MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016810	CAG	2	6	45746	45751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698022
1002	NC_016810	TGA	2	6	45790	45795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698022
1003	NC_016810	GCT	2	6	45871	45876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698022
1004	NC_016810	TAC	2	6	45941	45946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698022
1005	NC_016810	AACG	2	8	45958	45965	50 %	0 %	25 %	25 %	378698022
1006	NC_016810	ATC	2	6	46034	46039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_016810	TGAC	2	8	46042	46049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_016810	A	6	6	46056	46061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_016810	A	6	6	46090	46095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_016810	TCA	2	6	46104	46109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_016810	TA	3	6	46110	46115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016810	TAG	2	6	46150	46155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_016810	GAA	2	6	46160	46165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016810	GA	3	6	46177	46182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_016810	T	6	6	46208	46213	0 %	100 %	0 %	0 %	378698023
1016	NC_016810	AGC	2	6	46214	46219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698023
1017	NC_016810	CAT	2	6	46234	46239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698023
1018	NC_016810	TCA	2	6	46242	46247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698023
1019	NC_016810	CGC	2	6	46249	46254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698023
1020	NC_016810	CAA	2	6	46354	46359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698023
1021	NC_016810	TGT	2	6	46368	46373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698023
1022	NC_016810	GCC	2	6	46487	46492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698023
1023	NC_016810	CGG	2	6	46495	46500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698023
1024	NC_016810	GAT	2	6	46501	46506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698023
1025	NC_016810	ACT	2	6	46536	46541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698023
1026	NC_016810	GGGCT	2	10	46561	46570	0 %	20 %	60 %	20 %	378698023
1027	NC_016810	ATC	2	6	46670	46675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698023
1028	NC_016810	GAT	2	6	46676	46681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698023
1029	NC_016810	TTA	2	6	46695	46700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698023
1030	NC_016810	GGC	2	6	46747	46752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698023
1031	NC_016810	GCT	2	6	46774	46779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698023
1032	NC_016810	GCG	2	6	46788	46793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698023
1033	NC_016810	TA	3	6	46809	46814	50 %	50 %	0 %	0 %	378698023
1034	NC_016810	CGG	2	6	46839	46844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698023
1035	NC_016810	GAAA	2	8	46906	46913	75 %	0 %	25 %	0 %	378698023
1036	NC_016810	TCGC	2	8	46921	46928	0 %	25 %	25 %	50 %	378698023
1037	NC_016810	TGC	2	6	47049	47054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698023
1038	NC_016810	ATT	2	6	47063	47068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698023
1039	NC_016810	CTG	2	6	47075	47080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698023
1040	NC_016810	GCTG	2	8	47112	47119	0 %	25 %	50 %	25 %	378698023
1041	NC_016810	TG	3	6	47190	47195	0 %	50 %	50 %	0 %	378698023
1042	NC_016810	TTA	2	6	47259	47264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698023
1043	NC_016810	GTG	2	6	47309	47314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698023
1044	NC_016810	GC	4	8	47329	47336	0 %	0 %	50 %	50 %	378698023
1045	NC_016810	GA	3	6	47411	47416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_016810	TAT	2	6	47451	47456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698024
1047	NC_016810	AAG	2	6	47473	47478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698024
1048	NC_016810	CGC	2	6	47515	47520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698024
1049	NC_016810	TGT	2	6	47701	47706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698024
1050	NC_016810	CAG	2	6	47747	47752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698024
1051	NC_016810	GCG	2	6	47763	47768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698024
1052	NC_016810	GTG	3	9	47769	47777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698024
1053	NC_016810	CACG	2	8	47810	47817	25 %	0 %	25 %	50 %	378698024
1054	NC_016810	CAGC	2	8	47837	47844	25 %	0 %	25 %	50 %	378698024
1055	NC_016810	GCA	2	6	47888	47893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698024
1056	NC_016810	CTGC	2	8	47974	47981	0 %	25 %	25 %	50 %	378698024
1057	NC_016810	GTT	2	6	48035	48040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698024
1058	NC_016810	TGA	2	6	48089	48094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698024
1059	NC_016810	GAA	2	6	48219	48224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698024
1060	NC_016810	GA	3	6	48243	48248	50 %	0 %	50 %	0 %	378698024
1061	NC_016810	CGG	2	6	48262	48267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698024
1062	NC_016810	ACT	2	6	48289	48294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698024
1063	NC_016810	TACC	2	8	48321	48328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_016810	CAG	2	6	48381	48386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698025
1065	NC_016810	GCGTA	2	10	48437	48446	20 %	20 %	40 %	20 %	378698025
