MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103

Total Repeats: 11405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016812	GGTC	2	8	51	58	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016812	TTCA	2	8	532	539	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016812	CAAC	2	8	1059	1066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016812	TCGA	2	8	1099	1106	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016812	TAGG	2	8	1441	1448	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016812	CCGA	2	8	2845	2852	25 %	0 %	25 %	50 %	378824599
7	NC_016812	GGCG	2	8	3277	3284	0 %	0 %	75 %	25 %	378824599
8	NC_016812	CGAT	2	8	4306	4313	25 %	25 %	25 %	25 %	378824601
9	NC_016812	AAAC	2	8	4783	4790	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016812	GCCG	2	8	5586	5593	0 %	0 %	50 %	50 %	378824603
11	NC_016812	ACCG	2	8	5865	5872	25 %	0 %	25 %	50 %	378824603
12	NC_016812	CCGG	2	8	5954	5961	0 %	0 %	50 %	50 %	378824603
13	NC_016812	CTTC	2	8	6152	6159	0 %	50 %	0 %	50 %	378824603
14	NC_016812	GCCG	2	8	6281	6288	0 %	0 %	50 %	50 %	378824603
15	NC_016812	CGAG	2	8	6326	6333	25 %	0 %	50 %	25 %	378824603
16	NC_016812	GCCG	2	8	6345	6352	0 %	0 %	50 %	50 %	378824603
17	NC_016812	AAGG	2	8	6564	6571	50 %	0 %	50 %	0 %	378824603
18	NC_016812	GTCC	2	8	6961	6968	0 %	25 %	25 %	50 %	378824604
19	NC_016812	CCGG	2	8	7462	7469	0 %	0 %	50 %	50 %	378824604
20	NC_016812	CCGG	2	8	7636	7643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016812	TCCA	2	8	8180	8187	25 %	25 %	0 %	50 %	378824605
22	NC_016812	TCGA	2	8	8270	8277	25 %	25 %	25 %	25 %	378824605
23	NC_016812	TGCG	2	8	8351	8358	0 %	25 %	50 %	25 %	378824605
24	NC_016812	CCCG	2	8	8717	8724	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_016812	ACCT	2	8	8855	8862	25 %	25 %	0 %	50 %	378824606
26	NC_016812	TCGA	2	8	9080	9087	25 %	25 %	25 %	25 %	378824606
27	NC_016812	ATCG	2	8	9569	9576	25 %	25 %	25 %	25 %	378824606
28	NC_016812	CGAA	2	8	9973	9980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016812	GGCT	2	8	10641	10648	0 %	25 %	50 %	25 %	378824607
30	NC_016812	GCCG	2	8	10734	10741	0 %	0 %	50 %	50 %	378824607
31	NC_016812	CCCG	2	8	10928	10935	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_016812	CGGT	2	8	11619	11626	0 %	25 %	50 %	25 %	378824608
33	NC_016812	GGCA	2	8	11694	11701	25 %	0 %	50 %	25 %	378824608
34	NC_016812	TGAT	2	8	12105	12112	25 %	50 %	25 %	0 %	378824608
35	NC_016812	GGCC	2	8	12256	12263	0 %	0 %	50 %	50 %	378824608
36	NC_016812	GACG	2	8	12322	12329	25 %	0 %	50 %	25 %	378824608
37	NC_016812	GTGC	2	8	12428	12435	0 %	25 %	50 %	25 %	378824609
38	NC_016812	ACGG	2	8	12935	12942	25 %	0 %	50 %	25 %	378824609
39	NC_016812	GCCC	2	8	12994	13001	0 %	0 %	25 %	75 %	378824609
40	NC_016812	CGAA	2	8	13184	13191	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016812	ATAG	2	8	13387	13394	50 %	25 %	25 %	0 %	378824610
42	NC_016812	GCGA	2	8	14505	14512	25 %	0 %	50 %	25 %	378824611
43	NC_016812	GCTT	2	8	14865	14872	0 %	50 %	25 %	25 %	378824612
44	NC_016812	CGGA	2	8	14949	14956	25 %	0 %	50 %	25 %	378824612
45	NC_016812	TGCA	2	8	15243	15250	25 %	25 %	25 %	25 %	378824612
46	NC_016812	CCAG	2	8	15361	15368	25 %	0 %	25 %	50 %	378824612
