MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_016810	GC	3	6	163721	163726	0 %	0 %	50 %	50 %	378698120
3503	NC_016810	ATA	2	6	163728	163733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698120
3504	NC_016810	CCG	2	6	163803	163808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698120
3505	NC_016810	CTA	2	6	163914	163919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_016810	A	7	7	163951	163957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_016810	GAA	2	6	164066	164071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698121
3508	NC_016810	CTG	2	6	164274	164279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698121
3509	NC_016810	GAA	2	6	164300	164305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698121
3510	NC_016810	A	6	6	164388	164393	100 %	0 %	0 %	0 %	378698121
3511	NC_016810	TCG	2	6	164478	164483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698121
3512	NC_016810	ACG	2	6	164615	164620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698121
3513	NC_016810	CGG	2	6	164655	164660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698121
3514	NC_016810	GGC	2	6	164714	164719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698121
3515	NC_016810	GGC	3	9	164753	164761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698121
3516	NC_016810	GGC	2	6	164780	164785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698121
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3521	NC_016810	CG	3	6	164912	164917	0 %	0 %	50 %	50 %	378698121
3522	NC_016810	CAC	2	6	165046	165051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698121
3523	NC_016810	CTGG	2	8	165105	165112	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3524	NC_016810	ATCCC	2	10	165133	165142	20 %	20 %	0 %	60 %	378698122
3525	NC_016810	TGA	2	6	165214	165219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698122
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3533	NC_016810	AGA	2	6	165729	165734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698122
3534	NC_016810	GGC	2	6	165764	165769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698122
3535	NC_016810	GCA	2	6	165790	165795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698122
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3538	NC_016810	AGCGC	2	10	165841	165850	20 %	0 %	40 %	40 %	378698122
3539	NC_016810	AGC	2	6	165907	165912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698122
3540	NC_016810	ATC	2	6	165948	165953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698122
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3542	NC_016810	ATGA	2	8	166118	166125	50 %	25 %	25 %	0 %	378698122
3543	NC_016810	TGA	2	6	166137	166142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698122
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3545	NC_016810	GCG	2	6	166176	166181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698122
3546	NC_016810	TGA	2	6	166234	166239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698122
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3551	NC_016810	TGC	2	6	166720	166725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698123
3552	NC_016810	TGG	2	6	166745	166750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698123
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3556	NC_016810	GGAT	2	8	166909	166916	25 %	25 %	50 %	0 %	378698123
3557	NC_016810	GC	3	6	167003	167008	0 %	0 %	50 %	50 %	378698123
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3562	NC_016810	GAA	2	6	167351	167356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698123
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3565	NC_016810	ACC	2	6	167620	167625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698123
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3573	NC_016810	TGA	2	6	167921	167926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698124
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3580	NC_016810	GC	4	8	168403	168410	0 %	0 %	50 %	50 %	378698125
3581	NC_016810	GC	3	6	168424	168429	0 %	0 %	50 %	50 %	378698125
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3593	NC_016810	CGG	2	6	169192	169197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_016810	GTCG	2	8	169237	169244	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3595	NC_016810	GGC	2	6	169263	169268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_016810	AGC	2	6	169323	169328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3598	NC_016810	GTTG	2	8	169374	169381	0 %	50 %	50 %	0 %	378698126
3599	NC_016810	TGG	2	6	169449	169454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698126
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3604	NC_016810	TCG	2	6	169591	169596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698126
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3606	NC_016810	CAG	2	6	169748	169753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698126
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3610	NC_016810	ATGAC	2	10	169913	169922	40 %	20 %	20 %	20 %	378698126
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3868	NC_016810	GCTG	2	8	181214	181221	0 %	25 %	50 %	25 %	378698134
3869	NC_016810	CGG	2	6	181304	181309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698134
3870	NC_016810	AAAGTG	2	12	181335	181346	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378698134
3871	NC_016810	TGGAAG	2	12	181384	181395	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378698134
3872	NC_016810	ATC	2	6	181434	181439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698134
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3887	NC_016810	CGG	2	6	182237	182242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698134
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3894	NC_016810	A	6	6	182468	182473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3895	NC_016810	T	7	7	182490	182496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3896	NC_016810	ATG	2	6	182522	182527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3897	NC_016810	GCA	2	6	182564	182569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3898	NC_016810	TGTC	2	8	182607	182614	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3899	NC_016810	TCA	2	6	182663	182668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3901	NC_016810	AT	3	6	182720	182725	50 %	50 %	0 %	0 %	378698135
3902	NC_016810	ACA	2	6	182739	182744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698135
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3942	NC_016810	CTG	2	6	184159	184164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3974	NC_016810	CATC	2	8	184987	184994	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3975	NC_016810	TGGC	2	8	185115	185122	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3976	NC_016810	CG	3	6	185164	185169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3979	NC_016810	TC	3	6	185469	185474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3980	NC_016810	TGCC	2	8	185504	185511	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3981	NC_016810	T	6	6	185681	185686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3982	NC_016810	T	6	6	185694	185699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3983	NC_016810	CTA	2	6	185764	185769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3986	NC_016810	GAG	2	6	185839	185844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3992	NC_016810	TCC	2	6	186011	186016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698137
3993	NC_016810	GCT	2	6	186057	186062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698137
3994	NC_016810	ACC	2	6	186078	186083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698137
3995	NC_016810	CTG	2	6	186117	186122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698137
3996	NC_016810	ACA	2	6	186142	186147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698137
3997	NC_016810	TGAT	2	8	186157	186164	25 %	50 %	25 %	0 %	378698137
3998	NC_016810	TGC	2	6	186194	186199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698137
3999	NC_016810	CTG	2	6	186219	186224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698137
4000	NC_016810	ACG	2	6	186241	186246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698137

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