MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103c complete sequence

Total Repeats: 2963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016814	GGA	2	6	27138	27143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775823
502	NC_016814	GGC	2	6	27210	27215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775823
503	NC_016814	CTCC	2	8	27342	27349	0 %	25 %	0 %	75 %	378775824
504	NC_016814	ATAG	2	8	27388	27395	50 %	25 %	25 %	0 %	378775824
505	NC_016814	CGA	2	6	27466	27471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775824
506	NC_016814	ATC	2	6	27489	27494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775824
507	NC_016814	CGT	2	6	27521	27526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775824
508	NC_016814	GGC	2	6	27549	27554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775824
509	NC_016814	CAT	2	6	27596	27601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775824
510	NC_016814	CAG	2	6	27609	27614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775824
511	NC_016814	TCC	2	6	27619	27624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775824
512	NC_016814	CGC	2	6	27814	27819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775824
513	NC_016814	GCT	2	6	27902	27907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775824
514	NC_016814	CGA	2	6	27971	27976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775824
515	NC_016814	TCA	2	6	27983	27988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775824
516	NC_016814	GGA	2	6	27998	28003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775824
517	NC_016814	GCA	2	6	28028	28033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775824
518	NC_016814	CTT	2	6	28044	28049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775824
519	NC_016814	GCG	2	6	28058	28063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775824
520	NC_016814	GAG	2	6	28299	28304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775824
521	NC_016814	GTA	2	6	28307	28312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775824
522	NC_016814	GC	3	6	28339	28344	0 %	0 %	50 %	50 %	378775824
523	NC_016814	CAC	2	6	28353	28358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378775824
524	NC_016814	TGT	2	6	28445	28450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378775824
525	NC_016814	GTTTT	2	10	28508	28517	0 %	80 %	20 %	0 %	378775824
526	NC_016814	GAA	2	6	28540	28545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775824
527	NC_016814	GCG	3	9	28738	28746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775824
528	NC_016814	AAG	2	6	28752	28757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775824
529	NC_016814	GCA	2	6	28789	28794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775824
530	NC_016814	TTCG	2	8	28835	28842	0 %	50 %	25 %	25 %	378775824
531	NC_016814	TAC	2	6	28895	28900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775824
532	NC_016814	CAA	2	6	29051	29056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378775824
533	NC_016814	CCA	2	6	29066	29071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378775824
534	NC_016814	CGC	2	6	29095	29100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775824
535	NC_016814	GCC	2	6	29133	29138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775824
536	NC_016814	CATA	2	8	29301	29308	50 %	25 %	0 %	25 %	378775825
537	NC_016814	TCA	2	6	29358	29363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775825
538	NC_016814	CT	3	6	29372	29377	0 %	50 %	0 %	50 %	378775825
539	NC_016814	TCC	2	6	29414	29419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_016814	TTC	2	6	29420	29425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_016814	AGCG	2	8	29507	29514	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
542	NC_016814	CG	3	6	29757	29762	0 %	0 %	50 %	50 %	378775826
543	NC_016814	CGA	2	6	29791	29796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775826
544	NC_016814	CGT	2	6	29797	29802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775826
545	NC_016814	TAAC	2	8	29962	29969	50 %	25 %	0 %	25 %	378775826
546	NC_016814	GC	3	6	29970	29975	0 %	0 %	50 %	50 %	378775826
547	NC_016814	GCG	2	6	30069	30074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775826
548	NC_016814	GCT	2	6	30195	30200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775826
549	NC_016814	GC	3	6	30209	30214	0 %	0 %	50 %	50 %	378775826
550	NC_016814	ATG	3	9	30221	30229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775826
551	NC_016814	ATG	2	6	30435	30440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775826
552	NC_016814	GTTC	2	8	30469	30476	0 %	50 %	25 %	25 %	378775826
553	NC_016814	CTT	2	6	30527	30532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775826
554	NC_016814	GCAG	2	8	30578	30585	25 %	0 %	50 %	25 %	378775826
555	NC_016814	TGC	2	6	30641	30646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775826
556	NC_016814	GCG	2	6	31064	31069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775827
557	NC_016814	GTC	2	6	31187	31192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775827
558	NC_016814	CCTG	2	8	31213	31220	0 %	25 %	25 %	50 %	378775827
559	NC_016814	CGC	2	6	31272	31277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775827
560	NC_016814	CGG	2	6	31344	31349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775827
561	NC_016814	TGGA	2	8	31420	31427	25 %	25 %	50 %	0 %	378775827
562	NC_016814	GGC	2	6	31548	31553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775827
563	NC_016814	C	6	6	31601	31606	0 %	0 %	0 %	100 %	378775827
564	NC_016814	CCT	2	6	31689	31694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775827
565	NC_016814	T	6	6	31736	31741	0 %	100 %	0 %	0 %	378775827
566	NC_016814	ATA	2	6	31808	31813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378775827
567	NC_016814	GCTTG	2	10	31887	31896	0 %	40 %	40 %	20 %	378775827
568	NC_016814	TCA	2	6	31929	31934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775827
569	NC_016814	ATA	2	6	31956	31961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378775827
