MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_016810	GCG	2	6	519791	519796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698424
11002	NC_016810	CAT	2	6	519829	519834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_016810	CGT	2	6	519839	519844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_016810	TTTC	2	8	519853	519860	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11005	NC_016810	CGC	2	6	519897	519902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11006	NC_016810	CTCG	2	8	519917	519924	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11007	NC_016810	AGA	2	6	519959	519964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_016810	GCG	2	6	519973	519978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_016810	GGA	2	6	520050	520055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698425
11010	NC_016810	TTC	2	6	520071	520076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698425
11011	NC_016810	CGCGG	2	10	520150	520159	0 %	0 %	60 %	40 %	378698425
11012	NC_016810	CGA	2	6	520209	520214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698425
11013	NC_016810	ATC	2	6	520237	520242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698425
11014	NC_016810	TCG	2	6	520286	520291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698425
11015	NC_016810	AGC	2	6	520338	520343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698425
11016	NC_016810	CA	3	6	520358	520363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11017	NC_016810	A	6	6	520377	520382	100 %	0 %	0 %	0 %	378698426
11018	NC_016810	GAT	2	6	520393	520398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698426
11019	NC_016810	GCT	2	6	520423	520428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698426
11020	NC_016810	CGG	2	6	520452	520457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698426
11021	NC_016810	ATG	2	6	520484	520489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698426
11022	NC_016810	CGG	2	6	520543	520548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698426
11023	NC_016810	GTG	2	6	520625	520630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698426
11024	NC_016810	T	6	6	520666	520671	0 %	100 %	0 %	0 %	378698426
11025	NC_016810	GAA	2	6	520696	520701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698426
11026	NC_016810	CGG	2	6	520713	520718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698426
11027	NC_016810	GC	3	6	520797	520802	0 %	0 %	50 %	50 %	378698426
11028	NC_016810	CGG	2	6	520824	520829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698426
11029	NC_016810	GTG	2	6	520844	520849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698426
11030	NC_016810	CT	3	6	520859	520864	0 %	50 %	0 %	50 %	378698426
11031	NC_016810	GCG	2	6	520893	520898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698426
11032	NC_016810	CTG	2	6	520901	520906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698426
11033	NC_016810	GCT	2	6	520907	520912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698426
11034	NC_016810	GC	3	6	520917	520922	0 %	0 %	50 %	50 %	378698426
11035	NC_016810	TGG	2	6	520933	520938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698426
11036	NC_016810	GTG	2	6	520943	520948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698426
11037	NC_016810	CGC	2	6	520957	520962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698426
11038	NC_016810	GCTGG	2	10	520967	520976	0 %	20 %	60 %	20 %	378698426
11039	NC_016810	GAAG	2	8	521014	521021	50 %	0 %	50 %	0 %	378698426
11040	NC_016810	AGC	2	6	521125	521130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698426
11041	NC_016810	GTG	2	6	521150	521155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698426
11042	NC_016810	CCG	3	9	521160	521168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698426
11043	NC_016810	CTG	2	6	521219	521224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698426
11044	NC_016810	GTTGGC	2	12	521282	521293	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378698426
11045	NC_016810	GC	3	6	521295	521300	0 %	0 %	50 %	50 %	378698426
11046	NC_016810	GAT	2	6	521372	521377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698426
11047	NC_016810	GCC	2	6	521444	521449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698426
11048	NC_016810	GCG	2	6	521460	521465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698426
11049	NC_016810	GTC	2	6	521534	521539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698426
11050	NC_016810	TTG	2	6	521559	521564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698426
11051	NC_016810	TTG	2	6	521586	521591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698426
11052	NC_016810	GCGCT	2	10	521688	521697	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11053	NC_016810	TCA	2	6	521732	521737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11054	NC_016810	CGC	2	6	521747	521752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11055	NC_016810	T	6	6	521764	521769	0 %	100 %	0 %	0 %	378698427
11056	NC_016810	GC	3	6	521815	521820	0 %	0 %	50 %	50 %	378698427
11057	NC_016810	CGC	2	6	521839	521844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698427
11058	NC_016810	CATT	2	8	521898	521905	25 %	50 %	0 %	25 %	378698427
11059	NC_016810	GGAA	2	8	522003	522010	50 %	0 %	50 %	0 %	378698427
11060	NC_016810	GCG	2	6	522105	522110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698427
11061	NC_016810	TTTC	2	8	522178	522185	0 %	75 %	0 %	25 %	378698427
11062	NC_016810	CGG	2	6	522191	522196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698427
11063	NC_016810	T	6	6	522271	522276	0 %	100 %	0 %	0 %	378698427
11064	NC_016810	CGG	2	6	522357	522362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698427
11065	NC_016810	GCA	2	6	522385	522390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698427
11066	NC_016810	GAAT	2	8	522449	522456	50 %	25 %	25 %	0 %	378698427
11067	NC_016810	GGC	2	6	522488	522493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698427
11068	NC_016810	CAC	2	6	522509	522514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698427