1066	NC_016810	CCT	2	6	48460	48465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698025
1067	NC_016810	CATG	2	8	48542	48549	25 %	25 %	25 %	25 %	378698025
1068	NC_016810	CAG	2	6	48561	48566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698025
1069	NC_016810	TCC	2	6	48670	48675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698025
1070	NC_016810	CCA	2	6	48928	48933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698025
1071	NC_016810	CCG	2	6	48940	48945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698025
1072	NC_016810	CGT	2	6	48951	48956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698025
1073	NC_016810	CCA	2	6	48957	48962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698025
1074	NC_016810	GCA	2	6	48994	48999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698025
1075	NC_016810	GAG	2	6	49024	49029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698025
1076	NC_016810	GACCA	2	10	49042	49051	40 %	0 %	20 %	40 %	378698025
1077	NC_016810	A	6	6	49134	49139	100 %	0 %	0 %	0 %	378698025
1078	NC_016810	CCGGC	2	10	49184	49193	0 %	0 %	40 %	60 %	378698025
1079	NC_016810	GTCGTA	2	12	49209	49220	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378698025
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1081	NC_016810	AAGT	2	8	49336	49343	50 %	25 %	25 %	0 %	378698025
1082	NC_016810	CCAG	2	8	49394	49401	25 %	0 %	25 %	50 %	378698025
1083	NC_016810	CG	3	6	49523	49528	0 %	0 %	50 %	50 %	378698025
1084	NC_016810	AAG	2	6	49564	49569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698025
1085	NC_016810	GCG	2	6	49599	49604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698025
1086	NC_016810	CAG	2	6	49626	49631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698025
1087	NC_016810	CAT	2	6	49689	49694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698025
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1089	NC_016810	AGT	2	6	49763	49768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698025
1090	NC_016810	GTT	2	6	49839	49844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698025
1091	NC_016810	T	6	6	49973	49978	0 %	100 %	0 %	0 %	378698025
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1093	NC_016810	TG	3	6	50141	50146	0 %	50 %	50 %	0 %	378698025
1094	NC_016810	TTGA	2	8	50175	50182	25 %	50 %	25 %	0 %	378698025
1095	NC_016810	TGG	2	6	50218	50223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698025
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1097	NC_016810	CAGAC	2	10	50374	50383	40 %	0 %	20 %	40 %	378698025
1098	NC_016810	TTG	2	6	50394	50399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698025
1099	NC_016810	TGG	2	6	50411	50416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698025
1100	NC_016810	TCT	2	6	50483	50488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698026
1101	NC_016810	GAAA	2	8	50510	50517	75 %	0 %	25 %	0 %	378698026
1102	NC_016810	AGT	2	6	50518	50523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698026
1103	NC_016810	GCA	2	6	50593	50598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698026
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1107	NC_016810	GCCA	2	8	50851	50858	25 %	0 %	25 %	50 %	378698026
1108	NC_016810	CAT	2	6	50859	50864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698026
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1110	NC_016810	CAG	2	6	50886	50891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698026
1111	NC_016810	AAG	2	6	50932	50937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698026
1112	NC_016810	GAT	2	6	50946	50951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698026
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1117	NC_016810	CGC	2	6	51117	51122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698026
1118	NC_016810	T	7	7	51128	51134	0 %	100 %	0 %	0 %	378698026
1119	NC_016810	GC	3	6	51209	51214	0 %	0 %	50 %	50 %	378698026
1120	NC_016810	TAAA	2	8	51244	51251	75 %	25 %	0 %	0 %	378698026
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1127	NC_016810	TGC	2	6	51456	51461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698026
1128	NC_016810	GC	3	6	51509	51514	0 %	0 %	50 %	50 %	378698026
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1133	NC_016810	CAG	2	6	51723	51728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698026
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1141	NC_016810	ATT	2	6	51985	51990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1239	NC_016810	GC	3	6	57008	57013	0 %	0 %	50 %	50 %	378698031
1240	NC_016810	TGT	2	6	57048	57053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698031
1241	NC_016810	CGGCG	2	10	57126	57135	0 %	0 %	60 %	40 %	378698031
1242	NC_016810	AGCGC	2	10	57234	57243	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1243	NC_016810	GTG	2	6	57256	57261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1244	NC_016810	TTCAC	2	10	57381	57390	20 %	40 %	0 %	40 %	378698032
1245	NC_016810	GAT	2	6	57401	57406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698032
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1247	NC_016810	AGCC	2	8	57441	57448	25 %	0 %	25 %	50 %	378698032
1248	NC_016810	AGC	3	9	57489	57497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698032
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1250	NC_016810	AAAG	2	8	57520	57527	75 %	0 %	25 %	0 %	378698032
1251	NC_016810	CGC	2	6	57547	57552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698032
1252	NC_016810	GGC	2	6	57607	57612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698032
1253	NC_016810	ATGG	2	8	57653	57660	25 %	25 %	50 %	0 %	378698032
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