MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016810	G	6	6	139957	139962	0 %	0 %	100 %	0 %	378698099
3002	NC_016810	CATC	2	8	140066	140073	25 %	25 %	0 %	50 %	378698099
3003	NC_016810	CTG	2	6	140082	140087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698099
3004	NC_016810	CCTG	2	8	140096	140103	0 %	25 %	25 %	50 %	378698099
3005	NC_016810	ATT	2	6	140112	140117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698099
3006	NC_016810	GATG	2	8	140204	140211	25 %	25 %	50 %	0 %	378698099
3007	NC_016810	AAG	2	6	140266	140271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698099
3008	NC_016810	CAA	2	6	140291	140296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698099
3009	NC_016810	GAT	2	6	140409	140414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698100
3010	NC_016810	AC	3	6	140427	140432	50 %	0 %	0 %	50 %	378698100
3011	NC_016810	CGG	2	6	140511	140516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698100
3012	NC_016810	CGAT	2	8	140567	140574	25 %	25 %	25 %	25 %	378698100
3013	NC_016810	CAT	2	6	140628	140633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698100
3014	NC_016810	GCTG	2	8	140652	140659	0 %	25 %	50 %	25 %	378698100
3015	NC_016810	TCT	2	6	140722	140727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698100
3016	NC_016810	CG	3	6	140801	140806	0 %	0 %	50 %	50 %	378698100
3017	NC_016810	GCC	2	6	140815	140820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698100
3018	NC_016810	CGG	2	6	140834	140839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698100
3019	NC_016810	GAG	2	6	140878	140883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698100
3020	NC_016810	TTG	2	6	140912	140917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698100
3021	NC_016810	GCG	3	9	140971	140979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698100
3022	NC_016810	GGA	2	6	141057	141062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698100
3023	NC_016810	GCTC	2	8	141083	141090	0 %	25 %	25 %	50 %	378698100
3024	NC_016810	GGCG	2	8	141106	141113	0 %	0 %	75 %	25 %	378698100
3025	NC_016810	ATC	2	6	141121	141126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698100
3026	NC_016810	CGG	2	6	141197	141202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698100
3027	NC_016810	A	6	6	141229	141234	100 %	0 %	0 %	0 %	378698100
3028	NC_016810	AGTTC	2	10	141313	141322	20 %	40 %	20 %	20 %	378698100
3029	NC_016810	AG	3	6	141333	141338	50 %	0 %	50 %	0 %	378698100
3030	NC_016810	CAG	2	6	141353	141358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698101
3031	NC_016810	TGCCT	2	10	141413	141422	0 %	40 %	20 %	40 %	378698101
3032	NC_016810	CAT	2	6	141482	141487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698101
3033	NC_016810	CGG	2	6	141493	141498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698101
3034	NC_016810	GGT	2	6	141503	141508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698101
3035	NC_016810	ACG	2	6	141510	141515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698101
3036	NC_016810	GAA	2	6	141606	141611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698101
3037	NC_016810	GCA	2	6	141668	141673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698101
3038	NC_016810	AGC	2	6	141734	141739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698102
3039	NC_016810	GAA	2	6	141768	141773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698102
3040	NC_016810	TCA	2	6	141784	141789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698102
3041	NC_016810	T	7	7	141835	141841	0 %	100 %	0 %	0 %	378698102
3042	NC_016810	CG	3	6	141849	141854	0 %	0 %	50 %	50 %	378698102
3043	NC_016810	ACCG	2	8	141951	141958	25 %	0 %	25 %	50 %	378698102
3044	NC_016810	AAG	2	6	142015	142020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698102
3045	NC_016810	CGG	2	6	142031	142036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698102
3046	NC_016810	TTTA	2	8	142134	142141	25 %	75 %	0 %	0 %	378698102
3047	NC_016810	GC	3	6	142146	142151	0 %	0 %	50 %	50 %	378698102
3048	NC_016810	A	6	6	142182	142187	100 %	0 %	0 %	0 %	378698102
3049	NC_016810	CGC	2	6	142224	142229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698102
3050	NC_016810	TAC	2	6	142230	142235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698102
3051	NC_016810	GCGA	2	8	142342	142349	25 %	0 %	50 %	25 %	378698102
3052	NC_016810	TCC	2	6	142392	142397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698102
3053	NC_016810	TGA	2	6	142436	142441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698102
3054	NC_016810	AAC	2	6	142473	142478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698102
3055	NC_016810	TGGCGA	2	12	142546	142557	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378698102
3056	NC_016810	CAA	2	6	142577	142582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698102
3057	NC_016810	TGG	2	6	142663	142668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698102
3058	NC_016810	TGA	2	6	142669	142674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698102
3059	NC_016810	GC	3	6	142761	142766	0 %	0 %	50 %	50 %	378698102
3060	NC_016810	TAG	2	6	142855	142860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698102
3061	NC_016810	TACT	2	8	142862	142869	25 %	50 %	0 %	25 %	378698102
3062	NC_016810	GGT	2	6	142945	142950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698102
3063	NC_016810	AG	3	6	142958	142963	50 %	0 %	50 %	0 %	378698102
3064	NC_016810	GTG	2	6	143127	143132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698102
3065	NC_016810	ATG	2	6	143136	143141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698102
3066	NC_016810	GCG	4	12	143161	143172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698102
3067	NC_016810	A	6	6	143223	143228	100 %	0 %	0 %	0 %	378698102
3068	NC_016810	CAA	2	6	143252	143257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698102
3069	NC_016810	TGG	2	6	143311	143316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698102
3070	NC_016810	TCA	2	6	143320	143325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698102
3071	NC_016810	TAC	2	6	143346	143351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698102