11069	NC_016810	CTT	2	6	522571	522576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698427
11070	NC_016810	T	6	6	522580	522585	0 %	100 %	0 %	0 %	378698427
11071	NC_016810	AAT	2	6	522594	522599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698427
11072	NC_016810	ATT	2	6	522608	522613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698427
11073	NC_016810	CATA	2	8	522626	522633	50 %	25 %	0 %	25 %	378698427
11074	NC_016810	CGG	2	6	522796	522801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11075	NC_016810	G	6	6	522800	522805	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_016810	CTG	2	6	522812	522817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11077	NC_016810	TGA	2	6	522824	522829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_016810	TGAA	2	8	522840	522847	50 %	25 %	25 %	0 %	378698428
11079	NC_016810	GGC	2	6	522890	522895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698428
11080	NC_016810	CTA	2	6	522967	522972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698428
11081	NC_016810	GCC	2	6	523025	523030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698428
11082	NC_016810	GCTG	2	8	523067	523074	0 %	25 %	50 %	25 %	378698428
11083	NC_016810	GTAC	2	8	523107	523114	25 %	25 %	25 %	25 %	378698428
11084	NC_016810	CG	3	6	523178	523183	0 %	0 %	50 %	50 %	378698428
11085	NC_016810	TCC	2	6	523186	523191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698428
11086	NC_016810	ATA	2	6	523213	523218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698428
11087	NC_016810	TATT	2	8	523225	523232	25 %	75 %	0 %	0 %	378698428
11088	NC_016810	TAA	2	6	523256	523261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698428
11089	NC_016810	GGC	2	6	523263	523268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698428
11090	NC_016810	CGG	2	6	523306	523311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698428
11091	NC_016810	GGT	2	6	523329	523334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698428
11092	NC_016810	CGA	3	9	523336	523344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698428
11093	NC_016810	TCT	2	6	523380	523385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698428
11094	NC_016810	ACC	2	6	523494	523499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698429
11095	NC_016810	CAC	2	6	523574	523579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698429
11096	NC_016810	TGC	2	6	523597	523602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698429
11097	NC_016810	CCG	2	6	523626	523631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698429
11098	NC_016810	CGC	2	6	523640	523645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698429
11099	NC_016810	CGA	2	6	523711	523716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698429
11100	NC_016810	ATA	2	6	523755	523760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698429
11101	NC_016810	G	6	6	523798	523803	0 %	0 %	100 %	0 %	378698429
11102	NC_016810	CAGGT	2	10	523951	523960	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11103	NC_016810	GGAA	2	8	523963	523970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_016810	CCCA	2	8	524018	524025	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11105	NC_016810	CTG	2	6	524052	524057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11106	NC_016810	AAT	2	6	524230	524235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698430
11107	NC_016810	GCG	2	6	524238	524243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698430
11108	NC_016810	ACATCC	2	12	524294	524305	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	378698430
11109	NC_016810	TCA	2	6	524348	524353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698430
11110	NC_016810	GC	3	6	524397	524402	0 %	0 %	50 %	50 %	378698430
11111	NC_016810	CAG	2	6	524476	524481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698430
11112	NC_016810	GATT	2	8	524532	524539	25 %	50 %	25 %	0 %	378698430
11113	NC_016810	TGT	2	6	524546	524551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698430
11114	NC_016810	GAT	2	6	524599	524604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698430
11115	NC_016810	CAGC	2	8	524640	524647	25 %	0 %	25 %	50 %	378698430
11116	NC_016810	AAGG	2	8	524668	524675	50 %	0 %	50 %	0 %	378698430
11117	NC_016810	GCT	2	6	524728	524733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698430
11118	NC_016810	CAG	2	6	524848	524853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698430
11119	NC_016810	CCG	2	6	524868	524873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698430
11120	NC_016810	AGCGG	2	10	524912	524921	20 %	0 %	60 %	20 %	378698430
11121	NC_016810	GAA	2	6	525027	525032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698430
11122	NC_016810	GCT	2	6	525052	525057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698430
11123	NC_016810	AAT	2	6	525085	525090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698430
11124	NC_016810	ATC	2	6	525149	525154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698430
11125	NC_016810	GCC	2	6	525179	525184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698430
11126	NC_016810	CT	3	6	525281	525286	0 %	50 %	0 %	50 %	378698430
11127	NC_016810	GAG	2	6	525296	525301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698430
11128	NC_016810	GCG	2	6	525364	525369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698430
11129	NC_016810	CTG	2	6	525389	525394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698430
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11131	NC_016810	GCCA	2	8	525530	525537	25 %	0 %	25 %	50 %	378698430
11132	NC_016810	GACA	2	8	525562	525569	50 %	0 %	25 %	25 %	378698430
11133	NC_016810	GCC	2	6	525746	525751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11134	NC_016810	TGTTA	2	10	525809	525818	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11135	NC_016810	CGT	2	6	525872	525877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698431
11136	NC_016810	TCA	2	6	525987	525992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698431
