MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
103001	NC_016810	AGACG	2	10	4870284	4870293	40 %	0 %	40 %	20 %	378702423
103002	NC_016810	ACC	2	6	4870381	4870386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378702423
103003	NC_016810	T	6	6	4870435	4870440	0 %	100 %	0 %	0 %	378702423
103004	NC_016810	CGT	2	6	4870449	4870454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378702423
103005	NC_016810	ACG	2	6	4870498	4870503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378702423
103006	NC_016810	ATG	2	6	4870582	4870587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378702423
103007	NC_016810	GTC	2	6	4870590	4870595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378702423
103008	NC_016810	CGC	2	6	4870637	4870642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378702423
103009	NC_016810	CCG	2	6	4870690	4870695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378702423
103010	NC_016810	TGG	2	6	4870742	4870747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378702423
103011	NC_016810	GA	3	6	4870786	4870791	50 %	0 %	50 %	0 %	378702423
103012	NC_016810	ATTG	2	8	4870914	4870921	25 %	50 %	25 %	0 %	378702423
103013	NC_016810	TCG	2	6	4870951	4870956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378702423
103014	NC_016810	TGT	2	6	4871027	4871032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378702423
103015	NC_016810	ATG	2	6	4871048	4871053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378702423
103016	NC_016810	TA	3	6	4871084	4871089	50 %	50 %	0 %	0 %	378702423
103017	NC_016810	AGTG	2	8	4871091	4871098	25 %	25 %	50 %	0 %	378702423
103018	NC_016810	TAT	2	6	4871168	4871173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378702423
103019	NC_016810	GTA	2	6	4871205	4871210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378702423
103020	NC_016810	CAT	2	6	4871423	4871428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378702423
103021	NC_016810	CT	3	6	4871440	4871445	0 %	50 %	0 %	50 %	378702423
103022	NC_016810	GCC	2	6	4871466	4871471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378702423
103023	NC_016810	TGA	2	6	4871529	4871534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378702423
103024	NC_016810	CCG	2	6	4871668	4871673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378702423
103025	NC_016810	CCG	2	6	4871705	4871710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378702423
103026	NC_016810	GC	3	6	4871759	4871764	0 %	0 %	50 %	50 %	378702423
103027	NC_016810	TCA	2	6	4871827	4871832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378702423
103028	NC_016810	AGT	2	6	4871996	4872001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378702423
103029	NC_016810	TCCG	2	8	4872061	4872068	0 %	25 %	25 %	50 %	378702423
103030	NC_016810	TCA	2	6	4872073	4872078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378702423
103031	NC_016810	A	6	6	4872118	4872123	100 %	0 %	0 %	0 %	378702423
103032	NC_016810	GCCA	2	8	4872243	4872250	25 %	0 %	25 %	50 %	378702423
103033	NC_016810	GTT	2	6	4872329	4872334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378702423
103034	NC_016810	TTA	2	6	4872364	4872369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378702423
103035	NC_016810	CTG	2	6	4872371	4872376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378702423
103036	NC_016810	T	6	6	4872378	4872383	0 %	100 %	0 %	0 %	378702423
103037	NC_016810	T	6	6	4872400	4872405	0 %	100 %	0 %	0 %	378702423
103038	NC_016810	TTA	2	6	4872421	4872426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378702423
103039	NC_016810	CTGC	2	8	4872455	4872462	0 %	25 %	25 %	50 %	378702423
103040	NC_016810	C	7	7	4872462	4872468	0 %	0 %	0 %	100 %	378702423
103041	NC_016810	TCA	2	6	4872508	4872513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378702423
103042	NC_016810	GTAAAA	2	12	4872648	4872659	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103043	NC_016810	GGC	2	6	4872750	4872755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378702424
103044	NC_016810	TGA	2	6	4872780	4872785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378702424
103045	NC_016810	ATA	2	6	4872852	4872857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378702424
103046	NC_016810	TAA	2	6	4872878	4872883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378702424
103047	NC_016810	TTG	2	6	4872909	4872914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378702424
103048	NC_016810	AT	3	6	4872957	4872962	50 %	50 %	0 %	0 %	378702424
103049	NC_016810	ATC	2	6	4873014	4873019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378702424
103050	NC_016810	G	6	6	4873076	4873081	0 %	0 %	100 %	0 %	378702424
103051	NC_016810	ATA	2	6	4873147	4873152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378702424
103052	NC_016810	ATTG	2	8	4873236	4873243	25 %	50 %	25 %	0 %	378702424
103053	NC_016810	TCA	2	6	4873249	4873254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378702424
103054	NC_016810	CAA	3	9	4873286	4873294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378702424
103055	NC_016810	T	6	6	4873358	4873363	0 %	100 %	0 %	0 %	378702424
103056	NC_016810	CCTG	2	8	4873399	4873406	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103057	NC_016810	GGC	2	6	4873507	4873512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378702425
103058	NC_016810	CTG	2	6	4873527	4873532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378702425
103059	NC_016810	CAT	2	6	4873563	4873568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378702425
103060	NC_016810	ATC	2	6	4873678	4873683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378702425
103061	NC_016810	TGG	2	6	4873830	4873835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378702425
103062	NC_016810	GAT	2	6	4873951	4873956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378702425