570	NC_016814	CGC	2	6	32076	32081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775827
571	NC_016814	GAAGA	2	10	32151	32160	60 %	0 %	40 %	0 %	378775827
572	NC_016814	TGGG	2	8	32173	32180	0 %	25 %	75 %	0 %	378775827
573	NC_016814	AC	3	6	32242	32247	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_016814	GCC	3	9	32294	32302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_016814	GAC	2	6	32336	32341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_016814	AGC	2	6	32391	32396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_016814	AGT	2	6	32406	32411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_016814	GT	4	8	32423	32430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_016814	GC	3	6	32444	32449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
580	NC_016814	GAC	2	6	32512	32517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_016814	GGCA	2	8	32521	32528	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
582	NC_016814	TCG	2	6	32553	32558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_016814	GCC	2	6	32627	32632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_016814	GCC	2	6	32647	32652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775828
585	NC_016814	ATG	2	6	32698	32703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775828
586	NC_016814	GCG	2	6	32706	32711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775828
587	NC_016814	CTC	2	6	32793	32798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775828
588	NC_016814	CAC	2	6	32849	32854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378775828
589	NC_016814	TGC	2	6	32922	32927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775828
590	NC_016814	CCG	2	6	32972	32977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775828
591	NC_016814	CGG	2	6	32978	32983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775828
592	NC_016814	CGCTGG	2	12	33006	33017	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378775828
593	NC_016814	C	6	6	33043	33048	0 %	0 %	0 %	100 %	378775828
594	NC_016814	GAA	2	6	33165	33170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775828
595	NC_016814	ATC	2	6	33217	33222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775828
596	NC_016814	CCT	2	6	33245	33250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775828
597	NC_016814	CAT	2	6	33255	33260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775828
598	NC_016814	GCG	2	6	33294	33299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775828
599	NC_016814	AGGC	2	8	33300	33307	25 %	0 %	50 %	25 %	378775828
600	NC_016814	GC	3	6	33362	33367	0 %	0 %	50 %	50 %	378775828
601	NC_016814	TTC	2	6	33475	33480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775828
602	NC_016814	GAT	2	6	33489	33494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775828
603	NC_016814	CATC	2	8	33548	33555	25 %	25 %	0 %	50 %	378775828
604	NC_016814	TCG	2	6	33574	33579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775828
605	NC_016814	AGG	2	6	33580	33585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775828
606	NC_016814	GGGA	2	8	33595	33602	25 %	0 %	75 %	0 %	378775828
607	NC_016814	CTG	2	6	33639	33644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775828
608	NC_016814	GAG	2	6	33657	33662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775828
609	NC_016814	GCA	2	6	33668	33673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775828
610	NC_016814	AGATCG	2	12	33704	33715	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378775828
611	NC_016814	CAG	2	6	33810	33815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775828
612	NC_016814	GGC	3	9	33822	33830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775828
613	NC_016814	CGC	2	6	33932	33937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775828
614	NC_016814	GTCG	2	8	34104	34111	0 %	25 %	50 %	25 %	378775828
615	NC_016814	TCT	2	6	34163	34168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775828
616	NC_016814	CGA	2	6	34210	34215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775828
617	NC_016814	CCG	2	6	34220	34225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775828
618	NC_016814	ATC	2	6	34261	34266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775828
619	NC_016814	GAT	2	6	34332	34337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775828
620	NC_016814	GAT	2	6	34340	34345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775828
621	NC_016814	GAA	2	6	34364	34369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775828
622	NC_016814	CCGA	2	8	34383	34390	25 %	0 %	25 %	50 %	378775828
623	NC_016814	AGCGA	2	10	34429	34438	40 %	0 %	40 %	20 %	378775828
624	NC_016814	GCA	2	6	34450	34455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775828
625	NC_016814	GCT	2	6	34467	34472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775828
626	NC_016814	CAG	2	6	34512	34517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775828
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628	NC_016814	TCG	2	6	34613	34618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775828
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869	NC_016814	ACCG	2	8	45999	46006	25 %	0 %	25 %	50 %	378775841
870	NC_016814	GACAA	2	10	46021	46030	60 %	0 %	20 %	20 %	378775841
871	NC_016814	GCA	3	9	46116	46124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775841
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877	NC_016814	TC	3	6	46332	46337	0 %	50 %	0 %	50 %	378775841
878	NC_016814	GAG	2	6	46345	46350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775841
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996	NC_016814	AGC	2	6	53092	53097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775851
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998	NC_016814	GAA	2	6	53214	53219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775851
999	NC_016814	GCCG	2	8	53220	53227	0 %	0 %	50 %	50 %	378775851
1000	NC_016814	GGC	2	6	53291	53296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775851

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