47	NC_016812	CGAA	2	8	15383	15390	50 %	0 %	25 %	25 %	378824612
48	NC_016812	CCGG	2	8	15851	15858	0 %	0 %	50 %	50 %	378824612
49	NC_016812	CGGC	2	8	16063	16070	0 %	0 %	50 %	50 %	378824612
50	NC_016812	TCGA	2	8	16993	17000	25 %	25 %	25 %	25 %	378824613
51	NC_016812	GATC	2	8	17966	17973	25 %	25 %	25 %	25 %	378824615
52	NC_016812	GCCG	2	8	18398	18405	0 %	0 %	50 %	50 %	378824615
53	NC_016812	CGGC	2	8	19156	19163	0 %	0 %	50 %	50 %	378824616
54	NC_016812	TTCC	2	8	19598	19605	0 %	50 %	0 %	50 %	378824616
55	NC_016812	CAGA	2	8	19837	19844	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016812	GACG	2	8	20637	20644	25 %	0 %	50 %	25 %	378824618
57	NC_016812	CGGG	2	8	20905	20912	0 %	0 %	75 %	25 %	378824619
58	NC_016812	GCAC	2	8	21303	21310	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016812	GCCG	2	8	21650	21657	0 %	0 %	50 %	50 %	378824620
60	NC_016812	CGTC	2	8	21758	21765	0 %	25 %	25 %	50 %	378824620
61	NC_016812	CGGC	3	12	22012	22023	0 %	0 %	50 %	50 %	378824620
62	NC_016812	GACC	2	8	22253	22260	25 %	0 %	25 %	50 %	378824620
63	NC_016812	CCTC	2	8	22525	22532	0 %	25 %	0 %	75 %	378824620
64	NC_016812	GGGC	2	8	22816	22823	0 %	0 %	75 %	25 %	378824621
65	NC_016812	CCGC	2	8	22930	22937	0 %	0 %	25 %	75 %	378824621
66	NC_016812	GAGC	2	8	23960	23967	25 %	0 %	50 %	25 %	378824623
67	NC_016812	GCAA	2	8	23986	23993	50 %	0 %	25 %	25 %	378824623
68	NC_016812	CGGT	2	8	24081	24088	0 %	25 %	50 %	25 %	378824623
69	NC_016812	GCCG	2	8	24524	24531	0 %	0 %	50 %	50 %	378824623
70	NC_016812	CGGC	2	8	24581	24588	0 %	0 %	50 %	50 %	378824623
71	NC_016812	CACG	2	8	24710	24717	25 %	0 %	25 %	50 %	378824623
72	NC_016812	TCCG	2	8	24896	24903	0 %	25 %	25 %	50 %	378824623
73	NC_016812	CAGG	2	8	25037	25044	25 %	0 %	50 %	25 %	378824623
74	NC_016812	GCCG	2	8	26168	26175	0 %	0 %	50 %	50 %	378824623
75	NC_016812	GCGG	2	8	26683	26690	0 %	0 %	75 %	25 %	378824624
76	NC_016812	TCCT	2	8	26920	26927	0 %	50 %	0 %	50 %	378824624
77	NC_016812	CCGG	2	8	26970	26977	0 %	0 %	50 %	50 %	378824624
78	NC_016812	GTCT	2	8	27210	27217	0 %	50 %	25 %	25 %	378824624
79	NC_016812	GGAG	2	8	27419	27426	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016812	AGGC	2	8	27788	27795	25 %	0 %	50 %	25 %	378824625
81	NC_016812	CGGA	2	8	27959	27966	25 %	0 %	50 %	25 %	378824625
82	NC_016812	GATC	2	8	29549	29556	25 %	25 %	25 %	25 %	378824625
83	NC_016812	GCGA	2	8	29761	29768	25 %	0 %	50 %	25 %	378824625
84	NC_016812	GACC	2	8	31043	31050	25 %	0 %	25 %	50 %	378824626
85	NC_016812	CATC	2	8	31598	31605	25 %	25 %	0 %	50 %	378824626
86	NC_016812	CGAC	2	8	32209	32216	25 %	0 %	25 %	50 %	378824626
87	NC_016812	GCCG	2	8	32742	32749	0 %	0 %	50 %	50 %	378824626
88	NC_016812	GGCG	2	8	33643	33650	0 %	0 %	75 %	25 %	378824627
89	NC_016812	GGCG	2	8	33745	33752	0 %	0 %	75 %	25 %	378824627
90	NC_016812	AAGG	2	8	33782	33789	50 %	0 %	50 %	0 %	378824627
91	NC_016812	GATC	2	8	34597	34604	25 %	25 %	25 %	25 %	378824627
92	NC_016812	CTGG	2	8	34804	34811	0 %	25 %	50 %	25 %	378824627
93	NC_016812	CGGA	2	8	35382	35389	25 %	0 %	50 %	25 %	378824627
94	NC_016812	GGCG	2	8	35818	35825	0 %	0 %	75 %	25 %	378824627
95	NC_016812	CTCG	2	8	36720	36727	0 %	25 %	25 %	50 %	378824628