3072	NC_016810	GGC	2	6	143352	143357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698102
3073	NC_016810	CAT	2	6	143384	143389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698102
3074	NC_016810	GCG	2	6	143392	143397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698102
3075	NC_016810	A	7	7	143443	143449	100 %	0 %	0 %	0 %	378698102
3076	NC_016810	TAAT	2	8	143458	143465	50 %	50 %	0 %	0 %	378698102
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3079	NC_016810	CG	3	6	143535	143540	0 %	0 %	50 %	50 %	378698103
3080	NC_016810	GA	3	6	143549	143554	50 %	0 %	50 %	0 %	378698103
3081	NC_016810	GCG	2	6	143578	143583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698103
3082	NC_016810	GTG	2	6	143602	143607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698103
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3087	NC_016810	GTC	2	6	143731	143736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698103
3088	NC_016810	CAGC	2	8	143742	143749	25 %	0 %	25 %	50 %	378698103
3089	NC_016810	TGG	2	6	143813	143818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698103
3090	NC_016810	ACC	4	12	143842	143853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698103
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3092	NC_016810	TCT	2	6	144034	144039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698103
3093	NC_016810	GCA	2	6	144051	144056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698103
3094	NC_016810	GGC	2	6	144063	144068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698103
3095	NC_016810	GCC	2	6	144079	144084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698103
3096	NC_016810	GGC	2	6	144147	144152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698103
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3098	NC_016810	CAT	2	6	144178	144183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698103
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3101	NC_016810	TGGC	2	8	144226	144233	0 %	25 %	50 %	25 %	378698103
3102	NC_016810	CGA	2	6	144338	144343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698103
3103	NC_016810	CTG	2	6	144418	144423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698103
3104	NC_016810	CCG	2	6	144476	144481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698103
3105	NC_016810	CG	3	6	144480	144485	0 %	0 %	50 %	50 %	378698103
3106	NC_016810	GGT	3	9	144540	144548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698103
3107	NC_016810	GGC	2	6	144591	144596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698103
3108	NC_016810	GAA	2	6	144688	144693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698103
3109	NC_016810	TCG	2	6	144704	144709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698103
3110	NC_016810	TGAC	2	8	144713	144720	25 %	25 %	25 %	25 %	378698103
3111	NC_016810	GAG	2	6	144736	144741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698103
3112	NC_016810	CG	3	6	144743	144748	0 %	0 %	50 %	50 %	378698103
3113	NC_016810	CGT	2	6	144858	144863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698103
3114	NC_016810	ATT	2	6	144920	144925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698103
3115	NC_016810	AC	3	6	145054	145059	50 %	0 %	0 %	50 %	378698104
3116	NC_016810	CTG	2	6	145158	145163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698104
3117	NC_016810	GTC	2	6	145168	145173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698104
3118	NC_016810	GCC	2	6	145236	145241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698104
3119	NC_016810	GTG	2	6	145269	145274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698104
3120	NC_016810	CCG	2	6	145318	145323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698104
3121	NC_016810	AAC	2	6	145371	145376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698104
3122	NC_016810	GCT	2	6	145397	145402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698104
3123	NC_016810	GCG	2	6	145497	145502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698104
3124	NC_016810	GGC	3	9	145517	145525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698104
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3144	NC_016810	CT	3	6	146468	146473	0 %	50 %	0 %	50 %	378698105
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3152	NC_016810	TCG	2	6	146766	146771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698105
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3154	NC_016810	CTG	2	6	146849	146854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698105
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3241	NC_016810	GCA	2	6	150817	150822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698108
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3363	NC_016810	GGC	2	6	156777	156782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698113
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3488	NC_016810	TCT	2	6	163169	163174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698119
3489	NC_016810	TTA	2	6	163305	163310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698120
3490	NC_016810	GC	3	6	163337	163342	0 %	0 %	50 %	50 %	378698120
3491	NC_016810	CG	3	6	163384	163389	0 %	0 %	50 %	50 %	378698120
3492	NC_016810	CAT	2	6	163393	163398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698120
3493	NC_016810	CGTCA	2	10	163433	163442	20 %	20 %	20 %	40 %	378698120
3494	NC_016810	ACC	2	6	163443	163448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698120
3495	NC_016810	CAG	2	6	163487	163492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698120
3496	NC_016810	CTG	2	6	163526	163531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698120
3497	NC_016810	CTG	2	6	163550	163555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698120
3498	NC_016810	TTC	2	6	163592	163597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698120
3499	NC_016810	A	6	6	163606	163611	100 %	0 %	0 %	0 %	378698120
3500	NC_016810	CGG	2	6	163648	163653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698120

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