MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016810	CGG	2	6	22994	22999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698002
502	NC_016810	CTGG	2	8	23000	23007	0 %	25 %	50 %	25 %	378698002
503	NC_016810	TAT	2	6	23025	23030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698002
504	NC_016810	ATA	2	6	23051	23056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698002
505	NC_016810	TTA	2	6	23166	23171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016810	TCTTAA	2	12	23203	23214	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
507	NC_016810	TTAT	2	8	23265	23272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016810	A	7	7	23338	23344	100 %	0 %	0 %	0 %	378698003
509	NC_016810	TGA	2	6	23345	23350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698003
510	NC_016810	ACG	2	6	23351	23356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698003
511	NC_016810	ATA	2	6	23369	23374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698003
512	NC_016810	CTTTT	2	10	23393	23402	0 %	80 %	0 %	20 %	378698003
513	NC_016810	T	6	6	23399	23404	0 %	100 %	0 %	0 %	378698003
514	NC_016810	CAG	2	6	23407	23412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698003
515	NC_016810	TTG	2	6	23452	23457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698003
516	NC_016810	TTTA	2	8	23498	23505	25 %	75 %	0 %	0 %	378698003
517	NC_016810	GTT	2	6	23548	23553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698003
518	NC_016810	ATG	2	6	23564	23569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698003
519	NC_016810	AT	3	6	23582	23587	50 %	50 %	0 %	0 %	378698003
520	NC_016810	CG	3	6	23652	23657	0 %	0 %	50 %	50 %	378698003
521	NC_016810	ACG	2	6	23753	23758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698003
522	NC_016810	TGA	2	6	23789	23794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698003
523	NC_016810	GC	4	8	23795	23802	0 %	0 %	50 %	50 %	378698003
524	NC_016810	GCT	2	6	23847	23852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698003
525	NC_016810	TCTG	2	8	23955	23962	0 %	50 %	25 %	25 %	378698003
526	NC_016810	A	7	7	23967	23973	100 %	0 %	0 %	0 %	378698003
527	NC_016810	GGC	2	6	23999	24004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698003
528	NC_016810	AT	3	6	24056	24061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016810	GTT	2	6	24116	24121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016810	ACA	2	6	24195	24200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_016810	GAT	2	6	24232	24237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016810	TAA	2	6	24259	24264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016810	TAA	2	6	24266	24271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016810	ACG	2	6	24306	24311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_016810	AAG	2	6	24353	24358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016810	T	7	7	24363	24369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016810	GAA	2	6	24399	24404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016810	CAG	2	6	24409	24414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_016810	A	6	6	24425	24430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_016810	TGAA	2	8	24466	24473	50 %	25 %	25 %	0 %	378698004
541	NC_016810	TGT	2	6	24521	24526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698004
542	NC_016810	TAC	2	6	24543	24548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698004
543	NC_016810	CGGTA	2	10	24561	24570	20 %	20 %	40 %	20 %	378698004
544	NC_016810	CGC	2	6	24594	24599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698004
545	NC_016810	CTGTT	2	10	24600	24609	0 %	60 %	20 %	20 %	378698004
546	NC_016810	TGG	2	6	24680	24685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698004
547	NC_016810	AGA	2	6	24696	24701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698004
548	NC_016810	CCAG	2	8	24737	24744	25 %	0 %	25 %	50 %	378698004
549	NC_016810	GCG	2	6	24748	24753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698004
550	NC_016810	CGA	2	6	24824	24829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698004
551	NC_016810	ATG	2	6	24905	24910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698004
552	NC_016810	T	7	7	25025	25031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016810	CG	3	6	25064	25069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
554	NC_016810	A	8	8	25115	25122	100 %	0 %	0 %	0 %	378698005
555	NC_016810	ATT	2	6	25141	25146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698005
556	NC_016810	CTG	2	6	25151	25156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698005
557	NC_016810	CGG	2	6	25158	25163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698005
558	NC_016810	CCT	2	6	25245	25250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698005
559	NC_016810	ATT	2	6	25256	25261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698005
560	NC_016810	TTC	2	6	25264	25269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698005
561	NC_016810	T	7	7	25281	25287	0 %	100 %	0 %	0 %	378698005
562	NC_016810	CGC	2	6	25344	25349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698005
563	NC_016810	CT	3	6	25350	25355	0 %	50 %	0 %	50 %	378698005
564	NC_016810	A	6	6	25370	25375	100 %	0 %	0 %	0 %	378698005
565	NC_016810	AT	3	6	25380	25385	50 %	50 %	0 %	0 %	378698005
566	NC_016810	TAT	2	6	25390	25395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698005
567	NC_016810	ACCG	2	8	25414	25421	25 %	0 %	25 %	50 %	378698005
568	NC_016810	TATTT	2	10	25434	25443	20 %	80 %	0 %	0 %	378698005
569	NC_016810	AAAT	2	8	25474	25481	75 %	25 %	0 %	0 %	378698005