96	NC_016812	TGGC	2	8	37324	37331	0 %	25 %	50 %	25 %	378824628
97	NC_016812	AAGA	2	8	37952	37959	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016812	ACCG	2	8	38145	38152	25 %	0 %	25 %	50 %	378824630
99	NC_016812	CTCG	2	8	38475	38482	0 %	25 %	25 %	50 %	378824630
100	NC_016812	GCCC	2	8	38994	39001	0 %	0 %	25 %	75 %	378824630
101	NC_016812	GCGG	2	8	39418	39425	0 %	0 %	75 %	25 %	378824631
102	NC_016812	AAGG	2	8	40018	40025	50 %	0 %	50 %	0 %	378824632
103	NC_016812	CGGC	2	8	40207	40214	0 %	0 %	50 %	50 %	378824632
104	NC_016812	GTCG	2	8	40371	40378	0 %	25 %	50 %	25 %	378824632
105	NC_016812	GCCG	2	8	41130	41137	0 %	0 %	50 %	50 %	378824633
106	NC_016812	CAGC	2	8	41457	41464	25 %	0 %	25 %	50 %	378824635
107	NC_016812	TGGC	2	8	41658	41665	0 %	25 %	50 %	25 %	378824635
108	NC_016812	CGGC	2	8	42395	42402	0 %	0 %	50 %	50 %	378824636
109	NC_016812	GCCG	2	8	42834	42841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016812	GGCG	2	8	42941	42948	0 %	0 %	75 %	25 %	378824637
111	NC_016812	GACG	2	8	43058	43065	25 %	0 %	50 %	25 %	378824637
112	NC_016812	GCGA	2	8	43176	43183	25 %	0 %	50 %	25 %	378824637
113	NC_016812	CGAT	2	8	43737	43744	25 %	25 %	25 %	25 %	378824637
114	NC_016812	CGGG	2	8	44123	44130	0 %	0 %	75 %	25 %	378824637
115	NC_016812	ACCA	2	8	44632	44639	50 %	0 %	0 %	50 %	378824638
116	NC_016812	TCGA	2	8	44689	44696	25 %	25 %	25 %	25 %	378824638
117	NC_016812	GCCG	2	8	44892	44899	0 %	0 %	50 %	50 %	378824638
118	NC_016812	ACCT	2	8	44911	44918	25 %	25 %	0 %	50 %	378824638
119	NC_016812	CGGC	2	8	44980	44987	0 %	0 %	50 %	50 %	378824638
120	NC_016812	AGGC	2	8	44993	45000	25 %	0 %	50 %	25 %	378824638
121	NC_016812	ACGG	2	8	46721	46728	25 %	0 %	50 %	25 %	378824640
122	NC_016812	ATCG	2	8	47463	47470	25 %	25 %	25 %	25 %	378824641
123	NC_016812	CGGC	2	8	48151	48158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016812	GGCA	2	8	48186	48193	25 %	0 %	50 %	25 %	378824642
125	NC_016812	GTCG	2	8	48571	48578	0 %	25 %	50 %	25 %	378824642
126	NC_016812	CCAG	2	8	48903	48910	25 %	0 %	25 %	50 %	378824642
127	NC_016812	GATG	2	8	48930	48937	25 %	25 %	50 %	0 %	378824642
128	NC_016812	GACG	2	8	49632	49639	25 %	0 %	50 %	25 %	378824642
129	NC_016812	CGAA	2	8	49759	49766	50 %	0 %	25 %	25 %	378824642
130	NC_016812	TGCC	2	8	49815	49822	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_016812	TCGT	2	8	50404	50411	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016812	ATCG	2	8	50439	50446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016812	TGCC	2	8	50994	51001	0 %	25 %	25 %	50 %	378824644
134	NC_016812	CCGA	2	8	51154	51161	25 %	0 %	25 %	50 %	378824644
135	NC_016812	GGCC	2	8	51714	51721	0 %	0 %	50 %	50 %	378824644
136	NC_016812	GAAG	2	8	51768	51775	50 %	0 %	50 %	0 %	378824644
137	NC_016812	ACGC	2	8	51860	51867	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016812	TCGA	2	8	51985	51992	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016812	TCAT	2	8	52244	52251	25 %	50 %	0 %	25 %	378824645
140	NC_016812	GGGT	2	8	53497	53504	0 %	25 %	75 %	0 %	378824647
141	NC_016812	GCCG	2	8	54347	54354	0 %	0 %	50 %	50 %	378824648
142	NC_016812	CCGG	2	8	54628	54635	0 %	0 %	50 %	50 %	378824648
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