MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_016810	CGG	2	6	279425	279430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698215
6003	NC_016810	GCG	2	6	279431	279436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698215
6004	NC_016810	GCTG	2	8	279447	279454	0 %	25 %	50 %	25 %	378698215
6005	NC_016810	AGG	2	6	279507	279512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698215
6006	NC_016810	TGGCGC	2	12	279513	279524	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378698215
6007	NC_016810	CGA	2	6	279526	279531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698215
6008	NC_016810	TGG	2	6	279590	279595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698215
6009	NC_016810	ACA	2	6	279613	279618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698215
6010	NC_016810	ACG	2	6	279623	279628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698215
6011	NC_016810	CTGC	2	8	279662	279669	0 %	25 %	25 %	50 %	378698215
6012	NC_016810	TGG	2	6	279697	279702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698215
6013	NC_016810	GAA	2	6	279725	279730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698215
6014	NC_016810	CGA	2	6	279836	279841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698215
6015	NC_016810	CGC	2	6	279849	279854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698215
6016	NC_016810	TGT	2	6	279855	279860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698215
6017	NC_016810	AGC	2	6	279913	279918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698215
6018	NC_016810	AGA	2	6	279919	279924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698215
6019	NC_016810	AAG	2	6	279927	279932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698215
6020	NC_016810	GCGCT	2	10	279961	279970	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6021	NC_016810	CAC	2	6	280018	280023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6022	NC_016810	CAA	2	6	280031	280036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_016810	ATG	2	6	280228	280233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698216
6024	NC_016810	TCAT	2	8	280289	280296	25 %	50 %	0 %	25 %	378698216
6025	NC_016810	GCA	2	6	280326	280331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698217
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6027	NC_016810	CCT	2	6	280494	280499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698217
6028	NC_016810	CGT	2	6	280716	280721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698218
6029	NC_016810	ATG	2	6	280804	280809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698218
6030	NC_016810	TGA	2	6	280839	280844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698218
6031	NC_016810	ATC	2	6	280907	280912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698218
6032	NC_016810	GCGA	2	8	280981	280988	25 %	0 %	50 %	25 %	378698218
6033	NC_016810	GCG	2	6	281017	281022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698218
6034	NC_016810	TGG	2	6	281029	281034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698218
6035	NC_016810	CAG	2	6	281035	281040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698218
6036	NC_016810	GC	3	6	281054	281059	0 %	0 %	50 %	50 %	378698218
6037	NC_016810	CGA	2	6	281147	281152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698218
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6040	NC_016810	TAT	2	6	281379	281384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698219
6041	NC_016810	GCCA	2	8	281403	281410	25 %	0 %	25 %	50 %	378698219
6042	NC_016810	GAT	2	6	281424	281429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698219
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6044	NC_016810	TCT	2	6	281604	281609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698219
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6048	NC_016810	GCA	2	6	281805	281810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698220
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6050	NC_016810	TGC	2	6	281825	281830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698220
6051	NC_016810	TGA	2	6	281891	281896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698220
6052	NC_016810	GAA	2	6	281920	281925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698220
6053	NC_016810	CGG	2	6	281963	281968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698220
6054	NC_016810	TAT	2	6	282007	282012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698220
6055	NC_016810	CG	3	6	282013	282018	0 %	0 %	50 %	50 %	378698220
6056	NC_016810	GTAT	3	12	282134	282145	25 %	50 %	25 %	0 %	378698220
6057	NC_016810	GCG	2	6	282157	282162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698220
6058	NC_016810	GGC	2	6	282234	282239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698220
6059	NC_016810	TGC	2	6	282263	282268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698220
6060	NC_016810	CACT	2	8	282375	282382	25 %	25 %	0 %	50 %	378698220
6061	NC_016810	CAA	2	6	282444	282449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_016810	ACG	2	6	282527	282532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698221
6063	NC_016810	TCG	2	6	282549	282554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698221
6064	NC_016810	GTC	2	6	282644	282649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698221
6065	NC_016810	GC	4	8	282670	282677	0 %	0 %	50 %	50 %	378698221
6066	NC_016810	AGC	2	6	282812	282817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698221
