814	GCC	2	6	125590	125595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775941
2572	NC_016814	CCATA	2	10	125615	125624	40 %	20 %	0 %	40 %	378775941
2573	NC_016814	GC	3	6	125683	125688	0 %	0 %	50 %	50 %	378775941
2574	NC_016814	CGAGC	2	10	125864	125873	20 %	0 %	40 %	40 %	378775941
2575	NC_016814	GGT	2	6	125889	125894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378775941
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2578	NC_016814	CGAC	2	8	125990	125997	25 %	0 %	25 %	50 %	378775941
2579	NC_016814	GATC	2	8	126004	126011	25 %	25 %	25 %	25 %	378775941
2580	NC_016814	GGCA	2	8	126015	126022	25 %	0 %	50 %	25 %	378775941
2581	NC_016814	CCG	2	6	126043	126048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775941
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2583	NC_016814	TCG	2	6	126062	126067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775941
2584	NC_016814	TCA	2	6	126109	126114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775941
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2587	NC_016814	CGAT	2	8	126251	126258	25 %	25 %	25 %	25 %	378775941
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2591	NC_016814	CGA	2	6	126362	126367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775941
2592	NC_016814	GATC	2	8	126371	126378	25 %	25 %	25 %	25 %	378775941
2593	NC_016814	CCT	2	6	126450	126455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775942
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2596	NC_016814	GC	3	6	126646	126651	0 %	0 %	50 %	50 %	378775942
2597	NC_016814	TGCAA	2	10	126656	126665	40 %	20 %	20 %	20 %	378775942
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2603	NC_016814	GCG	2	6	126983	126988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775942
2604	NC_016814	TTCG	2	8	127019	127026	0 %	50 %	25 %	25 %	378775942
2605	NC_016814	GGC	3	9	127085	127093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775942
2606	NC_016814	GC	3	6	127250	127255	0 %	0 %	50 %	50 %	378775942
2607	NC_016814	TGC	2	6	127355	127360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775942
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2613	NC_016814	TCGA	2	8	127487	127494	25 %	25 %	25 %	25 %	378775942
2614	NC_016814	CGT	2	6	127532	127537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775942
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2622	NC_016814	CTC	2	6	128050	128055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775943
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