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103065	NC_016810	ATAAA	2	10	4874021	4874030	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103066	NC_016810	ATATT	2	10	4874031	4874040	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103067	NC_016810	CTT	2	6	4874055	4874060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103068	NC_016810	TCTGT	2	10	4874061	4874070	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103069	NC_016810	GGC	2	6	4874080	4874085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103070	NC_016810	TAA	2	6	4874172	4874177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103071	NC_016810	AAG	2	6	4874188	4874193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103072	NC_016810	TGA	2	6	4874200	4874205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103073	NC_016810	T	6	6	4874229	4874234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103074	NC_016810	ATA	2	6	4874236	4874241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103075	NC_016810	TTA	2	6	4874243	4874248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103077	NC_016810	TTTA	2	8	4874261	4874268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103078	NC_016810	TAA	2	6	4874289	4874294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103079	NC_016810	ACG	2	6	4874298	4874303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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103081	NC_016810	CTG	2	6	4874433	4874438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378702426
103082	NC_016810	TCA	2	6	4874614	4874619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378702426
103083	NC_016810	ATA	2	6	4874652	4874657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378702426
103084	NC_016810	GGT	2	6	4874664	4874669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378702426
103085	NC_016810	A	6	6	4874679	4874684	100 %	0 %	0 %	0 %	378702426
103086	NC_016810	TCT	2	6	4874698	4874703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378702426
103087	NC_016810	GATT	2	8	4874830	4874837	25 %	50 %	25 %	0 %	378702426
103088	NC_016810	T	7	7	4874932	4874938	0 %	100 %	0 %	0 %	378702426
103089	NC_016810	CCG	2	6	4874965	4874970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378702426
103090	NC_016810	ATT	2	6	4874994	4874999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103091	NC_016810	CAA	2	6	4875084	4875089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103092	NC_016810	TGA	2	6	4875166	4875171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103093	NC_016810	AGCGA	2	10	4875243	4875252	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103094	NC_016810	GGA	2	6	4875267	4875272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103095	NC_016810	GA	3	6	4875280	4875285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103096	NC_016810	GGCG	2	8	4875301	4875308	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103097	NC_016810	CGC	2	6	4875328	4875333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103098	NC_016810	CTC	2	6	4875343	4875348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103099	NC_016810	CGG	2	6	4875350	4875355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103100	NC_016810	GAT	2	6	4875404	4875409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103101	NC_016810	TCA	2	6	4875446	4875451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103102	NC_016810	ATT	2	6	4875501	4875506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103103	NC_016810	AGC	2	6	4875612	4875617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103104	NC_016810	TGA	2	6	4875627	4875632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103105	NC_016810	AGC	2	6	4875659	4875664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103106	NC_016810	T	6	6	4875675	4875680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103107	NC_016810	T	6	6	4875719	4875724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103108	NC_016810	AGG	2	6	4875852	4875857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103109	NC_016810	CGC	2	6	4875964	4875969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378702427
103110	NC_016810	TGG	2	6	4875994	4875999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378702427
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103113	NC_016810	TTC	2	6	4876104	4876109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378702427
103114	NC_016810	GC	3	6	4876119	4876124	0 %	0 %	50 %	50 %	378702427
103115	NC_016810	GCA	2	6	4876156	4876161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378702427
103116	NC_016810	CG	3	6	4876163	4876168	0 %	0 %	50 %	50 %	378702427
103117	NC_016810	ACG	2	6	4876271	4876276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378702427
103118	NC_016810	CAG	2	6	4876313	4876318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378702427
103119	NC_016810	ATC	2	6	4876370	4876375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378702427
103120	NC_016810	AG	3	6	4876535	4876540	50 %	0 %	50 %	0 %	378702427
103121	NC_016810	CAT	2	6	4876579	4876584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378702427
103122	NC_016810	CCTG	2	8	4876721	4876728	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103123	NC_016810	CAA	2	6	4876809	4876814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378702428
103124	NC_016810	CAT	2	6	4876815	4876820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378702428
103125	NC_016810	TAA	2	6	4876926	4876931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103126	NC_016810	AT	3	6	4876949	4876954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103127	NC_016810	TGA	2	6	4876983	4876988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103128	NC_016810	ATC	2	6	4876990	4876995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103129	NC_016810	TCA	2	6	4877014	4877019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103130	NC_016810	TAA	2	6	4877057	4877062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103131	NC_016810	TGA	2	6	4877066	4877071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103132	NC_016810	TAAAT	2	10	4877094	4877103	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103133	NC_016810	TAAA	2	8	4877109	4877116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103134	NC_016810	GCC	2	6	4877356	4877361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378702429
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103138	NC_016810	TAC	2	6	4877560	4877565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378702429
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103147	NC_016810	A	8	8	4877969	4877976	100 %	0 %	0 %	0 %	378702429
103148	NC_016810	ATA	2	6	4878007	4878012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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