MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016810	GC	3	6	254120	254125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5502	NC_016810	AC	3	6	254151	254156	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5503	NC_016810	AAC	2	6	254189	254194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_016810	AC	4	8	254193	254200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5505	NC_016810	GC	3	6	254390	254395	0 %	0 %	50 %	50 %	378698195
5506	NC_016810	CAT	2	6	254409	254414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698195
5507	NC_016810	CTGAA	2	10	254456	254465	40 %	20 %	20 %	20 %	378698195
5508	NC_016810	AAGCG	2	10	254520	254529	40 %	0 %	40 %	20 %	378698195
5509	NC_016810	GCT	2	6	254539	254544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698195
5510	NC_016810	TTC	2	6	254560	254565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698195
5511	NC_016810	GCTG	2	8	254576	254583	0 %	25 %	50 %	25 %	378698195
5512	NC_016810	AAGA	2	8	254683	254690	75 %	0 %	25 %	0 %	378698195
5513	NC_016810	AAC	2	6	254821	254826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698195
5514	NC_016810	GAA	2	6	254992	254997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698195
5515	NC_016810	TAA	2	6	255016	255021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698195
5516	NC_016810	GGC	2	6	255060	255065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_016810	GTA	2	6	255173	255178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_016810	ATG	2	6	255333	255338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698196
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5520	NC_016810	CTGA	2	8	255354	255361	25 %	25 %	25 %	25 %	378698196
5521	NC_016810	GCG	2	6	255420	255425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698196
5522	NC_016810	A	6	6	255426	255431	100 %	0 %	0 %	0 %	378698196
5523	NC_016810	GCT	2	6	255444	255449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698196
5524	NC_016810	GACT	2	8	255512	255519	25 %	25 %	25 %	25 %	378698196
5525	NC_016810	CGC	2	6	255569	255574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698196
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5529	NC_016810	GCAA	2	8	255798	255805	50 %	0 %	25 %	25 %	378698196
5530	NC_016810	CTG	2	6	255835	255840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698196
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5532	NC_016810	GAA	2	6	255935	255940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698196
5533	NC_016810	CTG	2	6	256008	256013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698196
5534	NC_016810	GACT	2	8	256082	256089	25 %	25 %	25 %	25 %	378698196
5535	NC_016810	GCA	2	6	256092	256097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698196
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5537	NC_016810	GAG	2	6	256135	256140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_016810	CTT	2	6	256155	256160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_016810	CT	3	6	256168	256173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5540	NC_016810	GAAA	2	8	256263	256270	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_016810	GCG	2	6	256321	256326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698197
5542	NC_016810	TGGTG	2	10	256424	256433	0 %	40 %	60 %	0 %	378698197
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5544	NC_016810	CGCC	2	8	256574	256581	0 %	0 %	25 %	75 %	378698197
5545	NC_016810	CTG	2	6	256644	256649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698197
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5547	NC_016810	TCTG	2	8	256670	256677	0 %	50 %	25 %	25 %	378698197
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5551	NC_016810	CGT	2	6	256950	256955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698197
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5555	NC_016810	TTA	2	6	257046	257051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_016810	TG	3	6	257096	257101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_016810	GTCTG	2	10	257105	257114	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5558	NC_016810	CTG	2	6	257249	257254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698198
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5572	NC_016810	GCG	2	6	257797	257802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5593	NC_016810	ATGGC	2	10	258691	258700	20 %	20 %	40 %	20 %	378698199
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5595	NC_016810	GC	3	6	258749	258754	0 %	0 %	50 %	50 %	378698199
5596	NC_016810	GC	3	6	258764	258769	0 %	0 %	50 %	50 %	378698199
5597	NC_016810	GGC	2	6	258828	258833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698199
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5600	NC_016810	CG	3	6	258993	258998	0 %	0 %	50 %	50 %	378698199
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5603	NC_016810	T	6	6	259161	259166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_016810	CG	3	6	259255	259260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5605	NC_016810	A	6	6	259339	259344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5609	NC_016810	GTCC	2	8	259491	259498	0 %	25 %	25 %	50 %	378698200
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5620	NC_016810	ACTTT	2	10	259986	259995	20 %	60 %	0 %	20 %	378698200
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5868	NC_016810	GCC	2	6	272265	272270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698210
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5871	NC_016810	CGG	2	6	272474	272479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698210
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5876	NC_016810	CCGC	2	8	272740	272747	0 %	0 %	25 %	75 %	378698210
5877	NC_016810	TGA	2	6	272822	272827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698210
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5888	NC_016810	TGA	2	6	273326	273331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698211
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5985	NC_016810	CT	3	6	278696	278701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5986	NC_016810	GCG	2	6	278727	278732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5987	NC_016810	TCA	2	6	278815	278820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698215
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5989	NC_016810	GCA	2	6	279010	279015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698215
5990	NC_016810	CTG	2	6	279041	279046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698215
5991	NC_016810	CCGG	2	8	279068	279075	0 %	0 %	50 %	50 %	378698215
5992	NC_016810	CTT	2	6	279119	279124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698215
5993	NC_016810	GA	3	6	279136	279141	50 %	0 %	50 %	0 %	378698215
5994	NC_016810	T	6	6	279232	279237	0 %	100 %	0 %	0 %	378698215
5995	NC_016810	GC	4	8	279244	279251	0 %	0 %	50 %	50 %	378698215
5996	NC_016810	CAG	2	6	279263	279268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698215
5997	NC_016810	GCG	2	6	279287	279292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698215
5998	NC_016810	GCT	2	6	279331	279336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698215
5999	NC_016810	ACTG	2	8	279362	279369	25 %	25 %	25 %	25 %	378698215
6000	NC_016810	CGG	2	6	279375	279380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698215

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