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6069	NC_016810	AGT	2	6	283066	283071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698221
6070	NC_016810	GGC	2	6	283112	283117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698221
6071	NC_016810	CGAT	2	8	283125	283132	25 %	25 %	25 %	25 %	378698221
6072	NC_016810	ATTA	2	8	283181	283188	50 %	50 %	0 %	0 %	378698221
6073	NC_016810	TCT	2	6	283200	283205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698221
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6075	NC_016810	CGC	2	6	283276	283281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698221
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6078	NC_016810	CAG	2	6	283331	283336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698221
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6080	NC_016810	CCA	2	6	283375	283380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698221
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6083	NC_016810	GCG	2	6	283453	283458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698221
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6087	NC_016810	TCA	2	6	283705	283710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698221
6088	NC_016810	CG	3	6	283717	283722	0 %	0 %	50 %	50 %	378698221
6089	NC_016810	TCA	2	6	283752	283757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698221
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6092	NC_016810	GCA	2	6	283894	283899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698221
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6094	NC_016810	GGCT	2	8	283946	283953	0 %	25 %	50 %	25 %	378698221
6095	NC_016810	GTT	2	6	283988	283993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698221
6096	NC_016810	CACG	2	8	284002	284009	25 %	0 %	25 %	50 %	378698221
6097	NC_016810	T	6	6	284021	284026	0 %	100 %	0 %	0 %	378698221
6098	NC_016810	TA	3	6	284056	284061	50 %	50 %	0 %	0 %	378698221
6099	NC_016810	ATC	2	6	284082	284087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698221
6100	NC_016810	GC	3	6	284091	284096	0 %	0 %	50 %	50 %	378698221
6101	NC_016810	TGG	2	6	284106	284111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698221
6102	NC_016810	TGT	2	6	284176	284181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698221
6103	NC_016810	A	7	7	284229	284235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_016810	AAAT	2	8	284433	284440	75 %	25 %	0 %	0 %	378698222
6105	NC_016810	CGT	2	6	284470	284475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698222
6106	NC_016810	GGC	3	9	284545	284553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698222
6107	NC_016810	CCA	2	6	284595	284600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698222
6108	NC_016810	CCA	2	6	284613	284618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698222
6109	NC_016810	CT	3	6	284648	284653	0 %	50 %	0 %	50 %	378698222
6110	NC_016810	GCC	2	6	284778	284783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698222
6111	NC_016810	GCC	2	6	284785	284790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698222
6112	NC_016810	TGA	2	6	284801	284806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698222
6113	NC_016810	CGC	2	6	284892	284897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698222
6114	NC_016810	GACCA	2	10	284908	284917	40 %	0 %	20 %	40 %	378698222
6115	NC_016810	GCT	2	6	284986	284991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698222
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6117	NC_016810	GCA	2	6	285077	285082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698223
6118	NC_016810	GC	3	6	285129	285134	0 %	0 %	50 %	50 %	378698223
6119	NC_016810	CGC	2	6	285182	285187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698223
6120	NC_016810	AAC	2	6	285347	285352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698223
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6122	NC_016810	AATG	2	8	285407	285414	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6252	NC_016810	GTG	2	6	291870	291875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6379	NC_016810	GTA	2	6	298663	298668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698231
6380	NC_016810	GCC	2	6	298793	298798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698231
6381	NC_016810	CGT	2	6	298873	298878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698231
6382	NC_016810	GAC	2	6	298886	298891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698231
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6385	NC_016810	CG	3	6	298949	298954	0 %	0 %	50 %	50 %	378698231
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6441	NC_016810	AAT	2	6	302122	302127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6442	NC_016810	CT	3	6	302158	302163	0 %	50 %	0 %	50 %	378698235
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6471	NC_016810	GA	3	6	303964	303969	50 %	0 %	50 %	0 %	378698237
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6483	NC_016810	CTT	2	6	304498	304503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6495	NC_016810	CGGG	2	8	305196	305203	0 %	0 %	75 %	25 %	378698238
6496	NC_016810	CG	3	6	305214	305219	0 %	0 %	50 %	50 %	378698238
6497	NC_016810	GGC	2	6	305247	305252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698238
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6500	NC_016810	GC	3	6	305328	305333	0 %	0 %	50 %	50 %	378698238

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