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11139	NC_016810	A	7	7	526232	526238	100 %	0 %	0 %	0 %	378698432
11140	NC_016810	A	6	6	526245	526250	100 %	0 %	0 %	0 %	378698432
11141	NC_016810	AGGG	2	8	526280	526287	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11142	NC_016810	T	6	6	526295	526300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11143	NC_016810	GGCT	2	8	526307	526314	0 %	25 %	50 %	25 %	378698433
11144	NC_016810	T	6	6	526373	526378	0 %	100 %	0 %	0 %	378698433
11145	NC_016810	GAA	2	6	526418	526423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698433
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11151	NC_016810	GCA	2	6	526610	526615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698433
11152	NC_016810	ATAA	2	8	526654	526661	75 %	25 %	0 %	0 %	378698433
11153	NC_016810	TCA	2	6	526732	526737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698433
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11156	NC_016810	T	6	6	526895	526900	0 %	100 %	0 %	0 %	378698434
11157	NC_016810	T	6	6	526947	526952	0 %	100 %	0 %	0 %	378698434
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11164	NC_016810	TCA	2	6	527316	527321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698434
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11170	NC_016810	TGG	2	6	527454	527459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11171	NC_016810	AAT	2	6	527479	527484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11172	NC_016810	TGCTAT	2	12	527508	527519	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11173	NC_016810	TTA	2	6	527556	527561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11174	NC_016810	GAG	2	6	527570	527575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11175	NC_016810	GAAT	2	8	527624	527631	50 %	25 %	25 %	0 %	378698435
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11191	NC_016810	TCG	2	6	528435	528440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11197	NC_016810	AATC	2	8	528656	528663	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11198	NC_016810	A	6	6	528695	528700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11230	NC_016810	TGCG	2	8	530122	530129	0 %	25 %	50 %	25 %	378698437
11231	NC_016810	TTGCG	2	10	530133	530142	0 %	40 %	40 %	20 %	378698437
11232	NC_016810	AAGA	2	8	530194	530201	75 %	0 %	25 %	0 %	378698437
11233	NC_016810	ACGA	2	8	530211	530218	50 %	0 %	25 %	25 %	378698437
11234	NC_016810	CGA	3	9	530234	530242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698437
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11241	NC_016810	AATA	2	8	530523	530530	75 %	25 %	0 %	0 %	378698437
11242	NC_016810	CCG	2	6	530531	530536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698437
11243	NC_016810	CCA	2	6	530555	530560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698437
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11245	NC_016810	CTT	2	6	530615	530620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698437
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11365	NC_016810	ACC	2	6	536162	536167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698440
11366	NC_016810	TGC	2	6	536238	536243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698440
11367	NC_016810	GCG	2	6	536258	536263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698440
11368	NC_016810	CG	3	6	536282	536287	0 %	0 %	50 %	50 %	378698440
11369	NC_016810	TCG	2	6	536293	536298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698440
11370	NC_016810	GAA	2	6	536342	536347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698440
11371	NC_016810	CCA	2	6	536349	536354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698440
11372	NC_016810	TGC	2	6	536397	536402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698440
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11375	NC_016810	TGG	2	6	536574	536579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698440
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11389	NC_016810	ATCG	2	8	537236	537243	25 %	25 %	25 %	25 %	378698440
11390	NC_016810	CGA	2	6	537313	537318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698440
11391	NC_016810	TGAAG	2	10	537325	537334	40 %	20 %	40 %	0 %	378698440
11392	NC_016810	CGG	2	6	537346	537351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698440
11393	NC_016810	CG	3	6	537389	537394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11394	NC_016810	GC	3	6	537405	537410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11395	NC_016810	GC	4	8	537515	537522	0 %	0 %	50 %	50 %	378698441
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11414	NC_016810	GTC	2	6	538438	538443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698442
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11438	NC_016810	CTG	2	6	539521	539526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11439	NC_016810	TGAT	2	8	539549	539556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11440	NC_016810	CAA	2	6	539563	539568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11441	NC_016810	CAGGCG	2	12	539639	539650	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11442	NC_016810	AT	3	6	539722	539727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11443	NC_016810	CAG	2	6	539745	539750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698444
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11455	NC_016810	CGT	2	6	540445	540450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698445
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11458	NC_016810	CG	3	6	540531	540536	0 %	0 %	50 %	50 %	378698445
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11474	NC_016810	GCT	2	6	541234	541239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698445
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11487	NC_016810	GC	4	8	541651	541658	0 %	0 %	50 %	50 %	378698445
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11491	NC_016810	GC	3	6	541766	541771	0 %	0 %	50 %	50 %	378698445
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