570	NC_016810	TAC	2	6	25631	25636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698005
571	NC_016810	A	6	6	25667	25672	100 %	0 %	0 %	0 %	378698005
572	NC_016810	CCG	2	6	25691	25696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698005
573	NC_016810	ACG	2	6	25766	25771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698005
574	NC_016810	ATG	2	6	25795	25800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698005
575	NC_016810	TCTG	2	8	25931	25938	0 %	50 %	25 %	25 %	378698006
576	NC_016810	GGC	2	6	25988	25993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
577	NC_016810	ACG	2	6	26070	26075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698006
578	NC_016810	GC	3	6	26083	26088	0 %	0 %	50 %	50 %	378698006
579	NC_016810	GCCT	2	8	26112	26119	0 %	25 %	25 %	50 %	378698006
580	NC_016810	GGC	3	9	26180	26188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
581	NC_016810	GCC	2	6	26223	26228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698006
582	NC_016810	GCA	2	6	26249	26254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698006
583	NC_016810	GGC	2	6	26279	26284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
584	NC_016810	GGC	2	6	26397	26402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
585	NC_016810	ACT	2	6	26470	26475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698006
586	NC_016810	GCG	2	6	26494	26499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
587	NC_016810	AGCGAC	2	12	26508	26519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698006
588	NC_016810	GCA	2	6	26522	26527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698006
589	NC_016810	ATT	2	6	26606	26611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698006
590	NC_016810	CCTT	2	8	26618	26625	0 %	50 %	0 %	50 %	378698006
591	NC_016810	GAC	2	6	26649	26654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698006
592	NC_016810	CAT	2	6	26747	26752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698006
593	NC_016810	GCC	2	6	26768	26773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698006
594	NC_016810	CCG	2	6	26806	26811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698006
595	NC_016810	GCG	2	6	26815	26820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
596	NC_016810	CCG	2	6	26881	26886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698006
597	NC_016810	GGC	2	6	26908	26913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
598	NC_016810	GCG	2	6	26922	26927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
599	NC_016810	TAG	2	6	26951	26956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698006
600	NC_016810	TCAG	2	8	26977	26984	25 %	25 %	25 %	25 %	378698006
601	NC_016810	GCG	2	6	27073	27078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
602	NC_016810	ATA	2	6	27142	27147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698006
603	NC_016810	GAT	2	6	27261	27266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698006
604	NC_016810	ATT	2	6	27343	27348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698006
605	NC_016810	TTA	2	6	27356	27361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698006
606	NC_016810	AGG	2	6	27366	27371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698006
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608	NC_016810	TTA	2	6	27424	27429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698006
609	NC_016810	CAGC	2	8	27434	27441	25 %	0 %	25 %	50 %	378698006
610	NC_016810	TGA	2	6	27458	27463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698006
611	NC_016810	TTG	2	6	27474	27479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698006
612	NC_016810	ACA	2	6	27529	27534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698006
613	NC_016810	TGA	2	6	27620	27625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698006
614	NC_016810	CTG	2	6	27717	27722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698006
615	NC_016810	ACA	2	6	27742	27747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698006
616	NC_016810	GCG	2	6	27784	27789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
617	NC_016810	CAG	2	6	27864	27869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698006
618	NC_016810	GGC	2	6	27888	27893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
619	NC_016810	TGG	2	6	27895	27900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698006
620	NC_016810	AGCC	2	8	27924	27931	25 %	0 %	25 %	50 %	378698006
621	NC_016810	CG	3	6	28013	28018	0 %	0 %	50 %	50 %	378698006
622	NC_016810	GGT	2	6	28028	28033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698006
623	NC_016810	ACA	2	6	28044	28049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698006
624	NC_016810	GAT	2	6	28092	28097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698006
625	NC_016810	TGA	2	6	28106	28111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698006
626	NC_016810	CCGA	2	8	28131	28138	25 %	0 %	25 %	50 %	378698006
627	NC_016810	GC	3	6	28141	28146	0 %	0 %	50 %	50 %	378698006
628	NC_016810	GC	3	6	28177	28182	0 %	0 %	50 %	50 %	378698006
629	NC_016810	ACGGTG	2	12	28233	28244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378698006
630	NC_016810	TTG	2	6	28267	28272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698006
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754	NC_016810	A	6	6	33926	33931	100 %	0 %	0 %	0 %	378698014
755	NC_016810	TA	3	6	33938	33943	50 %	50 %	0 %	0 %	378698014
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889	NC_016810	AAT	2	6	39980	39985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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